Entry information : HaPrx[P]47 (HanXRQChr04g0105071)
Entry ID 13601
Creation 2016-05-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-28 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaPrx[P]47 (HanXRQChr04g0105071)
Name (synonym) HaPrx[P]47 (HanXRQChr04g0105071)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx005]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaPrx[P]47
start..stop
S start..stop
LsaPrx12 531 0 1..329 1..327
LsaPrx13 496 1e-178 1..329 1..326
HaPrx20 493 3e-177 1..329 1..330
HaPrx[P]76 488 2e-175 26..329 33..334
Literature and cross-references HaPrx[P]47 (HanXRQChr04g0105071)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr04 (53368876..53362210)
Protein sequence: HaPrx[P]47 (HanXRQChr04g0105071)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (303)
PWM (Da):   %s   35161.97 (32429.4) Transmb domain:   %s   i12-34o (i12-34o)
PI (pH):   %s   8.75 (8.57) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-329
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEALSPNRKP TLLVVLLATL ITMAVGQGTR LGFYRTSCPR VESIVQSAVQ SAIRSNPAMA PGLLRMFFHD CFVNGCDASI LLDGSSSEKT APPNSLLRGF EVIDAAKTQL ETACPGVVSC  ADILALAARD SVVQTGGTGW PVPLGRRDGL VSRAADTANL NLPAFNDPVG VQIRKFTDKG LNTQDLVALS GAHTIGTAAC ALFSYRLYNY NNTNGPDPTI DPAFLPTLRN LCPNGGDGSR 
RVDLDPASVG RFDNSYYANL RNRRGVLESD AALWNDPTTQ RFVNRFLGVR GLLGLTFNVE FGRSMIKMGN IQVKTGTQGE IRRVCSATN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic. Large intron after "GRRDGLVSRAADTANL" without prediction with FGenSH. No EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCCA CAAATATTAT TGCACTCATA TTCTTCCTGC TCTTAACTAT CAACACACTA TGTGAAGTAC AATTATCTTC TACATTCTAC GACGCTACAT GTCCTAATGC GCTACGTACA  ATCAGATCCA CCGTCCGAAC CGCCATATCG CATGAGCGTC GCATGGCAGC TTCCATCCTT CGTCTCCACT TCCATGACTG CTTCGTTCAG GTACACTACT AGTTCAACCA CATATGAAAA  CCTATGTTGT CAAAAACGTT AGGCGCACTT AAGGCGCCAA GGTCTCGCCG GGAGCGTAGA CGCAAAGCGC AAAAAAAGCA AGGACTATTT TTTAAGTAAG GCGCCGTAGT AAAAAAAATA  AAATAAAAGA AATTATATAT AATAGGCATA AAATTAGTAT TTTTACACTA TTATACAAAT ATAATGTAAA AAATCATAAT ATTCTTTTAG AATATGTACA ACAATAATTA ATGTTTATAA  AAATATCTAA GTATTTATTA CAAACTAAAA CAATAAAGTG AAAAACAATT TAAAGATCTT TAGTTGGGTC ACCCATCTAT TCTATAAAAT AGTTTAGTTA TTTAAAACAA AGGCTAGCCC  AAATACAATC TACACATCAT CTACAAAACG CAACCATCAA TTTTATTGAA TTGGAGTTTC CTATCAAAAA GAGCAGCCAA CCGACACTAG TCCACCACAT TGCTCGTTGG CCACAATGCA  CTAGAATTTA ACCAAGTAGT CTTCAAGAAG TTGCTAAACC AAGTTTTTAA CTATCTACCC TCTCTAAATT AATGTTTCAG GACATCCCTT CTTGTTTAAG GCTGTTTTTT TTTTTTTCGG  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GTTGATTGGC GACGAAGGAG TTATACGGAA CGTTTGCGGT GTTTTTGATC CGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGCTC TTTCTCCTAA CAGAAAACCT ACGTTGTTGG TTGTGTTGTT AGCCACCTTA ATAACCATGG CAGTAGGACA AGGCACACGA CTTGGATTCT ATCGGACCTC ATGCCCAAGA  GTGGAATCCA TCGTGCAGTC TGCGGTCCAG TCTGCTATCC GCTCCAACCC TGCCATGGCA CCCGGTTTAC TAAGAATGTT CTTTCACGAC TGCTTTGTTA ATGGCTGCGA CGCCTCTATT  CTACTCGACG GTTCTTCTTC TGAAAAAACC GCTCCCCCAA ACTCGTTGTT GAGAGGCTTT GAAGTCATTG ATGCCGCAAA GACACAGCTG GAAACCGCGT GTCCTGGGGT GGTTTCTTGT  GCTGACATTC TTGCCCTCGC TGCCCGTGAT TCTGTTGTCC AGACCGGAGG AACGGGCTGG CCAGTGCCAT TAGGTCGCAG AGATGGATTA GTTTCACGTG CAGCGGATAC GGCGAACCTG  AACCTGCCTG CATTCAACGA CCCTGTTGGT GTCCAAATCA GGAAGTTTAC TGACAAAGGT CTTAACACCC AAGATCTTGT CGCTCTTAGT GGAGCGCATA CAATTGGGAC AGCAGCGTGC  GCATTATTTA GCTACAGGCT ATACAACTAT AACAACACCA ATGGACCGGA CCCGACTATC GACCCTGCAT TCCTTCCCAC GCTTCGAAAC TTGTGCCCCA ACGGTGGAGA TGGCTCGAGA  CGTGTGGATT TAGACCCAGC AAGCGTTGGC AGATTCGACA ATTCATACTA CGCAAACTTG AGGAATAGGC GGGGAGTACT TGAATCCGAT GCTGCTTTAT GGAATGACCC GACAACACAA  AGGTTTGTGA ACCGGTTTCT TGGAGTTAGG GGACTGCTTG GATTGACATT CAATGTTGAG TTCGGCAGAT CGATGATTAA GATGGGTAAT ATTCAAGTGA AAACCGGTAC TCAAGGAGAA 
ATCCGGAGGG TTTGCAGTGC TACTAATTGA 

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