Entry information : HaPrx10 (HanXRQChr13g0388991)
Entry ID 13556
Creation 2016-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaPrx10 (HanXRQChr13g0388991)
Name (synonym) HaPrx10 (HanXRQChr13g0388991)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx010]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaPrx10
start..stop
S start..stop
HaPrx11 554 0 1..321 1..321
CiPrx02 550 0 1..321 1..321
LsePrx23 510 0 1..321 1..321
VvPrx35 471 8e-169 15..321 19..326
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 12849744..12849968 225 N° 2 12849014..12849205 192 N° 3 12848678..12848843 166 N° 4 12847806..12848188 383
complement(join(12847806..12848188,12848678..12848843,12849014..12849205,1284974 4..12849968))


exon

Literature and cross-references HaPrx10 (HanXRQChr13g0388991)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr13 (12849968..12847806)
EST ref. GenBank:   GE499568.1 [3' end]   GE499567.1 [Fragment]
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr13g0388991
Protein sequence: HaPrx10 (HanXRQChr13g0388991)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321
PWM (Da):   %s   34238.7 Transmb domain:   %s   o15-37i
PI (pH):   %s   7.99
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MALSTLSSLFKLSTFTLFFLVLFGPSYGQLSANFYTTTCPNFRSIIRSAVNTAVSNEARMGASLLRLHFHDCFVNGCDASVLLDDTANFTGEKTARPNSNSIRGFNIIDTIKTQLESQCPGVVSCADILSAAASDSVVALGGPSWNVLFGRRDSTTASLSAANSNLPSGASSLSTLISSFSNQGFTTNEMIALSGAHTIGQARCTTFRNRLYNDNNINASFAASLTPNCPSSGGDNNLSPLDSSPTTFDNRYYRDLINQRGLLHSDQELFNGGSADAQVRTYSTNPTTFSRDFASAMLKMSNLNPLTGSSGQVRTNCRRTN

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 2 ESTs
DNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTTTATCAACTTTATCATCTTTGTTTAAGCTTTCAACTTTTACATTATTTTTTTTGGTTCTGTTTGGACCTAGTTATGGTCAGCTATCTGCCAACTTCTATACTACAACGTGCCCA
AATTTTCGTAGTATTATAAGAAGCGCTGTGAACACAGCTGTGTCAAATGAAGCTCGAATGGGAGCCTCGTTGCTTCGCCTTCATTTCCATGATTGTTTTGTTAAC
GCAAGTCTCGTTACT
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TTATAAGCTGTCTTTTTTGGAAATAATATAATATGAGAAGATCTATAATTTTTATATTTCCTTATAAATGGGTACACTACTTATTCAAGAGAGCAGTTATTCTAAATATATATTTATATA
TAAGCACAAGTTTGTTCGGTCACTATGAGTATATTTCTAGATACTTTTGAATGACCAACTATATCCTAAACAGTTTGAACATATGTATATGACTTTAATAGTTTAATACGTATTAAAAAA
AACATTGGAGAATTTTATTTTGATTTGTATTTAACTTAAATTAACACATTATTGTCTCCTCTCAGATTGTTTACTTGTTGACTTTATATGTGTCCTTCAATGATTAAATTTCGTATCAAT
GTCGTTAAACATATTTTTCTGATTTTTTGCTTAAAATATGTAGGGATGTGATGCATCCGTCTTACTGGACGACACTGCAAACTTTACTGGAGAAAAAACAGCACGTCCAAATAGCAATTC
GATTAGAGGTTTCAACATCATTGACACTATCAAAACTCAATTGGAGAGTCAATGCCCCGGTGTTGTTTCTTGTGCTGATATATTATCTGCGGCTGCTAGTGATTCCGTTGTGGCT
GTAAG
TACAAAAATATTGAACGTAAAGAGATATATTATCGTAAAAATGTTTTCTACGACCGTTTTTACCATGGAGTCAGTTTTGTTCGAAAAATGTTGCTAAAGCCAAACCGACGAATTTCATAG
TAGGGATGAATTTAGCTGATTTTGTTGTAACTTTTTAAATTTCAGCTTGGTGGGCCAAGTTGGAATGTGTTATTTGGAAGAAGGGACTCAACAACAGCTAGTTTAAGTGCTGCAAATTCT
AATCTTCCATCAGGAGCATCAAGTCTCAGTACCCTCATTTCATCCTTTTCAAACCAAGGCTTTACTACTAATGAAATGATAGCTCTATCAG
GTGACTTACTTTGACTGATCAGTTTTGGT
CAACTAAATATCAGTTGAGACTTGTTATTCGTGCTAAATCAACAACTATCATCTATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAT
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TATTATTATTATAACAACAGTGACACTTAATACAAAAATAATGTTCATGGGTGATTAATTATTTTTTTTGTAAACAAATGACAACTACAACATTCATTACCGTGTGTTTCTATGTACAGT
GACACTTAATAAAAAAAAAATATTGTTCATGGGTGATTTATTATATTTTTTTGAAAACAAATGACAACTAGAATATTCATTATCGTGTGTTTCTTTGTAGGAGCTCATACAATTGGCCAA
GCAAGGTGCACAACGTTTCGTAATCGTCTCTACAATGACAACAACATTAACGCATCGTTTGCGGCGTCACTGACACCAAATTGTCCGTCGAGTGGCGGTGACAACAATCTGTCACCACTA
GATTCTTCACCTACAACTTTTGACAACAGATACTATCGTGATTTGATTAACCAAAGGGGATTATTGCATTCAGACCAAGAGTTATTTAATGGAGGTTCGGCTGATGCACAAGTGAGAACC
TATAGTACGAATCCGACCACTTTCTCTCGTGACTTTGCAAGTGCAATGTTGAAGATGAGCAACCTTAACCCTTTAACTGGCTCAAGTGGTCAAGTTAGGACCAATTGCCGAAGAACAAAT
TAA

