Entry information : AtTrx01 (AT1G52990/TARWCGPC)
Entry ID 14102
Creation 2016-10-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-10-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-10-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtTrx01 (AT1G52990/TARWCGPC)
Name (synonym) AtTrx01 (AT1G52990/TARWCGPC)
Class Other Thioredoxin    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtTrx01
start..stop
S start..stop
ThasTrxM04-2 79 5e-18 200..313 89..191
ThasTrxM04 77 5e-17 200..313 91..193
AtTrxM04 76 8e-17 200..313 89..191
HaTrxM06 72 0.000000000000001 223..303 73..152
Literature and cross-references AtTrx01 (AT1G52990/TARWCGPC)
Omic ref. AtProteome:   At1g52990 ATTED-II:   At1g52990 e-FP Browser:   At1g52990 TAIR:   At1g52990
Protein sequence: AtTrx01 (AT1G52990/TARWCGPC)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   314
PWM (Da):   %s   35798 Transmb domain:   %s   i7-24o
PI (pH):   %s   8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEKLRVLYRL ILTITCLVCY GFNVGKCSEF DFLIETYVSS SSVPSCRVKC NYDASHHEGD VVSGLGWLIR NSQGTVLECG MGKFQGRMTP EEAECSALIW AIQATSAFGY TKVIFEGDNS  NVNRLINTKS DNPRLKHYLD TIKSWIPSFT STEFIFTHRE QNQCADTLVK KAIKSSTQWS LFNCCPHFLY PIVLSILGQP HLNFADWSGL IAWLPLLLRI TELNSQTPHV MVMFTARWCG 
PCRDMIPILN KMDSEYKNEF KFYTVNFDTE IRFTERFDIS YLPTTLVFKG GEQMAKVTGA DPKKLRELVK KYI* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAAC TTAGGGTTTT GTACCGTTTG ATACTGACGA TAACGTGCTT GGTGTGTTAC GGGTTTAATG TTGGGAAGTG TTCAGAATTC GATTTCTTGA TCGAGACTTA CGTGTCATCA  TCATCAGTGC CGTCGTGCCG GTCCGACAGT TGCGAATGCC CTACGCAAAG CTTAGAAAAA TGTTTTTTTA TATACTACAA AAACCATAAA CAAATATTCT TTTAAAAAAC TATTCTCAAA  TTTGCAACTT TTTCAAAAAA AAAACAATTT GCGAAATACA AAAGGAAATA AATTCAAAAA CAAACAAACA ACTCTTCTAA AAATAAATAT GATTTCAATA TAAAAAAAAA AAAAAAAAAA  AAAAATATGA TTTCAAAGAG TAAAGTGCAA CTATGATGCT TCTCATCATG AGGGAGATGT AGTGTCCGGA CTTGGATGGC TAATACGGAA CTCCCAAGGG ACGGTATTAG AGTGCGGCAT  GGGTAAATTC CAAGGCCGAA TGACACCGGA AGAGGCTGAA TGCTCGGCAC TGATATGGGC AATACAAGCC ACCTCCGCTT TTGGATATAC AAAGGTAATA TTTGAGGGAG ATAACAGTAA  CGTTAATCGT CTGATAAACA CAAAGTCAGA TAACCCCAGG CTCAAACATT ATCTCGATAC CATAAAAAGT TGGATTCCAA GCTTTACATC AACGGAGTTC ATCTTCACAC ACCGAGAACA  AAACCAATGT GCTGATACGC TAGTTAAGAA GGCTATCAAG TCTTCTACTC AATGGTCTTT GTTTAATTGT TGTCCTCATT TCCTTTATCC GTATGTAAAC AATGATATTG CTTAAACTAT  AAATGAAGAT ATTAGTTGGA AAAAAAAAAA TATATATGAT TTCAATTGTA TAAAAAAAGC AAAACGACTA TTTTTTTGTA TTTGGTCTAA TCTGTGCAGA AGTGGTATCA CGTAAGTTCA  AAGAAAAAGC GTCGTTCAAC GTTTTAGGTC TATTAAATAA TTTTTTTTTT CCTTAATTTT GTTATTATAG ATATAATTTG TCTTTCTCTA AAATCCCAAA TTAATTTCTA AAAAAGACCC  TACATTAAAC ATAAATAGTT TTACAGTATA ACTACGAGTC TACGACTTAA CAATTTTTTT GCTTAAAATA GCTTTAATTT TTTGGGCCCG AATCATTGTC TTCAGTGGCT TGGCCTCTAG  GCTGGACTTG ATCATCCTCA CTAACATCTA ACAATGATTT GGTGTATTAC ACCCGAATGG TGACTTATTG GTGTTGGGAG ACAAACAAAC TTCCCGGAAG ATTAGAAAAT AATCTATATA  TACATTTTTG CAGCCATTTT GTGAAATAAA