Entry information : HaRboh12 (HanXRQChr17g0533891)
Entry ID 13789
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaRboh12 (HanXRQChr17g0533891)
Name (synonym) HaRboh12 (HanXRQChr17g0533891)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh12
start..stop
S start..stop
HaRboh05 1375 0 5..859 21..927
CclRboh01 1343 0 16..859 30..946
PtRboh03 1339 0 14..859 27..948
CsRboh01 1338 0 16..859 30..946
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 2050162..2050564 403 N° 2 2050658..2050823 166 N° 3 2051326..2051374 49 N° 4 2053155..2053268 114
N° 5 2054184..2054600 417 N° 6 2055268..2055654 387 N° 7 2055745..2055840 96 N° 8 2055908..2056023 116
N° 9 2056425..2056592 168 N° 10 2056827..2056986 160 N° 11 2057062..2057244 183 N° 12 2057848..2057976 129
N° 13 2058516..2058594 79 N° 14 2058675..2058787 113  
join(2050162..2050564,2050658..2050823,2051326..2051374,2053155..2053268,2054184 ..2054600,2055268..2055654,2055745..2055840,2055908..2056023,2056425..2056592,20 56827..2056986,2057062..2057244,2057848..2057976,2058516..2058594,2058675..20587 87)


exon

Literature and cross-references HaRboh12 (HanXRQChr17g0533891)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr17 (2050162..2058787)
Protein sequence: HaRboh12 (HanXRQChr17g0533891)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   859
PWM (Da):   %s   98140.19 Transmb domain:   %s   o298-320i440-462o482-504i661-678o
PI (pH):   %s   8.83
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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MTTKAGAEADRHNTQSETSPDEELVEITLDLQNNDAIILRSVGMDTPVTATSNRSRQSSMRMQNDVVGVDSHSRGVRDGEVDRSRCGTGKALKGLRFISNGKINGVDGWKEVEINFDKYAKDGYLYRADFAQCIGMRDSKEFAVEVFDAISRRRRRRLKVDKISRDELSEYWSQITDQSFDSRLQIFFDMVDKNEDGRITEEEVKIIMVSASANKLSRLQDQAEEYAALIMEELDPQRLGYIELWQLETLLLQKDTYLNYSQALSYTSQALSQNLLRNHSPIKRISFKFLYYLQENWRRLWIISLWILIMIGLFHWKYFQYKQRAAFDVMGYCVLSAKGAAETLKLNMAIVLLPVCRNTITWLRSTKLSYFIPFDDNINFHKTVAAAIVMGIILHAGNHLACDFPRLINEDENSYALNMSKYFGENKPSYITLLRGVEGVTGIIMVVCMTIAFTLATRWFRRSLVKLPKPFDHLTGYNAFWYSHHLFVIVYILLLVHGWFLYLVKEWYKKTTWMYLAFPVLLYAGERTLRFFRSGSYTVRLLKVAIYPGNVLTLQMSKPPKFRYKSGQYMFVQCPIVSSFEWHPFSITSAPDDDYLSVHIRQLGDWTLELKRVFSEVCEPPLAGKSGLLRADETTKATLPRLLIDGPYGAPAQDYRKYDVLLLVGLGIGATPFISILKDLLNNIVKSDELSHSSSDQSSTCADSSPQGKISPRKKKGVRTTNAYFYWVTREQGSFDWFKGVMNEVAECDHQGVIEMHNYLTSVYEEGDARSALITMVQALNHAKNGVDIVSGTRVRTHFARPNWKKVFSKTCKKHAGARIGVFYCGAPVLAKGLSKLCDEYNQKGGSTNLEFHKEHF

