Entry information : CclRboh06 (Ciclev10030372m)
Entry ID 13509
Creation 2015-12-10 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Peroxidase information: CclRboh06 (Ciclev10030372m)
Name (synonym) CclRboh06 (Ciclev10030372m)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus
Organism Citrus clementina    [TaxId: 85681 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CclRboh06
start..stop
S start..stop
CsRboh06 1723 0 1..860 1..844
PtRboh05 1159 0 16..860 11..846
EgrRboh06 1149 0 13..860 5..857
EglRboh06 1147 0 13..860 5..857
Literature and cross-references CclRboh06 (Ciclev10030372m)
Protein sequence: CclRboh06 (Ciclev10030372m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   861
PWM (Da):   %s   98636.53 Transmb domain:   %s   i305-324o339-361i382-404o439-461i485-507o517-534i678-695o
PI (pH):   %s   9.38
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVSGSNSRKH ADSRSVLESL EVDRMVDVPI NDDTSGRVVS KPPTAPSLRR NASTAIRRSG MLGTNSIRNP AKMDRTASSA ARGLQSLRFL DRTVTGKEND AWRSIERRFQ QFAVNGRLPK  DKFGICVGMG ESTEFSVGVF EALARRRKVN TENGITKEEV RMFWEDMTKK DLDARLQIFF DISQRIDVIS SSSRCDKNGD GILTEDEVRE VIVLSASANR LSNLKENSST YAALIMEKLD  PDCKGYIEMW QLEILLRGMV NEEGPKMNNR TSTLTKAMIP QNYRNPTTKF FSMTTEFIFD NFKRIWIVTL WLAVNLGLFM WKFIELQSGP VFQITGYCVC FAKGCGETLK FNMALILLTV  CRRSLTKLRS TFLHKIIPFD DNLNFHKLIA LGIAIGSIVH TLFHLLCNYP KLSSCRPEKF MYLLGPALNY HQPTYYDLMI HTVGYTGVLM LVIMAISFTL ATHSFRRNVI KLPWIFHRFA  GFNSFWYAHH LLVLAYVLLF MHGFFLIFDK PWYDKTTWIY IFFPVLFYAN ERFLAKFHDL NHKVEVIKAV IYTGNVLALY MTKPPGFKYQ SGMYLFVKCP DLSPFEWHPF SITSAPGDYY  LSVHIRTLGD WTTELKQRFE KVCEAPAPAK PNRGNLMRME TKSAANNANF EQIQASFPKI LIKGPYGAPA QDYKNYDILL LIGLGIGATP FISIIKDLLN HIKSHERDTV RNKEFLENGF  KKGPERAYFY WVTREQGSFE WFKGVMDDIA DHDDKNVIEM HNYLTSVYEE GDARSALIAM VQKLQHAKNG VDIVSESRIK THFARPNWRK VFGQLATDHE SSRIGVFYCG SATLTKTLKE 
LCLEFSLESP TRFDFHKENF * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTCGG GCTCGAATAG TAGAAAGCAT GCAGATTCGA GATCGGTATT GGAAAGCTTG GAGGTCGACC GGATGGTAGA TGTACCTATA AACGATGACA CGAGCGGCAG AGTCGTGTCG  AAACCGCCGA CGGCGCCGTC TTTGCGGAGG AATGCAAGCA CTGCCATCAG GAGAAGTGGG ATGCTCGGTA CTAACAGCAT CCGTAATCCC GCAAAGATGG ACAGAACAGC GTCGTCCGCG  GCTAGAGGCC TCCAGAGCTT ACGTTTTCTT GACAGGACCG TCACTGGAAA AGAAAATGAT GCCTGGAGAT