Entry information : AtGOX03 (At3g14415/GOX2)
Entry ID 13756
Creation 2016-05-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-31 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-05-31 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtGOX03 (At3g14415/GOX2)
Name (synonym) AtGOX03 (At3g14415/GOX2)
Class Glycolate Oxidase    [Orthogroup: GOX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtGOX03
start..stop
S start..stop
AtGOX04 696 0 1..373 1..367
HaGOX09 681 0 1..371 1..365
BstrGOX03 681 0 1..373 1..369
ThasGOX11 679 0 1..373 1..367
Literature and cross-references AtGOX03 (At3g14415/GOX2)
EST ref. GenBank:   CB264500.1 [5' end]   EG462474.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   19659077
Protein sequence: AtGOX03 (At3g14415/GOX2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   374
PWM (Da):   %s   40908.49  
PI (pH):   %s   9.17
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEITNVTEYD AIAKAKLPKM VYDYYASGAE DQWTLQENRN AFARILFRPR ILIDVNKIDM ATTVLGFKIS MPIMVAPTAF QKMAHPDGEY ATARAASAAG TIMTLSSWAT SSVEEVASTG  PGIRFFQLYV YKNRKVVEQL VRRAEKAGFK AIALTVDTPR LGRRESDIKN RFTLPPNLTL KNFEGLDLGK MDEASIDQIA NDSGLASYVA GQIDRTLSWK DIQWLQTITN MPILVKGVLT  GEDARIAIQA GAAGIIVSNH GARQLDYVPA TISALEEVVK ATQGRVPVFL DGGVRRGTDV FKALALGASG IFIGRPVVFA LAAEGEAGVK KVLQMLRDEF ELTMALSGCR SLSEITRNHI 
VTEWDTPRHL PRL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs. 3 transcripts are predicted but only At3g14415.2 is confirmed with ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATCA CTAACGTTAC CGAGTATGAT GCAATCGCAA AGGCGAAGTT GCCTAAGATG GTATATGACT ACTATGCATC TGGTGCAGAA GATCAATGGA CTCTTCAAGA GAACAGAAAC  GCTTTTGCAA GAATCCTGTG AGTTTTTCTT TTCTTAATAA GATAAGATAC ACTTTTTGTT ATTGGTTTTC ACAAGAGAAC TGAGTTTGAT GTACATAACT TGGGATGTTT TAACAGCTTC  CGGCCTCGGA TTTTGATTGA TGTGAACAAA ATTGATATGG CGACTACCGT CTTGGGGTTC AAGATCTCGA TGCCGATCAT GGTTGCTCCT ACTGCCTTTC AAAAGATGGC TCACCCTGAT  GGTAAAAGAC GTTTTTCTTT TTTCCTGAAA CAGTCATTTC TAGAGAGTTA AAACTTGTTT TAGTATCACT AGAGACAAAG ACTGAGGCTT ACTCTAATGG AAACTAATGC AGGGGAATAT  GCTACGGCTA GAGCTGCGTC TGCTGCTGGA ACCATCATGG TATGTTATTA TATTCAAAAG AAGATTTTAA CCGTCTTGGT GTTTATAGCT GCTTAATCCA CCAATCCATG CATAACCAAG  TTTCTGGTTT GAGTTATTTT CTTCCATGAT GTTTCAGACA CTATCTTCAT GGGCTACTTC AAGTGTTGAA GAAGTTGCTT CCACAGGGCC AGGAATCCGA TTCTTCCAGC TCTATGTAAG  TTGCTTGATG AACAATTCTG