Entry information : HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)
Entry ID 13661
Creation 2016-05-10 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)
Name (synonym) HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)
Class Thioredoxin Type TDX    [Orthogroup: TDX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaTDX01
start..stop
S start..stop
AtTDX01 452 4e-160 1..364 2..371
ThasTDX01 405 9e-142 1..360 1..347
PpaTDX01 234 5e-74 1..229 1..268
KflTDX01 181 1e-53 64..245 143..337
KflTDX01 51 0.0000002 1..46 4..49
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 90156988..90157097 110 N° 2 90157174..90157207 34 N° 3 90159840..90159941 102 N° 4 90160040..90160127 88
N° 5 90160580..90160660 81 N° 6 90160967..90161031 65 N° 7 90161925..90162065 141 N° 8 90162926..90163042 117
N° 9 90163251..90163278 28 N° 10 90163373..90163701 329  
join(90156988..90157097,90157174..90157207,90159840..90159941,90160040..90160127 ,90160580..90160660,90160967..90161031,90161925..90162065,90162926..90163042,901 63251..90163278,90163373..90163701)


exon

Literature and cross-references HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr13 (90156988..90163701)
Protein sequence: HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   364
PWM (Da):   %s   39962.39  
PI (pH):   %s   6.2
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MDDSKIHELKLFVESCQSDPSILHNPSLGFFKTFLQSLGAKIPPASTGAENGHTSNEDIVESDLELDDSDVVKPDDDPPQKMGDLSIEVSDESRDLAQSLKSKAIEAISEGNLDEAIDHLTEAITLNPSSAILYATRASVYVKQKKPNAAIRDADAALKINADSAKGYKTRGMARAMLGHWEDAAHDLGLASNLDHDEEIGSTLKKIEPNVHKIREHRRKYERLRKEKKVRATEHAKQKTKAETEDVKASTQTGEVVSICKASELETRLTASSKSNQLAILYFTATWCGPCRFMAPLYTSLASKYPKVVFLKIDIDEASDVAAKWSISSVPTFFFTKNGKEIDKVVGADKSSLENKLAKYAS

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Remarks
DNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATGATTCCAAGATTCATGAACTGAAGCTCTTCGTAGAAAGCTGTCAATCAGACCCTTCAATTCTCCACAACCCATCACTAGGCTTCTTCAAAACCTTTCTCCAGAGGTATACTATA
ATTCCACTTATTATTATTCTACGATTTTTAATTAATAATTTTATTTCTTCAATTGTTTGTTTCCAGTCTTGGCGCCAAAATCCCACCTGCCTCAACACCGGTGAGCCCTATTTAATTGAT
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TTATTTCCATACTTTTCTGTCACGTATTTTGATATCTATTTTTTTTTGTTATAATGTGTCTTTTTTGACGTTTCCAAAAAAATCTTATGAAGGGTGCTGAAAATGGACACACGTCCAACG
AGGATATTGTTGAGTCTGACCTGGAGTTAGATGATTCTGATGTCGTAAAACCTGACGATGACCCTCCACAAAAG
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TCTCTATACCTAATTGCAGCTAGTGTATATGTGAAACAAAAAAAACCAAATGCTGCAATCCGAGATGCTGATGCAGCTTTAAAGGTCTGTCTTTACACCTTAGCTAGTAATGGTTAGGGG
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TCATATGAATTTTTCAGATCAATGCTGACTCAGCAAAAGGCTATAAAACGCGTGGGATGGCAAGGGCTATGCTTGGTCATTGGGAAGATGCAGCACATGATTTGGGTCTAGCATCGAATT
TGGATCATGATGAGGAAATTGGGTCAACCCTTAAAAAG
GTGCTTCTCTTTCTCACACCTGTTTTAGCTTTTTTTAAGGTTTAATTTCGTATAAAACCAGCTTAACGTTTCAGTGGTTTAG
CCCATTAACCTTATTCTGTTTTTGCAATGGATGCATCCCTTAGTTCTTTTTTTTGACTTGTTGAAATTCTGCTTTGACATGTTGAACTACTTAAGCGGTTGTGTGGACAATGGACACAAG
TATGAATTATAAATAGAGTAAAGTACACAAATGGTCCCTGTGGTTTGCACTTTGCAACGCATTTAGTCCCCTGCTTTTTCTAAAAGTACATGGATCATGGATGGTCCCTATGGTTTGCAT
TTTGTAACACATTTAGTTCCTAACTTGGACCTCCTAAAACCTTTAGATTTGATAGCTAGGGACTAAATGCGTTACAAAGTGCAAACCACAGGGACCATCCGTATACTTTTGAAAATCTAG
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AATAAGCGCGAGGCATTTAGGTCCCGAAAGCAGAGGCATTAGGTGTGAGAAGCGAGGCGTAAGCTTTAAGTACGCGAGGTGTTTCTCTATGTACAACCAAATAAGCTTGATGTACAACCA
CACGTCGCATCTCTCTTGTCTCTTTTACATATCAACCATCTTCACCAAGCAAACTGTTCATAACTACCATTCCAGTACACGTCGAGTACCAGACGCATTTCATATTTGGCTATTTTCTTA
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GAAGAAAGTTAGAGCAACTGAGCATGCAAAGCAAAAAACGAAAGCGGAAACCGAG
GCATGTTATATTCTTTTCTATATATTTAGAATATCATTATAACTTTTAATCTAGGGTACAACAAA
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AATTTTTTTATATGTTGATCTTTAGGTGAAGTGGTTAGCATTTGTAAAGCTAGCGAGTTGGAAACAAGGTTGACCGCTTCATCAAAGTCAAACCAACTAGCCATTTTGTACTTCACGGCT
ACATGGTGTGGGCCCTGCCGGTTCATGGCTCCTCTCTATACAAGCTTGGCGTCCAAGTACCCAAAAGTAGTGTTCTTGAAAATCGACATTGATGAAGCGAGTGATGTGGCCGCAAAGTGG
AGTATTAGCAGCGTGCCAACGTTCTTTTTCACTAAAAATGGAAAGGAAATTGATAAAGTTGTCGGGGCAGATAAATCTTCACTTGAAAACAAACTCGCCAAGTATGCTTCATAA

