Entry information : HaRboh10 (HanXRQChr08g0229011)
Entry ID 13787
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaRboh10 (HanXRQChr08g0229011)
Name (synonym) HaRboh10 (HanXRQChr08g0229011)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh10
start..stop
S start..stop
HaRboh01 1699 0 16..928 3..917
HaRboh04 1526 0 3..928 1..930
CsiRboh01 1498 0 3..928 1..922
HaRboh11 1496 0 26..928 11..913
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 96829427..96830054 628 N° 2 96830178..96830340 163 N° 3 96830435..96830483 49 N° 4 96831315..96831428 114
N° 5 96831528..96831950 423 N° 6 96832090..96832473 384 N° 7 96832547..96832642 96 N° 8 96832909..96833024 116
N° 9 96833109..96833211 103 N° 10 96833317..96833384 68 N° 11 96833792..96834324 533 N° 12 96834932..96835041 110
join(96829427..96830054,96830178..96830340,96830435..96830483,96831315..96831428 ,96831528..96831950,96832090..96832473,96832547..96832642,96832909..96833024,968 33109..96833211,96833317..96833384,96833792..96834324,96834932..96835041)


exon

Literature and cross-references HaRboh10 (HanXRQChr08g0229011)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr08 (96829427..96835041)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr08g0229011
Protein sequence: HaRboh10 (HanXRQChr08g0229011)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   928
PWM (Da):   %s   105176.73 Transmb domain:   %s   o376-395i514-536o558-580i737-754o
PI (pH):   %s   9.36
Sequence
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Send to Peroxiscan
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Remarks
DNA
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GGGCCACTGAGTGTAAGTGGCCCGCTGAACAAAAGAGGCGCCCGGAAAGGCGCCAGGTTTAACATAGACGGAAGTACAAGCGGGAGTGTGAAATCCTCACACTCCAACAATAACGACGAG
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GTTTTGGTTTTAGTGGGAATTTAAATATGGAAATACAATGAATGCCAGGGTTGATAAAGATGCAGACGGCAGGATTACAGAAGACGAAGTCAGAGAGGTATGTATTGACACGTATAGTAA
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AAAAACCCAAATCACGTATGTTGAAAACAATAATCACGCATATTGAAAACATTAATCACGCGTATTGAAAACATTAATCACGCATGCTATAGAACATAATCACGCACGTTGTCGTACGTG
ATGTACACTATCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAAAATATAATGTACTTCACGCCAACGTACATTAACGTACTTCACGAAATATATAACATGCGTA
ATTATTTTTTTGACCAAAATAACGTGCGTGATTTTGGATCCCATGCGTGATTATGTGGTCTCATGCGTGCTTATATGTTCTATGCGTGATTATACCCCTGATCCAACGGTTACCATTGTC
TCCTACGTGAAGTATGATAAGCCGTGAAGTATGTTAACCTTTCTATATATATATATATTGGTTTCTTATGATATTACAAGAATTAGTTTTTTTAAAGTGGTTAAATAAAACATTAGGTGC
GGTGGACATGAAGTTAAAGGGGTGGTTAGTGGTAGTTTAGAATATTTTGTCCCAACATTTGCCAATAATTGATACCCATGTGATGTAGATTATCAGCCTAAGTGCATCAGCCAACAAGTT
ATCAAACATTCAAAAACAAGCAGATGAATATGCAGCATTGATCATGGAAGAACTAGACCCCGACAACGTCGGTTACATCATG
GTACGGTTACAGATCGCACTACTACTTTTGATGTAGTT
CGGGTGGAAGTTTTGTTTCGTGATTAGTGGTTAGTGATTAATGATTAACGTTTCGAAACAGATTGAAAACTTGGAGATGTTATTGTTACAAGCGCCGACACATAATGTGAGAGGAGAAAG
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GATTGTACTTTGGATAGGAATAATGGCGGGTTTGTTTACGTGGAAGTACTTTCAATACAGAAACCGAGCTGTGTATAAGTTGTTGGGACAATGTGTATGTATAGCGAAAGGTGCAGCCGA
GACTTTAAAGCTTAACATGGCGATTATATTATTACCCGTTTGTCGAAACACGATTACTTGGTTGAGGAACAAGACTAAGATGGGTGTCGTGGTCCCGTTCGATGACAATCTTAATTTCCA
CAAG
GTAAGTTAATGTTAATTCTCACATTTGAAAATATTATTTTTACTATATTTGAAAAGTTTCTTTTTATTGGGTAACTGTGACTGTGAGAACCCATTAGCGAAAGTGTTTCTTATTTA
TTGAATGGTGTTATTATGTTTAGGTGATTGCAGTGGCGATTACGATTGCAATTGGGTTACACGCGATTTCCCATTTAACATGCGACTTTCCTCTACTAATTCACGCAACAGAGGAAGAAT
ATAGACCGATGCAACAGTTTTTTGGAGATCAAGCCGAAAATTATTGGCATTTTGTGAAGGAACCAGTGGGGTATACGGGAATAATAATGGTAGTACTAATGACTATAGCTTTTACGCTAG
CAACCCCTTGGCTAAGACGAGGCAAGCTCAACCTACCCCCATGGTTAAAGAAACTAACGGGGTTTAACGCTTTTTGGTATTCCCACCACCTGTTTGTTATCGTCTATGTGATGCTTATAG
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GTTAGTTCCTTAATGTTCTGTCACTTCATTAAAACCGTGCTTCTTTAGACTAAATCATGCTTTTCGGATGCAG

