Entry information : EgrPrx[P]188
Entry ID 13731
Creation 2016-05-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-19 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-05-19 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: EgrPrx[P]188
Name EgrPrx[P]188
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus grandis    [TaxId: 71139 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EgrPrx[P]188
start..stop
S start..stop
EguPrx[P]188 335 7e-120 1..184 1..186
EcamPrx[P]188 238 2e-81 8..184 1..204
EglPrx167 209 2e-69 33..184 69..222
EgrPrx167 207 1e-67 33..184 167..320
Literature and cross-references EgrPrx[P]188
DNA ref. Phytozome 11:   Chr11 (151192..155560)
Protein sequence: EgrPrx[P]188
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   180
PWM (Da):   %s   19486.48  
PI (pH):   %s   4.45
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
LEAKDILEIG EAMLVINYI* VKTIGIGLLY TEPKLNLSDL ITAFTNKGFT AQEMVALSGS HTIGEARCTT FRDRLYNESN MNSSFAAPSK ANCPSSRGDD SLSPRNVTSP TSFDNG*FWK 
SQKGLLHLDQ QLLEGGSTDD HVTDYSDNLG LF*NDFAAAM D*DGFLSPLT GSSSQIRMNC REVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic (frame and stop codon in frame).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTGAAGCAA AGGACATCCT TGAGATCGGG GAAGCCATGC TGGTAATTAA TTATATCTAA GTCAAAACAA TTGGTATCGG GCTGTTATAC ACGAAAAGTG CCTAGTATAG TTGACATATA  CGTGCAATAT ATGTGCCATG TATGTGCAAT ATACGTGCAA TCTTGAAAGA TAAGGATAAT TAACATAAAT ATCATCAAGA CATTGTTAAT GTAACCATAA AATTATTTTA ACCTAGTAAT  GGTGCAAGGG CAGCCACACA TTTGCTTGAT CGCATCGACC TCTACCTCGA CACAATTGTC CGAGGAGAAC TACTACACAG CAAAGTGCCC AAAGGCACTT GAGACCGTGA GATCCAACGT  GAAGGCGGCG ATGGCCAAGG AGGCTCGCAT GGGAGCATCC TTGCTCCGAC TTCACTTTCA CAACTGCTTC GTCAATGTAA GTGTCTTTCA CTTTCTAGCT CTATTCAACC CGTCTTCTTT  TTTTCATCTA ATATTAACGA AAGTTATTTT TAATTTGTTT TAGAGGGATG TGATGCATCC ATTCTACTAG ACGATACAGC GAACTTCATC GGGAGAAGAC GGCCCTTCCC AATGCAAACT  CCGTGAGAAG ATTCGACTTG ATCGACACCA TCAAGTTGGA AGTAGAGAAG TTATGCCCTG GTGTTGTCTC GTGCGCTGAC ATCTTAGCCA TTGCCGCTAG GGACTCTGTT GTCACGGTAA  GTGCCAACCC TTGAAATTTC TTGAAACATC CACAGAGGCT ATTATTTTTC CTGAACTTAT TTGGATTCAA TTTTTGATGT GTAGTTGGGT GGACCGAGTT GGCAAGTTTA GCTCGGAAGA  AGGGATTCGA CCATGGCGAA CGGAAGTGCT GCTAATACCA ACCTTCCATC TCCAAAGCTA AATCTCAGCG ACCTCATCAC CGCTTTCACC AACAAAGGGT TCACTGCCCA AGAAATGGTG  GCACTCTCAG GATCTCACAC CATAGGCGAG GCTAGGTGCA CGACATTCCG AGACCGGCTC TACAACGAGA GTAACATGAA CTCGTCATTT GCCGCTCCTT CGAAAGCCAA TTGCCCCAGC  TCGAGAGGCG ACGACAACCT TTCCCCTTCC ACGTCCTTTG ACAATGGCTA CTTCCGGAAC TTGGTGAGCC AAAAGGGCTT ACTCCACTCG AACCAGCAAT TGTTCAGTGG AGGTTCGAAG  AATGCTCAAA TGACTGCCTA CAGCAAGAAC TTTGGCTCAT TTCAGAAAGA TTTTGCCAAG GCTGTGGTCA AGATGGGTGG CCTTAGCCCT CTCACCGACT ATCCCAGCTT AATTTTCGAA  AATTAATTAA TTAATTACAA AAATTATTAG ATAAATGCCA TAAATCTAAT TTAGGCCTAT AATGCCTAAT TGGACGTCGA AACAGACCCA AAAAATTTCC AAGATTCGTT CAATAAATAG  TAGAGCGTGT CTACTAGCTA ACTACACTAA CCAATTGCCT AACATGCATT GATAAAGCAC TAATTTAATT ACTCTACTCT AATATATCCA CATAATTGCA TTTAATTAAA TCTAAACAAC  CCCTAAGCAT CATTAGCCTA CTAAGTGAGG ATTAGTGAGC AAAACTCACT TGATTAATGA GCGGGTCGGT ATGAAATTTC