Entry information : CclGPx01 (orange1.1g026028m)
Entry ID 13494
Creation 2015-12-10 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Peroxidase information: CclGPx01 (orange1.1g026028m)
Name (synonym) CclGPx01 (orange1.1g026028m)
Class Plant glutathione peroxidase    [Orthogroup: Gpx2001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus
Organism Citrus clementina    [TaxId: 85681 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CclGPx01
start..stop
S start..stop
CsGPx01 472 4e-172 1..244 1..245
LuGPx211 358 6e-127 1..244 1..241
PtGPx01 350 4e-124 42..244 29..232
LuGPx140 346 4e-122 1..244 1..244
Literature and cross-references CclGPx01 (orange1.1g026028m)
Protein sequence: CclGPx01 (orange1.1g026028m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   245
PWM (Da):   %s   26878.66  
PI (pH):   %s   9.51
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASYSMPFSA AFSSPLRHFT QIKTCPAAWA SSMAASWTPT NSIKSSIGSA KPGFLQHGLF SQSSNLPGFF VKRRSFGVHA TAATEKSLYD FTVKDIDGKD VPLSKFKGKV LLIVNVASRC  GLTPSNYSEL SHLYEKYKTQ GFEILAFPCN QFGGQEPGSN PEIKEFACTR FKAEFPIFDK VDVNGPNTAP VYQFLKSSAG GFLGDLVKWN FEKFLVDKNG KVIERYPPTT SPFQIEDIQK 
LVVA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from phytozome.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT ATTCGATGCC TTTCTCTGCA GCTTTCTCCT CACCTTTACG GCATTTCACA CAAATCAAAA CATGCCCTGC TGCATGGGCT TCATCAATGG CGGCTTCATG GACTCCTACT  AATTCAATCA AATCATCAAT TGGGTCCGCT AAACCAGGCT TTCTTCAACA TGGGCTGTTT TCCCAATCTT CAAATTTGCC TGGGTTTTTC GTGAAACGTC GTTCCTTTGG TGTTCACGCT  ACAGCTGCTA CTGAGAAGTC TTTATATGAC TTCACCGTCA AGGTAATTTA TTTTGCTCCT TGTGGACTTA AAAATTTTAA TCCTTTGATT GCTATTATTT GCTTCTTCGC TTAATAGTAT  GTAGTCGTGA TGACCATAAG TGTTTGGTCT AATAGTTTAA GCTTGGAGTT AAGGGCCTAA ACAATTTTAT TTAACCTTCT TTAACATTCA CTTTGTGTGA ATTCAATTGT ATATGGAGGA  TTCGAACACA AGACCTTTAG GTCAAATTTG CTGTGATACC GTGTTCTAGA AGTTGCTTGA CTTGACCCAA AAGCGTAAGC TTGAAGGATC CAGACAATAG TATTTAAGCT TGTCTAATTC  TAAATTATCA TAGCAACTCA ATCTGCTGTA TGCTCTATGT GTTTGGCTGT TTGCGTGCTG GCATTACTTA GGCTTCAACT TAGCTGCTAT CGTGGAGAAA AAAGAAAGAA AGATACCGGA  GCTTGGGGCT GAATTGCTCA AGCTAAAGTT TTTCTCTGTT TTGCTTTAAC TTTTTTTTTT TTTATTGTAT TGAAGTATGT ATTAGTTTAT GAATATTGAA TACTGGTGTG GATTTGTGAA  ATAAATCAAC CGGATTGTGT CATACGCTAC TTGAGTGAAA ATAATTTCTG CTTGTTATTA TATTGCTCAA ATTGGTAAGA AATATTTGTG TTGAGCATGG TTTTATTTCT CTTCTGATGC  AGGATATTGA TGGTAAAGAT GTTCCTCTTA GCAAGTTTAA GGGCAAAGTT CTGTTGATTG TGAATGTCGC TTCAAGATGG TACTTTCTCT TTTGATTATC