Entry information : HaPrx41 (HanXRQChr01g0008451)
Entry ID 13595
Creation 2016-05-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-12-08 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-12-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaPrx41 (HanXRQChr01g0008451)
Name (synonym) HaPrx41 (HanXRQChr01g0008451)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx029]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaPrx41
start..stop
S start..stop
CroPrx51 466 2e-166 20..340 31..352
PtPrx07 463 3e-165 7..339 15..344
VvPrx53 461 2e-164 31..340 38..346
MePrx10 460 6e-164 22..339 32..347
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 57568029..57568268 240 N° 2 57568341..57568541 201 N° 3 57582954..57583535 582  
join(57568029..57568268,57568341..57568541,57582954..57583535)


exon

Literature and cross-references HaPrx41 (HanXRQChr01g0008451)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr01 (57568029..57583535)
Protein sequence: HaPrx41 (HanXRQChr01g0008451)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   340 (319)
PWM (Da):   %s   37556.04 (35343.9)  
PI (pH):   %s   8.9 (9.01) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-340
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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Retrieve as FASTA  
Remarks No EST.
DNA
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GCCAAAACATGCCCTCAACTCGAACAGATTGTCGCCTTCGTCACTTCTCAAAACTTTAAAGTGTCGCCGGCCACTGCTCCGGCGACTATCCGCCTTTTCTTCCATGACTGTTTTGTCCAG
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TTTTATTAGTTGAAAGATAAATAAATATAAAAAAATTAAAAAGTTAAATATATTTGCTTACATTATCTCTTTGTAATATATAAAAGCACATGATTTTGTTAAATATTTCTTAAAGCTATT
TTATAAGAGAACTAATGGATGTATTGACCGGTCATATTCTCTATTGCCTATTAGAATATTGTAGGTTAGCAATTTGGTAACAACATGTGATCCAGTGAGATGGGGCCAATTCATTAACGA
TCAAATTATGTCCCTTTGATGATTAGATAAAATCTGTTTGTCTGAAAAGTGTTTTGCGTGCCCTTTTAAAATGTATAAAGTGACGTATGTAACGTAAAGTGTAACTTTATATATAGTCTA
TTTTTCTACTTATGTGATGTATAGTTGTTTTGATGTTGTATATATATATAGTAACTTTAGTACATGGGTAAGATCAAATAAAAAGTATATTTTGCCTAAATAGGATAAGAAGGAATCTTA
ACCATCAATTTTTCAAATCAATGGTTAAGATGCAAGTGTAGGAGAAAGGATGAGTGGAAGGGTATATTAGGAAAATCATATTTATGGACTTTCTCTCTCCACATGCAAGACACATGCATA