GGGAATGTGA TGGAGACCGA CTATCCTCAA GGCAGGCCAA  GCAACCAAGG CTCAGGATCA CCTCAAAACG GGCTTGGAAG CTTGCTGGAA ACCACTTTTC TGTTCTCTAT TTGCTACTAG TTGAGAGTCA ATCCGAGGCC GGTTGAGGCG AGCAAGGGCT  GATGATGCTG CAGCAAGGTT GAGCGGCCAA CGGTGGGGCT CGGCGGGGCT TGGACAACGA TGGACAGTCT CCAATTGGGC TGAGGACAGC CATGGGACAC ATGGGCAGAG GCAGACGGGG  ACGGTTGGGC GCAGTGGCAC GCGAGCGGAC GGCGGAGTGC ACGGGCGGCG AACGGCGACG GTGGCGGCGT GCAAGCAGCT CCTGCTGTCT CCGGCAGTAT TGCTGGCTTC CTTGGTTGCT  GTGGCGTCGA ACAGTAATGG AGAGAGAGAG GAAGGAGTGA GGAACATGCT TGGCTTTAGC AGGGTCTCCT TGGCCAATTC TTCTAATGCT TTGTCCCTTT GACTCTTCCT TGGCCTAGTG  TTGTCCCTTG GCCCTCCTTC AGCCAACAAG GCCTCCATAT AGAAACTTAT GGCGGTCCAA ATGTTGAGGG TGGTGGAGGC ATATGAAATT CCAAGCAAAA AGGCTTCAAT TGGACACCCA  TTCGTGCTTA ATTCAATCTA ATTCGGCCTC AACAAATCCC GTCATCGAGT CAATACTCAA TCTAGTATTT TTCCTCACCC ATTGAACCAT CTTGCATCCC AATTTCATGA TAAAAAACGG  TCCCGCCTTT TTTCCGAACA AAAACGGCCC TAGAACGACT TTTTCCCAAA AAGTCTCGGG TTACAGAAAA ACCTTCTGAG ATTGAGTCGA CGTTCCTAGA ATTTATTGTG ACATGACAGA  ATCTTCAATT TTCGAAATTA GACTGAATTT CGTAGTTAAT TTCACTCAAG CGCGTTTTTA ACGTGACTTA AGCTATCGGG TAGTTTTTAG AAATTTTTAG TGCAAATGAC CCGTGATCGA  TTTTTTTCGA GCCACAATAA ACCCACTCGA CACATTGGCT ACTCTCGGTT GTCATGAAAA TCTCGAGGAT TCAAATACGA ACAAAGGGTA CCAAAACGAC AGAAGAATCA GTCTAGGGCT  GCTCAACGAG AATTTTCTAA TTTAGTGGAG TCACCCATGA TTAGCCACAT ATCTTAGTCG AGTTGACATA TCTCTGTTCT CAAATCAACT TTTAACTGTG TCATAATGGC CTCTAAGGAT  GAGCACAGTC TTGAAGCCAA TTCCTGGTCA AATTCTCAAT CCATCGCATT AAAATTCTTT AACAGCTTCC CTGGATAGTC TAATTATCTC AAAAGTGATC AGCTCTGAGA ACAACCCTAT  AGGCGCGTCG ATGAAATGTC TGATTTATTC AATAAAAAAT AGAAATGAAA ATTTGGGATG TCACAATGAT CCTATCATAA TTTGTCCATA GTTCTCCTAT AAATACCACC GGTCGAAGCT  CATGAACAAT CCAAACCAAC GCACGACACT CATCTAAAGA GCTCTCCCTT GTCTCCCTCT CTTTCCCATC TAACTAGCCC CTTCAGTAAT GTCCCCCGAT ACGCCCCAGA AACTATGCTA  TCACAATTTG GATAGGACCA TATATGACTC CACTCAAATC CGATCCGATC CACTCATTTG ACAAATGCAG GGGAAAATTG TTCGGGCTAT AACAGGAGCC ACTAGACACG TGGCGATCAA  TGAGCGGAGA AAACTACAAC TTACGTGGAA GTCCAAGACT ACACCATGTT TTTCTCGCTA AGGGAACCGA ACTTTTGAAA CATTGACCAT TGAGATGCGG GAAAAAGATG TCGCCACTCT  CATTTTCTGA AAAGGCTTCC TGAGAAAGCC AGGGAGACAG AGCCCACCGG AACCGAACCG AGCAAAAAAG GAGGAAGAAG AAGGCCAACA AGCTTGGTCT CGCCCGCCCA TGGAAGCGCA  GCTCCTGATG CCTTGTCCCC TACATTTATA CTCCCCAGGC ATGCTCAAAG TTCCCGACTT GACCGCCACC ACCACCACCA CCACCACCCA TCATCGAAGC AACTCCACCG TCGTTTTGCC  AAATCTCTCA TCAAAAGAGC TAATATGTGC AATGTATGTG CCATGTACGT GCAAGATACG TGCAATCTTG AAAGATAAGG ATAATTAATG TAAATATCAT CAAGACATAG TTAGTATAAC  CATACAGTTA TTTTAACCTA GTAACAGCGG TCACACATTT CACTTTAGAT GGAAAGGGGA CCCAATACAA CCTAGAAACT GTGCTTCCTC TTTTTCGTTT GCTTGATCGC ATCGACGTCC  GCCTCGACAC AATTGTTCGA GGAGAATTAC TATGCAGTAA AGTGCCCGAT GGCGCTCGAG ACTATGAGAT CCGCCGTGAA ATCAGCGGTA GCCAACGAGG CGTGCATGAA AGCATCCTTG  CTCTGCCTTC ACTTTCATGA CTGCTTTGTC AATGTAAGTC TCTCCCCTCG CAACGTCACA AGTCCTACAT CCTTTGACAA CGGCTAATTC TGGAAGAGCC AAAAGGGCCT ACTCCACCTG  GACCAACAAT TGCTCGAGGG AGGTTCAACA GACGATCATG TGACCGACTA CAGCGACAAT TTGGGTTTAT TCTAAAACGA TTTTGCTGCT GCCATGGACT AAGACAGGAT TCCTTAGCCC 
TCTCACCGGG TCTAGCAGTC AGATAAGGAT GAATTGCAGG GAGGTCAAT 

Retrieve as FASTA