Entry information : CirDiOx01 (QPDY-2030997)
Entry ID 13921
Creation 2016-10-18 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-10-18 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-10-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CirDiOx01 (QPDY-2030997)
Name (synonym) CirDiOx01 (QPDY-2030997)
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Coleochaetophyceae Coleochaetaceae Coleochaete
Organism Coleochaete irregularis    [TaxId: 187194 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CirDiOx01
start..stop
S start..stop
MtDiOx01 592 0 11..652 31..627
PsDiOx01 592 0 11..651 31..626
NatDiOx01 587 0 11..653 30..627
CclDiOx02 581 0 11..651 26..622
Literature and cross-references CirDiOx01 (QPDY-2030997)
Protein sequence: CirDiOx01 (QPDY-2030997)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   676
PWM (Da):   %s   76470.15  
PI (pH):   %s   6.86
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTVVDRNGKP KISLLHKLLY QVLAFIDRHF QFNNVPTLLG LLYLGLRRLL MNEDNLIPVG PPKQPELRED SHAFPYRDED GEYTDPFMPK AGAQFSFFGR LMPAQPQGEY KEESKAPTGF  FSKVGDMKER LKDTVAAGLH LGGPKYSLLD PHPSLVAEKL LVRKSTDAKD IINAGDQFNM LAASWIQFNI HDWIDHEEKE DKLQEISAPA GVKCPLGNFK FYATKETPTN QMYPTTGHRN  IRTAWWDGSV VYGQSEERAK TVRTHKDGKV RLNDKGLLEY EANGVQVVGD VKNPFLGVTL LQLLFMKEHN RVCDILKAAH PDWDDDKLYH TARLVIAALI AKIHTIDWTV ELLKTPLGKA  SLNTNWYGLF GKAFKKKHGH LGNAALSGFP GSKAANNHGV PYALTEEFTS VYRLHPLLVE EIDIYDASSP VDPATHLPSK KALTASMQDM ILGQGDKILD QYGEASVWVS YGATSCGLMR  LHNYPVFLRK LIPTNTDGTP RMEHPIDLAA LEIYRDRERG VPRYNNFRRG LHLNPISKWS DLTVNKQYQK ELQEVYGDDV EKLDLMVGLF AEDLIPGWAI TETSFFVFLS MASRRLDADR 
FFTSEYNEET YSKEGLEVVE TTESMKDLLM RHFPDVVIKY LKVDSVFNKW NGNAKAFPDH ATWELFLMTG PKKPVA 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from RNA seq (1KP)
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGGTGG TTGACCGGAA TGGCAAGCCC AAGATTTCCT TGCTCCACAA GCTCCTCTAC CAAGTGCTGG CCTTCATTGA CAGACATTTC CAATTCAACA ACGTACCCAC CTTGCTGGGA  CTTCTTTACC TTGGACTGCG TCGTCTTCTA ATGAACGAGG ACAACCTAAT CCCCGTGGGG CCCCCGAAGC AGCCTGAACT GCGTGAGGAC TCGCATGCGT TCCCTTACCG CGACGAAGAC  GGGGAGTACA CGGACCCATT CATGCCAAAG GCCGGAGCAC AGTTCTCCTT CTTCGGACGC TTGATGCCTG CTCAGCCGCA GGGCGAATAC AAGGAGGAGT CCAAGGCCCC CACCGGTTTC  TTCTCCAAGG TAGGCGACAT GAAGGAGCGC CTCAAGGACA CCGTTGCCGC CGGCCTCCAC TTGGGGGGCC CCAAGTACTC TCTCTTGGAC CCCCACCCAT CTCTGGTGGC TGAGAAGCTT  CTCGTGCGCA AGAGCACGGA CGCCAAGGAC ATCATCAATG CCGGTGACCA GTTCAACATG CTCGCCGCCT CATGGATCCA GTTCAACATC CACGACTGGA TTGACCATGA GGAGAAGGAA  