TTCCACCCCCATTTTTTAAACGTTCATAACTTTTTTATACGACATTATTTTTTCATAAAAATTTCACCGTAAAATGGAGCGTTTTTTATCTTTAATTTGAGTACCATATTGCTATATACA
ATATGAAGACTAAAAAAACCTACTAAAATGTGTTGTATTTCTATGTTGTATAACATTTTTTTGTGCTGAATTTTTGTACTATATTTTTGTGCTGAATTTTTTTGTTTTAATTTTTTTCTC
AATTTTTTGTGCTGGATTTTTTTTTGTACTACATTTTTTCGCTGAATTTTTTCGTGCTATATTTTTTTTATACTAGATTTTTTTTGTACTATATTTTTTTGTACTAGATTTTTTGTGCTA
TATTTTTTGTACTAGATTTATTTTTGTTGTATTTTTTTTAAAAAAAAGGGTGCTACATGTCATTTTCACTCCTATTTATAAGGACCAAAATGCTCTTCATTTCTATTTATTAGGAGTGCC
ACATGTCATCATCACAATCCTTTCTAGGCTACTTAGACAAAATCCACTTTTTAATGGATCATTCCCCCTTTATTATATATATTATTTTTAAGTTTACTTTCATCTATATATTTTAAATAA
TACACGTTTTTAACTCATTTACTTTTCATTTAGTTTAACTTTTCTTTAAAAACTTGTTCTAAGTGCCGGTAATGTAATGAACCAAACCGATCTTGATCGAAAAGCATATCAAGACTTTAC
TTTTTGTGTTTTCTTATTCGGTTGCTATACGTAATGAATCAGACAGATACCGACTGTATTTTCACAGCGAAACGCAAGAGAATCCCACTAGCTCATGTATAAATTGTTTATACATGTTCC
ATAGAGCATCTGCAATCAAACTTCACATCAGACTTCGTTGTCATATGGGCATGGCTCTCTGAGATTCTTAAAAAAACCTGGCCCTATCCACCCTGTAATGTTATAATATTAAAAGTTTCT
AAACGAAATCATTCAAAGTTTCAATTCCATATATAATATTGGGTTTTTATTTGGCTTAAAATTATAATTTAATTAGAGTAATCCATAACTGGGTAAATGGTAAATGATTATAATTAAAAA
ATGGTTTAAATGTTTAGTGGACCTAAAATGAATTAAATGTTAATGAGAGAGTGGGTTTAACTGCGGCCGAGACAAGAGGGGAACTCGTTCGCCTATAAGCTCGGTTTGGTAAGGAATTGA
TAAGGTACCCGTACAGTCCCACAGTCGCTATAGCAACCTAAAGAGAAAACACACACAATATAAAGTTGTAATATGGCTAAAAGAATATCGACACGTGCTCGGTACATTTTTTTATTATTT
AACTAAAAATAATAAATGATTTTATTATGTTAATTTTAAACTAAATACTAAACACATAAACATAAATAATCCCTCACTAATACTTGAATAGTAGAAGGAAAAGGATTAACAAAATAAACC
CCCAAAACTACATAATTTTGTTACGTTAAATTTGAATTAACTTGACATAATTTTAATATATTTTAAATTAAATTTCATTTTAAGGTAGGAAAAATTAGTTAAGTTCTAATACATTCCTAC
AAATAAAATACTAATTAACTATTAACAACATTTCTGTTAACTTCATTTTCCAAATGGAAAAAAAGAAAATAAAATTTCATGCACAAGCAAGGATTCGATCCAACGACTTATGTTTCAATT
TGGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATAGGGAGAAGATCATGCGAGAACCACCTCTTATTGTGAG
AACCGCGAGAACAAATGTGAACACACAAAAAATGCCTAAAAATAGCTAAAAATCACACAAAAATTTTTTTTTTGAATTTTTTAATATTGTTTATAAAAAAATCGCTACTTTTCGAAGCAA
AAAAAAAAAAAATTTTTAAAATTTTTTTTTTGGCTTCTAAAAGTTGCGATTTTAACATAAAAAATATTAAAAAATGCAAAAAAAAAATTTTAGATTTTTTTAATTTTTTTAGGTTTTTTG