ACATGGATGTACTTGACCGTCCCGCTTGCACTCTACACTTGTGAAAGATTAATAAGGGCATTCCGGTCAAGTGTTAAACCCGTCAAGATACTTAAG
GTATAATCTTACATTCGTGGGTTG
AATTTTTTTAATCAATGGTAGCAATTTCGACCATTAATTAACTTAAAAAATGGACAACGTAGTGTTTGCTTGTCAACGTTTCCTAACCCGACCCGACCCGACATGTCTCAACCTAAATCA
GTTTTGATAAGTCACCCAACCTGACTGGCACGTCCATCTTTCTACATGTATATTCGTTTGTTTATTTTGTTAATTGGGAAATAATATGAAAATATCTAATAATAGTGTGTGTTACTTAAA
AGGTGGCTGTTTATCCCGGAAATGTGTTGGCACTTCATATGTCAAAGCCACAAGGATTCAAATACAAGAGTGGTCAATACATGTTTGTCAACTGTGCCGCTGTCTCCCCATTTGAATGGT
GAGTTGTACCTTCAAAATATGTCCATAATGGCCGATCAACCCGACTCATTTCAATATCATAACACTTGATACATGTCAACAGGCACCCATTTTCCATTACGTCTTCCCCGGGTGATGATT
ACCTGAGTGTACATATCCGGACTCTTGGTGATTGGACTAGACAACTAAGAACCGTCTTTTCCGAG
GTATGTAACCCGTTATCTACTGTTAAATTTGGTAATGTAGGGCGTTTTACGACAT
GTGTAGTAGTTGATTATATCACCTAACAAGTGTTTTTTGGTCTTTGGTAGGTATGTCAGCCTCCACATAATGGAAAAAGTGGGCTTCTTAGAGCTGATTGCCAAGGAGAAAATCCAAAGT
AAGTGTGTTTGACTGTTTCAAAACTTGCACACACACACACACATATACATATATACGTATATGTATTAAAGGTGGGAAGAAGGGCGGGTTGGGTAACGGGTCAAAAAAACACTGTTTCCC
CTTTTAAGATAGTTGATGTATGTTACAAAAATATTATCATTATAATAATGTAAATCTTTAGATATAAATATAAGGTTTAGAAGCAAAGCATAATAAGTTGAATATTCTGTCAACATCATG
CAAATAAGGACATGTAATGTAACAGATTAAAAAAAGTTGGCAACACATCAGATGCATGAGTTTTTTGACTTTTTCAACCCAAACCCATTTTGACCCGTTTCGCCACCTGTGAGCTCTAAA
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TAAAACGGGTTCAAGAAGTACAAACAACTTTAGAACAACACGGGCTTACTTCTATTGGGTCACTAGAGAACAGGGTTCGTTTGATTGGTTTAAAGGTGTTATGAATGAGGTTGCTGAGAT
GGACAAAAATGGCGTTATAGAGATGCATAATTATTGCACAAGTGTTTATGAGGAAGGTGATGCGAGATCTGCTTTAATTACTATGCTTCAGTCACTTAATCATGCTAAAAATGGTGTTGA
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GTCAGTCCTACTAACTCATTCT
CATATTTTATTTCTTTTAGTTATAGAATTATATACTCATAAAAAGTATATTGACTACTATATAAAAACAGGCAGCCTTAGAACAAACTGTACTTTATTAAACCAAATAACGCGTTTTAGT
ATTAGCTTCGGGACAACAGTCCTTTTCATACTATATCTTAATAGGGATAATTTAAAGTATTATGACTAAAAAGATCACCTATAATCTAGAATAGTTTATGATAATAACTCCAAATCTAGA
TGGTAAACAAATGATAAAGATGAACCTTAAAAAATAGCTAAAAGACAACCTTTATAGTGTCGGGTCATTATCCAATACGAGTGGAGATTACTTAATATTTAGTGCTAATTAACTAATCAT
GATTCATATTAACGACATTGACAAAGAAAGATCAACCATGATTTATGCCAAAAAAAAAGTTTTGAACAAAATATATATATGCACAATGAGTAGTAGGAGTCGGGTCGTTTCCTCGTGTCA
AAATGGTGACCGACACGAGTCAACCATAGAGTGTTTAACCCGTGTAGCGCATAAATTATAATATTATATATAACTAAAAACAGAGTTTTTTTTTTAAATTTGCAGGAGTATTCTATTGTG
GAGCACCAGCACCAACAAAGGAATTGAAACAATTAGCTTTAGATTTCTCACACAAGACACCAACAAAGTTTGACTTCCACAAAGAGAATTTCTAA

