Entry information : HaGPx[P]10 (HanXRQChr09g0254291)
Entry ID 13678
Creation 2016-05-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-11 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaGPx[P]10 (HanXRQChr09g0254291)
Name (synonym) HaGPx[P]10 (HanXRQChr09g0254291)
Class Plant glutathione peroxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaGPx[P]10
start..stop
S start..stop
HaGPx07 123 4e-37 75..138 1..64
StGPx08 96 2e-26 75..138 1..67
NtGPx06-1B 96 1e-25 52..138 41..129
LeGPx08 94 1e-25 75..138 1..67
Literature and cross-references HaGPx[P]10 (HanXRQChr09g0254291)
Protein sequence: HaGPx[P]10 (HanXRQChr09g0254291)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   138
PWM (Da):   %s   15235.39 Transmb domain:   %s   o10-32i39-61o
PI (pH):   %s   8.97
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVHPHSLLVI TINGAGLFIE TVYLLLFLIY SNHKQRIKVL LIMLAEIVFV GVLSALVLTV AEIVFVGVLQ QQSSMVAQPK KTLYDFTVMD AKGNDVDLSV HKGKVVLIVN VASKCGLINN 
NYDELNQIYL KYKEKGLH 

Retrieve as FASTA  
Remarks 5' part only , 100 AA are missing
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAAAA GAAAGGGGTG TCAATCAAAA ACCCTAATTC ACTCTAACGG AGAACAAGAA GATGAATTCA GAGATCAACA GTCTAATGAT TCAGAGATCA ACCCGAATTC AACCAATTGA  TCAAAATTTC AGGCCAACAT TCATCCAGAT CGTGAAGAAA GGGGCAGTGG AGTAGTTCTC ACCGGTGTCG TACCTCGCGA CATTTGTGAA CTGCGGGATA TGGGTGTTGT ACGGGCTGCC  AATGGTGCAT CCACACAGCT TATTGGTCAT CACAATCAAC GGTGCGGGTT TGTTCATCGA GACCGTTTAT CTGCTCCTTT TCTTGATCTA CTCTAACCAC AAGCAGAGGA TCAAGGTGCT  GCTCATAATG CTGGCTGAGA TAGTGTTTGT TGGGGTTTTA TCTGCTTTGG TGTTGACTGT GGCTGAAATA GTGTTTGTTG GGGTTTTACA GCAGCAATCA TCCATGGTTG CCCAACCTAA  GAAAACCCTC TACGATTTCA CAGTCATGGT TTCAACTTTC TCTCTCAATA ACCCTAATTT CAATTTTCAG TTTTGTTTTA TTTTTCTTGT GTGTCTGTAG AATTGATTAA CTATGATTAG  AATTGACATG CTACTCAAAA CCTAGAAATC ATGAACAAGT TAATTCTGCT AATCTGTTTA AAAGATAGAA AAAATCAATC TTTTCTTCTT TTTATGGGGT CAAGTTATTC TACAAAGGCT  TCTAATTGTA AGAAGTGTAA GAAAGATTTA TAGAGTGACA AGTGTCCAAT AAGCTAAAAC TAAACCCACT ACATCACCAC CAAAAACCTA AACACCCACC CCCACCCCAC CCCACCACCA  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GTTGGTTTGG AATATATTGG TTTGGAACTA AATGATGTAT TAGATAATAT ATTTTTAATT ACTGCGTTTT CTGTGTT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGCATC CACACAGCTT ATTGGTCATC ACAATCAACG GTGCGGGTTT GTTCATCGAG ACCGTTTATC TGCTCCTTTT CTTGATCTAC TCTAACCACA AGCAGAGGAT CAAGGTGCTG  CTCATAATGC TGGCTGAGAT AGTGTTTGTT GGGGTTTTAT CTGCTTTGGT GTTGACTGTG GCTGAAATAG TGTTTGTTGG GGTTTTACAG CAGCAATCAT CCATGGTTGC CCAACCTAAG  AAAACCCTCT ACGATTTCAC AGTCATGGAT GCTAAGGGTA ACGATGTAGA CCTTAGCGTA CACAAGGGAA AAGTTGTACT TATTGTTAAC GTTGCGTCCA AGTGTGGGCT TATAAACAAC 