GGGGGTTTAGTTTTTAGCATTTTAGCTTGGGGTGGGGGGGGAGGTTTAGGTTTTTTTGGGGGGGGGGGTTAGGGGGTTAGGTTATTTTAGGTTTTTTTAGCTATTTTAGGTTGTGTTCAC
ATTGGTTCTCAAGGTTCTCGCATGAGCCCCTCCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGGCTTTGGTTCAATTAAGAACCACAACGAATTATGATAACCATG
AGAGCTCATACTTTCTGCGTGAGTTGTGCCATAATTTTTGCACAAACATAGATGAAAATATTATAAACACATCTATAAGAAAAATTGTCGAGTCAGTAGTTACGCCTGATATAAGTTTTG
TTTACTCCTGGTGTAAGTTTTGTTTACGACTGATGTAGATTCTGTTACATTACGGAGATGAGATTTTTTTTACACCTGATGTAAATTTTTGCATGCAACATTTTTTTTTATTTTTTATTT
TTTTGACGAAACAGGTGATTTTTTTTAAAGATTTTCGAGAAATTTTTTTTTGAAAAAACCTTTTGCAAGACTTAGTTCTCTGATTCTTGCAATTCAAGGTGGTTTTCATTTTACCCTTTG
TCTATATGTATACATATAAAATATAAAACATATTCAGACCCTGTTTCGATTTTGACCCTGAGTCGGCATCCACCCGACGCATGCTTGGCCATGCACATGGGCCATTGACGCACACTACGG
ATGTTCACACATGTCTATATCCATATAAATCATATATAATGCCTTGTGAAGAAAGTGGTAATTTTTGGCATGTGGATATAAGCAGGACCCTCAAACCCAAATGATTTTTTTTTTTTTTGT
CTTAAAGATGACTTTTCAAAGGAACTAACCGGTACCAATACCGCAAGTACTGGTGCCAAAAAACGGAAAAAGTGGATACCGGTACCAGTATTTACCGGTGTTTAACCCATAAATACCGGT
ACCGTACCGTTACCGAAAAAAGGGGAAAGTGGGTACCGGTATCGAATATACCTGATACGGTTCGGTACCGATACCCAATACCAAATGCTCATCCCTAGATCACACCGACTGAATTTGGTA
AGATAATGAAACCATTATTTGATTAGGGTACAACCACTTAAATACAATTTACAATCATACATGTATATTATAGAATTATATGGCAAGAGATTGATAATTCTCATTCATACTTCAAAAACT
CGGCAGAGCCGATTACAAATACAAGAAGAAACATGCAAACATGGAAAGTATCAACTAAATGGGGAAGGAATATCACTAGGGGAAATAATAAAGAAGAATAAGGAAATAGGATATTCTATA
TTCCCCCTCAAGATGAAGCGTGTAAATCAATCATGCAAATCTTGCCAAGTAGGAAATCGAGTTGTTGTCTTGAGAGGCCTTTTGTCAACAGATCAGCAATCTGCATTTTACTACTGATAT
TCATAGTAACAATCTCCTTGGACTCCACGCGCTCACTCACAAAGTAACAGTCCATTTCGACATGTTTTGTCCTCTCGTGGTAGACCAGATTATTTGCAATGTGTCGAGCTGCTTGGTTGT
CACAGAACAAGGGGGTAGGCGAACCACTTTGAATTCCTAATTCCTTAAAGAGCCAGTGCAACCAAAGAATTTCGCTCACCGTGCTTGCCATTGCACGATACTCGGCTTCGGGCGAAGAGC
GCGAGACCACTGATTGTTTCTTCGTTTTCCACGAGATGGGAGAGCCCCCGAGCAATAAGAAGTAACCTGTGCGTGACCTCCTTGTGTAGGGACATCCTAGCCAGTCAGAATCACAATACG
CGGATAGAGTCGGGTCCCCGGTACGCGAGAGAAGGATACCTTGCCCCGGGGTACCCTTCAGGTATCCAAGAACCCGATTGACTGCCTCCAAATGATTGCTTCTAGGATCCGCCACGAACT
GACTTTGGACATTAACCGCATATGTGATGTCTGGTCGAGTGGCTTGTAAATATAAAAGCCGCCCTATCAAGCGACGATATTGACCAGCATCAACACGATCATTTTCTTCTCCTTTGTCTA
CCTTCAAACCCCGTTCAATCGGAGTCACACAAGGTTTACACCCCAGCTTTCCGCTATCCTCCAAAATGTCCAACGTGTATTTGCGTTGGCTAAGGACAAGACCCTCTTTGGTTCTGGCAA