ATATACCTGT GGTCACACGT GATGGTTCAC ACGTTATGAT TGTTCTGAGT AGGTATACAA GAACAGGAAG GTGGTTGAGC AGCTCGTGAG AAGAGCCGAG  AAAGCTGGGT TCAAAGCCAT TGCTCTCACT GTAGACACCC CAAGGCTAGG TCGCAGAGAG TCTGATATCA AGAACAGGTA AAGCCACATC AATTGAAATG TGATAAGAGT TGATTAGACT  CGAATATGCA AACATATAGC TAAACAATTA TAGAGTAACG ATGTGTGTTC TTCTACTACA GATTCACTTT GCCTCCAAAC CTGACATTGA AGAACTTTGA AGGTCTTGAC CTTGGAAAGA  TGGACGAGGC AAGCATCGAT CAGATAGTAT CCATTACTTA AGTCTGAATA GTGTCAATGA TCCACTTAAA AACTAGCTTT AAAGCATACG GTTTGTTTCC TGATTATGTT CCTAAACTTG  TTATGTTTCC ACCTGCAGGC CAATGACTCT GGCTTGGCTT CGTATGTTGC TGGTCAAATT GACCGTACCT TGAGCTGGAA GGTAAGAGAA TACAACAAAT TTTCAGATAC CACAGCAAAA  CCAAAAACTT GATTCAGATT GCTCTAACTT TCATCTACAA AAACAGGATA TCCAGTGGCT CCAAACAATC ACCAACATGC CAATTCTTGT CAAGGGTGTT CTTACAGGAG AGGATGGTGA  GTTTCCATTT GCCAAACAAA TAATTTCAAC ACTCTAGTGT CATAGAAATA CCTGACAAGG TCAACTATTA TTGTCCCCAT GCAGCAAGGA TAGCGATTCA AGCTGGAGCA GCAGGGATCA  TTGTGTCAAA TCATGGAGCT CGCCAGCTTG ATTATGTCCC AGCAACAATC TCAGCCCTTG AAGAGGTAGA TCATTCTCGA CTACAAACAT AAATCTGTGT TCTCGATAAG TATTTATGTA  CAAGCACATT AGCTTTGTTC TCTTGTGTTC AGGTTGTCAA AGCAACACAA GGACGAGTTC CTGTCTTCTT GGATGGTGGT GTTCGACGTG GCACTGATGT CTTCAAGGCA CTTGCACTTG  GAGCCTCTGG AATATTTGTA AGCATCACAT CATATATCCA TTCACCAGAA AGTTGCTTAA AAACAGTAAA TATTTAAAAT GCCTTCTCAA TCTCAGATTG GAAGACCAGT GGTTTTTGCA  CTAGCTGCTG AAGGAGAAGC CGGAGTCAAA AAGGTGCTTC AAATGTTGCG TGATGAGTTC GAGCTAACCA TGGCACTAAG TGGGTGCCGG TCACTCAGTG AAATCACCCG TAACCACATT 
GTCACGGAAT GGGACACTCC ACGCCATTTG CCCAGGTTAT AG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATCA CTAACGTTAC CGAGTATGAT GCAATCGCAA AGGCGAAGTT GCCTAAGATG GTATATGACT ACTATGCATC TGGTGCAGAA GATCAATGGA CTCTTCAAGA GAACAGAAAC  GCTTTTGCAA GAATCCTCTT CCGGCCTCGG ATTTTGATTG ATGTGAACAA AATTGATATG GCGACTACCG TCTTGGGGTT CAAGATCTCG ATGCCGATCA TGGTTGCTCC TACTGCCTTT  CAAAAGATGG CTCACCCTGA TGGGGAATAT GCTACGGCTA GAGCTGCGTC TGCTGCTGGA ACCATCATGA CACTATCTTC ATGGGCTACT TCAAGTGTTG AAGAAGTTGC TTCCACAGGG  CCAGGAATCC GATTCTTCCA GCTCTATGTA TACAAGAACA GGAAGGTGGT TGAGCAGCTC GTGAGAAGAG CCGAGAAAGC TGGGTTCAAA GCCATTGCTC TCACTGTAGA CACCCCAAGG  CTAGGTCGCA GAGAGTCTGA TATCAAGAAC AGATTCACTT TGCCTCCAAA CCTGACATTG AAGAACTTTG AAGGTCTTGA CCTTGGAAAG ATGGACGAGG CAAGCATCGA TCAGATAGCC  AATGACTCTG GCTTGGCTTC GTATGTTGCT GGTCAAATTG ACCGTACCTT GAGCTGGAAG GATATCCAGT GGCTCCAAAC AATCACCAAC ATGCCAATTC TTGTCAAGGG TGTTCTTACA  