Entry information : StPrx300 (PGSC0003DMT400015043)
Entry ID 13518
Creation 2015-12-11 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-12-11 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-12-11 (Qiang Li)
Peroxidase information: StPrx300 (PGSC0003DMT400015043)
Name (synonym) StPrx300 (PGSC0003DMT400015043)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx030]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx300
start..stop
S start..stop
LePrx58 677 0 1..345 1..345
MguPrx89 435 3e-154 3..338 2..338
MguPrx300 435 3e-154 3..338 2..338
CroPrx20 420 4e-148 1..345 3..347
Literature and cross-references StPrx300 (PGSC0003DMT400015043)
Protein sequence: StPrx300 (PGSC0003DMT400015043)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   346 (315)
PWM (Da):   %s   38873.78 (35567.0) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.65 (8.66) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-345
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEKYSGILLL LLPILMSFVA VSLNAGYANA AVFLPPEDKP LVRHYYKKLN TCANVEPFVQ HQVKLYWDKD KTITAKLLKL LYADCMVNGC DASILLTGPN TERNSSKNAR LDGYLLIDKI  KKVLEIRCPR AVSCADILNL AVRDAVHYAG APSYPVFLGR RDGVESKTEW IDYPSPSMSW EEGLAYFESK NLDVQDFVTL LGAHTMGQAH CSSFYDRLYD FKGTGKPDPS MKRSVLVKLR 
DQCPKNSKND SPVYFTEEYG SNYTFSNKFY TKVLVHESLL RVDQQLSYGG DTGELVNEYA KSLEQFRRGF ALSISRMGGL KVLTGKNGEI RQDCKFTNKN NPNIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns). Containing motif 'YSDC'. chr08:4271499..4277221 forward
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAAT ACTCAGGGAT TCTTCTTCTT CTTCTTCCGA TATTGATGAG TTTTGTTGCA GTGAGCTTGA ATGCAGGTTA TGCAAACGCC GCAGTGTTTT TGCCACCGGA GGATAAACCA  TTGGTGAGAC ATTACTATAA GAAGCTAAAT ACATGTGCCA ATGTGGAACC ATTTGTTCAA CATCAAGTGA AGCTCTATTG GGACAAGGAT AAGACTATTA CTGCTAAACT CCTCAAGTTA  CTCTATGCTG ATTGCATGGT TAATGTATGT CTCTTTGTCT CTCTCTTTTA TTTCCTGCAC AATTTTTAAT ATTAATGAAC GGATATTGTT ATTTTTGTAT TATTCCATTG TTATATTAAA  AAGCGCATGC AATTGAGTTT GAGAAAGTTG GGCAGTGTGA CTGTTTTCTT AGCTTGTTGA ATATGTGACC CATAGATCAC ACAAAGATAA TTTTATCATT GCTGCAAGAC GTACTCTCCT  TCATATTATT TCAGTGCTAT TTTAGTTTCA ATTACTGGAC TATCACTATA ACAAAAACAA CTTTTAGCGG CAATAAATAA ACACATTAAT AAAGAGTGCT AAAGTTTTTT ACCAACACTA  ATTAAGTACC ATTAGGTCCA