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CDS
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ATGCAAATGCATAGGATGAGCACAGATGATGGAAGAACCGGGTTGTCAGAAGATTACAACCGCCATGTTCATTACCACTCCGACACAGAAGTGGTCGGAGTGGACAGGAAATCATTCAGC
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AGGTCCTCGTTCGGGTCGTCCGCGGTGAAAAACGCGTCCGCGAAGATCCGACAGGTGTCGCAAGAGCTGAAGCGGCTGACTTCGTTCTCGAAACCGATGAAGCGTTTAGAGAGAACGAAG
TCAGCCGCAGCTTATGCCCTTAAAGGGCTGAAGTTTATTAGCAAGAACGACGGCGGGGCGGCCTGGGCCGCCCTCGAAAAGCGGTTTGATGAACTCACCGGAGACACCAATGGCTTACTT
CCTCGGTCACTTTTTGGTGAATGCATAG
GGATGAATAAAGATTCAAAAGAGTTCGCCGGAGAGTTGTTTGATTCACTTTCCCGGCGGCGGAATATCACCGGCGACGTGATAAACAAAGAA
CAGTTAAAGGAGTTTTGGGATCAAATTTCTGATCAGAGTTTTGATTCAAGGCTGCAAACTTTCTTTGACAT
GGTTGATAAAGATGCAGACGGCAGGATTACAGAAGACGAAGTCAGAGAG
ATTATCAGCCTAAGTGCATCAGCCAACAAGTTATCAAACATTCAAAAACAAGCAGATGAATATGCAGCATTGATCATGGAAGAACTAGACCCCGACAACGTCGGTTACATCATGATTGAA
AACTTGGAGATGTTATTGTTACAAGCGCCGACACATAATGTGAGAGGAGAAAGCCGAAAGCTGAGCCAAATGTTGAGCCAAAAGCTGAAAACGACGCACTATGGAAACCCGATAAGAAGA
TGGTATGAAGATTTTAAGTACTTTTTACAGGACAATTGGAAGAGATGTTGGGTGATTGTACTTTGGATAGGAATAATGGCGGGTTTGTTTACGTGGAAGTACTTTCAATACAGAAACCGA
GCTGTGTATAAGTTGTTGGGACAATGTGTATGTATAGCGAAAGGTGCAGCCGAGACTTTAAAGCTTAACATGGCGATTATATTATTACCCGTTTGTCGAAACACGATTACTTGGTTGAGG
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GTGATTGCAGTGGCGATTACGATTGCAATTGGGTTACACGCGATTTCCCATTTAACATGCGAC
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ATGGTAGTACTAATGACTATAGCTTTTACGCTAGCAACCCCTTGGCTAAGACGAGGCAAGCTCAACCTACCCCCATGGTTAAAGAAACTAACGGGGTTTAACGCTTTTTGGTATTCCCAC
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ACATGGATGTACTTGACCGTCCCGCTTGCACTCTACACT
TGTGAAAGATTAATAAGGGCATTCCGGTCAAGTGTTAAACCCGTCAAGATACTTAAG
GTGGCTGTTTATCCCGGAAATGTGTTGGCACTTCATATGTCAAAGCCACAAGGATTCAAATAC
AAGAGTGGTCAATACATGTTTGTCAACTGTGCCGCTGTCTCCCCATTTGAATG
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ATCGACGGTCCATACGGTGCACCAGCACAAGACTACAAAAAATACGATGTGGTGTTGCTAGTGGGCTTAGGAATTGGAGCAACGCCGATGATCAGTATTGTGAAAGACATTGTGAACAAC
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AAGCGAATTGCACTCAATCACAATGGTTCCAGGATAG
GAGTATTCTATTGTGGAGCACCAGCACCAACAAAGGAATTGAAACAATTAGCTTTAGATTTCTCACACAAGACACCAACAAAG
TTTGACTTCCACAAAGAGAATTTCTAA

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cDNA
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GTGGTAGGAT ACAAACAGAG ATACCAGCTA GTCACCTAAT TGTTGACTCA ATATGTATAT ATATTTTTTC AGATTTTGAG ATATAGTAAT AATGAATATG T 

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