Entry information : HaRboh07 (HanXRQChr06g0178241)
Entry ID 13783
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaRboh07 (HanXRQChr06g0178241)
Name (synonym) HaRboh07 (HanXRQChr06g0178241)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh07
start..stop
S start..stop
HaRboh02 1597 0 1..914 2..922
VvRboh07 1375 0 1..914 1..917
PtRboh09 1327 0 25..914 39..926
CclRboh04 1315 0 24..914 35..910
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 46531371..46531932 562 N° 2 46530870..46531029 160 N° 3 46529964..46530012 49 N° 4 46529667..46529780 114
N° 5 46528508..46528930 423 N° 6 46528012..46528395 384 N° 7 46527830..46527925 96 N° 8 46527640..46527755 116
N° 9 46527376..46527546 171 N° 10 46526940..46527291 352 N° 11 46526723..46526851 129 N° 12 46526563..46526641 79
N° 13 46526377..46526486 110  
complement(join(46526377..46526486,46526563..46526641,46526723..46526851,4652694 0..46527291,46527376..46527546,46527640..46527755,46527830..46527925,46528012..4 6528395,46528508..46528930,46529667..46529780,46529964..46530012,46530870..46531 029,46531371..46531932))


exon

Literature and cross-references HaRboh07 (HanXRQChr06g0178241)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr06 (46531932..46526377)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr06g0178241
Protein sequence: HaRboh07 (HanXRQChr06g0178241)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   914
PWM (Da):   %s   103467.89 Transmb domain:   %s   o351-370i486-508o534-556i714-731o
PI (pH):   %s   8.84
Sequence
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Remarks
DNA
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AGTTAAGTTTTTCGTTCAAAGGGTAGTTTGGTCATTTAGCATGCTCTGTATTCATTATTCAAACAATCAAACCTGAATGCAAGGATGCCCCTCTAAATATAATAATAAAATTGACTGAAT
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GCTTAGCGCTTCAGCAAATAGATTGTCAAAGTTGAAAGAAGAAGCCGAGGAATACGCTTCTTTAATCATGGAAGAACTTGACCCTGAAAATCTTGGTTATATTGAG
GTAATATAGCTGAA
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CCCGTTTAGCTAAATTGTATTCATGGGTTCAACCCGAAACTGACCTGGGCCCTTTTAGACTAAACCCAAAACACGTAAATTCCGTGTTAGGTTTGTGTAGTGTTTTTGTGTTCAGAGATT
ACACTCCTAAATTGAAAATTTTCATGTAATGCACTCAACATTTTCCACAAGCAGTGGTGGATCCAGCCCTGTTTTGTGGGTTCACATGAACCCACTCGGTTTGGAAAAAATTAGTAAGAA
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AGTTATGGCAGTTGGAAACACTTTTACTACAAAGAGAAGTTTACATGAACTACAGTAGACCTCTAAGCATACCAAGTGGAGGGTGGAGCCAGAATTTGAGTTCACTGAAGCCAAAAAGCA
TCGTCCATCGGCTAAGTCATTTCGTGAGGTGGGCATTGATCGAAAACTGGCAAAGAAGTTGGGTTTTGCTGCTATGGTTTCTAGCCATGGCATGGTTATTTTCTTGGAAATTTAAGCAAT
ATAAACACAAGGCGGCGTTTCAGGTGATGGGTTATTGTTTAACCACTGCTAAAGGGGCTGCCGAGACTCTCAAACTCAATATGGCTCTTATTCTTCTACCCGTTTGTAGAAACATGCTAA