ATGTCGCTAA AGGCTTTAGG GACATATACA AATAGTGCTA ATTGTCACTA AATATACATA TTTAGACATA ATTGAGCTAT TGCCGTTAAT TAATTAATTG  CCGCTAAATT AAATCATTTT TGATGTAGTG TATAATGATG AATCTAAGAT TTTTAGAATA TGAGTGCATC AACAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAGGAAAAA TGCAGTAAGT  GCAATTAATC CCCCTAGTAC TCTAGGCAAT TAACTCAATA CTCAACCAAG TGCACCGTTT AGCCATTAAT TTAAGAGTAG CATGGATGCG AACAATTAAT ATAAACCAAT ATTAAAAAAT  AGAGACATAA AATATCTAAT TTTACGGAAA GACCACAGAT TCACGTGTCT CATTTTTAAC CTATAATTAT TCCACCCCTC CCTATAATTA TAGTTAGGGG TCATCTTATT GCTAGTTAAG  GGAGTCGTTC ATATATTAAA ACTAGCACAA CTAATATCAT GTTTGATAAC TTTTTATTTT GCATAAAATT TACCACACCA AAAAAATGAA TTAATGTTTT TAATTGCTCA AAATAACGTT  ACGTGTACGA TTATTTTGAC ACAAATAAGG GAAATAGTGC TAGTATTCTC CATTTCCCCA TACTTGTTTA CAGTGCAAAA GTGAACCTAT AAATATACAA ATTGAATAAT GTCTAGTATA  TATTGCTAAT TCAGTTTTTA AGACTATAGT TTTAAGATTA ATGAAAACTC AATACAAAGG TTGAATTACA ATTTTTTTTC TTAGGTAAAT TTTAAATCCT TTAATATGTG ATTATATCAC  TAATTAATAG AAGGGGGTGG GGTGGAGTCT CATCTCTAGG AATTTGAAGA TGAAGAAATA CGATGAAAAC AAATGATAAT ATTTCTTTGA ATTTCTAGGC TGAGATCCAA ACTAGATCAA  ATTCTTTGTG GTGTCCATGA ATATGAGTAA ATAATATTAC TCCCTCAATT ACTATATGGG ATGATTACGA CAGCTACAGA CTTTGGCCAA CTAGTTCACA AAATATGTAT AAAATGTATA  TAAGTAGTAT ATACTTTATA CTATATATAT ACAACACATA CACTGATATA GTATAGTATA TTATATATAT TTCGATCATA TTGATAAACT AGTTATAAGC CAAATCATAT ATATCCTTCG  TATAATATCT CTATGGAGGC CTTAGGAAAG AATCTTGGGT AGCTTCGTAA ATTGAGATAT AGCTTTAACC ATAAGCAACT AAGTTTAATA CACACTAAAA TAGAGGACAT ATTAGACAAT  GATCTAGAGA TCTAAGCCTA TAAAAATGGT GTGTCTCCTC TTTAAAGAAA AAAATGTAAA TATAACACTA AGAGCTTGTT TGGATTGGTA TTTGACTATA TTAAATAAGT CAGAAGTCAT  AAGTTAAAAA TTTTAATTTT TAATTTTTAG TTTGTATTTA TCGTTTTATC TTAATATAAT GTGCTTAATA CTTCAAAAGT CTTTTAAAAG TATTTAAAAT AAGTCAATCT AGACAGCATC  TAAGTTTGTT ACACACGCTT GAGAAGATAA TTCCTAGAAA TAAATTCCAT AATAATGAAT ATTTTTTTAA AAAAAAATTC TATAAGTGGA ATAATAATCT GAAAAATAAC ATAATCAATC  TTCTATAACA GGTTTAACTA CACGGTACAA ATTTTGTGAA TACAATTTAC ACTAAATCCT CAAAAATAAA GACTTATGTT TATGAATATG AGTTAATTAT ATGTGATTAT AAACGAATGG  GGTTTCTGCG AATTCTGAGG TTACGTTGGA TCTAAACTAC ATCAATTGTG GTGTCCAATA ATATAAGTAA ATTATATTAA TCCCTTTTGT TTTAATTTAT CTGAAGAAGT TCAAAGTACG  AGAGTTAATA TATATATATA TATATATATA TGAAAATTAC ATTAAAACGT ACCCTCTAAT TTATATTAAG