GACAAGCTCC AGGAGATCAG TGCTCCAGCA GGAGTCAAGT GCCCGCTTGG CAATTTCAAG TTCTATGCAA CCAAGGAGAC CCCAACAAAT CAGATGTACC CCACAACAGG ACACAGGAAC  ATCCGTACTG CGTGGTGGGA CGGAAGCGTT GTCTACGGAC AGTCTGAAGA GCGTGCAAAG ACCGTGCGTA CACACAAGGA TGGGAAGGTC CGGCTCAACG ACAAGGGGCT GCTCGAGTAC  GAGGCTAACG GAGTTCAGGT TGTTGGAGAC GTTAAGAACC CGTTTTTGGG TGTCACGCTC CTGCAGCTCC TGTTCATGAA AGAGCACAAC CGTGTGTGCG ACATCCTCAA GGCCGCCCAT  CCCGACTGGG ATGATGACAA GCTCTACCAC ACTGCGCGCC TTGTCATTGC CGCGCTCATC GCCAAGATCC ACACCATCGA CTGGACCGTC GAGCTCCTCA AGACGCCCCT TGGAAAAGCG  TCACTCAACA CAAACTGGTA TGGCCTCTTC GGGAAGGCGT TCAAGAAGAA GCACGGACAC CTGGGAAACG CTGCCCTGAG CGGATTCCCT GGCAGCAAGG CTGCAAACAA CCATGGAGTC  CCTTACGCCC TCACAGAGGA GTTCACATCC GTGTACCGCC TGCATCCATT GCTTGTGGAG GAGATTGATA TCTACGATGC CAGCAGCCCA GTTGACCCAG CCACGCATCT GCCCAGCAAG  AAGGCCCTCA CGGCAAGCAT GCAGGACATG ATCCTCGGGC AGGGGGACAA GATCCTGGAC CAGTACGGCG AGGCATCCGT GTGGGTGTCT TACGGCGCGA CGTCGTGCGG CTTGATGCGC  CTGCACAACT ACCCTGTCTT TCTGCGCAAG CTCATCCCCA CCAACACCGA CGGGACTCCC CGCATGGAAC ATCCCATTGA CCTCGCGGCT CTTGAGATCT ACCGTGACAG GGAGCGTGGG  GTGCCCCGCT ACAACAACTT CCGCCGTGGC CTCCACCTGA ACCCAATCTC CAAGTGGTCA GACCTCACTG TCAACAAGCA GTACCAGAAG GAACTGCAGG AAGTCTACGG AGATGATGTT  GAGAAACTGG ACCTCATGGT CGGCCTGTTT GCCGAAGACC TTATCCCAGG GTGGGCCATC ACCGAGACAT CCTTCTTCGT CTTCCTCTCC ATGGCCTCCC GGCGCCTGGA TGCTGACCGC  TTCTTCACAT CCGAGTACAA TGAGGAGACG TACAGCAAGG AGGGCCTGGA GGTGGTGGAG ACCACGGAGT CTATGAAGGA CCTTCTCATG CGCCACTTCC CGGATGTGGT CATCAAGTAC 
CTCAAGGTGG ACAGCGTATT CAACAAGTGG AATGGGAATG CCAAGGCCTT CCCCGACCAT GCCACGTGGG AACTGTTCTT GATGACCGGT CCTAAGAAGC CTGTGGCCTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTTGTCCGGC AAAACATGCC CCGGAAGGGG CAAAACATGT TTCGGAAGCG GCCAAACGCT ACAGGACTTT CGTCCATAAA TAAACATCAG GCTCAAGCAG TTTTTGTGAG TGGAGTCCGC  CAAAGATCAC TGCAAGTATC ATCAACACTT AGAGCTTTTT GAACAAGGTT GTCGAGATGA CGGTGGTTGA CCGGAATGGC AAGCCCAAGA TTTCCTTGCT CCACAAGCTC CTCTACCAAG  TGCTGGCCTT CATTGACAGA CATTTCCAAT TCAACAACGT ACCCACCTTG CTGGGACTTC TTTACCTTGG ACTGCGTCGT CTTCTAATGA ACGAGGACAA CCTAATCCCC GTGGGGCCCC  CGAAGCAGCC TGAACTGCGT GAGGACTCGC ATGCGTTCCC TTACCGCGAC GAAGACGGGG AGTACACGGA CCCATTCATG CCAAAGGCCG GAGCACAGTT CTCCTTCTTC GGACGCTTGA  TGCCTGCTCA GCCGCAGGGC GAATACAAGG AGGAGTCCAA GGCCCCCACC GGTTTCTTCT CCAAGGTAGG CGACATGAAG GAGCGCCTCA AGGACACCGT TGCCGCCGGC CTCCACTTGG  GGGGCCCCAA GTACTCTCTC TTGGACCCCC ACCCATCTCT GGTGGCTGAG AAGCTTCTCG TGCGCAAGAG CACGGACGCC AAGGACATCA TCAATGCCGG TGACCAGTTC AACATGCTCG  CCGCCTCATG GATCCAGTTC AACATCCACG ACTGGATTGA