Entry information : HaFSD03 (HanXRQChr08g0223341)
Entry ID 13746
Creation 2016-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-12-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaFSD03 (HanXRQChr08g0223341)
Name (synonym) HaFSD03 (HanXRQChr08g0223341)
Class FeSOD    [Orthogroup: FSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaFSD03
start..stop
S start..stop
HaFSD01 403 1e-143 3..255 1..270
LeFSD03 344 5e-121 5..248 2..247
HaFSD02 338 1e-119 50..255 2..199
LeFSD02 333 7e-116 3..245 1..259
Literature and cross-references HaFSD03 (HanXRQChr08g0223341)
Protein sequence: HaFSD03 (HanXRQChr08g0223341)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   255
PWM (Da):   %s   28476.46  
PI (pH):   %s   6.23
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVMASVTTIA SHLTSTFLYA PEFCRLSQSL HTSQRPCTRK SVSGTISANI DLKPPPYALD ALEPHMSKET LEYHWGKHHR GYVNNLNKQI EGTELDKMSL ESIILASHNK GDILPAFNNA  AQVWNHEFFW ESMKPGGGGK PSGELLELIN RDFGSFEALI QEFKLAATTQ FGSGWAWLVY DLEDKKLVVL KSSNAINPLV LGSYPLLTLD VWEHAYYLDF KNLRPDYIST FLDKLVSWDA 
VSSRLEAAKV SIEGK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Prediction confirmed with EST from Helianthus exilis
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTAATGG CGTCTGTCAC CACAATCGCT TCTCATCTAA CCTCCACCTT TCTTTACGCT CCAGGTTTGG TTTTACCACT CTTTACTCTT ATCTATATAT ATGACAGTTA ATAGTTTCTG  GCTTTTGTTG AATAATTAAA TTTGGACCAA TTACAGAATT CTGTAGATTG TCTCAGAGCT TACACACGTC ACAGAGACCG TGTACTAGAA AATCTGTTTC CGGGACAATA TCAGCCAACA  TAGATTTGAA GCCACCTCCT TATGCATTGG TATGAGTAAC ATGTACTATA CAGGGATGAC AAACGATCCC GAAACCAGTG GGGATACCTG AAACATTTGG TACGGGTAAT ATAATGGGTG  TTCGGGTATG TGATTAGTTT AAAAAAAATT AGTGGGTATG ATATTATTTC ATTCACATCC CTTCCATCTT TTTTACCCTA TAATTTCTCT AAAAACAACT ATATTTTCTC TCTACTTTTG  ATTAAATAAT ATTTTTATAC TTTTCTGATT CCTTTTTTGT CTTTCCTTCA CTTAAAACCA CTTTCAAAAT ATATTAAAAA ATTATAGAGA AATTTACAGA TGAACAATAA CATTTTCTGT  GTCATCTACT CACAATCACT TCCAACCACC TATAGTCACT TTTCATAATA TAAAAAGTTC TCTCACAGAA TTTGAGTACG GATTGTGAAT GCACGTAGGC GCTATCAGCT TGATTACCTG  CAAACATTTT CCTTTAATTT AGGTAATAAA TAATCAACTA ATTCACTAAC TTTTTAATTT TATATTTATA ATTTCATTGG GTGGTAATAT TATATAAAAA ATAAAATATT AAGAAACCCA  TGTGGAAATC CTAATGGGTA AGTTTTAACA AACTAATATA GCTTAAATAG TTCAATTGCT TCGATCTGTA AACTGTAATT AATATATATT CTATATATTT CATGTTGTAT GTATGGTAGG  ATGCTCTGGA ACCACACATG AGCAAAGAGA CATTGGAATA TCATTGGGGA AAGCACCACA GAGGTTATGT CAACAATCTA AACAAGCAAA TTGAGGGAAC