TGAATTCAGG TTAGGAGCAT GACACACCTT TTAAGAAAAA TATGTAAGGA  TATAAATCAA ATACTACTTT CTATTATTAT CCTTTTGATT ACTATTAAAT TATTCTCCTA AAAAATGTAA AGTAGTTAAT AACTTTATTA AAAGAAAGGA TTAACATGAA AAAAAAAGAG  TCTTAATAAT CTTATGAACT TTGAAAAAGT TCACTTATTT TGAACAAAAA ATTCTTAATA ATTCCCTTAC TATGGACTAG AGGAAGTACT ACAAACGTAA CTAATAATTC AAAATATTTT  AATTTTTTTT TGATAAAATT ATAATAATAA AAAATACTAT TGGATTCCAC AAACAATAAA CACCTTATCT TAAAATGGAA CAAAGGGAAT GTATCTCTAT TCAGCTCTTA GAAAAGTATC  TTGGGCAGAG TCTTAAAAGA CAGATAGCTT TAATTAAGCA ACTAATTAAT CAAAATAGAG GAAATATTAG ACAATGATCT AGATCTAAGC CTCGAAATTT GGCTTGTGAT CTCTCTTTAA  AGAAACAAAT TATATAGTAT AATATAAAGG GTGTGTTTGC TGTCGAGAAA AATATTTTTC AGAAAATGTT TTTTCAATTT TTTCATATTT AATTGGTCAA ATATTTTTTC TAGATTAACA  AGTTCCTTAA GAGATATTTT TTCATTATCT CTTCCCCACG CACCCAATAA TCTCACCCCG TTCCCCTTGA CCATCCCAAC CCTCGCCACC CCTGAGGGTT ACAATTAATT GCAAGATTTC  CTTGCATTGA ATTTGAGCAG AGTGTGTGTT TATATAGAGA TCCTAACTAT CGTAAAATAT CTCTCGATAA CAATATCATT TTTTCTAATA TTTTTTAATT GTAAGATAAC ATATAGTATA  ACTTATAACA TGAAAGATCG ATTTCACGGA AAATATGATT GTTATAGTGA AATATTATTA CAAAATATGA TAATTATAAA GAGGTCTGAC TGTAATTGAA AGTAACTTGA AAAATGACGC  AATTAATCTT CTATATCAGG TTCGAAATTC ATTACACTGT CAGTAAATAT GAGTTATACA TACTATAGAG TATACAATGA CAATGACTTT CTGATAATAT AACTATTAGT TGAATGACCA  TATGAGATAT ATCAACTTAA TTAGTTACTA ATAAATTCGT GCTATTTATT CATGTGTACT TATTTCTTTA CTAATTGTTG TCCAGGGTTG CGATGCATCA ATTCTACTAA CGGGTCCAAA  CACAGAGAGA AATTCATCGA AAAATGCAAG GCTAGATGGA TACTTGTTGA TCGATAAAAT AAAAAAAGTG CTTGAAATTC GATGTCCTAG AGCAGTTTCT TGTGCTGATA TTCTCAATCT  TGCTGTTAGG GATGCCGTCC ATTATGTAAC TAATCTATCT CTCTCTATCG CGCTTTATTT ATTTAATTTA TCGCGATATA TATTAACTAA TTTTGAAAAA AAACCCATGT AAAACAGGCA  GGTGCACCAT CTTATCCAGT GTTCTTGGGA AGAAGGGATG GAGTGGAGTC AAAAACTGAA TGGATTGATT ATCCTTCACC TTCAATGTCT TGGGAGGAAG GACTTGCTTA CTTTGAATCC  AAAAATCTTG ATGTTCAAGA CTTTGTCACA CTTTTAGGTA CACAAATATA TGACTTATAT AATTTTCTGT CATTTTAACT GCTTATTATA TGATCATTCA ACTAATAGTT ATTTTCTTAA  GAAGTATCTA GAATCAAGAA AAAAAATATG ATGTTCTGAG AAATCAACCA TTAGGTTAAC ATAACCTTTT TGACACAACT TAGAATAATT CTTCCTTCTT GGTTGTCTTT TTATAGACCC  GAATAGAGTA TTTACAATAT CGCAGATGCC ACCTACTTAG AATTGAGGAG TAGTTGTTTT GAGTTTCCCA CATCACCTAA GCGATGGGGG ACTTGGTCTC TTTATATGTA TTGGGAAATC  CTCAATTCTT GAACTAGCTT