Entry information : AtFSD01 (AT4G25100|ATFSD1)
Entry ID 13736
Creation 2016-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-10-20 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtFSD01 (AT4G25100|ATFSD1)
Name (synonym) AtFSD01 (AT4G25100|ATFSD1)
Class FeSOD    [Orthogroup: FSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtFSD01
start..stop
S start..stop
ThasFSD01 361 3e-129 1..210 1..210
AtFSD02 302 1e-104 1..212 43..271
HaFSD03 295 2e-102 2..210 41..251
ThasFSD02 282 2e-96 2..209 47..271
Literature and cross-references AtFSD01 (AT4G25100|ATFSD1)
Omic ref. AtProteome:   At4g25100 ATTED-II:   At4g25100 e-FP Browser:   At4g25100 ePlant:   At4g25100 TAIR:   At4g25100
Protein sequence: AtFSD01 (AT4G25100|ATFSD1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   213
PWM (Da):   %s   23775.96  
PI (pH):   %s   6.51
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAASSAVTAN YVLKPPPFAL DALEPHMSKQ TLEFHWGKHH RAYVDNLKKQ VLGTELEGKP LEHIIHSTYN NGDLLPAFNN AAQAWNHEFF WESMKPGGGG KPSGELLALL ERDFTSYEKF 
YEEFNAAAAT QFGAGWAWLA YSNEKLKVVK TPNAVNPLVL GSFPLLTIDV WEHAYYLDFQ NRRPDYIKTF MTNLVSWEAV SARLEAAKAA SA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATTTTTTTTT TTTTTAATAC CGGATTGGCT GATCCACTTA TGATGACTCA AATGTTATTA AGTTTCAAGA CAATTTATGA TGACACAAAT CACAATGAGT CAATAGTAGC CACGAAGCCA  GAAAAAAAAA ATGTACTACA AAAAGATAAT GATAGTACAA AATGATACGT CGTACTGCCA CATGTACGAC ACAACTCGAT TACCAAAAAG CAGAGCCATC CAACCATAAA ACTCAAAACA  CACAGATTCC ACTGGCGTGT GCTCTCCTCA CTTCACTCGT CCTTGAAACT TGAGGTACTG ATTCTATCTC TCATCCACAT CTTAGTTCAT GTTCGAGTTT CTCTGGTCTC TTACTCTTTC  ACCTAGAAAT TTGTTTGGTC TCCCAACAAC ATAAACGCAT GTATACATTT TCATGTGTCT TTGTAAGGAT ATTGATTCAT TTTTTTGGGC AAATAGATAA TCAATTCAAT GCTATGTTTT  GTCTGAAATG TGCAGCTTCA ATTACAAAGA ATGGCTGCTT CAAGTGCTGT CACCGCAAAC TACGTCCTCA AGCCACCTCC ATTCGCACTG GTACTTTCTT ATGATAAAGA TTGATATTGT  CGGCAAATGT CATTTTGTTT TCGTTGGACT ATAGATTTTG CTTTTCTATT ACTAGATGAT ATAACTTGTT GCTCCCACAA AGCCCTAAAA ATATCTTTTC ATCCTCGTCA AAGGCGTTAC  AAATGATTTT CAGCTATTAT TAACGGAAAA CCAATACCAA AAAGGCGTTA CAAATGAACT CCTCTAATTC ATATTTGAAG AAAATAAAAA TCGAATCAAT CTACGCATTA GTGTTTTTCC  CGGAAATTAA TTGTAGGAAC GGGTCAAGTT GGGTGGTCCA TATTGGGTAA AGGCCGTGAA TGTTCTAGTT GGTACGTACT ATCCGACATT TGTCAAATGG GAAATTTGGG TATGGCCATA  GGGGTTAGGT ATGGGTCAAC ATATCTGAAA TGATTTTGAA ACCATAGCTT TCATAGAACA TTGATTCTTA ATTGACCCTC AATTGAACTA GTGAAAATTT GTTGTTTTTG TATACAAAAA  CTATCTCAAT CTGACCCGTT ACTCAAACTA CACTAAACTG TCCAAATCAT ATTACTTTGT AAGAAAATTG TTACGTTGTG TAATGTCAAT