Entry information : HaFSD03 (HanXRQChr08g0223341)
Entry ID 13746
Creation 2016-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-12-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaFSD03 (HanXRQChr08g0223341)
Name (synonym) HaFSD03 (HanXRQChr08g0223341)
Class FeSOD    [Orthogroup: FSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaFSD03
start..stop
S start..stop
HaFSD01 403 1e-143 3..255 1..270
HaFSD02 338 1e-119 50..255 2..199
AtFSD02 318 3e-110 25..248 28..266
ThasFSD01 300 1e-104 41..252 2..211
Literature and cross-references HaFSD03 (HanXRQChr08g0223341)
Protein sequence: HaFSD03 (HanXRQChr08g0223341)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   255
PWM (Da):   %s   28476.46  
PI (pH):   %s   6.23
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVMASVTTIA SHLTSTFLYA PEFCRLSQSL HTSQRPCTRK SVSGTISANI DLKPPPYALD ALEPHMSKET LEYHWGKHHR GYVNNLNKQI EGTELDKMSL ESIILASHNK GDILPAFNNA  AQVWNHEFFW ESMKPGGGGK PSGELLELIN RDFGSFEALI QEFKLAATTQ FGSGWAWLVY DLEDKKLVVL KSSNAINPLV LGSYPLLTLD VWEHAYYLDF KNLRPDYIST FLDKLVSWDA 
VSSRLEAAKV SIEGK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Prediction confirmed with EST from Helianthus exilis
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGTGACTTGT ACTACTATAT CAATTACCGG TCTTTCAAAC CCATCCACAT CCCAACTATC CTCATTCTCC TTACAAACAA CCTCTGCTGC TGCAGAAACA TGGTAATGGC GTCTGTCACC  ACAATCGCTT CTCATCTAAC CTCCACCTTT CTTTACGCTC CAGGTTTGGT TTTACCACTC TTTACTCTTA TCTATATATA TGACAGTTAA TAGTTTCTGG CTTTTGTTGA ATAATTAAAT  TTGGACCAAT TACAGAATTC TGTAGATTGT CTCAGAGCTT ACACACGTCA CAGAGACCGT GTACTAGAAA ATCTGTTTCC GGGACAATAT CAGCCAACAT AGATTTGAAG CCACCTCCTT  ATGCATTGGT ATGAGTAACA TGTACTATAC AGGGATGACA AACGATCCCG AAACCAGTGG GGATACCTGA AACATTTGGT ACGGGTAATA TAATGGGTGT TCGGGTATGT GATTAGTTTA  AAAAAAATTA GTGGGTATGA TATTATTTCA TTCACATCCC TTCCATCTTT TTTACCCTAT AATTTCTCTA AAAACAACTA TATTTTCTCT CTACTTTTGA TTAAATAATA TTTTTATACT  TTTCTGATTC CTTTTTTGTC TTTCCTTCAC TTAAAACCAC TTTCAAAATA TATTAAAAAA TTATAGAGAA ATTTACAGAT GAACAATAAC ATTTTCTGTG TCATCTACTC ACAATCACTT  CCAACCACCT ATAGTCACTT TTCATAATAT AAAAAGTTCT CTCACAGAAT TTGAGTACGG ATTGTGAATG CACGTAGGCG CTATCAGCTT GATTACCTGC AAACATTTTC CTTTAATTTA  GGTAATAAAT AATCAACTAA TTCACTAACT TTTTAATTTT ATATTTATAA TTTCATTGGG TGGTAATATT ATATAAAAAA TAAAATATTA AGAAACCCAT GTGGAAATCC TAATGGGTAA  GTTTTAACAA ACTAATATAG CTTAAATAGT TCAATTGCTT CGATCTGTAA ACTGTAATTA ATATATATTC TATATATTTC ATGTTGTATG TATGGTAGGA TGCTCTGGAA CCACACATGA  GCAAAGAGAC ATTGGAATAT CATTGGGGAA AGCACCACAG AGGTTATGTC AACAATCTAA ACAAGCAAAT TGAGGGAACT GAATTAGATA AAATGTCATT AGAAAGCATA ATATTAGCGT  CACATAATAA GGGTGATATT CTTCCAGCCT TCAACAATGC TGCACAGGTT