CGGTTTTAAGGTCTACACGAGCCTGTTTCTTCATTCCTTTCGATGACAATATCAACTTTCACAAG
GTGATTGATTAACCAGTAACCATCCTTTAGACGTTACACATTTACACCATGAGAA
ACCTTTTATAAAATGTATTATTAACTTATATCTACATGCCATACATATGAATTGTAGACAATTGCTTTCGCTATAGCCGTTGGAATCGTTTTGCACGTTGGAAATCATATGATTTGTGAT
TTCCCTCGGTTGGTAAACTCTTCGCCAGAAAAGTTTGCTCTCATAGCATCAGATTTTCATGACAAAAAGCCGACATACAAGGAATTAGTAGCCGGTGTGGAAGGTGTGACTGGAATTTCT
ATGCTGATATTGATGGCCTTCGCTTTCACTCTAGCTTCAAAATATTTTAGGAAAAATCAGTTAAAACTGCCATCACCATTTAACCGGTTGACAGGATTCAATGCATTTTGGTTTTCACAT
CATCTTTTTGGTTTGGTGTACATACTGCTCATCATTCACGGGTCATTCTTGTTCTTGGCTCATAAGTGGACTGAGAAAACG
GTAAATCGTTTTTGTTCTTGTGGTAGAAAAACAATAACA
ATATCAATACTGTTTTTCGGCTAAGAATATATGTCCGAATCTCGCAGACATGGATGTATATCTCCGTCCCAATCTTAATATATGCAGCCGAGCGGAGTTTGAGAACAGGACGGTCAGAAC
ACTACTCTGCTAAAATCATAAAG
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GTATATATATGTTACATATGTCTACAA
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CCGGACAGTTGGAGACTGGACAAAAGAATTAAAGGAAGTGTTGACGGATGATAATGGTTCAGCGTGTACAATTGGACGCGCCAAATTTAGGAAGCTAGGGGAGGTCAATTCGAAAGG
GTA
GTTATATCTGGCGTTAAAAGCTCACTATTCTATATGCATGACGAAAATCAAAAAACTAAACAAAAATATTATATCATGCAGTTTACCCAAGCTACTGTTGGATGGACCTTACGGTGCACC
AGCGCAAGACTACCGGAACTACGATGTGTTACTTCTTGTGGGATTAGGAATTGGAGCTACTCCTTTCATAAGTATTCTAAGAGACTTGTTAAACAATAACCGGACGTTAGAAGACCAAAC
AGATTCAAACACGGAAACGAGTATTTCAGGCGATAGTCTTCTGAGTCTAGCATCTTCAAATATGGCATCAACAACTGAAAAGAAGAAATCAAGAAGGGCTAAGAGTGCAAATTTTTATTG
GGTCACTAGGGAGCCCGGCTCGTTTGAATGGTTCAAAGGAGTCATGAACGAAGTCGCTGAAATGGATCACAAA
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ATGATCTACCAATTAACTTGATTGTGACTATTTTGAAATAGGGTCAAATTGAGATGCACAATTATCTAACAAGTGTTTATGAGGAGGGTGATGCAAGATCAACTCTAATAACTATGGTTC
AAGCACTTACACATGCCAAACATGGTGTTGACATCCTATCTGGCACTAGA
GTATGAACTATGATACATTATACATGCTACATTATTAGATATGCTATAATGAAACTAGTAAGACACAAAG
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CDS
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AACAATGATCAGGACCTAGTGGAAGTCACGTTGCAGTTGGAAGACGATTCCATTATTCTATGCAATGTGACTCCATCTGTAAACAATTCTAATTATCATCATGATCATGTCGCTTTACAA
TTGTCACCAAATGCTAGTGTCAAGTCTAAGCTTTGTAGGAAGTTCTCGTGGCTGTCGTCGTCGGCATCTTCTTCACGAGCTTCTTCGCTTTCTGATGCGAGTGTGGAGCGTGTTGTTGCG
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TGGAGAAACGTTGAGTCGCGATTTGTGAGCCTTGTTAAAGAGGATGGGTTACTAGCGCGAGAAGATTTCGCCGAATGTATAG
GAATGGCGGATTCGAAGGAATTTGCGGTGGGAGTTTTC
GATGCATTGGCGAGAAGAAGGCAGCAGAAATTGGGGAAGATCACAAAAGAAGAGCTTCATGAATTTTGGTTACAGATATCCGATCAGAGCTTCGACGCGCGTCTGCAGATTTTCTTCGAT
AT
GGCCGACAGCAACGAAGATGGAAGGATTACGAGGGACGAGATACAAGAGCTGCTCGTGCTTAGCGCTTCAGCAAATAGATTGTCAAAGTTGAAAGAAGAAGCCGAGGAATACGCTTCT
TTAATCATGGAAGAACTTGACCCTGAAAATCTTGGTTATATTGAG
TTATGGCAGTTGGAAACACTTTTACTACAAAGAGAAGTTTACATGAACTACAGTAGACCTCTAAGCATACCAAGT
