Entry information : CclGPx04 (Ciclev10022566m)
Entry ID 13497
Creation 2015-12-10 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Peroxidase information: CclGPx04 (Ciclev10022566m)
Name (synonym) CclGPx04 (Ciclev10022566m)
Class Plant glutathione peroxidase    [Orthogroup: Gpx2003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus
Organism Citrus clementina    [TaxId: 85681 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CclGPx04
start..stop
S start..stop
CsGPx04 342 6e-123 1..170 1..170
NtGPx08-1A 301 8e-107 1..167 1..167
PtGPx08 299 4e-106 1..170 1..170
LeGPx08 291 4e-103 1..167 1..167
Literature and cross-references CclGPx04 (Ciclev10022566m)
Protein sequence: CclGPx04 (Ciclev10022566m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   171
PWM (Da):   %s   19304.76  
PI (pH):   %s   4.73
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTSQFIQNPE SIFDLSVKDA RGHEVDLSTY KGKVLLIVNV ASKCGMTNSN YIELSQLYDK YKDQGLEILA FPCNQFGEEE PGSNDQIADF VCTRFKSEFP IFEKIDVNGE HASPLYKLLK 
LGKWGIFGDD IQWNFAKFLV DKNGEVVDRY YPTTSPLSLE RDIKKLLGLS * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from phytozome.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAAGCC AGTTTATACA AAACCCGGAG TCAATTTTTG ACTTATCTGT CAAGGTCTGT TTCTTCTTTC TCCAATTCTT TTCATCTACT TTTAGATTTC TTTTTATTTT TTTTTCATTT  TTTTAACGTT TTAATTTCCA TTTGGGTATG CTTGGAATCA CGCCATCTTA CTAGAGGAGG ATAGATGGTT CATACGTGGT TCTGCTTGGT GTGGTTATGG GGTCGTCGCT TCGGGAAAGA  AATAAATTAA ATCTTAAATT TAATTGATCA AAAATCATCA TTTATTTCCT ATTACAGTAA TGTTTTTAGG AGTTTTATTT ATTTATTTAT TTTATTATTA TTATTATTGG CCACTCGCAG  GATGCCAGAG GCCATGAGGT AGATCTCAGC ACATACAAAG GCAAAGTCTT ACTCATAGTT AATGTTGCTT CAAAATGGTA TTGTGTAATG TGTATGCTTT GCTTCTCAAT GTTGTTAAAC  TCGGTTTATT GATTGAGGAG ATTGTGCAAC TGAAATATGT ATACCCATCT TTAAGTCTTA ACCCTTTGGT ACGTTGTCAT TGATTCTGGC AGTGGGATGA CCAATTCGAA TTACATAGAG  CTAAGTCAGT TATATGACAA ATACAAAGAT CAAGGTCTGC ATTTTGATCT TGCAATTATT TGATGCTTTT GTTTCCATAG TGTTTGCTTA TTTGTACAAT TGCTTAAACT GAAATATGTT  TGCGGTAATT TGATAAAGCA TTGTACTGAT TGGTCTTTGG AGCGAAACTG GAAGACATGG ATTTCGTATT TAAAAGATGA TATTGGTGGT TTATCATATG AAATATCCTT TTTGAGAGAT  ATTTAATTAA AGACATGGCA TTTCATTTTT CTTGGTGCAG GCTTAGAGAT TCTGGCATTT CCATGCAATC AATTTGGTGA AGAGGAACCA GGAAGTAATG ATCAGATCGC AGATTTTGTC  TGCACTCGCT TCAAATCAGA GTTTCCAATT TTTGAAAAGG TAGATATGTG ATATCTAGTT GCTCTTAAAT CTGAATGCTC CTGAGTCCTG AAGTGCTCGG CAATACAAGG GTTGTCTTAG  ATATTGACTA TTAGTTCTAG ATTTGCATGT ATTGTGTCAT TTTAGTTACT CTACTAGCTT TAACCAAATC GGTTTTCCTG TCATTTGGAT TGTTGACTAG TAATGTTGGA CATTGTTGTA  TGATTTTTAT TTTTTGTGAT TAATAACTAT TGACCTTGCT GGTTTTGTTT AAAAGATTGA TGTAAATGGT GAACATGCTT CTCCACTTTA CAAGCTCTTG AAGTTGGGTA AATGGGGTAT  TTTTGGGGAT GATATTCAGT GGAACTTCGC CAAGTTCCTA GTTGATAAGA ATGGAGAAGT TGTTGATCGT TACTACCCCA CAACTTCTCC GCTTAGCCTT GAGGTAATCC TATAATCTTG  CAACTTTAAA GTTGATTTTA TGGTTTGCTA GCAAGTAATT ATCACCCAGA TTCCCAAATT GTCATATAAC AAACTCATTT AGCTTCATCA AATATTGACA TCGCAGCGTG ACATCAAGAA 
GCTCTTGGGC CTCTCGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAAGCC AGTTTATACA AAACCCGGAG TCAATTTTTG ACTTATCTGT CAAGGATGCC AGAGGCCATG AGGTAGATCT CAGCACATAC AAAGGCAAAG TCTTACTCAT AGTTAATGTT  GCTTCAAAAT GTGGGATGAC CAATTCGAAT TACATAGAGC TAAGTCAGTT ATATGACAAA TACAAAGATC AAGGCTTAGA GATTCTGGCA TTTCCATGCA ATCAATTTGG TGAAGAGGAA  CCAGGAAGTA ATGATCAGAT CGCAGATTTT GTCTGCACTC GCTTCAAATC AGAGTTTCCA ATTTTTGAAA AGATTGATGT AAATGGTGAA CATGCTTCTC CACTTTACAA GCTCTTGAAG  TTGGGTAAAT GGGGTATTTT TGGGGATGAT ATTCAGTGGA ACTTCGCCAA GTTCCTAGTT GATAAGAATG GAGAAGTTGT TGATCGTTAC TACCCCACAA CTTCTCCGCT TAGCCTTGAG 
CGTGACATCA AGAAGCTCTT GGGCCTCTCG TGA 

Retrieve as FASTA