CCATGAGGAG AAGGAAGACA AGCTCCAGGA GATCAGTGCT CCAGCAGGAG TCAAGTGCCC GCTTGGCAAT TTCAAGTTCT  ATGCAACCAA GGAGACCCCA ACAAATCAGA TGTACCCCAC AACAGGACAC AGGAACATCC GTACTGCGTG GTGGGACGGA AGCGTTGTCT ACGGACAGTC TGAAGAGCGT GCAAAGACCG  TGCGTACACA CAAGGATGGG AAGGTCCGGC TCAACGACAA GGGGCTGCTC GAGTACGAGG CTAACGGAGT TCAGGTTGTT GGAGACGTTA AGAACCCGTT TTTGGGTGTC ACGCTCCTGC  AGCTCCTGTT CATGAAAGAG CACAACCGTG TGTGCGACAT CCTCAAGGCC GCCCATCCCG ACTGGGATGA TGACAAGCTC TACCACACTG CGCGCCTTGT CATTGCCGCG CTCATCGCCA  AGATCCACAC CATCGACTGG ACCGTCGAGC TCCTCAAGAC GCCCCTTGGA AAAGCGTCAC TCAACACAAA CTGGTATGGC CTCTTCGGGA AGGCGTTCAA GAAGAAGCAC GGACACCTGG  GAAACGCTGC CCTGAGCGGA TTCCCTGGCA GCAAGGCTGC AAACAACCAT GGAGTCCCTT ACGCCCTCAC AGAGGAGTTC ACATCCGTGT ACCGCCTGCA TCCATTGCTT GTGGAGGAGA  TTGATATCTA CGATGCCAGC AGCCCAGTTG ACCCAGCCAC GCATCTGCCC AGCAAGAAGG CCCTCACGGC AAGCATGCAG GACATGATCC TCGGGCAGGG GGACAAGATC CTGGACCAGT  ACGGCGAGGC ATCCGTGTGG GTGTCTTACG GCGCGACGTC GTGCGGCTTG ATGCGCCTGC ACAACTACCC TGTCTTTCTG CGCAAGCTCA TCCCCACCAA CACCGACGGG ACTCCCCGCA  TGGAACATCC CATTGACCTC GCGGCTCTTG AGATCTACCG TGACAGGGAG CGTGGGGTGC CCCGCTACAA CAACTTCCGC CGTGGCCTCC ACCTGAACCC AATCTCCAAG TGGTCAGACC  TCACTGTCAA CAAGCAGTAC CAGAAGGAAC TGCAGGAAGT CTACGGAGAT GATGTTGAGA AACTGGACCT CATGGTCGGC CTGTTTGCCG AAGACCTTAT CCCAGGGTGG GCCATCACCG  AGACATCCTT CTTCGTCTTC CTCTCCATGG CCTCCCGGCG CCTGGATGCT GACCGCTTCT TCACATCCGA GTACAATGAG GAGACGTACA GCAAGGAGGG CCTGGAGGTG GTGGAGACCA  CGGAGTCTAT GAAGGACCTT CTCATGCGCC ACTTCCCGGA TGTGGTCATC AAGTACCTCA AGGTGGACAG CGTATTCAAC AAGTGGAATG GGAATGCCAA GGCCTTCCCC GACCATGCCA  CGTGGGAACT GTTCTTGATG ACCGGTCCTA AGAAGCCTGT GGCCTGAGCG GAGGACACAA GGGGATGATG ATGGGCGGCC TCGTCTCTGC TGGAGGTCGC TTGGAGTGGT GGAGATAGGA  AGGGGCAGAT GAGTTGGTTG GTGCTGGAGG TGGAAAGGGA GAGAAGCAAG AAGTGGAAGG CAGTAGGGGT GGGAGAGGGA GAGGGACTAC AGAGAACGAG TGAAGTGGAG AGAGGTATAT  TGGGGGAAGG GGGTGGGGAG GCAAATTGGC TAACTCGGTA AGCGTGGTGG TCGCAAGGTG TTTGGTTGGT TGAGAAGGGG AGGAGGGTGA ATGAGAGGGT AAGGGACATG CAGCAGGGAT  GGATGGGAGG GTCGTGGCAT GGCAAAAATT TCTCTTACTT GGTGGAAAGA GAGGCAAGGG CTGAATATCA GGTTGTATTT GTAAGGATGT CATAATTATC AAAATGTCAA GGAGAAAGAG  GTATATTAGT GGGTATCATT GTGCATGGAG ATAAAGGTGG CATGTGAAAG TTCTTTCTGT AATGTCAGTG TCATTGCAAA AAGGAAGGTG GCCATGGTCA ATAGTATGTG TTCTTGCCTG  TTGTTAGATT GGCATGACAC GCTCAGCAAG CATGTGCACA AGTAGTCAAA CACCGAAGAA AGTGTTGATG TGTCAAAGCA TAGTCGGCAA ATTCTGCATG AAGTCGTACA TGTCCACGTC 
ACGTAGTCAT CAATATGGCC TGAGACAAGC CTTCTATCAA ACAAAAACTT TCTATAGTCT TTTTGGCATG AGATGATGGT TTTGAATAAT TAGCAAGCTT TT 

Retrieve as FASTA