CCATTGAGAG GCGCTTTCAA CAATTTGCAG TTAACGGCAG ACTGCCTAAA  GATAAATTTG GCATATGCGT CGGTAATGCA TTTTCTTTTT CCCAAAAAAA AAAAAATCAG AAAATTTCTC TTTTGATATT TTTTTTGGTT TCAATTCTAA GATCAAACAT TATTTATAGG  CATGGGAGAA TCAACCGAAT TTTCCGTGGG AGTGTTTGAG GCGTTGGCCC GGCGGAGGAA AGTGAACACG GAAAATGGGA TTACAAAGGA AGAAGTTAGA ATGTTTTGGG AAGATATGAC  TAAGAAAGAT CTCGATGCTC GACTTCAGAT ATTCTTTGAC ATGTAAGTAA ATGATTTTCT CTCTCTCTCT CTCTCTTTTT GTCAGATCAC AACGCATTGA CGTGATTTCT TCTTCTTCCA  GGTGTGATAA GAATGGTGAT GGGATTTTGA CGGAGGACGA AGTGAGGGAG GTTATAGTGT TGAGTGCTTC CGCAAACAGG CTCTCAAACC TTAAGGAGAA TTCCAGTACG TATGCAGCTT  TGATCATGGA AAAACTGGAC CCCGATTGTA AGGGATATAT AGAGGTTAGC ATCAATCTTG ATTCTAGTAA TTTATTAATC CACCTCTTTT TATAGTTTCT TTTTCTTCTT TTTCATTTAA  TTTAATCTTT TTTGTTCGTT AAACAGATGT GGCAGCTGGA AATTTTACTG AGGGGAATGG TGAATGAAGA AGGTCCCAAA ATGAACAACA GAACTAGTAC ACTGACCAAA GCTATGATCC  CACAAAATTA TAGAAACCCT ACCACCAAAT TCTTTTCCAT GACAACAGAA TTTATTTTTG ACAATTTTAA AAGAATATGG ATCGTCACAT TATGGCTAGC AGTAAACTTA GGACTCTTTA  TGTGGAAGTT CATTGAGTTG CAGTCGGGAC CTGTGTTCCA AATCACTGGT TACTGCGTCT GCTTTGCCAA GGGTTGTGGA GAGACTCTCA AATTTAATAT GGCTTTAATT CTGCTAACAG  TCTGTAGAAG GAGTCTCACA AAACTAAGGT CGACATTTCT CCATAAGATC ATCCCTTTCG ACGACAACTT AAACTTTCAC AAACTGATCG CATTAGGAAT TGCGATTGGT AGTATTGTAC  ATACTCTCTT TCATCTCCTT TGCAATTATC CCAAGTTGAG CTCTTGCCGA CCGGAGAAAT TCATGTACCT TCTTGGTCCT GCTCTCAATT ATCATCAACC AACCTATTAC GATTTGATGA  TACATACTGT TGGCTACACT GGGGTATTAA TGCTCGTTAT AATGGCAATT TCATTCACTC TTGCAACGCA TTCCTTTAGA AGGAATGTCA TCAAGTTACC ATGGATTTTT CACCGTTTCG  CGGGATTCAA TTCCTTCTGG TATGCCCATC ATCTGCTGGT TTTGGCCTAT GTCCTGCTAT TCATGCATGG CTTTTTCCTC ATTTTTGACA AGCCGTGGTA CGACAAAACG GTATATAGGA  TTTTGAACTA CAAAGATGAT CGTGTATATT ATATAAACTA CAATTTAAAG AGTTGCTGAA ACTATTTGTC CTATCTCTCT TTCTCTGCAG ACATGGATTT ACATCTTTTT CCCAGTTCTC  TTTTATGCTA ATGAAAGATT TTTAGCAAAA TTCCACGACC TTAATCATAA AGTGGAAGTC ATTAAGGTCT GCAGCAGAAA CCAAATTTTT TTTAATTCTT CCTCTACATT CCTCAAGTCC  TGAGCGAATT AGATCTGTTC TGTTCTCTGC AAATGGCAGG CAGTAATATA CACGGGAAAT GTTCTAGCCC TATACATGAC AAAACCTCCA GGCTTCAAGT ACCAAAGTGG AATGTACCTT  TTTGTCAAGT GTCCAGATTT ATCGCCTTTC GAGTGGTAAA ATTTATTAGA TGCTCTGCTG ATGATTGAAA AATAATCAAA CCCATTAATT TTTTTTTTTT TTTCACTTAG TTACTCTAGT  GCTGCTCATT TGTCACAGGC ACCCTTTCTC CATCACTTCT