CTTCTATACCAAGAAAGTATTTTAGGACTCCCAGGTCCTTAATGCTGAAATTTTGATCAAGTTTCTTCTTAACCTCTTCGATCTTTGCCAAACAATTCCCCGTTATTATGACATCGTCAA
CATAGATCAAAATAACTGTCATGATGTCACCGGTCTCGAAAATGAACAAGGAGTGGTCCGCTTTGGATTGTTTGAAACTCATGCTTAAAAGAAATGTGGTGAATTTGTGGTACCAATTTC
GTGAGGCCTGCTTTAACCTATATAGGGACTTCCTTAGTCGACACACACGCGTTTCGTCTTTGTTGGTGAAACCTTGAGGAATCTTCATGTACACTTCTTCCTCGAGTTCACCGTGAAGGA
AGGCATTGTTTACGTCGAGTTGGTGAATAACCCAGTTTCTTTTGACCGCCACGGCAAGAAGAGTTCGCATGGTTACTAGTTTAGCAACAGGCGCGAACGTGTCATGATAATCAATTCCTT
CTTGTTGCGTAAACCCCTTTGCAACGAGTCGAGCCTTGAATCTTTCAATTTCACCGTTTGGCTTGTACTTAATTTTGTAGACCCACTTCGAATCAATGGCTCGTTTCCCTTGCGGAAGAC
TTTCCAAGGTCCACGTCCCGTTCTTTTCCAAGGCCTTAATTTCACTTCTCATAGCTTCACACCAACGCGAGTCTTGCGAAGCTTCTTGAAAACACCTTGGCTCATCATTTTTATTGATGG
CCGCTAAAAAGGCCTTTTGCTTACAAGAAAAATTGTTATATGAAACAAAATCAGAAATAGGATACATGGGTTTACATACCACGGAGGAGGCTTGACTGGATCTGGGGTGTTGAACCGAGG
GGGGAACGTTGACCACGAAATCTTTGAATTTTGAAGGTTGCGACCTGGTACGAGTTGGTCTGGCTTCGGCAGTGGGTTCTACCCCACCAACTTCAATATTTTCACCTTCCAAATTATTTA
TTTCAATATTGGGTCCAACTCCATTATCTTCGGCCTCCCCTTATACATTTTGGCCCAAATCAGAATCTACCTCAGGCCCATTTACATTCTCGTGATCAGGCCCATTCACATTCTCATTGA
TTTCAACTTCCTGACTTTCAATATTTTGAGATTGGTTTGGGTGGCAATCGGTCAATGGCTCTTGAACTTGGCAATTATCAAGACACTCATGTATTTTAACAAGCTTAACATTATCATCTA
CCTCACCCGTGTGAATTTTGGCAAAAGGAAAGTTCTCTTCGTAGAAGAGAACATCTCTACTGACCATGATCTTTCTTGTTTCAAGATCGAAAATTTTGTATCCTTTTATTCCCGGAGGGT
ATCCTAGAAATACTCCCGGTTTCCCCCTTTGCTCGAACTTGTCCCCCTTTGTATTAAAATTTTTAAAATAAACAAGGCAACCAAAGACCCTAAGATGACCGTAATCGGGTTTGGTTCCAA
AGATGATTTCATAGGGAGTTTTGTTTTTAAGGACATTTGAAGGTAAACGATTTATAACATATACCGCCGTAAGAACACACTCTCCCCAAAAACGTTTAGGGAGGTTTGCACCGAACCTTA
AGGCCCGAGCCGTCTCTAAAAGATGTCGGTGTTTTCTCTCAACAACGCCGTTTTGTTGAGGGGTGTGGGGACACGTGGTCTCAAGTAACATCCCCCTTTCATTATAGAATTCCATCATGT
CATTAGATGTAAACTCACCACCGTTGTCACATCTTATCCTTTTAATGTTTTTATCAATTTGGACCTCAACCATTTTACAAAAAAACATAAGACATTTGCTCGCATCACTTTTATGTTTAA
TAAGAAACACCCACACGGCTCTACTATAGTCATCAACTATGGTAAGGAAATAATTGGCCTTGGTATACGATGGCACACGATACCCCCCCCCCCCCAAAAATATCACAGTGAACTAACTGA
AAAGGTTCAATGGTTTTAATAAAACTAGATGGAAAAGGTGTTCTGGCAAATTTGGCCATGGCACAAGAATCACAAAAATTACCAAGTTCAGTAGTAATAGTACTTAGAAAATCAACTTTG