TTGTTTGAAG ATGTCATTTT  TCTGGATGAG GTTTTGCTTG TTTGATGTTT AATAATTGAG GTCTGATTTG AGGATTTTGC TTTGAATCTT AGTGGCTTGA CACCATCTAA TTACTCGGAG CTCTCTCACT TATATGAGAA  GTACAAGACT CAAGGTGGGC CAAATTTTAG TGGAAAGAAC TGTCTTTTTC TTTTGGTACT TGTTATGAAT TAAATTTCTA TAGCATTCAA TTACCTTATC TTTTGCTTTA TGTATATGTT  TAATGACTCG GGAATCAGCT TCCTAAATGG AATCACTTTG AAGATTGATT GCCCATTTGC ATCCCCCCTT CCCTCCGGGC CCCCCCCCCC CCAAAAAAAA AAAAACATAC GTAATTGAAC  TTGTCACACA GCAATTCGTG CAAGACTATC CATGGATATT GAATGATTTT ATTGAGAAAG CTAGTGGTGT TCATGAATTC AGGATTTGTA CTGGAACTTG TAACCAGTAC TTGCTTTCCA  GAGAATCATT GCAATCCTGA TTTTATAGTG TTATTACGTT TATGTTAATG CTTTTATTCC AAGTACAAAT CAATGCCTCT AAAATCCATA AAAATTTGGA ACTGCTGGAA GTCACCATTA  CTTTTAGTAT TGTGGTAGTC TAATTGTAAA CATGGAGACA TTTCCACTTC ATGTATTATC CCTTTGCCGA TTTGTGACTG CACGAGTTTT TTTGTTCTTT CTCATTTGGC TATGATCTTG  TTGCCCTCAG ATTCACCTTT AGTTTCACTT AGCTATTGCG ATTTTTCTTC AATCAGAGGT AACATTATGT TTTCCTTGGA TGACTTGAGT TGATATGGAC ATTAACTTCC TTGCAGGATT  TGAGATTCTA GCTTTCCCTT GCAATCAATT TGGTGGGCAA GAGCCTGGAT CAAACCCTGA GATCAAGGAA TTCGCTTGTA CTAGGTTTAA GGCAGAATTT CCCATATTTG ACAAGGTAAG  TCAAACTTAT TTTCTCATGC TTATAATTCA TGTGGAAGGG CGAAAATGAT TCACTGGCTA AGGTTTTACT TGACAGGTTG ATGTAAATGG ACCAAACACA GCTCCAGTTT ACCAGTTTTT  GAAGTCAAGT GCTGGGGGAT TTTTAGGCGA CCTTGTCAAG TGGAACTTTG AGAAGTTCTT AGTGGACAAA AATGGTAAAG TCATCGAGAG ATATCCACCA ACTACCTCGC CTTTCCAAAT  TGAGGTACAT TTTCTACTTT CGAGATGCTG AAATTCTTTA AATTATTCAT GGACACACCT GCTGGGTACA CTAGATGTGT ACTGTCATAG ACATGAAAGA GTATCTAGCT CTCTTGGCTG 
TTGCTATTCA CTGATAAACA ATTTTCCTGT TTATTTTCTA CAGAAGGACA TCCAGAAGCT TGTTGTGGCA TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT ATTCGATGCC TTTCTCTGCA GCTTTCTCCT CACCTTTACG GCATTTCACA CAAATCAAAA CATGCCCTGC TGCATGGGCT TCATCAATGG CGGCTTCATG GACTCCTACT  AATTCAATCA AATCATCAAT TGGGTCCGCT AAACCAGGCT TTCTTCAACA TGGGCTGTTT TCCCAATCTT CAAATTTGCC TGGGTTTTTC GTGAAACGTC GTTCCTTTGG TGTTCACGCT  ACAGCTGCTA CTGAGAAGTC TTTATATGAC TTCACCGTCA AGGATATTGA TGGTAAAGAT GTTCCTCTTA GCAAGTTTAA GGGCAAAGTT CTGTTGATTG TGAATGTCGC TTCAAGATGT  GGCTTGACAC CATCTAATTA CTCGGAGCTC TCTCACTTAT ATGAGAAGTA CAAGACTCAA GGATTTGAGA TTCTAGCTTT CCCTTGCAAT CAATTTGGTG GGCAAGAGCC TGGATCAAAC  CCTGAGATCA AGGAATTCGC TTGTACTAGG TTTAAGGCAG AATTTCCCAT ATTTGACAAG GTTGATGTAA ATGGACCAAA CACAGCTCCA GTTTACCAGT TTTTGAAGTC AAGTGCTGGG  GGATTTTTAG GCGACCTTGT CAAGTGGAAC TTTGAGAAGT TCTTAGTGGA CAAAAATGGT AAAGTCATCG AGAGATATCC ACCAACTACC TCGCCTTTCC AAATTGAGGA CATCCAGAAG 
CTTGTTGTGG CATGA 

Retrieve as FASTA