GCACCAGGAG ATTACTATTT GAGTGTCCAC ATAAGAACCT TGGGAGATTG GACTACCGAA CTTAAGCAGA GATTTGAGAA  GGTGTTAAGC CATTTGCTTT ACAAGTACCC ACTTATACTT AGCAAATGGT GATTAAAAGC TGCGGCACCT CAATCCCAAA TGTGCCCGCA AATTAATGTT CATTCTCTTT CAGGTCTGTG  AGGCTCCAGC GCCAGCAAAA CCAAACAGGG GAAACCTGAT GAGAATGGAA ACTAAATCTG CAGCAAATAA TGCCAATTTT GAGCAGATAC AAGCTAGGTG AGAGGAATTC AACTCAAGTT  AGCTTAAGTT ACAGATTATA ATATTCCTAG ATTATCAGGT CCGATATGGC TTTGATCACC ATGTAGCTTT CCGAAAATCC TCATCAAGGG ACCATATGGA GCCCCAGCTC AGGATTACAA  GAACTATGAT ATCCTCTTAC TCATTGGATT GGGAATTGGA GCTACTCCAT TTATTAGCAT TATAAAAGAT CTCCTGAACC ACATCAAGTC GCATGAAAGG GACACCGTAC GTAACAAGGC  AAATCAAATT TTATAGTGAA ATTATGATCA TAAACATTAT TAGGCTTATT AGGCTTCAAC GTAACCAAAA ATTTGGCTGA TGCAGGAATT CCTAGAAAAT GGATTCAAGA AAGGCCCTGA  GAGGGCTTAC TTCTATTGGG TAACAAGGGA ACAAGGCTCA TTTGAATGGT TTAAAGGTGT TATGGATGAC ATTGCAGATC ATGATGACAA GGTAAAAATT TTATTTGTTA TATGTTCTTC  AATAACATTA ATCAAATCAT ATTAATTGGC AGTTTTCTGG GTTCTTTGAC TGCTTAGAAT GTGATAGAAA TGCACAACTA CTTAACGAGT GTGTATGAAG AAGGAGATGC TAGGTCTGCG  CTCATTGCCA TGGTTCAGAA ACTGCAACAT GCGAAGAATG GAGTTGATAT TGTCTCAGAA AGTCGGGTAG CTCACAAATC AAGCACACTA ATACGTTGCA TAATTTCACT GGCGTTTTAC  AATTCATTAG TTTCTTTACT AATTAATATA CGTTATAACA ACAGATAAAA ACACATTTTG CAAGACCAAA CTGGAGAAAG GTGTTCGGTC AATTGGCAAC TGACCATGAA TCTTCCCGAA  TAGGTAATTA TATATCAAGA CTAACTTTCT GTTCATACCA CAGATCATTC CTAATAAAGA TATTCGCTTA ATGTTGTAGG TGTGTTCTAT TGTGGGAGTG CAACACTTAC AAAAACCCTG 
AAGGAGCTTT GTCTTGAATT TAGCCTAGAG TCACCAACCC GGTTTGATTT CCACAAGGAG AATTTCTAG 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTCGG GCTCGAATAG TAGAAAGCAT GCAGATTCGA GATCGGTATT GGAAAGCTTG GAGGTCGACC GGATGGTAGA TGTACCTATA AACGATGACA CGAGCGGCAG AGTCGTGTCG  AAACCGCCGA CGGCGCCGTC TTTGCGGAGG AATGCAAGCA CTGCCATCAG GAGAAGTGGG ATGCTCGGTA CTAACAGCAT CCGTAATCCC GCAAAGATGG ACAGAACAGC GTCGTCCGCG  GCTAGAGGCC TCCAGAGCTT ACGTTTTCTT GACAGGACCG TCACTGGAAA AGAAAATGAT GCCTGGAGAT CCATTGAGAG GCGCTTTCAA CAATTTGCAG TTAACGGCAG ACTGCCTAAA  GATAAATTTG GCATATGCGT CGGCATGGGA GAATCAACCG AATTTTCCGT GGGAGTGTTT GAGGCGTTGG CCCGGCGGAG GAAAGTGAAC ACGGAAAATG GGATTACAAA GGAAGAAGTT  AGAATGTTTT GGGAAGATAT GACTAAGAAA GATCTCGATG CTCGACTTCA GATATTCTTT GACATATCAC AACGCATTGA CGTGATTTCT TCTTCTTCCA GGTGTGATAA GAATGGTGAT  GGGATTTTGA CGGAGGACGA