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CDS
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTTTATCAACTTTATCATCTTTGTTTAAGCTTTCAACTTTTACATTATTTTTTTTGGTTCTGTTTGGACCTAGTTATGGTCAGCTATCTGCCAACTTCTATACTACAACGTGCCCA
AATTTTCGTAGTATTATAAGAAGCGCTGTGAACACAGCTGTGTCAAATGAAGCTCGAATGGGAGCCTCGTTGCTTCGCCTTCATTTCCATGATTGTTTTGTTAAC
GGATGTGATGCATCC
GTCTTACTGGACGACACTGCAAACTTTACTGGAGAAAAAACAGCACGTCCAAATAGCAATTCGATTAGAGGTTTCAACATCATTGACACTATCAAAACTCAATTGGAGAGTCAATGCCCC
GGTGTTGTTTCTTGTGCTGATATATTATCTGCGGCTGCTAGTGATTCCGTTGTGGCT
CTTGGTGGGCCAAGTTGGAATGTGTTATTTGGAAGAAGGGACTCAACAACAGCTAGTTTAAGT
GCTGCAAATTCTAATCTTCCATCAGGAGCATCAAGTCTCAGTACCCTCATTTCATCCTTTTCAAACCAAGGCTTTACTACTAATGAAATGATAGCTCTATCAG
GAGCTCATACAATTGGC
CAAGCAAGGTGCACAACGTTTCGTAATCGTCTCTACAATGACAACAACATTAACGCATCGTTTGCGGCGTCACTGACACCAAATTGTCCGTCGAGTGGCGGTGACAACAATCTGTCACCA
CTAGATTCTTCACCTACAACTTTTGACAACAGATACTATCGTGATTTGATTAACCAAAGGGGATTATTGCATTCAGACCAAGAGTTATTTAATGGAGGTTCGGCTGATGCACAAGTGAGA
ACCTATAGTACGAATCCGACCACTTTCTCTCGTGACTTTGCAAGTGCAATGTTGAAGATGAGCAACCTTAACCCTTTAACTGGCTCAAGTGGTCAAGTTAGGACCAATTGCCGAAGAACA
AATTAA

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cDNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AAAAAGATCT CTATATATAC ATGTTGCATA ACCTTTCATC AATCACAACT AATACTTCTT TCTCAAACAT CTATCACTTG TTGATATTGC ATACACATGG CTTTATCAAC TTTATCATCT  TTGTTTAAGC TTTCAACTTT TACATTATTT TTTTTGGTTC TGTTTGGACC TAGTTATGGT CAGCTATCTG CCAACTTCTA TACTACAACG TGCCCAAATT TTCGTAGTAT TATAAGAAGC  GCTGTGAACA CAGCTGTGTC AAATGAAGCT CGAATGGGAG CCTCGTTGCT TCGCCTTCAT TTCCATGATT GTTTTGTTAA CGGATGTGAT GCATCCGTCT TACTGGACGA CACTGCAAAC  TTTACTGGAG AAAAAACAGC ACGTCCAAAT AGCAATTCGA TTAGAGGTTT CAACATCATT GACACTATCA AAACTCAATT GGAGAGTCAA TGCCCCGGTG TTGTTTCTTG TGCTGATATA  TTATCTGCGG CTGCTAGTGA TTCCGTTGTG GCTCTTGGTG GGCCAAGTTG GAATGTGTTA TTTGGAAGAA GGGACTCAAC AACAGCTAGT TTAAGTGCTG CAAATTCTAA TCTTCCATCA  GGAGCATCAA GTCTCAGTAC CCTCATTTCA TCCTTTTCAA ACCAAGGCTT TACTACTAAT GAAATGATAG CTCTATCAGG AGCTCATACA ATTGGCCAAG CAAGGTGCAC AACGTTTCGT  AATCGTCTCT ACAATGACAA CAACATTAAC GCATCGTTTG CGGCGTCACT GACACCAAAT TGTCCGTCGA GTGGCGGTGA CAACAATCTG TCACCACTAG ATTCTTCACC TACAACTTTT  GACAACAGAT ACTATCGTGA TTTGATTAAC CAAAGGGGAT TATTGCATTC AGACCAAGAG TTATTTAATG GAGGTTCGGC TGATGCACAA GTGAGAACCT ATAGTACGAA TCCGACCACT  TTCTCTCGTG ACTTTGCAAG TGCAATGTTG AAGATGAGCA ACCTTAACCC TTTAACTGGC TCAAGTGGTC AAGTTAGGAC CAATTGCCGA AGAACAAATT AAACTACCTT ATATTATAAA  AAAATCGCCT TACAATCCGT TTAAGATGCT GAAATATGAT CATTTTTAAC GGGTAATGTT TTGTTCTTTT TAAGTTTCAT TTGTATTGTG ACTAGTTTTG CGTGATTTTG TGAATCATGA  AGTTGTAATT TGTGAACAAC AATAATAATT GAAGGCGTTT TGCATTTATA TGTCACTTTA CTTGCACCCA AGATAATAAT AGTTTTTATG ATTAATATTG ATGATAAATG GCACAATAGT 
ACATTTCAAT AGCCCCTGA 

Retrieve as FASTA