GCAAGTTTTCCCTTCGAGGCATGTCCAAGTCTCTTGTGCCACGTCTCAATGGTGCTTGCCAAGGCTTTCTTCTCTTGTACCATCTTCATTCGGTATAGCCCCCCCCGCATCTACCCGCTC
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ATAAAGGACGTTTTTTACTTTGGCTCCTCCAGGGAGAACGTATTCCCCCTTTCCCTTTACAGGGATGGATTCACCATTCGGAATGAGTACGGACCCTTCGAATGGTGCAGCCTTTTCATT
AATAAGAGTGTTTTGCAAATGTGTTATATATTCGGTGCAACCCGAATCTATTATCCACTCACCTACTTCGTCTGTTTTACTAGCCATATTAGCAAAAGATTTTGTTGTGTCAACATTACC
GGAGCTTGAGAACTGTTTGAGAAGTGTTTGGTAGTTCTCCTGTGTCAAACCGGGTATAGGGCTCGGTTCCGCTTCGACACAAGCGGCTCTTCCTTTAGTCTTTTCCCCTTTCTTCCCGGG
CCACCAATCGGGATATCCGACTAGTTTAAAACATCCCTCCCGCTTGTTGCCGTCTTTATTGCAAAAGGAGCAGTGATCGGCTCCCTCCTTCAATCCCTTCGTTCCCGCCTTTTCTTTGCC
GAAATTACCATCACGTTTCTGGAATGCCTTGAAAGCGGCTGCCTCCACGCCACCTTTGTTCTCACTTGAGACGGCCCGTTGCTTTTCATCATCGTGAACCATGTGGTATGCGGCCGTGAA
TGAAGAGATGGGTTTCGTGGCCAGAATCTGGGTTCGAATAACCGTGAATTCGGTGTTCAACCCCATGAGAAATTCATATAGATGTTCCTTCTCTTGGTGCTCAAACACTTTCTTCCCAAT
TTCACACTCACACTTGTTGCACGAACACTATGGAAACGGTTGAACCGACTGGGCCTCATCCCATAGTGATCGAAGGTGTGTGAAATATGCCGATACCGAATCCCTTCCTTGACGGGAAAC
AGCAATTTTCTGTTTGATTTCGTACGCTCTAGGAGCGCTCTCCTTTCCGAATCTTTCGTCAAGATCGGACCATATTTCGGCTGCCGTGCTAGCATATTTTACACTATTGCGGATGTTCTT
TTCCATTGCCGTCGTTAGCCAACCCTTTATCATGGCGTCGGCACGCATCCACGGCATGTAATCTTTAGACGATTTTTCCGGTTTCTTGATTGATCCATCAACGAACTCAATCTTGTTTTT
GGCAAAAAGGAAGTTCGTCATCTCTTGCTTCCAATCTGCATAATTGTAGTCGGTTAAAGCTTCGTTGACATGTAACTGTTTCGGAAGATCCGATGGGTGGAGATAGTATGGTGATTCGTG
AGGAATGGCTCCAGCATAGCTTTCTCCGTCTTTGTTTTTGTTGGTCGAGTCTTCTCCCGCCATGAATTCGATCTTTCAAGAGCTAGGTAAAAACCCGCTCTGATACCATATAGAATTATA
TGGCAAGAGATTGATAATTCTCATTCATACTGAAAAAACTCGGCAGAGCCGATTACAAATACAAGAAGAAACATGCAAACATGGAAAGTATCAACTAAATGGGGAAGGAATATCACTAGG
GGAAATAATAAAGAAGAATAAGGAAATAGGATATTCTATATATAAATGTTACAAATTAATAGTATATAAATACAAATAAATAGGATAAGGGTACACATTGCCTATGAGGTTGAGTGGTTG
ACACCTAAGATGAACCTCTGTTCCATTGTAGCCCTTGCATCTATCATATAATCCATTTAATGATTTTCAAGAGATACATTAGGTTGCTCTAAATCAACATGACGTGTAGCAAGTTATATT
TCGAAGATACGTAGGTAATGAAACTTGAAGATAACCATTAATAGGGCTACACAACTTAATATGTATGACTAAAAGCTCTAAATATAGAAATACTCAAATGAAGAATCACATGTATGAGAT
CGCTACAAGTATAATCGGTTTGGTTCATTACGGTCTGGTTCAACTGATTTGGTTATGCAACATGCCAAAACCAAAACCAAACTACAAATTTCGCTTAATTGGTTATAGTTTAACTGAACC