TGAATTAGAT AAAATGTCAT  TAGAAAGCAT AATATTAGCG TCACATAATA AGGGTGATAT TCTTCCAGCC TTCAACAATG CTGCACAGGT TTGGAACCAT GAATTTTTCT GGGAATCTAT GAAACCTGGT GGTGGTGGAA  AGCCTTCCGG AGAGCTTTTG GAATTAATAA ACCGAGATTT CGGTTCATTT GAAGCGCTAA TTCAAGAGTT TAAGTTAGCT GCCACTACTC AGTTTGGTTC GGGTTGGGCT TGGCTTGTAT  GTAAGTGTTT GTTCCATCAG ATCTACAACC AGAAATTGGA ACCCATTTTT TTCAATGTTT ATTTTTGTGT AGATGACTTA GAGGACAAGA AGCTTGTTGT GCTGAAGAGC TCAAATGCAA  TTAATCCTCT TGTGTTGGGG TCTTATGTGA GTAGACAATA ATATTATGTT CTTTTAGTTA TCTTGGTTTT AATTCATGTA TCAACCCATA GTTATTGATG GCGAATAGTG ACAAATAGCG  ATAAGGTACC CATAGTTGTT AATGGCGAAT AGCTACATGA CGAATAACGA TAAATAGCGG GCGACTATTT TATAAATAGC GATACACTAA AAAAATTTAA ATGTTTGAGT AAACTGCCAA  AATGGTCCCT GGGGTTTGGT CCCTTTTGTC ACTTTAGTCC AAAACTCATA CCTTTTGAAT ATGGGTCCCT GTGGTTTCAA TTTTGTTGCC ATTTTCATCT AAAAGCAAAA TCTGGTCAGA  TTTTTTAGTT AACATCTAGT TTTTTTTGTC TTTTTTCTCC CTTTTAATGA AGGGCTAAAT GGTCAGATTT TTTAATATGT TATAATAAAA CATTAAAAGT TGTATGTTAA CTGAAAAATC  TGACCAAATT TTGAGTTTGG ATGAAAATGG CAACAAATTG AAACCACAGG GACCTAGATT CAAAAAGTTT GAGTTTTGGA CTGAAGTGGC AAAAGTGACC AAACCTCAAG CACCATTTTG  GCAGTTTACT CAAAATATTT TACATGTTTA TTTAACAAAA TCATATAATC CAGCTATTTT ATAGCTATAT TTAATTGCTA TTTAAATTTA AAAAAATATA ATTGTCGCTA TTCTCGCTAT  AACCCTAATA GCAACACGGC ATCAGTTTGC TACGTAGCGC GCTATAGCGA TCGCTATAGC CGCTATTAAC AACTATATAT TAACCCTGTG TTATATTTAT TGTACATCAT ACAGGGGTTA  TGTATGTATA TAATCTAATC TAACAACTAT TTTTTCTTTC CTTTGAATTT CTAGCCACTC CTCACCTTAG ATGTTTGGGA GGTAATTACA TCTCTTCACT TTCATTTTCA ACAACAAATA  GACCATACAT ATAATATATG TCCATGACAT GTTAACTAAC ATCAATTTGG ATCTGAATTG TAATTGCAGC ATGCTTACTA CCTGGATTTT AAGGCAAGAA CTTGCTATTT TCATACGCGA  AGCACATTTA TATATACAGG GGGTGATTGG ATTTGCGATA TAAACTGGTT AATTGGTTTC ATATTTGCAA GACAAAAATC ATTATTTAAG AAATGTTAAG ATCATACATT TTCCCACATT  TTCATTCTTA ATCATATTTC TAACATAACA TGTTAGAATT ATATAAGCTA AATATTTTCG AAACTTCATT AAGGAAATAA TTTCTAAAAA AAATACTAAA GTTTGTTCAA AGTCTTTAAG  TTTGAATACT TCAACAACAT ATAAAAAGGT CCATTTTGGT CGTTTTATCT ATTACTTCAT TTGTGAAACA CTAGTACAAG TGTACAACTA TTTTTTCACA GCTTCAAAAG GTTTGAAGAA  AATCCAACCA CTATGATAGT GGATTATTCA GCAATCAGCA TCAGATAATC AGTTTCAAAG TGCATGTCCA AACACCCTCT TTCACCATAT GTATAAACAA GTTGATCCTT TAGCCTATCT  AATGTTTGAT TAGTGTCACA ATAACGGTAT TAAAATTTAA TGTTCATTAC AGAACCTCAG GCCCGATTAT ATATCAACTT TCCTCGATAA GCTTGTATCA TGGGATGCGG TGAGTTCCAG 