TCATGGAGTT GGAACTTATT TACGATGGCT GTCACTGGCT TTTAATTATT GGGTTTTTCA GCAATAAATT GATTAACAAA CGAAAACATT  CCAAATATAT TCCAATCCCA TATATCACGC AGATTTTTCC AAAATTTGAA CAAAATTTTG GCAACTATTT AAAACAAAAA ATGTTTGACA ACCCAAAAGA CAATTGCAAT CCCTTAAAAT  GAGCAAAACG CAACTAAATA TATTTCTTAT CAATTCACTA AATCTTATTT CTCCAAAATT TGAACTAGAT TTCGACAACT ATTTAAAACA AAATTTTGTT TGACAAACTA AAACACAATT  GCAATCCCGT AAAATATTTA TTTTAATTAT AAATTTAAAT TAACGGGGTA CCGCGGTTTT TTTTACAGGA CGAGTTTGGC GGAACGGGTT TGGAAGGACG TTATTTAATA ACAATTGTAA  ACTATAAAAT AAAAATATTT TATAAATAGA TATAATTTGC AAAATTTTAT ATATATACTA ATTTAAAAAA ATAAATTGTC TCCGCGGTGT ACCGCGGGTT AAAATTTAGT TATTTATATA  TAAGTGAAGT CCAACCCCAA TTAATATAAA GTTTTTAGAA AAAAATCCAT GCAGACTTGG TCACTTGGTC CTTTACTACT CAATAGAACT TGAATAATAT TTTTATCATT TGGTTTGAGA  CTAGAGATCA TTTGTTATTT CATTACCCTG TATGTTCTCA AATCTAGAGC ATTGTTCTGT CAATACTAGG ACAGCCACAT CTCAATTTTG CTGATTGGTC TGGCCTCATT GCGTGGTTAC  CCCTCCTCCT ACGGATTACA GAGCTTAACT CTCAAACGCC TCACGGTACA AGTCACTATC TTCTCCATTT GGAAGGAGAA AAACAATAGG CTCTCCAACA AAAATAAGCT TTTATACACA  TGAGCGCTCG AGCTTGAACA TGGAGCTGGC AGTCCCCTTT TTCTTTGTCA TTGGTTTTAT TTTTCTCCCT AAAACATGCT ATATGGTAAT TTCCATATAA AAGATTTACA CGTTACAGAT  TCTTAATCAT TTTGTAATTT TTTGAGTAAA AGTGTTATAT TTGATCATTT TGTTATTTTG CTAGGGTTTT GGTTTACTTG TGACTCTCAT CTCAATATGG GCTAACACGT GTTCAACAGA  TTTCAATGGT TAGACGTACG CCACAGTAGC CATTTCAAAA TATATGGTGC TGATAAGAAA AAGGAGTGAT AATGTGGGGA CCCTTATCTT TTCTTCAACG TGATAATAAA TTATTTGATA  AGTGAGCTGT ATCATTTAAT TAGTTACCAA GTGAACTAGA GTTATGTTCC CAGTAATGGT TATGTTCACA GCCCGGTGGT GCGGACCGTG TCGTGACATG ATCCCCATAC TGAACAAAAT  GGACTCGGAA TACAAGAATG AGTTCAAATT CTACACAGTA AACTTTGACA CAGAGATAAG GTTCACAGAA CGTTTTGACA TAAGTTATCT CCCGACCACT CTCGTCTTTA AAGGCGGTGA 
ACAAATGGCT AAAGTCACCG GAGCTGACCC AAAGAAGTTA AGGGAACTCG TCAAGAAGTA CATATGA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAAC TTAGGGTTTT GTACCGTTTG ATACTGACGA TAACGTGCTT GGTGTGTTAC GGGTTTAATG TTGGGAAGTG TTCAGAATTC GATTTCTTGA TCGAGACTTA CGTGTCATCA  TCATCAGTGC CGTCGTGCCG AGTAAAGTGC AACTATGATG CTTCTCATCA TGAGGGAGAT GTAGTGTCCG GACTTGGATG GCTAATACGG AACTCCCAAG GGACGGTATT AGAGTGCGGC  ATGGGTAAAT TCCAAGGCCG AATGACACCG GAAGAGGCTG AATGCTCGGC ACTGATATGG GCAATACAAG CCACCTCCGC TTTTGGATAT ACAAAGGTAA TATTTGAGGG AGATAACAGT  AACGTTAATC GTCTGATAAA CACAAAGTCA GATAACCCCA GGCTCAAACA TTATCTCGAT ACCATAAAAA GTTGGATTCC AAGCTTTACA TCAACGGAGT TCATCTTCAC ACACCGAGAA  CAAAACCAAT GTGCTGATAC GCTAGTTAAG AAGGCTATCA AGTCTTCTAC TCAATGGTCT TTGTTTAATT GTTGTCCTCA TTTCCTTTAT CCCATTGTTC TGTCAATACT AGGACAGCCA  CATCTCAATT TTGCTGATTG GTCTGGCCTC ATTGCGTGGT TACCCCTCCT CCTACGGATT ACAGAGCTTA ACTCTCAAAC GCCTCACGTA ATGGTTATGT TCACAGCCCG GTGGTGCGGA  CCGTGTCGTG ACATGATCCC CATACTGAAC AAAATGGACT CGGAATACAA GAATGAGTTC AAATTCTACA CAGTAAACTT TGACACAGAG ATAAGGTTCA CAGAACGTTT TGACATAAGT 
TATCTCCCGA CCACTCTCGT CTTTAAAGGC GGTGAACAAA TGGCTAAAGT CACCGGAGCT GACCCAAAGA AGTTAAGGGA ACTCGTCAAG AAGTACATAT GA 

Retrieve as FASTA