ATTTCGGTTCGTCAATTCGGTTTCATTGCATATCTTGCTTTGTCCTTCTTTGCATGATCACTCATATCCAAGATTGCTTCCATCTCCTCCAGCCACTTAACAACTCTAGTACCTCCTTTC
TCATCATTGAAAGTTGTAGGTATACAAGACATGAAAGTCTTATAACTACTAAAAAACACCTTTCTTGACACATAAAGGGTACTTATGACATGCAAAATGGTGTCGTTGAAGGACACGTCA
TAAAATTAAGATGACATGCATTTATGTGTCATCTTTTGATGATACTTTGATGACACGCGTTCTTGACACTCATTTTTGATATGCTTTTACGACGTACATTTATGACATATATTTATGACG
TTCATTTACGTGTGTCATACTTTTAATTGTTTTTAAAAAGTTATAGAACCATTGTGTTTTTGTGTTTTTTTGTTGTGATCAACGGAAGGTGCTGAGACGTTTCTTTTTATAGGATGTTTT
TGGCGCGTAGTTTAGGCGGGATATTATTATAACAATAAATGCAATTAACAAAGTATTCGGTTTTGCTCAGCCTTATCCGTTAAATCTGTTAAACGTCCCCATCTCTCAGGATTGGCGTTT
ATATTTTATGGCGTTTTTGTAGGATAAGACCTTAACTAAAACACAGAAAAAACTACGCAGTAATAAAATTGGCGTTTTGTATTTATTTGACGTTTTATATTTTCAATGGCGTTTTATATA
TGAAAGTATGTTTACCCTTTTTACCCTTAATGAAGCACGTTCTAGTAATACAATTGATGTTATCCCTTAATCAAAATAGATAAAGCTACTACATTTGAACTTTAGCACCTAACATTAGGA
GAATGATAAGTTCTACAACCCTTTGACATTTCAATCGACGGTTGATCTTGGAGGAACCTTGTGAGACAAGGTGGTTAGACACGGAAAAGGTAATGTCAGTTTAGAAAGAAAATGGAATGC
CAATGAGCTAGTGGTGGAGTGGTAAGGGAGAGACCTTGTGTTCCAAGTGACTCAAGTTCAATTCCTGCCCCTAGCATTTAGTTTCTGCGGCACCTGGTGATGATGGGAGACTAGGCGAGT
AGGCGGCGATCGCTAGTTCGATCCTTGAACTGAGCGGGTTTTACCTCACCGCACTGTCGTGCCTTCGGGCGAGTGTTCACGGGCTTCGGCCCTAGGTGGGGGTTTTCCCCGGTTCGGAAG
GCGAGTGTATCCCGATGTGGTGAATTTCGCCAGTAGCCCATTTGGAGGATTCGTTGGCCGTTTAAAAAAAAAGAAAGAAAATGGAATGATGACATAGGAAGTAAGAGGCTTTGTCCTAGA
TTGAGAAATAAAGGTGTAAGGAGTGGTTAAACATTTGAGAGTGACAAACTAAAAAATCAATCAATGAGAGTGTGTCATGTCAAAGTGGTAAACTATGCTCAAAATTGGTTAGACACTTGG
TGAAGTGGTAAACTATTTAAAAAAAAAGAAAAATGTGTGATTGGTTGAGATTGGAATGGACCCCACCTCACAGTACCCTCTCTCTCTCACACTACCCCCTCTCTCTCATGATTCCCGAGT
GGCAAGCCTACACCGATTTGGCAATGAAACCGCGCAAAAGGGGTCGGCGGAGGTGTTGCCGCACGGCAAAACCCTTTGCCGCACCACTCCGGACAGCCTAAGGGATTTAAGTAGGAGTAT
TCGCGCTTGGTTTTAACGATTTTTTGGTCAACGTGTATGCCAAACTCTTAGTAACGATTTTTATTATCGAAAACCAAAAATGGACAGTTGAAAAATAAAACCGAACAAAAAATAATCGCT
CTTAACGATTTGGTTCTTGTTCGATTTTAGGTTTGAGCTTTATTGGGCCTCTAAAACTTAATAGGAAGCAATAACAGTTTTGAATAAAAACTGGGACTAAAACTTAACAATTAACATAAC
AAGGATTACAAAAAGTGATTAAACATGTTGACCTTGAAAATGATTTTAGCAAGAAAAGAAACGTTTAGGACTCAGACGGGTTAATAAAAGGAATATATCTTACTTAATATACTAAAAAAA
GAATAATAAAAATTTATGGCCTAGTCCAATTAATACGACCGGTTGCCGCAAGCCAAACTACTCGTTATGGTTTGAAATTTTTGAAACTAACCAACCAAACGTTTGAAAGAAAAACCGACC
