Entry information : CclRboh04 (Ciclev10007394m)
Entry ID 13505
Creation 2015-12-10 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Peroxidase information: CclRboh04 (Ciclev10007394m)
Name (synonym) CclRboh04 (Ciclev10007394m)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus
Organism Citrus clementina    [TaxId: 85681 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CclRboh04
start..stop
S start..stop
CsRboh04 1732 0 12..910 12..875
VvRboh07 1437 0 7..910 9..917
PtRboh09 1397 0 3..910 6..926
EgrRboh01 1338 0 8..910 3..925
Literature and cross-references CclRboh04 (Ciclev10007394m)
Protein sequence: CclRboh04 (Ciclev10007394m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   911
PWM (Da):   %s   103207.65 Transmb domain:   %s   o346-368i480-502o529-551i708-725o
PI (pH):   %s   9.12
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRSLSRSSSR SNYGRTFELP DDCEDPQSRR TSDYAVGGAM LPIFLNDLSR NSQQEQAQDL VELTIELEDD AVVLCSVSTP TAPARVSRSS HGSRRKFGWL RSGSSSDIEE RTISARDERR  IKAKLQRARS GAKRALNGLR FISKTAGASD AEELWRLVES RFESLAEDGL LAREDFGECI GMVDTKEFAV GIFDALARRR GQKIGKITKE ELREFWLQIS DQSFDARLQI FFDMADSNVD  GRITREEVQE LLMLSASANK LSKLKEQAEE YASLIMEELD PENLGYIELW QLETLLLQRD TYMNYSRPLS TTSKTSNWSQ NLSPFTPKGA FRKLSFTFRC LVLENWQRGW ILLLWMMAMA  GLFAWKFIQY KNMAAFQVMG YCLTTAKGAA ETLKLNMALI LLPVCRNTLT WLRSTRARYF VPFDDNINFH KTIACAIIIG VVLHVGNHLA CDFPRLVNSS PEEFAPMSTQ FHNKKPTYKY  LLTGVEGVTG IVMVVLMAIA FTLATHKFRK NGVRLPSPFN RLTGFNAFWY SHHLTAIVYI LLIVHGNFLY LAHEWYQKTT WMYISAPLLL YVAERNLRTR RSGHFSAKDL KVAVLPGNVL  SIVMSKPNGF RYRSGQYIFL HCPTISSFEW HPFSITSAPG DDHLSVHIRI VGDWTHELKR VFTEDKDSAC VIGRAEFGQV GTNNRIQPRL LVDGPYGAAA QDYSNYDVLL LVGLGIGATP  FISILRDLLN NTREELMDSN TDSSRSASLN SCTSSNTSPG SSMIAGGKKK PQRTRNAYFY WVTREPGSFE WFKGVMDQVA EMDLKGQIEL HNYLTSVYEE GDARSTLITM VQALNHAKHG 
VDILSGTRVR THFARPNWKE VFSRVATKHP NATIGVFYCG MPVLAKELKK LSHELTHRTS TRFEFHKEYF * 

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Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCGGTCTC TGTCGAGGAG CAGCTCGCGA TCGAATTACG GCCGCACGTT TGAATTACCA GATGACTGCG AAGACCCGCA GTCGCGACGG ACAAGTGACT ACGCCGTGGG CGGAGCAATG  TTGCCGATTT TTCTCAACGA TTTGAGCAGG AACAGCCAGC AGGAGCAAGC GCAGGACTTA GTCGAACTCA CGATTGAGCT CGAAGACGAC GCCGTCGTGT TGTGCAGTGT GAGCACTCCA  ACTGCTCCCG CGCGAGTGTC GAGGTCGAGC CACGGCAGCC GGCGGAAGTT CGGCTGGCTA AGATCGGGAT CGTCGTCGGA TATTGAGGAA CGGACGATTT CCGCGCGCGA TGAGAGGAGG  ATCAAAGCGA AACTTCAACG GGCGAGATCG GGCGCTAAGA GAGCGCTTAA CGGTCTGAGA TTCATTAGCA AAACGGCAGG CGCCTCCGAC GCAGAGGAGC TCTGGAGACT AGTTGAGTCC  AGGTTCGAAT CGCTAGCTGA GGACGGGTTG CTTGCGAGGG AAGATTTCGG TGAATGCATT GGTACGTTAC GTAGTAATTA AAACCGATCC ATAATCAGAT TCATTTTTCT TACTCTGTAC  TGATTTGTTC GTTATGATTT CATTTTTCCT ATTCTAAATT GTAATTAAAT AATTCATCGC AAAACAGGGA TGGTGGATAC GAAGGAGTTT GCGGTGGGGA TATTTGATGC GTTGGCGAGG  CGGAGAGGCC AAAAGATAGG CAAAATTACG AAAGAGGAGC TTCGTGAATT CTGGTTGCAA ATTTCGGACC AGAGCTTCGA CGCCCGTCTT CAGATTTTCT TTGACATGTG CGTACGCTTC  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AAGGAGTTGA AGAAACTATC ACATGAGCTG ACTCACCGGA CATCCACACG CTTCGAATTC CACAAGGAGT ACTTCTGA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCGGTCTC TGTCGAGGAG CAGCTCGCGA TCGAATTACG GCCGCACGTT TGAATTACCA GATGACTGCG AAGACCCGCA GTCGCGACGG ACAAGTGACT ACGCCGTGGG CGGAGCAATG  TTGCCGATTT TTCTCAACGA TTTGAGCAGG AACAGCCAGC AGGAGCAAGC GCAGGACTTA GTCGAACTCA CGATTGAGCT CGAAGACGAC GCCGTCGTGT TGTGCAGTGT GAGCACTCCA  ACTGCTCCCG CGCGAGTGTC GAGGTCGAGC CACGGCAGCC GGCGGAAGTT CGGCTGGCTA AGATCGGGAT CGTCGTCGGA TATTGAGGAA CGGACGATTT CCGCGCGCGA TGAGAGGAGG  ATCAAAGCGA AACTTCAACG GGCGAGATCG GGCGCTAAGA GAGCGCTTAA CGGTCTGAGA TTCATTAGCA AAACGGCAGG CGCCTCCGAC GCAGAGGAGC TCTGGAGACT AGTTGAGTCC  AGGTTCGAAT CGCTAGCTGA GGACGGGTTG CTTGCGAGGG AAGATTTCGG TGAATGCATT GGGATGGTGG ATACGAAGGA GTTTGCGGTG GGGATATTTG ATGCGTTGGC GAGGCGGAGA  GGCCAAAAGA TAGGCAAAAT TACGAAAGAG GAGCTTCGTG AATTCTGGTT GCAAATTTCG GACCAGAGCT TCGACGCCCG TCTTCAGATT TTCTTTGACA TGGCCGATAG CAATGTAGAT  GGAAGAATTA CGAGAGAAGA AGTGCAAGAG CTTTTAATGC TGAGTGCTTC GGCCAACAAG CTGTCCAAGT TAAAAGAGCA AGCTGAGGAA TATGCTTCTT TGATAATGGA AGAATTAGAT  CCTGAAAATC TTGGATATAT TGAGTTATGG CAATTGGAGA CGTTACTGCT ACAAAGAGAC ACCTACATGA ATTATAGCAG ACCTCTTAGC ACAACAAGCA AAACAAGCAA CTGGAGTCAG  AACTTGAGTC CATTTACACC CAAGGGCGCA TTCCGCAAAT TAAGCTTTAC ATTCCGGTGT CTAGTGCTAG AGAACTGGCA AAGAGGTTGG ATTTTGTTGC TGTGGATGAT GGCAATGGCC  GGGCTCTTTG CGTGGAAATT CATCCAGTAT AAAAACATGG CAGCATTTCA AGTCATGGGC TACTGCTTGA CCACAGCTAA AGGCGCCGCT GAGACTCTCA AGCTCAACAT GGCTCTGATA  CTCCTGCCCG TTTGTCGAAA TACCCTCACT TGGCTTCGGT CTACTAGAGC AAGATACTTT GTTCCTTTTG ATGACAACAT TAATTTTCAC AAGACGATAG CATGTGCCAT AATCATTGGA  GTCGTCCTTC ATGTGGGAAA TCATCTGGCA TGCGACTTTC CCCGATTAGT AAACTCATCT CCAGAAGAAT TTGCCCCCAT GTCTACACAA TTCCACAACA AGAAGCCCAC TTACAAATAC  CTTTTAACCG GCGTTGAAGG TGTGACGGGG ATTGTTATGG TCGTTTTAAT GGCCATTGCA TTCACTCTGG CAACACACAA ATTTAGGAAA AATGGGGTCA GGCTACCTTC ACCCTTCAAC  AGATTGACAG GCTTTAATGC ATTCTGGTAT TCACATCACC TTACTGCCAT CGTCTACATT TTGCTGATTG TCCATGGAAA TTTCTTGTAC TTGGCACATG AGTGGTATCA AAAAACAACA  TGGATGTACA TCTCTGCTCC TTTGTTGCTC TATGTGGCAG AGCGGAATCT GCGAACAAGA AGATCAGGAC ATTTTTCTGC AAAAGATTTA AAGGTTGCAG TTCTACCAGG AAATGTCTTA  AGCATAGTTA TGTCAAAACC AAATGGATTT AGGTACAGAA GCGGTCAGTA CATTTTTCTA CATTGTCCTA CGATCTCCTC ATTTGAATGG CATCCATTTT CTATTACCTC AGCACCAGGG  GATGACCACC TGAGTGTTCA CATCCGGATA GTTGGAGACT GGACGCATGA ATTGAAGCGA GTTTTCACAG AGGACAAGGA TTCAGCATGT GTTATTGGCC GGGCTGAATT TGGCCAAGTT  GGGACCAACA ACAGAATCCA ACCCAGACTA CTTGTTGATG GCCCATATGG TGCAGCCGCA CAGGACTATA GCAATTACGA TGTCTTGCTC CTAGTAGGAC TAGGAATTGG AGCTACCCCT  TTTATAAGCA TACTTAGAGA TCTTTTAAAC AATACAAGAG AGGAACTGAT GGACTCAAAC ACAGATTCAA GTAGATCAGC CAGCTTGAAC AGCTGTACAT CTTCAAATAC ATCTCCAGGT  TCAAGTATGA TAGCAGGTGG CAAGAAGAAA CCACAGAGGA CTAGAAATGC TTATTTCTAC TGGGTGACCA GGGAGCCTGG TTCATTTGAA TGGTTCAAAG GAGTAATGGA TCAAGTTGCA  GAAATGGATC TTAAAGGTCA GATCGAGCTG CACAACTACC TAACAAGTGT TTATGAAGAG GGGGATGCAA GATCAACTTT GATCACCATG GTTCAAGCTC TTAACCATGC CAAACACGGA  GTCGACATCT TATCTGGCAC CAGAGTAAGG ACACACTTTG CAAGGCCAAA CTGGAAAGAA GTTTTCAGCA GAGTAGCTAC AAAACATCCG AATGCCACGA TAGGTGTGTT CTACTGTGGG 
ATGCCAGTGT TAGCAAAGGA GTTGAAGAAA CTATCACATG AGCTGACTCA CCGGACATCC ACACGCTTCG AATTCCACAA GGAGTACTTC TGA 

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