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CDS
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATGATTCCAAGATTCATGAACTGAAGCTCTTCGTAGAAAGCTGTCAATCAGACCCTTCAATTCTCCACAACCCATCACTAGGCTTCTTCAAAACCTTTCTCCAGAGTCTTGGCGCC
AAAATCCCACCTGCCTCAACACCG
GGTGCTGAAAATGGACACACGTCCAACGAGGATATTGTTGAGTCTGACCTGGAGTTAGATGATTCTGATGTCGTAAAACCTGACGATGACCCTCCA
CAAAAG
ATGGGAGATCTCTCAATTGAAGTTAGTGATGAAAGCCGTGATCTTGCACAAAGTTTGAAGTCAAAGGCTATTGAGGCAATCTCTGAAGGTAATCTGGATGAAGCTATAGATCAC
CTAACTGAAGCTATAACACTAAATCCAAGTTCAGCCATATTATATGCAACGAGAG
CTAGTGTATATGTGAAACAAAAAAAACCAAATGCTGCAATCCGAGATGCTGATGCAGCTTTAAAG
ATCAATGCTGACTCAGCAAAAGGCTATAAAACGCGTGGGATGGCAAGGGCTATGCTTGGTCATTGGGAAGATGCAGCACATGATTTGGGTCTAGCATCGAATTTGGATCATGATGAGGAA
ATTGGGTCAACCCTTAAAAAG
ATTGAACCTAATGTTCACAAGATCAGAGAGCATCGGAGGAAGTATGAACGATTAAGGAAAGAGAAGAAAGTTAGAGCAACTGAGCATGCAAAGCAAAAA
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GATGTGAAGGCTTCGACTCAAACATATGGTGAAGTGGTTAGCATTTGTAAAGCTAGCGAGTTGGAAACAAGGTTGACCGCTTCATCAAAGTCAAACCAACTA
GCCATTTTGTACTTCACGGCTACATGGTGTGGGCCCTGCCGGTTCATGGCTCCTCTCTATACAAGCTTGGCGTCCAAGTACCCAAAAGTAGTGTTCTTGAAAATCGACATTGATGAAGCG
AGTGATGTGGCCGCAAAGTGGAGTATTAGCAGCGTGCCAACGTTCTTTTTCACTAAAAATGGAAAGGAAATTGATAAAGTTGTCGGGGCAGATAAATCTTCACTTGAAAACAAACTCGCC
AAGTATGCTTCATAA