GTGAAACCAAATCGATGACCGATTTGAGCGGTTTTGTAGTTTTAAACTAATCCGTGAACACCCATATTTCAAGGAAACAAGACAAAGTGCAAAGTTTGGGAAAATGCATATGGGCAACGT
AAGTATGACATTAAAACATGTTGCAATTAGAAAAAAGACGGGACATGCACCAAAGAAATAACCTAACAACAAACATGTTTTGAGTATGATAAACTTGTCATTTATGATGTAATTGCCCCA
AATTGAAACATAACAAGTTTAGTGAAGTGAGTAAGGAAAAAGGGCATGATTTTGTTACGAACGTGGAAGAGGCATGATAGATCCTAGATGTGGTTAGAGCAGCAGTCCAGCCAAGTCTTT
GAAATAGGAACGAGACCATTCCCACCACCACGAGCAGGCAAGTTGGATCGTTAGCAAGGCATGTTATAACCAAAGAGGCATGTCTTTATACGAAAAGAAGACATTTTGATACTAGTTGTG
ACTCAAAGCATGGACCAAATGGATAATAACATGGCCCTTGGTGAAATAGCGCTCAACAAGAAACCGAGAGAGCAGCACATTACAAGTAAACTAGTTGTTCTATCACATGTAGTGGTGGAC
CAATGATTTATTTTTCTAAGAGCGCAATCGTGGGCTTAACCAAACTTTGAAGAGGAGAGTTCAGGATTTTTGCCTAAAACATAAACTAAATTTTAAATTTATATCCAAAGCTCTAGCTCA
TGAAAAATCTTCAAGCCTAGTCTAGTCTCGGTCACATTTAATAATTATTAAATTTATATACCTATATATATAGGCTAGCTCGGTATATAAACCTCGGGCTCGGGAGCGGTAATTAAACAT
TTTGTAGTCTCTAGCTCAGCACATTTACACACCTAGACGTATACAGTACTAATACATTTGATAATATATTTGTGTGTGTATGATACTAGATATATGTTATTTCCCTTTTCTTTTGTTCAT
CACATGTTAACTAAAGAACATCTATATATATTTTCTTAAAAACAGGCGGGAGGTCCATATTATGCGGTTAAGAAAGGAAGGTGGGATGGAAAACAAAAACCAATGGCAAGTTTGGTGTAC
CCAAATATCCCACATGCGAATTCCACCATTGATAACCTCATTAAGCTTTTCTCATCCAAAGGTCTTACGCTTAACGATCTGGTAGTCCTATCAGGAGCCCATTCTATCGGCTATGCGCAT
TGTAAACACTTTGTGAATCGCCTTTACAACTTTAAAGGGACAAACAAGCCAGATCCGGACATGGATCCGAGGCAACTGAAATCCCTTAGAATGACTTGCCCACAACATGGTGGCAACGTC
GGTGTTGTGATACCTTTTGATGCAACAACACCTTTTTCATTTGATAATGCATATTTTCAAAACTTGCAAGCGAAATTGGGTTTGTTGGCAACTGATAAAGAACTATTTTTGGACCCTAGA
ACGAGGCCTTTAGTACAAGCATTCGCAAACGACAAGAACAAGTTTTTTCAAGATTTTTCTTCGGCTATGGAGAGATTGGGAAATGTTGGTGTGAAAAGAGGAAAAAAGCATGGCGAGATA
CGAAGAGTATGCAATATGCATTTATAA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCTCTGTCATCTTCAATCCTCATACTCTTGTTCTCCACCACAATAACCACCTGCTTATCATCTGAAACCGTCAACACCTCCATGGTACACCACCGCTTCCTCACAGTGGATTACTAC
GCCAAAACATGCCCTCAACTCGAACAGATTGTCGCCTTCGTCACTTCTCAAAACTTTAAAGTGTCGCCGGCCACTGCTCCGGCGACTATCCGCCTTTTCTTCCATGACTGTTTTGTCCAG
GGGTGTGATGGATCAATCTTGATATCAATGAAGCCCGGAAGCATGGGATTGCCGGAGAAGGAGTCGGAGGATAACCAGGACATTCCGGCCTACGCGTATCAAATTATAGAGAAGGCGAAA
