Entry information : FcylAPx01
Entry ID 13524
Creation 2016-02-09 (Mbadinga)
Last sequence changes 2016-02-09 (Mbadinga)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-02-09 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: FcylAPx01
Name FcylAPx01
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Bacillariophyta Bacillariophyceae Bacillariaceae Fragilariopsis
Organism Fragilariopsis cylindrus    [TaxId: 186039 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value FcylAPx01
start..stop
S start..stop
PtrAPx01 379 2e-132 32..326 38..327
GtAPx02 375 2e-130 2..326 35..356
TpsAPx02 355 3e-123 1..326 17..326
TocAPx01 345 2e-119 35..326 18..305
Literature and cross-references FcylAPx01
EST ref. GenBank:   GW075703.1 [5' end]   GW073040.1 [3' end]   GW075818.1 [Fragment]
Protein sequence: FcylAPx01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   336
PWM (Da):   %s   36294.71  
PI (pH):   %s   4.9
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTAATSINQT PKTVALAAAA VSDTKVSANE YKEALLAARD DIDILLAENA CGPLMVRLAW HDAGNYDKNL ASEKWPLAGG ATGSIRFAPE INHGANAGLI NGVKLIQTHI KEKHPLISYA  DLYQMASSRA IEYTGGGPSL GIRYGRQDVD SPDGCQKEGN LPDGEADPDT GNYGGTSGTA STEDKTPGGH LRKVFYRMGM NDEEIVALSG AHSLGRAYHD RSGLGAEKTK FTDGSTTQQF 
ADGKVAPYHA GGSSWTEQFF VFDNSYFIVL DDDKSDPELL KMSSDKAVFK DDDFRPYAEK FRDNQDSFFE SYVKAHNKLS ELGSKFVYDT PITLD* 

Retrieve as FASTA  
Remarks complete sequence from EST
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTGCTG CTACTTCTAT CAATCAAACG CCAAAGACTG TTGCTCTTGC AGCTGCTGCT GTATCCGATA CTAAAGTTTC AGCCAATGAA TATAAAGAAG CATTATTAGC AGCAAGAGAT  GATATTGATA TACTGTTAGC TGAAAATGCA TGTGGACCAT TAATGGTACG ATTAGCATGG CATGATGCTG GTAATTATGA TAAAAATTTA GCCTCTGAAA AATGGCCATT GGCGGGTGGT  GCCACTGGAT CCATTCGTTT TGCACCGGAA ATTAATCATG GTGCGAACGC TGGTTTAATT AATGGTGTGA AATTAATACA AACACATATT AAAGAAAAAC ATCCACTGAT TAGTTATGCT  GACTTATATC AAATGGCCTC CTCACGTGCT ATTGAATACA CCGGTGGTGG ACCCAGTCTG GGTATTCGAT ACGGTCGTCA AGATGTGGAT TCACCAGACG GATGTCAAAA GGAAGGTAAT  TTACCAGATG GTGAAGCGGA TCCAGACACT GGCAATTATG GTGGTACATC CGGTACCGCA TCCACCGAAG ATAAAACACC GGGTGGACAT TTGCGGAAAG TATTTTATCG AATGGGGATG  AATGATGAAG AAATTGTAGC ATTAAGTGGT GCACATTCCT TAGGACGTGC CTATCACGAT CGTTCGGGAT TAGGTGCCGA AAAAACCAAA TTTACCGATG GATCCACCAC ACAACAATTT  GCCGATGGGA AAGTAGCACC ATACCATGCT GGTGGTTCAT CCTGGACGGA ACAATTTTTT GTATTTGATA ATAGTTATTT TATTGTCTTA GATGATGATA AATCAGATCC AGAATTATTA  AAAATGAGTT CTGATAAAGC GGTATTTAAA GATGATGATT TTCGACCATA TGCTGAAAAA TTTCGTGATA ATCAAGATTC ATTCTTTGAG AGTTATGTCA AAGCACATAA CAAACTTTCC 
GAACTTGGTT CGAAATTTGT GTATGATACA CCAATTACAT TAGATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACAAAACATC AGCAACAACA AGAATAACAT TAACATCATG ACTGCTGCTA CTTCTATCAA TCAAACGCCA AAGACTGTTG CTCTTGCAGC TGCTGCTGTA TCCGATACTA AAGTTTCAGC  CAATGAATAT AAAGAAGCAT TATTAGCAGC AAGAGATGAT ATTGATATAC TGTTAGCTGA AAATGCATGT GGACCATTAA TGGTACGATT AGCATGGCAT GATGCTGGTA ATTATGATAA  AAATTTAGCC TCTGAAAAAT GGCCATTGGC GGGTGGTGCC ACTGGATCCA TTCGTTTTGC ACCGGAAATT AATCATGGTG CGAACGCTGG TTTAATTAAT GGTGTGAAAT TAATACAAAC  ACATATTAAA GAAAAACATC CACTGATTAG TTATGCTGAC TTATATCAAA TGGCCTCCTC ACGTGCTATT GAATACACCG GTGGTGGACC CAGTCTGGGT ATTCGATACG GTCGTCAAGA  TGTGGATTCA CCAGACGGAT GTCAAAAGGA AGGTAATTTA CCAGATGGTG AAGCGGATCC AGACACTGGC AATTATGGTG GTACATCCGG TACCGCATCC ACCGAAGATA AAACACCGGG  TGGACATTTG CGGAAAGTAT TTTATCGAAT GGGGATGAAT GATGAAGAAA TTGTAGCATT AAGTGGTGCA CATTCCTTAG GACGTGCCTA TCACGATCGT TCGGGATTAG GTGCCGAAAA  AACCAAATTT ACCGATGGAT CCACCACACA ACAATTTGCC GATGGGAAAG TAGCACCATA CCATGCTGGT GGTTCATCCT GGACGGAACA ATTTTTTGTA TTTGATAATA GTTATTTTAT  TGTCTTAGAT GATGATAAAT CAGATCCAGA ATTATTAAAA ATGAGTTCTG ATAAAGCGGT ATTTAAAGAT GATGATTTTC GACCATATGC TGAAAAATTT CGTGATAATC AAGATTCATT 
CTTTGAGAGT TATGTCAAAG CACATAACAA ACTTTCCGAA CTTGGTTCGA AATTTGTGTA TGATACACCA ATTACATTAG ATTAAAATTA ATAATTAAAG AAGTTAGATT 

Retrieve as FASTA