Entry information : AtCPF01 (AT3G55040/GSTL2/CPFA5)
Entry ID 13975
Creation 2016-10-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-10-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-10-24 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtCPF01 (AT3G55040/GSTL2/CPFA5)
Name (synonym) AtCPF01 (AT3G55040/GSTL2/CPFA5)
Class CPF Grx    [Orthogroup: CPF002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtCPF01
start..stop
S start..stop
ThasCPF01 377 9e-133 59..288 69..298
HaCPF03 303 1e-104 56..285 1..229
ThasCPF04 297 2e-102 58..285 6..232
ThasCPF03 297 2e-102 57..285 5..232
Literature and cross-references AtCPF01 (AT3G55040/GSTL2/CPFA5)
Omic ref. AtProteome:   At3g55040 ATTED-II:   At3g55040 e-FP Browser:   At3g55040 TAIR:   At3g55040
Protein sequence: AtCPF01 (AT3G55040/GSTL2/CPFA5)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   293
PWM (Da):   %s   33037.09  
PI (pH):   %s   7.4
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSVGLKVSAF LHPTLALSSR DVSLSSSSSS LYLDRKILRP GSGRRWCKSR RTEPILAVVE SSRVPELDSS SEPVQVFDGS TRLYISYTCP FAQRAWIARN YKGLQNKIEL VPIDLKNRPA  WYKEKVYSAN KVPALEHNNR VLGESLDLIK YIDTNFEGPS LTPDGLEKQV VADELLSYTD SFSKAVRSTL NGTDTNAADV AFDYIEQALS KFNEGPFFLG QFSLVDVAYA PFIERFRLIL 
SDVMNVDITS GRPNLALWIQ EMNKIEAYTE TRQDPQELVE RYKRRVQAEA RL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAAATCCTT TCAGGAGCTG AGAAAGTGAA AGCTGTGAGG TATGAGTGTG GGACTGAAAG TTAGCGCGTT CTTACATCCA ACGCTTGCGT TATCCTCGAG AGATGTCTCT CTCTCTTCCT  CATCATCTTC TCTCTATCTT GATCGGAAAA TTCTCCGACC AGGCTCCGGG AGACGGTGGT GTAAATCCCG AAGAACCGAA CCAATATTGG CTGTTGTAGA GTCAAGGTAA TCAATCAAAT  ATGTTTTTCC TTCTATGAAG AGTGATTACA AGTTTAGTTG TGTATTGAAA GGTTACTATT TTGCAGTCGA GTACCGGAGC TTGATTCTTC TTCAGAACCA GTTCAAGTAT TCGATGGATC  AACAAGGTTT CGGTTTTCTA AAAATGCTTT TTTTATTTGT TTCATGTCTG GATAGATATT AGAGAAGTTG TTGATGAACA ACTTTTGGTT TGTGTGATTT TAAGGTTGTA CATATCTTAC  ACTTGCCCAT TTGCTCAGCG TGCGTGGATT GCTCGCAACT ACAAGGTTTC AAATTTGAAT CATTCTTCTT ATCGATGTTT CTATATATCT ATATCAATTT CTTTATGTTG CTTGTTTGTG  TAGGGTCTGC AAAACAAGAT AGAACTTGTA CCGATCGATC TTAAAAACAG GCCTGCTTGG TATAAGGAGA AAGTTTACTC GGCTAACAAG GTGTGAACTT TTCTATTTTA ATGCATATAT  ATGTGTGAAA GGATTTAGAG TTTTATGGCT TTTGTTCTCT GTTATATGCA