TGGAACCATG AATTTTTCTG GGAATCTATG AAACCTGGTG GTGGTGGAAA GCCTTCCGGA GAGCTTTTGG  AATTAATAAA CCGAGATTTC GGTTCATTTG AAGCGCTAAT TCAAGAGTTT AAGTTAGCTG CCACTACTCA GTTTGGTTCG GGTTGGGCTT GGCTTGTATG TAAGTGTTTG TTCCATCAGA  TCTACAACCA GAAATTGGAA CCCATTTTTT TCAATGTTTA TTTTTGTGTA GATGACTTAG AGGACAAGAA GCTTGTTGTG CTGAAGAGCT CAAATGCAAT TAATCCTCTT GTGTTGGGGT  CTTATGTGAG TAGACAATAA TATTATGTTC TTTTAGTTAT CTTGGTTTTA ATTCATGTAT CAACCCATAG TTATTGATGG CGAATAGTGA CAAATAGCGA TAAGGTACCC ATAGTTGTTA  ATGGCGAATA GCTACATGAC GAATAACGAT AAATAGCGGG CGACTATTTT ATAAATAGCG ATACACTAAA AAAATTTAAA TGTTTGAGTA AACTGCCAAA ATGGTCCCTG GGGTTTGGTC  CCTTTTGTCA CTTTAGTCCA AAACTCATAC CTTTTGAATA TGGGTCCCTG TGGTTTCAAT TTTGTTGCCA TTTTCATCTA AAAGCAAAAT CTGGTCAGAT TTTTTAGTTA ACATCTAGTT  TTTTTTGTCT TTTTTCTCCC TTTTAATGAA GGGCTAAATG GTCAGATTTT TTAATATGTT ATAATAAAAC ATTAAAAGTT GTATGTTAAC TGAAAAATCT GACCAAATTT TGAGTTTGGA  TGAAAATGGC AACAAATTGA AACCACAGGG ACCTAGATTC AAAAAGTTTG AGTTTTGGAC TGAAGTGGCA AAAGTGACCA AACCTCAAGC ACCATTTTGG CAGTTTACTC AAAATATTTT  ACATGTTTAT TTAACAAAAT CATATAATCC AGCTATTTTA TAGCTATATT TAATTGCTAT TTAAATTTAA AAAAATATAA TTGTCGCTAT TCTCGCTATA ACCCTAATAG CAACACGGCA  TCAGTTTGCT ACGTAGCGCG CTATAGCGAT CGCTATAGCC GCTATTAACA ACTATATATT AACCCTGTGT TATATTTATT GTACATCATA CAGGGGTTAT GTATGTATAT AATCTAATCT  AACAACTATT TTTTCTTTCC TTTGAATTTC TAGCCACTCC TCACCTTAGA TGTTTGGGAG GTAATTACAT CTCTTCACTT TCATTTTCAA CAACAAATAG ACCATACATA TAATATATGT  CCATGACATG TTAACTAACA TCAATTTGGA TCTGAATTGT AATTGCAGCA TGCTTACTAC CTGGATTTTA AGGCAAGAAC TTGCTATTTT CATACGCGAA GCACATTTAT ATATACAGGG  GGTGATTGGA TTTGCGATAT AAACTGGTTA ATTGGTTTCA TATTTGCAAG ACAAAAATCA TTATTTAAGA AATGTTAAGA TCATACATTT TCCCACATTT TCATTCTTAA TCATATTTCT  AACATAACAT GTTAGAATTA TATAAGCTAA ATATTTTCGA AACTTCATTA AGGAAATAAT TTCTAAAAAA AATACTAAAG TTTGTTCAAA GTCTTTAAGT TTGAATACTT CAACAACATA  TAAAAAGGTC CATTTTGGTC GTTTTATCTA TTACTTCATT TGTGAAACAC TAGTACAAGT GTACAACTAT TTTTTCACAG CTTCAAAAGG TTTGAAGAAA ATCCAACCAC TATGATAGTG  GATTATTCAG CAATCAGCAT CAGATAATCA GTTTCAAAGT GCATGTCCAA ACACCCTCTT TCACCATATG TATAAACAAG TTGATCCTTT AGCCTATCTA ATGTTTGATT AGTGTCACAA  TAACGGTATT AAAATTTAAT GTTCATTACA GAACCTCAGG CCCGATTATA TATCAACTTT CCTCGATAAG CTTGTATCAT GGGATGCGGT GAGTTCCAGG CTCGAAGCAG CCAAGGTTAG  CATTGAGGGA AAGTGAAATG GAGGCAATTG ATGCAATGCG TAACACTGCT GCAAAATAAC CAGGGAAGGA ATTGGTGCTG ATGATTTTCT GGATTGATTT TGGTGTTACA TGATTGTGGT  TTTGTATCGA GGTTGAATGA TGATTTCGGT TTAATTAATG TAATTTTATC CTTACTAACC TGGGTCAAAA TAGTAATGTG TTTGTATTGC TTATAGTTAG ATATATATTA TAGCCTAGTG  GTAAGAGACA AAGCTTCTTT GGAGAAGACC CAGATTCAAA TCTGGGCAAC GTGAAATTTA GCCGTTCAAA AAAAAAAAAG TTAGATGTAT TTTTGATGGT CTGATACTTA TGATCAATAA  TTAGATCATG ACCTTTACAA TGAAAATCTT GTTGGCCTCA TAATTTTTTT GATCTAGCTT GAAAGAAAGT TCTAGAGTGT TGGTGTAAAA ATTAGAAATA ATGTTTTATC GTGAGTTAAT 