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
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ATGACTACGAAAGCCGGTGCAGAAGCCGACCGCCACAATACGCAGAGTGAGACTTCTCCAGATGAAGAGCTTGTTGAAATCACTCTCGATCTTCAGAATAACGACGCTATCATTCTACGT
AGTGTAGGTATGGACACTCCGGTAACCGCAACATCGAATCGGTCACGGCAGTCATCCATGAGGATGCAAAACGACGTCGTAGGAGTGGATTCACATTCACGCGGAGTGCGTGATGGTGAG
GTTGATCGAAGTCGTTGCGGTACTGGTAAAGCTCTAAAAGGTCTCCGATTCATCAGTAATGGTAAAATCAACGGTGTGGATGGTTGGAAGGAAGTTGAGATTAATTTCGATAAGTATGCA
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GTTTTTTGTTTTTTTATTTAATTGAAACAAACTACTTGTATGTATTGTTAGTTAGAGATGTGATTGATCTGTTTGTT
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GTTTGCCTCTTTTGGGTAATGGGTTTAAAAGGGTGGCGAGTGGTTGAAGGAGGTGCTGGCATTATATCTTTTTTTCTGTTAAGTATGCATAATGCATGTGCGGAGTTGATTCGGTAGTCA
TTTCTGTTTTACAATATCTTCCCACTAAGATACACAAGAATTATTCGTTTACTGTTTATATATGATCCTTACTTTTAATGCATCATATATACAAGATTTTATATTTGTAACAATATATTT
TTTAAATGAAGCAGTATTTTACTGGATAACGTCACAATAATATATGATGACGATATAAATTGATGTTTTATTTTTTTTTCTTGTATGTTTTCTAACATTTTAAAACTACACACCCACAAA
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TGGTAAGTTACCTGAGGCGGCTTGATAAAAGTTTGAAACGAGCCTGGTATTTATATAAAGCTTGACTAGACCCACGTATCTAAACGAGATTGCATTTATGATCATTTAACAAAAGAGGTT
GAACACGTGTTTCACGTATAAAGCTTGACTAGACCCGCGTATCTAAACGAGCCTAGTATTTATATAAATAATACCAAAGGCTTTGTAGCATAGCGGTATCAAGGTGCAATAAAAGGTGTC
ACATTGTAGACAAAAGTGTAGATATAGGAGTATAGATAATAATTATTTCCATTAGGTTTGGGAAAAAATAACTTTTTTTTGAATTTCTTTTGTAAATTACATGTTCTTCCAATTTGCTAC
ACGACATTCTTTTTATATATACTTCTAAACTTAAGTTATATACTTCTAATAACAATTTTACGAAAACTTTGATTTATAATATTACTCATAATATTTATAAAAATTAAAAAGCGCTACTTA
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CATACCGGTAAACTAAGGGAACGGCAAAAAGTTGTACCGCTGGTAAATTGTGTTATACCGTTTTAAACTGGTTATACCGATACCAGACTAAGGTTAAAATTTGGACTTCTAATCTTTTAT
GGGCCCAAAAGGTGAGGATCTACCTTTTTCGTAAAACCTAGCGCTCACAATCCACATCGATCAAACTTCATCTATAATCCACATCAGTTGTTGGGTTATTTTTTTATTATGGAATAACTT
TTGGATATTTTTTGTTATGGAATGATTTAGTTTTGATTATTTTTTGAGTTGAAATTGTATTTATAGATTTATAGAGTTAATTAGTCAACCCGGTTGAACCGTCCAATACAACCCGGTTCA
ACCGGTTGAACCATTTCTGATGCTAACCCGGTATGATTAAAATACCGGTTTTAAAACATTTCATGGGAGTTAAGATTAAGTCTGGCTTTTTAAAACTGAAAACTGATAAACAGATAATAA
