Entry information : HaCRX10 (HanXRQChr09g0241581)
Entry ID 13721
Creation 2016-05-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaCRX10 (HanXRQChr09g0241581)
Name (synonym) HaCRX10 (HanXRQChr09g0241581)
Class Other cupredoxin Protein    [Orthogroup: CRX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaCRX10
start..stop
S start..stop
HaCRX08 175 4e-56 17..156 17..158
HaCRX07 169 1e-53 9..215 9..192
HaCRX14 164 7e-51 14..129 16..132
HaCRX09 146 8e-45 7..138 6..137
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 24990877..24991527 651  
join(24990877..24991527)


exon

Literature and cross-references HaCRX10 (HanXRQChr09g0241581)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr09 (24990877..24991527)
Protein sequence: HaCRX10 (HanXRQChr09g0241581)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   217 (191)
PWM (Da):   %s   22094.86 (19355.5) Transmb domain:   %s   i5-24o
PI (pH):   %s   5.93 (5.34) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-217
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAANFGLSLV FIAIMVASMQ FHGTMAQTTH IVGDASGWTI LNGGAAAYTT WASQQTFTVG DALIFNFTNR QHDVAEVSAA AYDPCTSTNP ISLATTSPAT LALTTPGTHY YICTFTSHCQ 
IGQKLTINVS ASATATSPPL TTPTTPASPP TTTPPSLTPT TPTELPCPPT SSPTSSPLSP PTFTTGNTTP TPNSAAPSFT AVVPAALMAI GLAFLNF 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAGCTA ATTTTGGTTT GAGTTTAGTC TTCATTGCCA TAATGGTTGC ATCTATGCAG TTTCATGGCA CCATGGCTCA GACCACACAC ATAGTCGGTG ACGCCTCGGG ATGGACCATT  CTTAATGGTG GCGCTGCGGC TTACACCACT TGGGCTTCAC AACAAACCTT CACCGTCGGT GACGCTCTGA TCTTTAACTT CACCAACCGA CAACACGACG TTGCAGAGGT TTCAGCAGCG  GCCTACGACC CATGCACTTC CACTAATCCC ATCTCCCTCG CCACCACTAG CCCCGCGACC CTCGCTTTGA CCACACCTGG CACACATTAT TACATTTGCA CCTTCACAAG TCATTGTCAA  ATTGGTCAGA AGTTAACTAT TAATGTCTCC GCCTCCGCCA CCGCCACGTC ACCTCCATTA ACTACTCCTA CAACACCAGC GTCTCCACCT ACCACCACTC CTCCATCATT GACTCCAACA  ACACCCACTG AATTACCATG TCCCCCCACC TCATCTCCGA CTTCCAGCCC GTTATCGCCA CCAACCTTCA CCACCGGCAA CACTACACCA ACACCTAATA GTGCAGCTCC ATCCTTTACG 
GCTGTGGTGC CTGCCGCTTT GATGGCAATT GGCTTAGCTT TTTTGAATTT T 

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CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAGCTA ATTTTGGTTT GAGTTTAGTC TTCATTGCCA TAATGGTTGC ATCTATGCAG TTTCATGGCA CCATGGCTCA GACCACACAC ATAGTCGGTG ACGCCTCGGG ATGGACCATT  CTTAATGGTG GCGCTGCGGC TTACACCACT TGGGCTTCAC AACAAACCTT CACCGTCGGT GACGCTCTGA TCTTTAACTT CACCAACCGA CAACACGACG TTGCAGAGGT TTCAGCAGCG  GCCTACGACC CATGCACTTC CACTAATCCC ATCTCCCTCG CCACCACTAG CCCCGCGACC CTCGCTTTGA CCACACCTGG CACACATTAT TACATTTGCA CCTTCACAAG TCATTGTCAA  ATTGGTCAGA AGTTAACTAT TAATGTCTCC GCCTCCGCCA CCGCCACGTC ACCTCCATTA ACTACTCCTA CAACACCAGC GTCTCCACCT ACCACCACTC CTCCATCATT GACTCCAACA  ACACCCACTG AATTACCATG TCCCCCCACC TCATCTCCGA CTTCCAGCCC GTTATCGCCA CCAACCTTCA CCACCGGCAA CACTACACCA ACACCTAATA GTGCAGCTCC ATCCTTTACG 
GCTGTGGTGC CTGCCGCTTT GATGGCAATT GGCTTAGCTT TTTTGAATTT T 

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cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAGCTA ATTTTGGTTT GAGTTTAGTC TTCATTGCCA TAATGGTTGC ATCTATGCAG TTTCATGGCA CCATGGCTCA GACCACACAC ATAGTCGGTG ACGCCTCGGG ATGGACCATT  CTTAATGGTG GCGCTGCGGC TTACACCACT TGGGCTTCAC AACAAACCTT CACCGTCGGT GACGCTCTGA TCTTTAACTT CACCAACCGA CAACACGACG TTGCAGAGGT TTCAGCAGCG  GCCTACGACC CATGCACTTC CACTAATCCC ATCTCCCTCG CCACCACTAG CCCCGCGACC CTCGCTTTGA CCACACCTGG CACACATTAT TACATTTGCA CCTTCACAAG TCATTGTCAA  ATTGGTCAGA AGTTAACTAT TAATGTCTCC GCCTCCGCCA CCGCCACGTC ACCTCCATTA ACTACTCCTA CAACACCAGC GTCTCCACCT ACCACCACTC CTCCATCATT GACTCCAACA  ACACCCACTG AATTACCATG TCCCCCCACC TCATCTCCGA CTTCCAGCCC GTTATCGCCA CCAACCTTCA CCACCGGCAA CACTACACCA ACACCTAATA GTGCAGCTCC ATCCTTTACG 
GCTGTGGTGC CTGCCGCTTT GATGGCAATT GGCTTAGCTT TTTTGAATTT TTAA 

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