GGTGCCTGCA TTAGAGCACA ATAACCGAGT ATTGGGAGAG AGCCTTGATC TGATTAAGTA CATTGACACT  AATTTTGAAG GGCCTTCGCT TACACCCGAT GTGAGTATCT ATGACATCTT TGATTTATTG AGCTCAATTT TAACACATTA AGTGAACCTA TACTTAGAAG AGAGATATCC ATGGATGGAA  TAATAACAGG GTTTAGAGAA GCAAGTTGTA GCTGATGAGT TACTCTCTTA CACTGACTCC TTCTCCAAGG CTGTAAGATC CACATTAAAC GGCACTGACA CTAATGCAGC AGGTGATTAG  AAGATGAAGT TGTTATCTTA CTTCTGTGTT TGCAGATACA TTATGTTGGC ATGTGTATGA ATCTTGTCTT TCATTTTTTC AGATGTTGCA TTTGATTACA TCGAGCAGGC TCTTTCCAAA  TTCAATGAAG GGCCTTTCTT TCTTGGTCAA TTTAGTTTGG TATTGTCGAT TATATTTCTA TATTCAATTT GCCATACCCA TATCAACTCT TGCTGCTGAG AAAAAAAATG GTGTTTATTT  CTATAGGTTG ATGTTGCATA TGCTCCTTTC ATAGAGAGAT TTCGGCTTAT CTTAAGTGAT GTGATGAACG TCGATATTAC ATCTGGTCGG CCTAACCTTG CCCTTTGGAT TCAGGTTAAG  CTATTACCTA GACATTTGTA ACTACCTTTC ATTCTAAGGC TAAATATTCC CCATACACAT GCTAATCTCT GGTTCTTTGC TTTTATGCAG GAGATGAACA AAATCGAAGC TTACACCGAA  ACCCGTCAAG ATCCACAAGA GCTTGTTGAA AGATACAAGA GACGAGTCCA AGCAGAAGCA CGTCTCTAAC CAGATGGTTC TCCGGATATC TCCATTTACA AGGGTTTAGA AGGATCAAAT  GGGAAGAGAT ATTGTAACCA AAGTTTTTTA TATATATAAA TTATATTGTA TCGGTAAAAG CATCTACATG ACATGCAACA ATTGTTTTCA TTTATATCAG AATTCATGAG ACCAAGTCTT 
CGACTAGAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTGTGG GACTGAAAGT TAGCGCGTTC TTACATCCAA CGCTTGCGTT ATCCTCGAGA GATGTCTCTC TCTCTTCCTC ATCATCTTCT CTCTATCTTG ATCGGAAAAT TCTCCGACCA  GGCTCCGGGA GACGGTGGTG TAAATCCCGA AGAACCGAAC CAATATTGGC TGTTGTAGAG TCAAGTCGAG TACCGGAGCT TGATTCTTCT TCAGAACCAG TTCAAGTATT CGATGGATCA  ACAAGGTTGT ACATATCTTA CACTTGCCCA TTTGCTCAGC GTGCGTGGAT TGCTCGCAAC TACAAGGGTC TGCAAAACAA GATAGAACTT GTACCGATCG ATCTTAAAAA CAGGCCTGCT  TGGTATAAGG AGAAAGTTTA CTCGGCTAAC AAGGTGCCTG CATTAGAGCA CAATAACCGA GTATTGGGAG AGAGCCTTGA TCTGATTAAG TACATTGACA CTAATTTTGA AGGGCCTTCG  CTTACACCCG ATGGTTTAGA GAAGCAAGTT GTAGCTGATG AGTTACTCTC TTACACTGAC TCCTTCTCCA AGGCTGTAAG ATCCACATTA AACGGCACTG ACACTAATGC AGCAGATGTT  GCATTTGATT ACATCGAGCA GGCTCTTTCC AAATTCAATG AAGGGCCTTT CTTTCTTGGT CAATTTAGTT TGGTTGATGT TGCATATGCT CCTTTCATAG AGAGATTTCG GCTTATCTTA  AGTGATGTGA TGAACGTCGA TATTACATCT GGTCGGCCTA ACCTTGCCCT TTGGATTCAG GAGATGAACA AAATCGAAGC TTACACCGAA ACCCGTCAAG ATCCACAAGA GCTTGTTGAA 
AGATACAAGA GACGAGTCCA AGCAGAAGCA CGTCTCTAA 

Retrieve as FASTA