GTTAGATTCA TAAATCTTTA ACTAGTATAT  GACCACTCCT AGTTCAAATT CAGATGTTCC TTGGTCTGAT ATTTTCGTTC CTTCTAGTGG ACCTATTGGT TGAGTCATGA GTGAGAGCAA TAGCCAATAT GATGAAATGT TTTTTTGATA  TAAAATTGGA AAGGATGCTT TGGAGCCGCA TATGAGCAAA CAAACTCTGG AGTTTCACTG GGGAAAACAT CACAGAGCTT ACGTGGACAA CCTCAAGAAA CAGGTTCTTG GAACCGAGCT  TGAAGGCAAG CCCTTAGAGC ACATTATCCA CAGCACTTAC AACAATGGTG ATCTCCTCCC TGCTTTCAAC AACGCTGCTC AGGTGATAAT TAACAAACCT ATTTTTAGTT TGAGATTATA  AAATGGGTGT GTGATTGGTT AGCTGATGAT CCATTGGTTA TGTTTATAGG CGTGGAACCA CGAGTTCTTC TGGGAGTCAA TGAAACCAGG TGGTGGAGGA AAACCATCAG GAGAGCTTCT  TGCTTTGCTT GAAAGAGATT TCACTTCTTA TGAGAAGTTC TATGAAGAGT TCAATGCTGC TGCAGCCACT CAGTTTGGAG CTGGCTGGGC CTGGCTTGCT TGTAAGTGTT TCAAATGTTT  AAGAGCTTTA GATAAATATA TTAACTTCTT CCTTACTCTT ATCTCAATGC TTTCAGATTC AAATGAAAAA CTCAAAGTAG TGAAAACTCC CAATGCTGTG AATCCCCTTG TGCTCGGCTC  TTTCGTAAGT TTTTCATTAA GGAACTTGAA TACACAATTT ACTTGATTAA ATATCACCGT AGAGTTAATG CAAATCCTTA ACTTTTAATC TTGGTTAATT TTCTTGCAGC CATTGCTTAC  CATTGATGTC TGGGAGGTAA ATAAACACTT TTATAGCTTG TTTGTCTTAA AACCTATTTT CTTTCTTACA AATTTTATTG ATAATTTTTG TTTTCTTTTG CTACATGAAC AGCATGCTTA  CTACCTTGAC TTCCAGGTAA CAGCTTATTC ATAATTGTTA GCAACAAGGT TTTCTTGAGT TTCTTTGTGT TGTTGATTGT TTCAATCTAT TTGTATATGA GCAGAACCGA AGACCAGATT  ACATAAAGAC ATTCATGACC AATCTTGTGT CTTGGGAAGC TGTAAGTGCC AGACTTGAGG CCGCCAAGGC TGCTTCTGCT TAAGCAAATT TCTGAACAAT TTGACTTCAG TGACAGTGAG  TTCTGCATCA CCGAAGTCTC TTATAAAATA TTGGTCGCTG TAATAAGGAC ACAGCTCTCT TGTTGTGTAT GTGTCACAGA GTTCTTCATT TTGCTTGTGT AATGAACAAT TAAACATGCT  CTTTTCTGAG TGTGTGTGCG TTTTGTGTGT GTCAAGTTTT TCATCGTCTC CTTTATTAAA CTCAAATTGG CACCTACCAT CAGTAATTCA TAGTTTGGCA TGGCCCATTA TTCAATTGGA 
CATTTATAGT TGTAATAACG TGGATGCCCC TGTCCCATTA AAAAATCACA ATTCATCACC ATAGCTGTTA AC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCTT CAAGTGCTGT CACCGCAAAC TACGTCCTCA AGCCACCTCC ATTCGCACTG GATGCTTTGG AGCCGCATAT GAGCAAACAA ACTCTGGAGT TTCACTGGGG AAAACATCAC  AGAGCTTACG TGGACAACCT CAAGAAACAG GTTCTTGGAA CCGAGCTTGA AGGCAAGCCC TTAGAGCACA TTATCCACAG CACTTACAAC AATGGTGATC TCCTCCCTGC TTTCAACAAC  GCTGCTCAGG CGTGGAACCA CGAGTTCTTC TGGGAGTCAA TGAAACCAGG TGGTGGAGGA AAACCATCAG GAGAGCTTCT TGCTTTGCTT GAAAGAGATT TCACTTCTTA TGAGAAGTTC  TATGAAGAGT TCAATGCTGC TGCAGCCACT CAGTTTGGAG CTGGCTGGGC CTGGCTTGCT TATTCAAATG AAAAACTCAA AGTAGTGAAA ACTCCCAATG CTGTGAATCC CCTTGTGCTC  GGCTCTTTCC CATTGCTTAC CATTGATGTC TGGGAGCATG CTTACTACCT TGACTTCCAG AACCGAAGAC CAGATTACAT AAAGACATTC ATGACCAATC TTGTGTCTTG GGAAGCTGTA 
AGTGCCAGAC TTGAGGCCGC CAAGGCTGCT TCTGCTTAA 

Retrieve as FASTA