AGTGAGGGAG GTTATAGTGT TGAGTGCTTC CGCAAACAGG CTCTCAAACC TTAAGGAGAA TTCCAGTACG TATGCAGCTT TGATCATGGA AAAACTGGAC  CCCGATTGTA AGGGATATAT AGAGATGTGG CAGCTGGAAA TTTTACTGAG GGGAATGGTG AATGAAGAAG GTCCCAAAAT GAACAACAGA ACTAGTACAC TGACCAAAGC TATGATCCCA  CAAAATTATA GAAACCCTAC CACCAAATTC TTTTCCATGA CAACAGAATT TATTTTTGAC AATTTTAAAA GAATATGGAT CGTCACATTA TGGCTAGCAG TAAACTTAGG ACTCTTTATG  TGGAAGTTCA TTGAGTTGCA GTCGGGACCT GTGTTCCAAA TCACTGGTTA CTGCGTCTGC TTTGCCAAGG GTTGTGGAGA GACTCTCAAA TTTAATATGG CTTTAATTCT GCTAACAGTC  TGTAGAAGGA GTCTCACAAA ACTAAGGTCG ACATTTCTCC ATAAGATCAT CCCTTTCGAC GACAACTTAA ACTTTCACAA ACTGATCGCA TTAGGAATTG CGATTGGTAG TATTGTACAT  ACTCTCTTTC ATCTCCTTTG CAATTATCCC AAGTTGAGCT CTTGCCGACC GGAGAAATTC ATGTACCTTC TTGGTCCTGC TCTCAATTAT CATCAACCAA CCTATTACGA TTTGATGATA  CATACTGTTG GCTACACTGG GGTATTAATG CTCGTTATAA TGGCAATTTC ATTCACTCTT GCAACGCATT CCTTTAGAAG GAATGTCATC AAGTTACCAT GGATTTTTCA CCGTTTCGCG  GGATTCAATT CCTTCTGGTA TGCCCATCAT CTGCTGGTTT TGGCCTATGT CCTGCTATTC ATGCATGGCT TTTTCCTCAT TTTTGACAAG CCGTGGTACG ACAAAACGAC ATGGATTTAC  ATCTTTTTCC CAGTTCTCTT TTATGCTAAT GAAAGATTTT TAGCAAAATT CCACGACCTT AATCATAAAG TGGAAGTCAT TAAGGCAGTA ATATACACGG GAAATGTTCT AGCCCTATAC  ATGACAAAAC CTCCAGGCTT CAAGTACCAA AGTGGAATGT ACCTTTTTGT CAAGTGTCCA GATTTATCGC CTTTCGAGTG GCACCCTTTC TCCATCACTT CTGCACCAGG AGATTACTAT  TTGAGTGTCC ACATAAGAAC CTTGGGAGAT TGGACTACCG AACTTAAGCA GAGATTTGAG AAGGTCTGTG AGGCTCCAGC GCCAGCAAAA CCAAACAGGG GAAACCTGAT GAGAATGGAA  ACTAAATCTG CAGCAAATAA TGCCAATTTT GAGCAGATAC AAGCTAGCTT TCCGAAAATC CTCATCAAGG GACCATATGG AGCCCCAGCT CAGGATTACA AGAACTATGA TATCCTCTTA  CTCATTGGAT TGGGAATTGG AGCTACTCCA TTTATTAGCA TTATAAAAGA TCTCCTGAAC CACATCAAGT CGCATGAAAG GGACACCGTA CGTAACAAGG AATTCCTAGA AAATGGATTC  AAGAAAGGCC CTGAGAGGGC TTACTTCTAT TGGGTAACAA GGGAACAAGG CTCATTTGAA TGGTTTAAAG GTGTTATGGA TGACATTGCA GATCATGATG ACAAGAATGT GATAGAAATG  CACAACTACT TAACGAGTGT GTATGAAGAA GGAGATGCTA GGTCTGCGCT CATTGCCATG GTTCAGAAAC TGCAACATGC GAAGAATGGA GTTGATATTG TCTCAGAAAG TCGGATAAAA  ACACATTTTG CAAGACCAAA CTGGAGAAAG GTGTTCGGTC AATTGGCAAC TGACCATGAA TCTTCCCGAA TAGGTGTGTT CTATTGTGGG AGTGCAACAC TTACAAAAAC CCTGAAGGAG 
CTTTGTCTTG AATTTAGCCT AGAGTCACCA ACCCGGTTTG ATTTCCACAA GGAGAATTTC TAG 

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