Entry information : CclRboh03 (Ciclev10000227m)
Entry ID 13506
Creation 2015-12-10 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Peroxidase information: CclRboh03 (Ciclev10000227m)
Name (synonym) CclRboh03 (Ciclev10000227m)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus
Organism Citrus clementina    [TaxId: 85681 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CclRboh03
start..stop
S start..stop
CsRboh03 1850 0 1..889 1..889
PtRboh10 1568 0 1..889 1..886
GmRboh02 1529 0 1..889 1..885
GmRboh15 1519 0 1..889 1..871
Literature and cross-references CclRboh03 (Ciclev10000227m)
Protein sequence: CclRboh03 (Ciclev10000227m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   890
PWM (Da):   %s   100981.97 Transmb domain:   %s   o338-357i478-500o520-542i702-719o
PI (pH):   %s   9.38
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDIQDYKDDS LSETGSTTSS RVGYSGPLSG PLVTTTNKKN SSRKSARFKD QDECYVEITL DVRDDSVSVQ NIRGGDSETA FLASRLERKP SSSSALSARL RQVSQELKRM ASSKRFDKVD  RTKSGAARAL KGLKFITKNV GTEGWGEVEK RFDELAVDGM LPKSSFGQCI GMNESKDFAS ELFDALARRR GLTSSSITKS ELRGFWEQIT DQSFDARLET FFDMVDKNLD GRITEEEVKE  IIALSASANK LSKIQERVEE YAALIMEELD PHNLGYIELY NLEMLLLQAP SQSANLLTDS RVLSQMLSQR LVPTKDRNPI KKCCRGLSYF VQDNWKRIWV MLLWLSICAG LFTWKFIQYK  HRAVFHVMGY CVTTAKGAAE TLKFNMALIL LPVCRNTITW LRSRTKLGRV VPFDDNINFH KVIAVGIAIG VGLHAGAHLT CDFPRLLHAT DEEYEPMKPF FGDDRPDDYW WFVKGTEGWT  GVVMVVLMAI SYTLAQPWFR RNRLNLPKIL KKLTGFNAFW YSHHLFVIVY VLFIIHGYFL YLSKKWYKRT TWMYLAVPVL LYACERLIRA FRSGYKSVRI LKVAVYPGNV LALQMSKPQG  FKYTSGQYIF VNCAAVSQFQ WHPFSITSAP GDDYLSIHIR TLGDWTSQLK SIFAKVCQPP SVDQSGLLRA DIGQADNRPR IPKLLIDGPY GAPAQDYKDY DVLLLVGLGI GATPLISIIK  DVLNNIKQQK EIEEGITEDG GATKNSKKKP FATKRAYFYW VTREQGSFEW FRGVMNEVAE YDQDGVIELH NYCTSVYEEG DARSALITML QSIHHAKNGL DIVSGTRVKT HFARPNWRTV 
FKHVAVKHTD ERVGVFYCGA PGLTGELRRL SQDFSRKTTT KFDFHKENF* 

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Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
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ATGGATATTC AAGACTACAA AGACGACTCA TTATCCGAAA CCGGAAGCAC AACAAGCTCA AGAGTAGGCT ACAGCGGGCC GTTGAGCGGT CCGTTGGTGA CGACAACGAA CAAAAAGAAC  AGCAGCAGAA AGAGTGCCAG GTTCAAGGAC CAAGATGAGT GCTACGTTGA AATCACACTG GACGTGCGAG ATGATTCAGT TTCTGTCCAG AACATCAGGG GAGGTGATTC GGAGACGGCG  TTTTTGGCCA GCAGATTGGA GAGGAAGCCT TCTTCTTCTT CTGCACTTTC GGCCCGGTTG AGGCAAGTTT CGCAGGAGCT AAAGCGAATG GCTTCTTCAA AGCGATTTGA TAAAGTTGAT  CGCACCAAGT CGGGAGCCGC TCGTGCTTTG AAAGGGCTAA AGTTTATCAC CAAGAATGTG GGGACTGAAG GTTGGGGCGA AGTTGAAAAG CGCTTTGATG AATTGGCTGT TGATGGGATG  CTGCCTAAAT CCAGCTTTGG TCAATGCATA GGTAAACATT TAACTAACTG ATTATGTTGT TTTGATAATG TTTGACAAGC ACTTCTAGAT GGTCAACAAG AACTTTTTTA AACTGGGTTT  GGTGTTGATG TGATCAGGGA TGAACGAATC AAAGGATTTT GCGAGTGAAT TATTTGATGC ATTGGCTCGT AGGAGAGGCT TAACATCTTC TTCAATTACC AAGTCTGAGT TGAGAGGATT  TTGGGAACAG ATTACAGACC AAAGCTTTGA TGCTAGGCTT GAAACCTTCT TTGACATGTA AGCACTTTTG GATTTAATTA GTAATTGTGT TACATTTCAT ATGACGAACT TCAGTTATTT  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ACCAAATTTG ATTTTCACAA AGAAAACTTT TGA 