TGGTGAGTGCGTCAGCAAACAAGCTATCAAGGTTGCAAGACCAAGCAGAAGAGTATGCAGCTCTAATTATGGAAGAATTGGACCCCCAAAGACTTGGCTACATTGAG
GTGCGTGCATTGG
CGAAGCCACGCCCCCCCGAATTTTCGCAAAACCGGGGGGGCGGCAACGTATATACCTATACGAAAGTACTATTTATAACACTACGCATCGAAAAGTTCGGGGGGTCGGGCGCCCCCCCCG
GACATAGCTTATCCTGCGCCAATGGGTGCGTGTGCGTGTGTGTGGGTGTTTTCCACTCGTATATATGTCAAAATTGTTAATTATAAAATGCAAAGAGTTAAAGCAATTTAAAAGAACGAA
TAATGTAATCATAATTCATACAAGTATGCCTCTTCCTAGTTGTATATATGATTAGGGTTGATTATTCAATGATTAGTGTCTTTTTAACTTGTAAACCCATACAAATTATAAGTAGCTAGC
TAGCTAACTTACGTTAATAGATCATCTATATTCACACGTCTTCTATCTATTAATTATAATATTGATATCGTTTCTTATTCATTTAGCTAATAATTAGGTATTCTAATTCTAAACATTATA
ATGCATGTTAAAGTCAGTCGTTATTCATTTTTATGTACTAGAATGTTACACGTTATTTTGTTCCCATCACTGAATTTGTTATATATAGAGTCCCTCAATTACGCGTATTCTCCACTATGC
CATGGGCCAGTCACCAGTGTGTATAAAGCTAAGTGGTCAACCATATATTGTCATCATAAAATACAAAAAAGAATAATCATATCCTCACTCACATTTATATTTGAACATACAACATGACTA
GTTGTACCATAACTCCATAACACTTTATTTCTTTTTCTAGCCAATTTCAGCTTTAATAATCATCATAAATTTATTTGAACATAAGCAAATAAAATCATCAAAGTTACAATTTTCTTAGTT
AGTGTGATCTCATTAACTTATTAATATAAAAATGTATATGATATTATGTTATGATCATCCAGCTATGGCAGCTCGAAACACTTCTGTTACAGAAAGACACTTACTTGAACTACAGTCAAG
CCTTGAGCTACACAAGCCAAGCCTTGAGCCAGAACCTCTTGAGAAACCATAGCCCAATAAAGCGAATCAGCTTCAAATTCCTTTATTATTTACAAGAGAACTGGAGAAGACTTTGGATTA
TCAGCTTATGGATATTGATTATGATAGGTCTATTTCATTGGAAATACTTCCAATACAAACAAAGGGCTGCATTTGACGTTATGGGCTACTGCGTTCTCTCCGCTAAAGGCGCAGCCGAAA
CTCTCAAGCTCAATATGGCTATCGTGTTATTGCCTGTGTGCAGGAACACCATAACTTGGCTGAGGTCCACCAAGTTATCTTATTTTATACCGTTTGATGATAACATCAACTTCCATAAG
G
TTCAAATCTATTACCCTTCTACGTGTTATAACTAGATTACATGTTAAATAGGTTCTGGTTAAATAAATGACATTTTTAGTAGTGGTTGAAACGGGTCAGAGCTGTATATACAAACATAAT
ATTACTACAGTAGTAATAAAAATATTGAATAAATAATTTAGAGTTAATTATGTTTTTCGTCCCTGTGATCTGTTGAAAATAACCATTATAGTCCACCTCACTTAACACCGTCCATTTAAC
CCGTTAAAATGAGTGGACGAAAAGGCAAGCACGTGGTCTGACTAACGGGTTAAATGGATAGTGTTAAGTGAGGTGGATTGTAATTGTTACAAAAGTGAAAGTATAGGTACTGTTTTTGCA
ATTTTTAAACTAATGGAATGTAATGGTTATTTTCAACAAACCATAGGGACGAAAAAAGTAATTAACTTTCTTTTTAAAAGGAATGGACGAAAATGCCCCTGCACATGCAAAGCACGTAGT
CTGACTAACAGATTAAATGGATGGTGTTAAGTAAGGTAGACTGTAATTGTTACAAAAGTGAAAATACCGGTACCATTTTCGCAAGTTTTAAACTAATAGAGTGTAATGGTTATTTCAGTG
ACTCAATAATTTAAAATGTTGTATTAACTGAAAACAGAATCTAAGTGATTTAAATTTCTTTTACAGACGGTAGCTGCAGCCATTGTAATGGGTATAATACTCCATGCGGGAAACCATCTG
GCATGCGATTTCCCAAGGCTTATAAACGAAGACGAAAACAGCTACGCTCTTAACATGAGTAAATACTTCGGGGAAAACAAACCGAGCTATATAACCCTGCTTCGAGGGGTAGAGGGTGTA