AACCTGTGCA AAGTCTAGGT GTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTAATGG CGTCTGTCAC CACAATCGCT TCTCATCTAA CCTCCACCTT TCTTTACGCT CCAGAATTCT GTAGATTGTC TCAGAGCTTA CACACGTCAC AGAGACCGTG TACTAGAAAA  TCTGTTTCCG GGACAATATC AGCCAACATA GATTTGAAGC CACCTCCTTA TGCATTGGAT GCTCTGGAAC CACACATGAG CAAAGAGACA TTGGAATATC ATTGGGGAAA GCACCACAGA  GGTTATGTCA ACAATCTAAA CAAGCAAATT GAGGGAACTG AATTAGATAA AATGTCATTA GAAAGCATAA TATTAGCGTC ACATAATAAG GGTGATATTC TTCCAGCCTT CAACAATGCT  GCACAGGTTT GGAACCATGA ATTTTTCTGG GAATCTATGA AACCTGGTGG TGGTGGAAAG CCTTCCGGAG AGCTTTTGGA ATTAATAAAC CGAGATTTCG GTTCATTTGA AGCGCTAATT  CAAGAGTTTA AGTTAGCTGC CACTACTCAG TTTGGTTCGG GTTGGGCTTG GCTTGTATAT GACTTAGAGG ACAAGAAGCT TGTTGTGCTG AAGAGCTCAA ATGCAATTAA TCCTCTTGTG  TTGGGGTCTT ATCCACTCCT CACCTTAGAT GTTTGGGAGC ATGCTTACTA CCTGGATTTT AAGAACCTCA GGCCCGATTA TATATCAACT TTCCTCGATA AGCTTGTATC ATGGGATGCG 
GTGAGTTCCA GGCTCGAAGC AGCCAAGGTT AGCATTGAGG GAAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGTGACTTGT ACTACTATAT CAATTACCGG TCTTTCAAAC CCATCCACAT CCCAACTATC CTCATTCTCC TTACAAACAA CCTCTGCTGC TGCAGAAACA TGGTAATGGC GTCTGTCACC  ACAATCGCTT CTCATCTAAC CTCCACCTTT CTTTACGCTC CAGAATTCTG TAGATTGTCT CAGAGCTTAC ACACGTCACA GAGACCGTGT ACTAGAAAAT CTGTTTCCGG GACAATATCA  GCCAACATAG ATTTGAAGCC ACCTCCTTAT GCATTGGATG CTCTGGAACC ACACATGAGC AAAGAGACAT TGGAATATCA TTGGGGAAAG CACCACAGAG GTTATGTCAA CAATCTAAAC  AAGCAAATTG AGGGAACTGA ATTAGATAAA ATGTCATTAG AAAGCATAAT ATTAGCGTCA CATAATAAGG GTGATATTCT TCCAGCCTTC AACAATGCTG CACAGGTTTG GAACCATGAA  TTTTTCTGGG AATCTATGAA ACCTGGTGGT GGTGGAAAGC CTTCCGGAGA GCTTTTGGAA TTAATAAACC GAGATTTCGG TTCATTTGAA GCGCTAATTC AAGAGTTTAA GTTAGCTGCC  ACTACTCAGT TTGGTTCGGG TTGGGCTTGG CTTGTATATG ACTTAGAGGA CAAGAAGCTT GTTGTGCTGA AGAGCTCAAA TGCAATTAAT CCTCTTGTGT TGGGGTCTTA TCCACTCCTC  ACCTTAGATG TTTGGGAGCA TGCTTACTAC CTGGATTTTA AGAACCTCAG GCCCGATTAT ATATCAACTT TCCTCGATAA GCTTGTATCA TGGGATGCGG TGAGTTCCAG GCTCGAAGCA  GCCAAGGTTA GCATTGAGGG AAAGTGAAAT GGAGGCAATT GATGCAATGC GTAACACTGC TGCAAAATAA CCAGGGAAGG AATTGGTGCT GATGATTTTC TGGATTGATT TTGGTGTTAC  ATGATTGTGG TTTTGTATCG AGGTTGAATG ATGATTTCGG TTTAATTAAT GTAATTTTAT CCTTACTAAC CTGGGTCAAA ATAGTAATGT GTTTGTATTG CTTATAGTTA GATATATATT  ATAGCCTAGT GGTAAGAGAC AAAGCTTCTT TGGAGAAGAC CCAGATTCAA ATCTGGGCAA CGTGAAATTT AGCCGTTCAA AAAAAAAAAA GTTAGATGTA TTTTTGATGG TCTGATACTT  ATGATCAATA ATTAGATCAT GACCTTTACA ATGAAAATCT TGTTGGCCTC ATAATTTTTT TGATCTAGCT TGAAAGAAAG TTCTAGAGTG TTGGTGTAAA AATTAGAAAT AATGTTTTAT 
CGTGAGTTAA TAACCTGTGC AAAGTCTAGG TGTAA 

Retrieve as FASTA