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CDS
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ATGGATATTC AAGACTACAA AGACGACTCA TTATCCGAAA CCGGAAGCAC AACAAGCTCA AGAGTAGGCT ACAGCGGGCC GTTGAGCGGT CCGTTGGTGA CGACAACGAA CAAAAAGAAC  AGCAGCAGAA AGAGTGCCAG GTTCAAGGAC CAAGATGAGT GCTACGTTGA AATCACACTG GACGTGCGAG ATGATTCAGT TTCTGTCCAG AACATCAGGG GAGGTGATTC GGAGACGGCG  TTTTTGGCCA GCAGATTGGA GAGGAAGCCT TCTTCTTCTT CTGCACTTTC GGCCCGGTTG AGGCAAGTTT CGCAGGAGCT AAAGCGAATG GCTTCTTCAA AGCGATTTGA TAAAGTTGAT  CGCACCAAGT CGGGAGCCGC TCGTGCTTTG AAAGGGCTAA AGTTTATCAC CAAGAATGTG GGGACTGAAG GTTGGGGCGA AGTTGAAAAG CGCTTTGATG AATTGGCTGT TGATGGGATG  CTGCCTAAAT CCAGCTTTGG TCAATGCATA GGGATGAACG AATCAAAGGA TTTTGCGAGT GAATTATTTG ATGCATTGGC TCGTAGGAGA GGCTTAACAT CTTCTTCAAT TACCAAGTCT  GAGTTGAGAG GATTTTGGGA ACAGATTACA GACCAAAGCT TTGATGCTAG GCTTGAAACC TTCTTTGACA TGGTGGACAA GAATTTAGAT GGGAGGATCA CTGAAGAAGA GGTGAAAGAG  ATTATTGCTC TAAGTGCATC TGCTAATAAG CTGTCAAAAA TCCAAGAACG TGTGGAAGAA TATGCAGCTC TAATCATGGA AGAGCTCGAC CCCCACAATC TCGGTTACAT TGAGCTGTAC  AATCTGGAAA TGTTACTGCT CCAAGCTCCA AGCCAATCGG CAAACCTGCT AACCGATAGT CGCGTTTTGA GCCAGATGCT CAGTCAAAGA TTGGTGCCAA CCAAAGACAG AAACCCGATC  AAGAAATGCT GCAGAGGCCT GAGCTACTTT GTCCAGGACA ATTGGAAGAG AATTTGGGTG ATGCTACTCT GGCTTTCAAT CTGTGCAGGT CTTTTCACCT GGAAATTCAT TCAGTATAAA  CATCGTGCGG TGTTTCATGT CATGGGGTAT TGTGTTACCA CAGCTAAGGG TGCAGCTGAG ACACTTAAGT TCAACATGGC TCTAATTCTT CTCCCAGTGT GCAGAAATAC AATTACTTGG  CTTAGAAGCA GAACAAAGTT GGGACGAGTT GTTCCTTTTG ATGACAATAT CAATTTTCAC AAGGTTATTG CTGTGGGGAT AGCCATTGGA GTTGGGCTAC ATGCTGGAGC ACATTTAACC  TGTGATTTTC CAAGGCTGCT GCATGCAACG GATGAGGAGT ATGAGCCAAT GAAGCCATTC TTTGGCGATG ACCGGCCGGA TGACTACTGG TGGTTTGTCA AAGGGACCGA GGGCTGGACC  GGGGTGGTGA TGGTGGTACT GATGGCAATA TCCTACACGT TAGCTCAGCC TTGGTTCCGC CGCAACAGAC TAAACCTCCC TAAAATCCTT AAAAAACTCA CAGGATTCAA CGCCTTCTGG  TATTCACATC ACCTGTTTGT TATTGTCTAT GTGCTATTCA TCATCCATGG CTACTTTCTC TACCTTTCCA AGAAATGGTA TAAGAGAACG ACATGGATGT ATTTGGCAGT TCCAGTGTTA  TTATATGCTT GTGAACGCCT TATTCGAGCA TTCAGGTCTG GCTATAAATC AGTGAGGATT CTTAAGGTTG CAGTGTATCC CGGAAACGTG CTAGCTCTGC AAATGTCAAA GCCTCAAGGA  TTCAAGTACA CTAGTGGGCA GTACATATTT GTAAATTGTG CAGCAGTTTC TCAATTTCAA TGGCACCCTT TCTCCATTAC TTCAGCTCCT GGAGACGATT ATCTCAGCAT TCATATCCGT  ACCTTGGGAG ACTGGACATC TCAACTCAAA TCCATTTTCG CCAAGGTATG TCAACCTCCA TCAGTTGATC AAAGTGGCCT ATTAAGGGCA GATATCGGAC AAGCCGATAA CAGGCCTAGG  ATTCCAAAAC TCTTGATTGA TGGCCCCTAT GGAGCTCCAG CACAGGACTA CAAAGATTAC GATGTTCTCC TCCTCGTAGG CCTCGGAATT GGAGCCACCC CATTAATCAG CATAATTAAA  GATGTGCTCA ATAACATTAA GCAACAGAAG GAAATAGAAG AAGGAATCAC AGAAGATGGC GGTGCAACGA AAAATAGTAA AAAAAAGCCT TTCGCAACCA AGCGAGCTTA TTTCTACTGG  GTCACCCGCG AGCAGGGCTC GTTCGAGTGG TTCAGGGGCG TAATGAACGA GGTTGCGGAG TACGATCAAG ACGGCGTGAT TGAGCTCCAT AATTACTGCA CCAGTGTTTA TGAAGAAGGA  GATGCAAGAT CGGCTCTAAT CACCATGCTT CAGTCCATCC ATCATGCTAA AAATGGTCTT GATATTGTTT CTGGCACCAG GGTGAAGACC CATTTTGCTA GACCAAACTG GAGAACTGTG  TTTAAGCATG TGGCTGTTAA ACACACTGAC GAAAGAGTTG GGGTGTTTTA CTGTGGAGCT CCAGGATTGA CTGGGGAATT ACGGCGGCTA TCTCAAGACT TCTCTCGGAA AACTACAACC 
AAATTTGATT TTCACAAAGA AAACTTTTGA 

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