GGAGAGGATG CAAGGATAGC GATTCAAGCT GGAGCAGCAG GGATCATTGT GTCAAATCAT GGAGCTCGCC AGCTTGATTA TGTCCCAGCA ACAATCTCAG CCCTTGAAGA GGTTGTCAAA  GCAACACAAG GACGAGTTCC TGTCTTCTTG GATGGTGGTG TTCGACGTGG CACTGATGTC TTCAAGGCAC TTGCACTTGG AGCCTCTGGA ATATTTATTG GAAGACCAGT GGTTTTTGCA  CTAGCTGCTG AAGGAGAAGC CGGAGTCAAA AAGGTGCTTC AAATGTTGCG TGATGAGTTC GAGCTAACCA TGGCACTAAG TGGGTGCCGG TCACTCAGTG AAATCACCCG TAACCACATT 
GTCACGGAAT GGGACACTCC ACGCCATTTG CCCAGGTTAT AG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGGATTAGAC CACAACCCAT CTGATATTTG TCCGCATCTC CACAACCATT CTTCACCTCC AACTTCTCAT CCATATTATA ATCCAACTTG CCAATAATTT TTTCAACTGT TACAGATTAC  TACATCAACG AAATATTAAA CATTTAACCA TATATAAAAG TTGGAGATAT ATGATATAAG CTTTTCTTAG CAGTCCCACC CTTCCTCTCT CGAGAGAGCT CCATTCCAAT CAAAGCTGTA  AACACACTTC AGAAGATGGA GATCACTAAC GTTACCGAGT ATGATGCAAT CGCAAAGGCG AAGTTGCCTA AGATGGTATA TGACTACTAT GCATCTGGTG CAGAAGATCA ATGGACTCTT  CAAGAGAACA GAAACGCTTT TGCAAGAATC CTCTTCCGGC CTCGGATTTT GATTGATGTG AACAAAATTG ATATGGCGAC TACCGTCTTG GGGTTCAAGA TCTCGATGCC GATCATGGTT  GCTCCTACTG CCTTTCAAAA GATGGCTCAC CCTGATGGGG AATATGCTAC GGCTAGAGCT GCGTCTGCTG CTGGAACCAT CATGACACTA TCTTCATGGG CTACTTCAAG TGTTGAAGAA  GTTGCTTCCA CAGGGCCAGG AATCCGATTC TTCCAGCTCT ATGTATACAA GAACAGGAAG GTGGTTGAGC AGCTCGTGAG AAGAGCCGAG AAAGCTGGGT TCAAAGCCAT TGCTCTCACT  GTAGACACCC CAAGGCTAGG TCGCAGAGAG TCTGATATCA AGAACAGATT CACTTTGCCT CCAAACCTGA CATTGAAGAA CTTTGAAGGT CTTGACCTTG GAAAGATGGA CGAGGCAAGC  ATCGATCAGA TAGCCAATGA CTCTGGCTTG GCTTCGTATG TTGCTGGTCA AATTGACCGT ACCTTGAGCT GGAAGGATAT CCAGTGGCTC CAAACAATCA CCAACATGCC AATTCTTGTC  AAGGGTGTTC TTACAGGAGA GGATGCAAGG ATAGCGATTC AAGCTGGAGC AGCAGGGATC ATTGTGTCAA ATCATGGAGC TCGCCAGCTT GATTATGTCC CAGCAACAAT CTCAGCCCTT  GAAGAGGTTG TCAAAGCAAC ACAAGGACGA GTTCCTGTCT TCTTGGATGG TGGTGTTCGA CGTGGCACTG ATGTCTTCAA GGCACTTGCA CTTGGAGCCT CTGGAATATT TATTGGAAGA  CCAGTGGTTT TTGCACTAGC TGCTGAAGGA GAAGCCGGAG TCAAAAAGGT GCTTCAAATG TTGCGTGATG AGTTCGAGCT AACCATGGCA CTAAGTGGGT GCCGGTCACT CAGTGAAATC  ACCCGTAACC ACATTGTCAC GGAATGGGAC ACTCCACGCC ATTTGCCCAG GTTATAGAGA AGAAAAAAAA AACAGAGAAC AGAAACAACA CGGCACCAAA ACGTATTCAT ATTCTGATTG  ATCACTTTGC TTCTACTCTG CTATATTTAT ATCTCGAAAA ACTTGTTTCT CCCTATATCG GATCACAAAA ACGTGCGTAG AGATTCTCTG TAATGCTATT TGGCTACATT TTACCTTTCC 
GTTTATTCTT ATTGCTTGTA CAATAGATGT TGATTCCTAC AATACCAATG AATACTAAAA TCTGTTCCCG GAAAA 

Retrieve as FASTA