GCTCGAAGCA GCCAAGGTTA GCATTGAGGG AAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTAATGG CGTCTGTCAC CACAATCGCT TCTCATCTAA CCTCCACCTT TCTTTACGCT CCAGAATTCT GTAGATTGTC TCAGAGCTTA CACACGTCAC AGAGACCGTG TACTAGAAAA  TCTGTTTCCG GGACAATATC AGCCAACATA GATTTGAAGC CACCTCCTTA TGCATTGGAT GCTCTGGAAC CACACATGAG CAAAGAGACA TTGGAATATC ATTGGGGAAA GCACCACAGA  GGTTATGTCA ACAATCTAAA CAAGCAAATT GAGGGAACTG AATTAGATAA AATGTCATTA GAAAGCATAA TATTAGCGTC ACATAATAAG GGTGATATTC TTCCAGCCTT CAACAATGCT  GCACAGGTTT GGAACCATGA ATTTTTCTGG GAATCTATGA AACCTGGTGG TGGTGGAAAG CCTTCCGGAG AGCTTTTGGA ATTAATAAAC CGAGATTTCG GTTCATTTGA AGCGCTAATT  CAAGAGTTTA AGTTAGCTGC CACTACTCAG TTTGGTTCGG GTTGGGCTTG GCTTGTATAT GACTTAGAGG ACAAGAAGCT TGTTGTGCTG AAGAGCTCAA ATGCAATTAA TCCTCTTGTG  TTGGGGTCTT ATCCACTCCT CACCTTAGAT GTTTGGGAGC ATGCTTACTA CCTGGATTTT AAGAACCTCA GGCCCGATTA TATATCAACT TTCCTCGATA AGCTTGTATC ATGGGATGCG 
GTGAGTTCCA GGCTCGAAGC AGCCAAGGTT AGCATTGAGG GAAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGTGACTTGT ACTACTATAT CAATTACCGG TCTTTCAAAC CCATCCACAT CCCAACTATC CTCATTCTCC TTACAAACAA CCTCTGCTGC TGCAGAAACA TGGTAATGGC GTCTGTCACC  ACAATCGCTT CTCATCTAAC CTCCACCTTT CTTTACGCTC CAGAATTCTG TAGATTGTCT CAGAGCTTAC ACACGTCACA GAGACCGTGT ACTAGAAAAT CTGTTTCCGG GACAATATCA  GCCAACATAG ATTTGAAGCC ACCTCCTTAT GCATTGGATG CTCTGGAACC ACACATGAGC AAAGAGACAT TGGAATATCA TTGGGGAAAG CACCACAGAG GTTATGTCAA CAATCTAAAC  AAGCAAATTG AGGGAACTGA ATTAGATAAA ATGTCATTAG AAAGCATAAT ATTAGCGTCA CATAATAAGG GTGATATTCT TCCAGCCTTC AACAATGCTG CACAGGTTTG GAACCATGAA  TTTTTCTGGG AATCTATGAA ACCTGGTGGT GGTGGAAAGC CTTCCGGAGA GCTTTTGGAA TTAATAAACC GAGATTTCGG TTCATTTGAA GCGCTAATTC AAGAGTTTAA GTTAGCTGCC  ACTACTCAGT TTGGTTCGGG TTGGGCTTGG CTTGTATATG ACTTAGAGGA CAAGAAGCTT GTTGTGCTGA AGAGCTCAAA TGCAATTAAT CCTCTTGTGT TGGGGTCTTA TCCACTCCTC  ACCTTAGATG TTTGGGAGCA TGCTTACTAC CTGGATTTTA AGAACCTCAG GCCCGATTAT ATATCAACTT TCCTCGATAA GCTTGTATCA TGGGATGCGG TGAGTTCCAG GCTCGAAGCA  GCCAAGGTTA GCATTGAGGG AAAGTGAAAT GGAGGCAATT GATGCAATGC GTAACACTGC TGCAAAATAA CCAGGGAAGG AATTGGTGCT GATGATTTTC TGGATTGATT TTGGTGTTAC  ATGATTGTGG TTTTGTATCG AGGTTGAATG ATGATTTCGG TTTAATTAAT GTAATTTTAT CCTTACTAAC CTGGGTCAAA ATAGTAATGT GTTTGTATTG CTTATAGTTA GATATATATT  ATAGCCTAGT GGTAAGAGAC AAAGCTTCTT TGGAGAAGAC CCAGATTCAA ATCTGGGCAA CGTGAAATTT AGCCGTTCAA AAAAAAAAAA GTTAGATGTA TTTTTGATGG TCTGATACTT  ATGATCAATA ATTAGATCAT GACCTTTACA ATGAAAATCT TGTTGGCCTC ATAATTTTTT TGATCTAGCT TGAAAGAAAG TTCTAGAGTG TTGGTGTAAA AATTAGAAAT AATGTTTTAT 
CGTGAGTTAA TAACCTGTGC AAAGTCTAGG TGTAA 

Retrieve as FASTA