TTTGAGAAGT TAGTTCAAGA TTCAATTTCT TTACATGATA TCAAAGCTGA ACCTATTTTA ATTCCATGTT TCACTAACAT TGGGCTTCCA TATATTGTCC  ATGCTCTTAA TTCCACGTTT CACTAATATT GGGCTTCCAT ATATTGTCCA TGTTGTAGTT GACAGGTCTA GACGTAGGTT AGATGTACGA GGGTGTGTTG AGCCTCCTAC TCAGGGATGA  GGCACTTGGT CTCTTCATAT GTCTTGGACA TTAATCCTCA CCTCTTGAAC TAGCTTTTGG GGTCGAGCTA GTCAAACCCA AGATCCACTT TTATATAGTT GTTGTTGTCG TTTCCTCAAC  GTCCTTTTTC ATCTTCTTTA ACGACATTTA AAAAAAAAAA ATACACACTT ACTCTCCCTA GACCCTAGAT TATACTGGAT ATGTTGTTAT TGTTCTAAAC GCCGGCCATT TGGTTCCTAT  TTCAGGGGCA CATACAATGG GACAAGCACA TTGCAGCTCC TTCTATGACC GCCTTTACGA TTTCAAAGGT ACCGGAAAAC CAGACCCCAG CATGAAGAGA TCTGTGTTAG TAAAGCTAAG  GGATCAATGC CCTAAAAACA GCAAAAATGA TTCACCTGTT TATTTCACAG AAGAATATGG TTCTAACTAT ACATTCAGTA ACAAATTCTA CACTAAGGTT CTTGTTCATG AATCACTTCT  TAGAGTTGAT CAACAATTAT CTTATGGAGG TGATACAGGT GAACTAGTCA ATGAATACGC AAAGAGTTTG GAGCAATTTC GAAGGGGATT TGCATTATCG ATTAGTAGAA TGGGAGGTCT 
TAAAGTGTTG ACTGGTAAAA ATGGCGAAAT TCGCCAAGAT TGTAAGTTTA CAAATAAGAA CAATCCTAAT ATCAATTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAAT ACTCAGGGAT TCTTCTTCTT CTTCTTCCGA TATTGATGAG TTTTGTTGCA GTGAGCTTGA ATGCAGGTTA TGCAAACGCC GCAGTGTTTT TGCCACCGGA GGATAAACCA  TTGGTGAGAC ATTACTATAA GAAGCTAAAT ACATGTGCCA ATGTGGAACC ATTTGTTCAA CATCAAGTGA AGCTCTATTG GGACAAGGAT AAGACTATTA CTGCTAAACT CCTCAAGTTA  CTCTATGCTG ATTGCATGGT TAATGGTTGC GATGCATCAA TTCTACTAAC GGGTCCAAAC ACAGAGAGAA ATTCATCGAA AAATGCAAGG CTAGATGGAT ACTTGTTGAT CGATAAAATA  AAAAAAGTGC TTGAAATTCG ATGTCCTAGA GCAGTTTCTT GTGCTGATAT TCTCAATCTT GCTGTTAGGG ATGCCGTCCA TTATGCAGGT GCACCATCTT ATCCAGTGTT CTTGGGAAGA  AGGGATGGAG TGGAGTCAAA AACTGAATGG ATTGATTATC CTTCACCTTC AATGTCTTGG GAGGAAGGAC TTGCTTACTT TGAATCCAAA AATCTTGATG TTCAAGACTT TGTCACACTT  TTAGGGGCAC ATACAATGGG ACAAGCACAT TGCAGCTCCT TCTATGACCG CCTTTACGAT TTCAAAGGTA CCGGAAAACC AGACCCCAGC ATGAAGAGAT CTGTGTTAGT AAAGCTAAGG  GATCAATGCC CTAAAAACAG CAAAAATGAT TCACCTGTTT ATTTCACAGA AGAATATGGT TCTAACTATA CATTCAGTAA CAAATTCTAC ACTAAGGTTC TTGTTCATGA ATCACTTCTT  AGAGTTGATC AACAATTATC TTATGGAGGT GATACAGGTG AACTAGTCAA TGAATACGCA AAGAGTTTGG AGCAATTTCG AAGGGGATTT GCATTATCGA TTAGTAGAAT GGGAGGTCTT 
AAAGTGTTGA CTGGTAAAAA TGGCGAAATT CGCCAAGATT GTAAGTTTAC AAATAAGAAC AATCCTAATA TCAATTAG 

Retrieve as FASTA