Entry information : CclDiOx03 (Ciclev10014631m)
Entry ID 13503
Creation 2015-12-10 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Peroxidase information: CclDiOx03 (Ciclev10014631m)
Name (synonym) CclDiOx03 (Ciclev10014631m)
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus
Organism Citrus clementina    [TaxId: 85681 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CclDiOx03
start..stop
S start..stop
CclDiOx02 1049 0 1..614 27..639
VvDiOx02 895 0 1..614 27..638
VvDiOx01 891 0 1..614 31..642
NatDiOx01 882 0 1..613 31..641
Literature and cross-references CclDiOx03 (Ciclev10014631m)
Protein sequence: CclDiOx03 (Ciclev10014631m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   615
PWM (Da):   %s   70100.37  
PI (pH):   %s   7.58
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTLIDKFLFL IVHTMDKLGI LWHRLPVFVG VRFNPGDYPY PTANGEYNDP FIEGAGSEGT FFGRNVLPAD KKHKLLKPDP VVVATKLLSR RSFIDTGKQF NTIAAAWIQT QIKFVNFNYY  IYDWIDHLRV DSPLSMHRFG VELVAPREVA GKCPLSSFKF YKTKEVPTGF HEIKHGHLNV RTPWWDGSAI YGSNAERLHK LRTFKDGKLK IAKDGLLLHD QNGVAVTGDV RNTWAGLSTL  QALFVKEHNA VCDALKKEYP DLGDEELYRH ARLVTSAVIA KVHTIDWTEE LLKTDPACRD AYQLRIVLLD HNDPILYGIL GKKFKDTFGH VGGAILGGFV RMKKPENHGV PYSLTEEFTS  VYRMHALLPD TLNLRDIDAQ PGPNKSPPLA EKVPMENLVG HKGEKALSDI GFGKRIVSMG HQACGALELW NYPLWLRDLI PQNTDGTDRL IMWTYQLLKA RDRERKVARY NEFRRALLLI  PISKWEDLTE DKEAIEVLNE VYGDDVEELD LQVGLMAEKK IKGFAISETA FLIFLLMASR RLEADRFFTS SFNEETYTKK GLEWVNTTES LKDVLYRHYP EITEKWMNST SAFSVWDSPP 
NSHNPIPLYL RVPQ* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTCTCA TCGACAAATT TCTCTTCCTG GTAAAATATC TCTCTCCATG CATGCATGCA GCTTTTAACT ATTTTAGTTT GTTAAACATT AATAATATTG ATTGTCATTC TTACATTTTG  TTGTTGAATT TTTGGTTTCT TATTATGTAT GTGTCGTGGT CATGCTTATG CAGATTGTGC ACACCATGGA TAAGCTGGGA ATATTATGGC ACCGGTTGCC CGTGTTTGTT GGTTTATTTT  ATCTGGGACT TCGGCGACAA CGTCGGGAAA ACCCCGGCAG GCGTTCGGTT TAATCCGGGC GATTATCCGT ACCCGACCGC CAATGGCGAA TATAACGATC CCTTCATTGA AGGTGCTGGC  AGTGAAGGAA CTTTCTTTGG CAGGAATGTT CTCCCTGCTG ATAAAAAACA CAAGGTATGT ACATGTATAT CCAACAATAA TATTAACAAT GATATAAGTA CAAACTAGTA GAAACTGTTT  TACAAATTTT CATGAACAAT TTAAGGCGGC GGCTTACATG ACATGAAATA ATTACTTAAA GTCAAGGCAG TTAATGAAAA TAATCAATCC CTTAAACACT ATGTAAATCG CCACTCAGAT  TGTATAAGAA ATTTTGTACA ACAATTTGTA GATGTATAAT ATTATACACG CAATCTAAAA ATTACTTCCC CAAGGATTTA GCCATATGAT TTTTAGCAAA TTTATTTAAT TAGCTACTAA  