GGAGGGTGGAGCCAGAATTTGAGTTCACTGAAGCCAAAAAGCATCGTCCATCGGCTAAGTCATTTCGTGAGGTGGGCATTGATCGAAAACTGGCAAAGAAGTTGGGTTTTGCTGCTATGG
TTTCTAGCCATGGCATGGTTATTTTCTTGGAAATTTAAGCAATATAAACACAAGGCGGCGTTTCAGGTGATGGGTTATTGTTTAACCACTGCTAAAGGGGCTGCCGAGACTCTCAAACTC
AATATGGCTCTTATTCTTCTACCCGTTTGTAGAAACATGCTAACGGTTTTAAGGTCTACACGAGCCTGTTTCTTCATTCCTTTCGATGACAATATCAACTTTCACAAG
ACAATTGCTTTC
GCTATAGCCGTTGGAATCGTTTTGCACGTTGGAAATCATATGATTTGTGATTTCCCTCGGTTGGTAAACTCTTCGCCAGAAAAGTTTGCTCTCATAGCATCAGATTTTCATGACAAAAAG
CCGACATACAAGGAATTAGTAGCCGGTGTGGAAGGTGTGACTGGAATTTCTATGCTGATATTGATGGCCTTCGCTTTCACTCTAGCTTCAAAATATTTTAGGAAAAATCAGTTAAAACTG
CCATCACCATTTAACCGGTTGACAGGATTCAATGCATTTTGGTTTTCACATCATCTTTTTGGTTTGGTGTACATACTGCTCATCATTCACGGGTCATTCTTGTTCTTGGCTCATAAGTGG
ACTGAGAAAACG
ACATGGATGTATATCTCCGTCCCAATCTTAATATATGCAGCCGAGCGGAGTTTGAGAACAGGACGGTCAGAACACTACTCTGCTAAAATCATAAAGGTTTCCAACCTT
CCAGGAGATGTATTCAGCATAATTATGTCTAAACCGAACGGATTTAAATACAGGAGTGGGCAGTATATATTTCTGCAGTGCCCTTCAATCTCTCCATTCGAATG
GCACCCGTTTTCAATT
ACTTCGTCACCAGGAGACGATTACCTCAGTGTTCACATCCGGACAGTTGGAGACTGGACAAAAGAATTAAAGGAAGTGTTGACGGATGATAATGGTTCAGCGTGTACAATTGGACGCGCC
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TTTACCCAAGCTACTGTTGGATGGACCTTACGGTGCACCAGCGCAAGACTACCGGAACTACGATGTGTTACTTCTTGTGGGATTA
GGAATTGGAGCTACTCCTTTCATAAGTATTCTAAGAGACTTGTTAAACAATAACCGGACGTTAGAAGACCAAACAGATTCAAACACGGAAACGAGTATTTCAGGCGATAGTCTTCTGAGT
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GCCAAACATGGTGTTGACATCCTATCTGGCACTAGA
GTAAGGACACATTTTGCTAGACCAAATTGGGGAGAGGTGTTCACCAAGGTAGCATCAAAACATCGGAATACAACCGTAGGAGTA
TTCTATTGTGGGATGCCGGTTTTGGCAAAGGAGTTGAAGAAATTATCATACGAGATGAGTCACAAGACATCGACACGATTTGAGTTCCACAAAGAGTATTTCTAA

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cDNA
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TGGGGGTTAA AGAAACAAGA CTCAACTACT CTCAACACAC ACAAGCGTTG AATTCGTGTG TTTATTTCAC AAACCCTTCA TTGATTCCAT TCTTCAATCC AAATTCACAC TTAAACACCT  ATGTTCTTCT ACTCCGAACC CGAACCAACA CTTCAGAGAC AACCATGAGT TCTGACTCTC CCGTTAGCAG CCGTTGTTCT TACGAAAGAT CAAATTTCAA TGACGTTTAT GGCGGCATCG  GGGGCACAAT GCTCCCGACA TTCCTTAACG ATCTACACCG CAACAACAAT GATCAGGACC TAGTGGAAGT CACGTTGCAG TTGGAAGACG ATTCCATTAT TCTATGCAAT GTGACTCCAT  CTGTAAACAA TTCTAATTAT CATCATGATC ATGTCGCTTT ACAATTGTCA CCAAATGCTA GTGTCAAGTC TAAGCTTTGT AGGAAGTTCT CGTGGCTGTC GTCGTCGGCA TCTTCTTCAC  GAGCTTCTTC GCTTTCTGAT GCGAGTGTGG AGCGTGTTGT TGCGTCAAGA GATGCTAGGA AAATGAAAGC ACAGCTGATT CGAACGAAAT CTAGCGCCCA ACGAGCGCTA GGGGGTTTGC  GGTTTATCAG TAAAACTACA AACACGGAGG ATGTTAATGA GTTGTGGAGA AACGTTGAGT CGCGATTTGT GAGCCTTGTT AAAGAGGATG GGTTACTAGC GCGAGAAGAT TTCGCCGAAT  GTATAGGAAT GGCGGATTCG AAGGAATTTG CGGTGGGAGT TTTCGATGCA TTGGCGAGAA