Entry information : AtCPF04 (AT5G02790/GSTL3/CPFA4)
Entry ID 13978
Creation 2016-10-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-10-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-10-24 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtCPF04 (AT5G02790/GSTL3/CPFA4)
Name (synonym) AtCPF04 (AT5G02790/GSTL3/CPFA4)
Class CPF Grx    [Orthogroup: CPF002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtCPF04
start..stop
S start..stop
ThasCPF04 389 1e-139 8..235 7..234
ThasCPF03 378 4e-135 8..235 7..234
AtCPF03 349 8e-124 1..232 3..235
HaCPF03 325 2e-114 12..235 9..231
Literature and cross-references AtCPF04 (AT5G02790/GSTL3/CPFA4)
Omic ref. AtProteome:   At5g02790 ATTED-II:   At5g02790 e-FP Browser:   At5g02790 TAIR:   At5g02790
Protein sequence: AtCPF04 (AT5G02790/GSTL3/CPFA4)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   236
PWM (Da):   %s   27072.88  
PI (pH):   %s   4.82
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPSFIFVED RPAPLDATSD PPSLFDGTTR LYTSYVCPFA QRVWITRNFK GLQEKIKLVP LDLGNRPAWY KEKVYPENKV PALEHNGKII GESLDLIKYL DNTFEGPSLY PEDHAKREFG 
DELLKYTDTF VKTMYVSLKG DPSKETAPVL DYLENALYKF DDGPFFLGQL SLVDIAYIPF IERFQTVLNE LFKCDITAER PKLSAWIEEI NKSDGYAQTK MDPKEIVEVF KKKFM* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTGTAATTTC GAGAAACGTA AACGCTTCCA CACAAAAAAA ATCCGTAGTT TCTTCTACAG AATCAGATCT TTGTATCGTC AATGGCTCCT TCTTTTATGT AAGGATCTAT GTTCTTATCC  GGAATTTAGA GTCTTTATTG AGTTTGATCG ATTTTGGGAT TATAAGTTTC GCAAAATTCA TGTTTTTTAC ATTAAGTCTA TTCGATTTCA GCTGTATTGG GAATTTAAGT TTTTCTGTGG  CTTGATTCTA TTGAGACAGT TTTGTAGAAG ATCGTCCAGC TCCGCTTGAT GCTACTTCTG ATCCACCGTC TCTCTTCGAC GGAACCACAA GGTTAATCTT CAATGTTGCT TCTTTTATGC  TTTTGGTTTT AGCTCTGTTC TGTAGTTTAT TGGATTTCCC TTATGTCTTA ACCTCTTATT GTTTTGTGTT ACCAAAGGTT GTACACAAGC TACGTTTGCC CATTTGCTCA ACGAGTTTGG  ATCACTCGAA ACTTCAAGGT TTAACAGCTT CTCCTTTGTA CTAGTCTCTC ACCTTTAACA ATATTTTGGT CGTATTAGGG ATATTTGAAG CCGGATTGGT TATCTTGTTG AAGTTTGTTA  ATTTGACGTC TCACAAACTT TTATCTTTCT TGCATATGTG TACTCTATTT ATAAAGTAGT TGGATTCTTT GGTTGGTTTC CGGTGGTTGT AGGGTTTGCA AGAAAAGATT AAACTTGTTC  CTTTGGATCT TGGGAATAGG CCTGCTTGGT ACAAGGAGAA AGTATATCCA GAGAACAAGG TTTTCTATTT ATAACTCACG AGTTCATATG TGACATTCCA CTTTTGGTTA TGACTTAGTG  GAAACTTCTC GTTATCTTTT TCAGGTGCCA GCGCTTGAGC ACAATGGAAA AATCATTGGG GAGAGTCTGG ATTTGATTAA ATATCTTGAT AACACTTTTG AAGGGCCTTC TCTTTACCCC  GAGGTAACAC ATCCCTTATA CCGAGTATGG