AAATCGAATT ATAAAATGGT ATGGTTAAAT AATTTATATA TATATCAACG TCGCCTATGT ACCCTTCTAT CTCTAAAAAA TAAAAAATCT ACCAACTACT TAAATTGACC CCCAAAAGTT  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TCAGTGA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTCTCA TCGACAAATT TCTCTTCCTG ATTGTGCACA CCATGGATAA GCTGGGAATA TTATGGCACC GGTTGCCCGT GTTTGTTGGC GTTCGGTTTA ATCCGGGCGA TTATCCGTAC  CCGACCGCCA ATGGCGAATA TAACGATCCC TTCATTGAAG GTGCTGGCAG TGAAGGAACT TTCTTTGGCA GGAATGTTCT CCCTGCTGAT AAAAAACACA AGCTACTGAA ACCAGATCCA  GTCGTAGTTG CCACAAAACT TCTATCACGG AGGAGTTTCA TAGACACAGG AAAGCAATTC AATACGATAG CAGCTGCGTG GATTCAGACA CAAATCAAGT TTGTAAATTT TAATTATTAT  ATATATGATT GGATTGATCA TTTGAGAGTC GACAGCCCCT TATCAATGCA TAGGTTTGGG GTTGAGCTGG TGGCGCCCAG AGAAGTGGCA GGCAAATGCC CTCTTAGTTC TTTCAAATTC  TACAAGACAA AGGAGGTTCC AACCGGCTTT CATGAAATCA AACACGGGCA TTTGAACGTT CGTACTCCTT GGTGGGATGG AAGTGCTATA TATGGAAGCA ACGCAGAGAG ATTGCATAAA  TTGAGGACTT TCAAGGACGG GAAGCTGAAA ATAGCAAAAG ATGGGCTTCT TCTCCATGAC CAAAACGGAG TTGCTGTAAC AGGAGATGTT CGCAATACTT GGGCTGGTCT CTCAACATTA  CAGGCTCTTT TCGTTAAAGA GCACAATGCG GTTTGTGACG CCCTCAAGAA GGAATATCCA GATTTGGGAG ATGAAGAACT TTACCGCCAT GCAAGGCTAG TGACTTCAGC TGTGATTGCT  AAAGTTCATA CTATTGATTG GACTGAGGAG CTCCTCAAAA CCGACCCTGC TTGCAGGGAT GCGTATCAAC TGAGAATTGT ATTACTTGAC CACAATGATC CAATACTGTA TGGAATTCTG  GGAAAGAAAT TCAAAGACAC ATTTGGGCAC GTTGGAGGAG CCATCTTGGG AGGCTTTGTA CGCATGAAGA AGCCTGAAAA TCATGGGGTC CCTTACTCAT TGACCGAGGA ATTCACCAGC  GTTTACCGCA TGCACGCGCT TCTACCAGAT ACCCTTAATC TCAGGGACAT CGATGCTCAA CCGGGACCCA ATAAATCTCC TCCGTTGGCT GAGAAGGTGC CTATGGAAAA TTTGGTTGGA  CACAAGGGAG AAAAGGCCTT ATCAGACATT GGATTTGGGA AGCGAATAGT TTCAATGGGT CACCAAGCTT GTGGGGCATT GGAGCTTTGG AATTATCCTC TCTGGCTAAG GGACCTTATT  CCGCAAAATA CGGACGGCAC GGATAGGCTG ATCATGTGGA CCTACCAGCT CTTGAAGGCA AGGGACAGGG AGAGAAAAGT TGCTAGGTAC AATGAGTTCC GTAGGGCTCT GCTCTTAATT  CCTATCTCCA AGTGGGAAGA TCTGACGGAG GATAAGGAAG CGATTGAAGT GCTTAATGAA GTGTACGGTG ACGATGTTGA AGAGCTTGAC CTTCAAGTAG GCCTCATGGC AGAGAAAAAG  ATAAAGGGTT TCGCTATCAG CGAGACCGCT TTTTTAATCT TCCTATTGAT GGCATCCAGG AGACTTGAAG CCGACAGGTT CTTCACAAGC AGTTTCAATG AGGAGACATA CACGAAGAAA  GGACTTGAGT GGGTCAACAC AACGGAGAGC CTGAAGGATG TATTGTATCG TCATTATCCT GAAATTACAG AGAAATGGAT GAACTCAACA AGTGCTTTCT CCGTCTGGGA CTCACCTCCA 
AACTCTCACA ATCCCATCCC TCTTTATCTT CGCGTTCCTC AGTGA 

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