AACTATGATG AACTGAATCA GATTTATTTG AAGTACAAGG AGAAAGGGCT TCACTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAAAA GAAAGGGGTG TCAATCAAAA ACCCTAATTC ACTCTAACGG AGAACAAGAA GATGAATTCA GAGATCAACA GTCTAATGAT TCAGAGATCA ACCCGAATTC AACCAATTGA  TCAAAATTTC AGGCCAACAT TCATCCAGAT CGTGAAGAAA GGGGCAGTGG AGTAGTTCTC ACCGGTGTCG TACCTCGCGA CATTTGTGAA CTGCGGGATA TGGGTGTTGT ACGGGCTGCC  AATGGTGCAT CCACACAGCT TATTGGTCAT CACAATCAAC GGTGCGGGTT TGTTCATCGA GACCGTTTAT CTGCTCCTTT TCTTGATCTA CTCTAACCAC AAGCAGAGGA TCAAGGTGCT  GCTCATAATG CTGGCTGAGA TAGTGTTTGT TGGGGTTTTA TCTGCTTTGG TGTTGACTGT GGCTGAAATA GTGTTTGTTG GGGTTTTACA GCAGCAATCA TCCATGGTTG CCCAACCTAA  GAAAACCCTC TACGATTTCA CAGTCATGGA TGCTAAGGGT AACGATGTAG ACCTTAGCGT ACACAAGGGA AAAGTTGTAC TTATTGTTAA CGTTGCGTCC AAGTGTGGGC TTATAAACAA  CAACTATGAT GAACTGAATC AGATTTATTT GAAGTACAAG GAGAAAGGGC TTCACTGATT TGGGAATGTG ATGGAAGAGA ATATGTAACA TCAACTATCC AGACCGTAGA CGCTTTCTTC  TTTCTCAAAT CATCCAAACC TGCTTGAAAG ACTTGTGAAT ATTGCAGAGG AAGATAATGA GAAATTCTGT TTAAAAGTCA AGATCGCATT GACCGGTAAT TTAAACTCAA CGTCTTTATC  TCGTCTTGAA TCATTTCTTC TCGTCGTTTT TAGATTATAA ATGGCTAAAG ACTTGCAAGA GATTTGGTTT TGTAATAACT TCGTTTGGAT TTGTCATCTT ATGACTTACG AGAGATCGTT  TGGTTTAATT TGTTGTTAAT TTTGATTTTT GCGAATGAGT TGATGGCGGC TGCGGCGGAG AAGCGAATGG CAGCATCTGC ATCGGCTGCT GTGGCGAAGA GTGGTTTTCA GTAAGTTCCA  AATCCTATGT GTAGAAATTG TGCTGAGTAC AAATATATTA ATCAACAGAA CGCAGATGGA TTTGCAAGGA CAACCAGGAT AAAGCTTTTA TAAATTGCTC AGTTCCACAA AGAGAAATCA  AACGCTGACA TTAACGAGGA GTTGGATTTA TTTGAAGGAT CTTGTGAGGA AGATGCTTGT AAAAATACTC GAGGGAACTC CAGTCAGTTG CCTCAAAAGC AATCTACAGG TAACCTTTGG  CCCATCGGAT TTGAGTACTA GAAAGGGATT TCGAGATGTC AATGAATTTG GCGATTCGGT ATCGGGGAAG CCGTTGCAGT TAACAAATGA GTCCAGTGAA TTAACTCAAG TTCAAACCAT  TTGGGCCGCA TTGCTTTGGC GAATCAAAAC AACGAGCAAG AGAATTGTTT TTTGTGAAGA TGTTTTCAGA TTAAAAAATG TGAGAACTTG AAGAAAGTCA ACTTTGAGAG TAGGTTAATT  ATGCCGGTTT TGGATTGAAC ATCGTCACTA GATGTTGTAT GAAACTGGAT TGGCTGGTGC TTACGAATGG TATAGAGGTG AAGTTACAAT GGAACGTGCT TAGTGTGATT GAAGCTCCTA  CTGCTGCGAT ACTGTACCGG AGAGTCCAGC CGCTCAGCAT CTGATTCGGA TCATTCAACG GAATATAATC GGAGATGGGA ACCAGAATCT CTGAATCTCT AGAGGTTATA CCGATCTTAA  ACTGGGAAAC CGAGACATTC AGCAAGCTCG CGTTAGCATT CATAATATTC TCATCAGTCG CAATATTCCC AACCGTATTT ATACCATCTA TACCCTCCAT GTGGGTCACA GGCATGAGCT  TCGATTAAAC ATAGGGATTT TACTAATAAT GTTCGGTGTC ACTATCGGAG CAACGCTTCC TTATTTCAAC GGTTCCCTAT TTTACAACAA AATTCAAGTG AGTATCTTGA TCAATTTATC  AACATGATCA AATGTAAGCG GACACGCTAG AAATTTGCTA AAGAGTGAAG ATCAAACTAA GTACATGGAC TGTTTTAAAG AGTCAAGATT CATGTCATGT TATTTGATCA TGAGCTCAGT  GATGAAGCTG AGTTGTAGAT GAGGATAAGG AGGAACGTCT CTTGAAGATT CTAAGATGGA TAGAAAGATG CTTAAACCAA AGTGCATCGA TTGCTACAGA TGAATTAAAA CACTCTATCA  AACACCAAAC ACTCATATTG ATGGTATTTA CTCTTCAACA CATTTTTTGT TACTTAAATA GTTTATCCTT ATAGTTTATT TATTTATAGT AACTATTGGT TTGGAACAGT GTTGGTTTGG 
AATATATTGG TTTGGAACTA AATGATGTAT TAGATAATAT ATTTTTAATT ACTGCGTTTT CTGTGTT 

Retrieve as FASTA