ACCGGAATCATAATGGTGGTATGCATGACGATTGCCTTCACACTCGCAACCAGATGGTTCAGGCGAAGTCTAGTGAAGCTACCAAAACCATTTGATCATCTCACTGGCTACAATGCCTTC
TGGTATTCACATCACCTTTTTGTGATCGTCTACATTTTGCTGCTAGTACATGGATGGTTCCTTTATTTGGTGAAGGAATGGTACAAAAAGACG
GTATGTATGATTGAAAACTTATTGCCT
ATTAGTTTAGCAATAAAAGGTGTTTTAGTTGTAAGTTATAACTGTCACCTAATGTGGTTACAGACATGGATGTATCTTGCATTTCCGGTTTTGCTTTATGCAGGCGAAAGAACGCTTAGA
TTCTTTCGGTCTGGCTCCTATACTGTCCGCCTTCTAAAG
GTTAGCAAAATGCGTCAAAGTTTCAACCTTTTTAACTTGTCTTATTTTTTATTGTAAAATTATTTAGGTTGCGATTTATCC
GGGTAACGTTCTCACGTTACAAATGTCCAAGCCTCCTAAGTTTCGGTATAAGAGTGGACAATACATGTTTGTTCAATGCCCGATTGTATCTTCATTCGAATG
GTGAATTTTCATTTCTAA
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CTTGAAACATGGCAGGTCCATCCAAAAAACTAACAACTGTTAGAACCTGCTGTTAACTAAAGGAAAATGACGTTTTTACCCTTCATTAAACGGTAGGTTTAATAAACGTTAAATTCTTGG
ACGGAACTGCCATGTTTCAAGAATATCAAGGACAGAGATGGTAGAGATTTGTAATTTGCCCTGGACTAATGGCACTTAACTCTTTTACATAAGAATAACAGTTAAACTAGCCATTTATCA
TGCTAAATTGTATTCTATTTCAGGCATCCATTTTCAATCACGTCTGCTCCAGACGATGATTATCTTTCAGTTCACATACGACAGCTAGGTGATTGGACACTAGAACTAAAAAGGGTATTT
TCGGAAGTCTGTGAACCACCTCTAGCTGGCAAAAGCGGGTTGCTCAGAGCAGACGAAACCACCAAAGCAAC
GTATATATATTTATTTAGCCACCCTTCTTTATTTATATGGGTCAGTTGG
TTTGAAACGGGCTGGGCCTGGTCAACGCACAAATACTACTTTTTTGGTTTGACGTGTTCTTCTCTTGATCATATTTTTTGACCCGTTTGAGATAGAACACTTTCACACAACCCAAAATGA
TGTAACCACATAAGATGGCCATGCGACATGCATGTCTTTTAATATTATGTGTAACTTTATTTTAGCTTGCCGAGACTATTGATTGACGGGCCGTATGGTGCTCCTGCACAAGACTACCGT
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GTAAGTAACTTTTGA
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TCGCCCAGAAAGAAGAAAGGTGTAAGGACGACAAATGCATACTTTTATTGGGTGACTAGAGAACAAGGTTCATTTGACTGGTTCAAAGGGGTGATGAACGAAGTTGCGGAATGTGACCAT
CAA
GTATACTCTAATACTTACTAAACAAACATTCATATATTTTCTTGATATCCAGAGTAGGGGTGTTCAAAACCAGATATACGAAAATTCGGATATCCGAAATTTTCGGATATCCGAAAT
TTTCGGATACCAGATTTCACTATCCGAATCCGTATCCGAAATTTCGGATATCCGGACCCAAATTCCGGATATGGATTCGGATAGTAAATCGGATATCCGAAAATTCAACTTTTTATTTAA
TTTTTATTTCTTTAGTATTTTTTTCATATTCGGAAACGGATATTTTGGATAGTTTCGGATATCCGAATATAAGTTTTCGGATATTTCGGATATTTTCGGATACTTCGGGTATATTCGGAT
ATTTGGATATCCGAAAAAAATGAAAATTAAATTTTCGGATATTTCGGATATCCGAAATATCTGAAAATTTTGAAAATCACTATCCGAATCCGAATCCGAAAATTTCGGATATCCGAAATT
TCGGATATCCGGTTTTTCGGATATTTCGGATTCGGATATCGGATATTTCGGATTGGATTTTTCGGATACGGATAGTTTTGAACACCCCTAATCCAGAGTCACTTATGAATAAAACTCTAT
