Entry information : AtCPF03 (AT5G02780/GSTL1/CPFA3)
Entry ID 13977
Creation 2016-10-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-10-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-10-24 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtCPF03 (AT5G02780/GSTL1/CPFA3)
Name (synonym) AtCPF03 (AT5G02780/GSTL1/CPFA3)
Class CPF Grx     [Orthogroup: CPF002]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtCPF03
start..stop
S start..stop
ThasCPF03 363 4e-129 10..237 7..234
ThasCPF04 356 2e-126 4..237 3..234
AtCPF04 349 8e-124 3..235 1..232
HaCPF03 320 2e-112 17..237 12..231
Literature and cross-references AtCPF03 (AT5G02780/GSTL1/CPFA3)
Omic ref. AtProteome:   At5g02780 ATTED-II:   At5g02780 e-FP Browser:   At5g02780 TAIR:   At5g02780
Protein sequence: AtCPF03 (AT5G02780/GSTL1/CPFA3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   238
PWM (Da):   %s   27149.94  
PI (pH):   %s   4.71
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALSPPKIFV EDRQVPLDAT SDPPALFDGT TRLYISYTCP FAQRVWITRN LKGLQDEIKL VPIDLPNRPA WLKEKVNPAN KVPALEHNGK ITGESLDLIK YVDSNFDGPS LYPEDSAKRE 
FGEELLKYVD ETFVKTVFGS FKGDPVKETA SAFDHVENAL KKFDDGPFFL GELSLVDIAY IPFIERFQVF LDEVFKYEII IGRPNLAAWI EQMNKMVAYT QTKTDSEYVV NYFKRFM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGTTTGATC CATAGTTCCT TTAAAACATC ATATCTGCAA TAATAATCCC CTGAAGAAAC AACTCTTATC AAATCCTCTC CATGGCTCTA TCTCCTCCGT AAGATCCTTT TTGTTTACTT  TATGAGGTTT CTTGATTAGT ATAAAGTCGT TTTTTCTTGT TAAATCTATA TTCATCTCCT TGATTTTTTT TCCTTTATCA AGAAAAATTT TCGTAGAAGA TCGTCAGGTT CCGCTCGATG  CTACCTCTGA TCCACCTGCT CTGTTCGACG GAACCACAAG GTTGTACATA AGCTACACTT GCCCATTTGC ACAACGTGTT TGGATTACAA GAAACCTCAA GGTACTTGTT TTTTATATAT  TTATGGTATA TATGTATGTA AATTGAGATC GAGATGAAAA ATTTATAAGC AAGATTTGTT GATTTGTTTG ACATTGGGGA GTTTTAGGGT CTGCAAGATG AGATCAAATT GGTTCCTATA  GATCTTCCTA ATAGGCCAGC TTGGTTAAAG GAGAAAGTTA ATCCTGCAAA CAAGGTGCCG TTTATTTTTA TGATTAATCC TTATAAACTA ATTAACGTTC TTTCAAAAGT GACAATAGAA  GACTCTAAAA GATTGTGATA ATGATGTATG TAGGTTCCTG CCCTTGAACA CAATGGAAAA ATCACTGGGG AGAGTCTTGA TCTAATCAAA TATGTCGATA GCAATTTTGA TGGACCTTCA  CTTTACCCTG AGGTATGACC TTGTTGGCAT GTTATAGACT TGTTCTTGTC ATGTAAGTAA CAATATTTCG ATGAGATGTT GTTTTTTTGA AATTTTTGGT CTAGGATTCT GCAAAGAGAG  AGTTTGGTGA AGAACTGTTG AAATATGTCG ATGAAACATT TGTAAAAACT GTGTTTGGCT CTTTCAAAGG TGACCCGGTT AAAGAAACAG GTAAGGTTGA TTTTCTTTTG TGTCTTGTCA  ATTGTTTTGG GCATCTGAAG GCTGAAACAT GTGTGTTTTT GACGCAGCAT CAGCCTTCGA TCACGTGGAA AATGCTCTGA AAAAGTTTGA TGATGGTCCT TTCTTCCTTG GCGAGCTTAG  TTTGGTATAT TAGTCTTATC AAAATGTTAA GTGCGAATGA ACCTTTTTTG AATGTGTCAC TATGGTTACA AAATTACTCG ATTTTGTTTG CTAGGTTGAT ATTGCATATA TCCCATTTAT  CGAACGCTTT CAAGTCTTCC TCGACGAAGT TTTTAAATAT GAAATTATAA TCGGACGGCC AAATCTAGCT GCTTGGATTG AGGTACACGT GTGATATATG CATGTCAACA TGGTAAAACT  TTTGTATGAT TTAGCTGCAT ACTTGATTGC TTTACCTCAA TGTGTGTGGT GCAGCAAATG AACAAGATGG TTGCATATAC GCAGACCAAA ACCGACTCCG AATATGTTGT CAATTACTTC  AAGAGATTCA TGGTAATTTC GCTTTTTATA AACGTTTAAA CTTTTGTTTA TTTGGACTCA AATGCCCTTT TTACTTTAAT GTTAGGCTTT GCAATTTTGT CTTAACTCAA TTTCCGGTTA  ACGTTCTAAA ACAAAACTAA CCGATTCCGG TTTTTCTTTA TTTGCAGTAA AAGTAACAAA TCTGTTGGAC TTTGGTAACG ATGCCATGAT GGCTTATGAA GAAGAAATAT TACTACTTGA  GAGTGTTATA AATTTCTGGA TTTGGTATTG TACATTTTGT GATAAATAAG AGATATTTGG TATTGTTTAC TTTCATTCAT CAAAGAGAGA GACATGGTTT ATTCCGGATA ATACAAATGT 
CAATAATA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCTAT CTCCTCCAAA AATTTTCGTA GAAGATCGTC AGGTTCCGCT CGATGCTACC TCTGATCCAC CTGCTCTGTT CGACGGAACC ACAAGGTTGT ACATAAGCTA CACTTGCCCA  TTTGCACAAC GTGTTTGGAT TACAAGAAAC CTCAAGGGTC TGCAAGATGA GATCAAATTG GTTCCTATAG ATCTTCCTAA TAGGCCAGCT TGGTTAAAGG AGAAAGTTAA TCCTGCAAAC  AAGGTTCCTG CCCTTGAACA CAATGGAAAA ATCACTGGGG AGAGTCTTGA TCTAATCAAA TATGTCGATA GCAATTTTGA TGGACCTTCA CTTTACCCTG AGGATTCTGC AAAGAGAGAG  TTTGGTGAAG AACTGTTGAA ATATGTCGAT GAAACATTTG TAAAAACTGT GTTTGGCTCT TTCAAAGGTG ACCCGGTTAA AGAAACAGCA TCAGCCTTCG ATCACGTGGA AAATGCTCTG  AAAAAGTTTG ATGATGGTCC TTTCTTCCTT GGCGAGCTTA GTTTGGTTGA TATTGCATAT ATCCCATTTA TCGAACGCTT TCAAGTCTTC CTCGACGAAG TTTTTAAATA TGAAATTATA 
ATCGGACGGC CAAATCTAGC TGCTTGGATT GAGCAAATGA ACAAGATGGT TGCATATACG CAGACCAAAA CCGACTCCGA ATATGTTGTC AATTACTTCA AGAGATTCAT GTAA 

Retrieve as FASTA