GCTATGGTGGAGATGAAGTGCCCTGGGGTTGTATCCTGTGCGGATATACTTGCACTTGCAGCCAGAGATTATATTCATTTG
GCGGGAGGTCCATATTATGCGGTTAAGAAAGGAAGGTGG
GATGGAAAACAAAAACCAATGGCAAGTTTGGTGTACCCAAATATCCCACATGCGAATTCCACCATTGATAACCTCATTAAGCTTTTCTCATCCAAAGGTCTTACGCTTAACGATCTGGTA
GTCCTATCAGGAGCCCATTCTATCGGCTATGCGCATTGTAAACACTTTGTGAATCGCCTTTACAACTTTAAAGGGACAAACAAGCCAGATCCGGACATGGATCCGAGGCAACTGAAATCC
CTTAGAATGACTTGCCCACAACATGGTGGCAACGTCGGTGTTGTGATACCTTTTGATGCAACAACACCTTTTTCATTTGATAATGCATATTTTCAAAACTTGCAAGCGAAATTGGGTTTG
TTGGCAACTGATAAAGAACTATTTTTGGACCCTAGAACGAGGCCTTTAGTACAAGCATTCGCAAACGACAAGAACAAGTTTTTTCAAGATTTTTCTTCGGCTATGGAGAGATTGGGAAAT
GTTGGTGTGAAAAGAGGAAAAAAGCATGGCGAGATACGAAGAGTATGCAATATGCATTTATAA

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cDNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
CTCAACCCAC AATTGAAACC ACCACCACCA TGTCTCTGTC ATCTTCAATC CTCATACTCT TGTTCTCCAC CACAATAACC ACCTGCTTAT CATCTGAAAC CGTCAACACC TCCATGGTAC  ACCACCGCTT CCTCACAGTG GATTACTACG CCAAAACATG CCCTCAACTC GAACAGATTG TCGCCTTCGT CACTTCTCAA AACTTTAAAG TGTCGCCGGC CACTGCTCCG GCGACTATCC  GCCTTTTCTT CCATGACTGT TTTGTCCAGG GGTGTGATGG ATCAATCTTG ATATCAATGA AGCCCGGAAG CATGGGATTG CCGGAGAAGG AGTCGGAGGA TAACCAGGAC ATTCCGGCCT  ACGCGTATCA AATTATAGAG AAGGCGAAAG CTATGGTGGA GATGAAGTGC CCTGGGGTTG TATCCTGTGC GGATATACTT GCACTTGCAG CCAGAGATTA TATTCATTTG GCGGGAGGTC  CATATTATGC GGTTAAGAAA GGAAGGTGGG ATGGAAAACA AAAACCAATG GCAAGTTTGG TGTACCCAAA TATCCCACAT GCGAATTCCA CCATTGATAA CCTCATTAAG CTTTTCTCAT  CCAAAGGTCT TACGCTTAAC GATCTGGTAG TCCTATCAGG AGCCCATTCT ATCGGCTATG CGCATTGTAA ACACTTTGTG AATCGCCTTT ACAACTTTAA AGGGACAAAC AAGCCAGATC  CGGACATGGA TCCGAGGCAA CTGAAATCCC TTAGAATGAC TTGCCCACAA CATGGTGGCA ACGTCGGTGT TGTGATACCT TTTGATGCAA CAACACCTTT TTCATTTGAT AATGCATATT  TTCAAAACTT GCAAGCGAAA TTGGGTTTGT TGGCAACTGA TAAAGAACTA TTTTTGGACC CTAGAACGAG GCCTTTAGTA CAAGCATTCG CAAACGACAA GAACAAGTTT TTTCAAGATT  TTTCTTCGGC TATGGAGAGA TTGGGAAATG TTGGTGTGAA AAGAGGAAAA AAGCATGGCG AGATACGAAG AGTATGCAAT ATGCATTTAT AAGGCATATA CCCAATTATT TAATTTAATT 
CTTTTATAAC GTTTATGTTG TTTGTGGCTT GTTAATTTTT ATAAGACATG AATGTGAGTT TTTTTGTTAC CGTTTGATTA AACAAGAATA TTTAAGCTTC TTTAAAGT 

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