TTTCCCTTCA TTATTCTCTG ATTCCACTAT TCATTTCCCT CTCTAGGATC ATGCAAAAAG AGAGTTTGGC GACGAGTTGC TCAAGTATAC  TGATACTTTC GTTAAAACTA TGTATGTGTC ACTCAAAGGA GACCCCTCTA AAGAAACCGG TGAGACTTTA AACTCTTCAA CTGTTTTCAG GGGTGAAAAG GCGACAAAAT TATGACCAAA  AATTTCATGT TCTTGTTTCA GCACCTGTGT TAGATTATCT GGAAAACGCT CTGTATAAGT TCGATGACGG GCCGTTCTTC CTCGGTCAGT TAAGCTTGGT ATAAGCCTCA CTAACCTTCT  TTGAGATCAT ACATTTCGCC TTTTGTTTGT CTTAATTCTT ATATGGACGG TTTGAATTCT TTGTTTTTTT CAAGGTTGAT ATCGCCTATA TCCCGTTCAT TGAAAGGTTC CAAACTGTAC  TCAATGAATT ATTTAAGTGC GACATTACTG CCGAACGTCC CAAACTATCA GCATGGATTG AGGTATATAT ATATGCAATC TTCATTAAGT CAGAAAAGAT TACACTTATC CTCACTAGGG  AATGGTACTT AAGCGATCGG TGTTATGTTT GCAGGAAATT AACAAGAGCG ATGGCTATGC ACAGACGAAA ATGGATCCTA AGGAGATTGT GGAGGTTTTC AAGAAAAAAT TCATGGTAAG  TCATACAACT AGGATATAAT TTTTTTAACT GAACTACCAC ATGATTTTAA TGGATCCAAA TGTGAGTTGC TTCATATTTT CTTGGGGGTT AGAACATAAA AGCTATATAT GCCTTTAAGC  ATCTGGTTGT TTAGGTGTGA ATGTTCGTTG CTTTGGGTTA GTTTTCTGTT TTGGGAATGA AAACCGAGTC GGTTTAGCAT CTGGCTCAGA GACAATCTCA TCTTTCTCCA ACGAGCGTTT  TGCGACTTAG ACGTTTTGAA AGCAAAGACC ATGCACTAAT CATCAGCTAG CCTATTACTA TGGCCAAATG ACTTGTTTAA TACTTTCTCG GTTAATGGTC TATACTAAAT GTGAGTCTAA  TTCCGGTTAT ATTCTTGCAG TAACTGTAAG CAAGCACGAA GCAGTAAAGT GTATGAGACC AAACCACCTT GTACGAACAG GTGGTCTTTG GATATGAAGA AATAAGATGT GTACTTGAAC  CTGATGATGC AATAAGATTT GTACTTTAAG CAGCAACAGC TTAATCTGTA TTCTAGTGTT GATCAAATTA TCAACCATTG ACATTGTTAA TATATTACTG TATGATAGTA ATACTATCAA 
AATCTCACAC ATTAAGAACC AGATGATGCA ATAAGGATAA GGTGTATAGT 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCTT CTTTTATTTT TGTAGAAGAT CGTCCAGCTC CGCTTGATGC TACTTCTGAT CCACCGTCTC TCTTCGACGG AACCACAAGG TTGTACACAA GCTACGTTTG CCCATTTGCT  CAACGAGTTT GGATCACTCG AAACTTCAAG GGTTTGCAAG AAAAGATTAA ACTTGTTCCT TTGGATCTTG GGAATAGGCC TGCTTGGTAC AAGGAGAAAG TATATCCAGA GAACAAGGTG  CCAGCGCTTG AGCACAATGG AAAAATCATT GGGGAGAGTC TGGATTTGAT TAAATATCTT GATAACACTT TTGAAGGGCC TTCTCTTTAC CCCGAGGATC ATGCAAAAAG AGAGTTTGGC  GACGAGTTGC TCAAGTATAC TGATACTTTC GTTAAAACTA TGTATGTGTC ACTCAAAGGA GACCCCTCTA AAGAAACCGC ACCTGTGTTA GATTATCTGG AAAACGCTCT GTATAAGTTC  GATGACGGGC CGTTCTTCCT CGGTCAGTTA AGCTTGGTTG ATATCGCCTA TATCCCGTTC ATTGAAAGGT TCCAAACTGT ACTCAATGAA TTATTTAAGT GCGACATTAC TGCCGAACGT 
CCCAAACTAT CAGCATGGAT TGAGGAAATT AACAAGAGCG ATGGCTATGC ACAGACGAAA ATGGATCCTA AGGAGATTGT GGAGGTTTTC AAGAAAAAAT TCATGTAA 

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