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TTTTTTTACG CCCTTTGTTT TAGTAAAAGG GTTTTTTTTT TTGGAAAATT TAAAAACATT GCACATTCGG CAATGTTCCT GAAAGACCTT TAAGAATACT ACTAACCTCA CTGATGAAAC  CGCAAAGTTG AGCATAACAT CAAACAAGAA CGATGGATGA TTCCAAGATT CATGAACTGA AGCTCTTCGT AGAAAGCTGT CAATCAGACC CTTCAATTCT CCACAACCCA TCACTAGGCT  TCTTCAAAAC CTTTCTCCAG AGTCTTGGCG CCAAAATCCC ACCTGCCTCA ACACCGGGTG CTGAAAATGG ACACACGTCC AACGAGGATA TTGTTGAGTC TGACCTGGAG TTAGATGATT  CTGATGTCGT AAAACCTGAC GATGACCCTC CACAAAAGAT GGGAGATCTC TCAATTGAAG TTAGTGATGA AAGCCGTGAT CTTGCACAAA GTTTGAAGTC AAAGGCTATT GAGGCAATCT  CTGAAGGTAA TCTGGATGAA GCTATAGATC ACCTAACTGA AGCTATAACA CTAAATCCAA GTTCAGCCAT ATTATATGCA ACGAGAGCTA GTGTATATGT GAAACAAAAA AAACCAAATG  CTGCAATCCG AGATGCTGAT GCAGCTTTAA AGATCAATGC TGACTCAGCA AAAGGCTATA AAACGCGTGG GATGGCAAGG GCTATGCTTG GTCATTGGGA AGATGCAGCA CATGATTTGG  GTCTAGCATC GAATTTGGAT CATGATGAGG AAATTGGGTC AACCCTTAAA AAGATTGAAC CTAATGTTCA CAAGATCAGA GAGCATCGGA GGAAGTATGA ACGATTAAGG AAAGAGAAGA  AAGTTAGAGC AACTGAGCAT GCAAAGCAAA AAACGAAAGC GGAAACCGAG GATGTGAAGG CTTCGACTCA AACATATGGT GAAGTGGTTA GCATTTGTAA AGCTAGCGAG TTGGAAACAA  GGTTGACCGC TTCATCAAAG TCAAACCAAC TAGCCATTTT GTACTTCACG GCTACATGGT GTGGGCCCTG CCGGTTCATG GCTCCTCTCT ATACAAGCTT GGCGTCCAAG TACCCAAAAG  TAGTGTTCTT GAAAATCGAC ATTGATGAAG CGAGTGATGT GGCCGCAAAG TGGAGTATTA GCAGCGTGCC AACGTTCTTT TTCACTAAAA ATGGAAAGGA AATTGATAAA GTTGTCGGGG  CAGATAAATC TTCACTTGAA AACAAACTCG CCAAGTATGC TTCATAAGCT AAGGTTCCTA AATTTTGGAC CAACCGTTGT GTTCTTTTTA ACCTTTGTTT TAAAAGTATG TTGTCATTGT  GTAACACCAG AGGTTCTGGG TTAACTCTAT TGTCGACGCT TGCCAGGTCC TTTTTAATGG AAAAACAGGT TATGTCGTGT GTGACATGTC CTTGTTTAGA AAGGGTAAAA TCATGAAACC  CAAAATGGTG ATTTTAGGGG AGCATGGTTT GACTCAAACA ACCTACTTTT GTTTTCGGGT CAACCAGACG GTATGTATTA ACCAAAGATT AGGTGTTGGT ATGTACTATG TAGTCTAATG  GTAGCGTCTA TTAGGGCTGT TTAACGAGTG TGTCAAGTTC GCTTCAACTT GGGTTCAAAC TATAATGAAC TAGCTTGGCT CGGCTTTGTT TATTCTTAAT GAGTTAATTT TGAGATTGAT 
TGTGTTCGGC TCGTGAAAAG CTTGAGCCAA CTCCTTTAAA TTAAAAATTA ATAGTTAATA ATTATAATGA TATTTAAAGT GATAGTTAAC CATAAAAATA ATG 

Retrieve as FASTA