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Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
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AGTGTAGGTATGGACACTCCGGTAACCGCAACATCGAATCGGTCACGGCAGTCATCCATGAGGATGCAAAACGACGTCGTAGGAGTGGATTCACATTCACGCGGAGTGCGTGATGGTGAG
GTTGATCGAAGTCGTTGCGGTACTGGTAAAGCTCTAAAAGGTCTCCGATTCATCAGTAATGGTAAAATCAACGGTGTGGATGGTTGGAAGGAAGTTGAGATTAATTTCGATAAGTATGCA
AAGGATGGATATCTGTATCGTGCTGATTTCGCACAATGCATAG
GAATGAGAGATTCAAAGGAGTTTGCAGTTGAAGTGTTTGATGCAATTAGCAGAAGAAGAAGACGTAGGCTAAAAGTT
GACAAGATCAGTAGAGATGAGTTATCTGAATATTGGTCACAGATCACTGATCAGAGCTTCGATTCTCGCCTCCAGATCTTCTTCGACAT
GGTAGACAAGAACGAAGATGGAAGAATCACT
GAAGAAGAAGTTAAAGAG
ATAATAATGGTGAGTGCGTCAGCAAACAAGCTATCAAGGTTGCAAGACCAAGCAGAAGAGTATGCAGCTCTAATTATGGAAGAATTGGACCCCCAAAGACTT
GGCTACATTGAG
CTATGGCAGCTCGAAACACTTCTGTTACAGAAAGACACTTACTTGAACTACAGTCAAGCCTTGAGCTACACAAGCCAAGCCTTGAGCCAGAACCTCTTGAGAAACCAT
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ATAACTTGGCTGAGGTCCACCAAGTTATCTTATTTTATACCGTTTGATGATAACATCAACTTCCATAAG
ACGGTAGCTGCAGCCATTGTAATGGGTATAATACTCCATGCGGGAAACCAT
CTGGCATGCGATTTCCCAAGGCTTATAAACGAAGACGAAAACAGCTACGCTCTTAACATGAGTAAATACTTCGGGGAAAACAAACCGAGCTATATAACCCTGCTTCGAGGGGTAGAGGGT
GTAACCGGAATCATAATGGTGGTATGCATGACGATTGCCTTCACACTCGCAACCAGATGGTTCAGGCGAAGTCTAGTGAAGCTACCAAAACCATTTGATCATCTCACTGGCTACAATGCC
TTCTGGTATTCACATCACCTTTTTGTGATCGTCTACATTTTGCTGCTAGTACATGGATGGTTCCTTTATTTGGTGAAGGAATGGTACAAAAAGACG
ACATGGATGTATCTTGCATTTCCG
GTTTTGCTTTATGCAGGCGAAAGAACGCTTAGATTCTTTCGGTCTGGCTCCTATACTGTCCGCCTTCTAAAG
GTTGCGATTTATCCGGGTAACGTTCTCACGTTACAAATGTCCAAGCCT
CCTAAGTTTCGGTATAAGAGTGGACAATACATGTTTGTTCAATGCCCGATTGTATCTTCATTCGAATG
GCATCCATTTTCAATCACGTCTGCTCCAGACGATGATTATCTTTCAGTTCAC
ATACGACAGCTAGGTGATTGGACACTAGAACTAAAAAGGGTATTTTCGGAAGTCTGTGAACCACCTCTAGCTGGCAAAAGCGGGTTGCTCAGAGCAGACGAAACCACCAAAGCAAC
CTTG
CCGAGACTATTGATTGACGGGCCGTATGGTGCTCCTGCACAAGACTACCGTAAATACGATGTTCTTTTGCTTGTTGGACTCGGCATTGGAGCAACACCTTTTATTAGTATTCTTAAAGAT
TTGCTAAACAACATTGTTAAATCGGATGAATTAGAA
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AGGACGACAAATGCATACTTTTATTGGGTGACTAGAGAACAAGGTTCATTTGACTGGTTCAAAGGGGTGATGAACGAAGTTGCGGAATGTGACCATCAA
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Retrieve as FASTA  
cDNA
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