GAAGGCAGCA GAAATTGGGG AAGATCACAA AAGAAGAGCT TCATGAATTT TGGTTACAGA  TATCCGATCA GAGCTTCGAC GCGCGTCTGC AGATTTTCTT CGATATGGCC GACAGCAACG AAGATGGAAG GATTACGAGG GACGAGATAC AAGAGCTGCT CGTGCTTAGC GCTTCAGCAA  ATAGATTGTC AAAGTTGAAA GAAGAAGCCG AGGAATACGC TTCTTTAATC ATGGAAGAAC TTGACCCTGA AAATCTTGGT TATATTGAGT TATGGCAGTT GGAAACACTT TTACTACAAA  GAGAAGTTTA CATGAACTAC AGTAGACCTC TAAGCATACC AAGTGGAGGG TGGAGCCAGA ATTTGAGTTC ACTGAAGCCA AAAAGCATCG TCCATCGGCT AAGTCATTTC GTGAGGTGGG  CATTGATCGA AAACTGGCAA AGAAGTTGGG TTTTGCTGCT ATGGTTTCTA GCCATGGCAT GGTTATTTTC TTGGAAATTT AAGCAATATA AACACAAGGC GGCGTTTCAG GTGATGGGTT  ATTGTTTAAC CACTGCTAAA GGGGCTGCCG AGACTCTCAA ACTCAATATG GCTCTTATTC TTCTACCCGT TTGTAGAAAC ATGCTAACGG TTTTAAGGTC TACACGAGCC TGTTTCTTCA  TTCCTTTCGA TGACAATATC AACTTTCACA AGACAATTGC TTTCGCTATA GCCGTTGGAA TCGTTTTGCA CGTTGGAAAT CATATGATTT GTGATTTCCC TCGGTTGGTA AACTCTTCGC  CAGAAAAGTT TGCTCTCATA GCATCAGATT TTCATGACAA AAAGCCGACA TACAAGGAAT TAGTAGCCGG TGTGGAAGGT GTGACTGGAA TTTCTATGCT GATATTGATG GCCTTCGCTT  TCACTCTAGC TTCAAAATAT TTTAGGAAAA ATCAGTTAAA ACTGCCATCA CCATTTAACC GGTTGACAGG ATTCAATGCA TTTTGGTTTT CACATCATCT TTTTGGTTTG GTGTACATAC  TGCTCATCAT TCACGGGTCA TTCTTGTTCT TGGCTCATAA GTGGACTGAG AAAACGACAT GGATGTATAT CTCCGTCCCA ATCTTAATAT ATGCAGCCGA GCGGAGTTTG AGAACAGGAC  GGTCAGAACA CTACTCTGCT AAAATCATAA AGGTTTCCAA CCTTCCAGGA GATGTATTCA GCATAATTAT GTCTAAACCG AACGGATTTA AATACAGGAG TGGGCAGTAT ATATTTCTGC  AGTGCCCTTC AATCTCTCCA TTCGAATGGC ACCCGTTTTC AATTACTTCG TCACCAGGAG ACGATTACCT CAGTGTTCAC ATCCGGACAG TTGGAGACTG GACAAAAGAA TTAAAGGAAG  TGTTGACGGA TGATAATGGT TCAGCGTGTA CAATTGGACG CGCCAAATTT AGGAAGCTAG GGGAGGTCAA TTCGAAAGGT TTACCCAAGC TACTGTTGGA TGGACCTTAC GGTGCACCAG  CGCAAGACTA CCGGAACTAC GATGTGTTAC TTCTTGTGGG ATTAGGAATT GGAGCTACTC CTTTCATAAG TATTCTAAGA GACTTGTTAA ACAATAACCG GACGTTAGAA GACCAAACAG  ATTCAAACAC GGAAACGAGT ATTTCAGGCG ATAGTCTTCT GAGTCTAGCA TCTTCAAATA TGGCATCAAC AACTGAAAAG AAGAAATCAA GAAGGGCTAA GAGTGCAAAT TTTTATTGGG  TCACTAGGGA GCCCGGCTCG TTTGAATGGT TCAAAGGAGT CATGAACGAA GTCGCTGAAA TGGATCACAA AGGTCAAATT GAGATGCACA ATTATCTAAC AAGTGTTTAT GAGGAGGGTG  ATGCAAGATC AACTCTAATA ACTATGGTTC AAGCACTTAC ACATGCCAAA CATGGTGTTG ACATCCTATC TGGCACTAGA GTAAGGACAC ATTTTGCTAG ACCAAATTGG GGAGAGGTGT  TCACCAAGGT AGCATCAAAA CATCGGAATA CAACCGTAGG AGTATTCTAT TGTGGGATGC CGGTTTTGGC AAAGGAGTTG AAGAAATTAT CATACGAGAT GAGTCACAAG ACATCGACAC  GATTTGAGTT CCACAAAGAG TATTTCTAAA GTAAAATCGC GTGTAACGTT GTACGTCTTA ATATACATAC ATTTACATTT TTTTAAGTAC AAAAAGAATG TAAATTTGTA CACTATAGTA 
TACACCAGCT AGTATAGATC AACCTGTATA ACTTGAGAAC CACAATCAAG AAAATGACAA ATAGACATTA CATTTGGTTA ATATTTTTTG TGAATTAG 

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