Entry information : PpaTDX01 (Pp3c20_8620)
Entry ID 14207
Creation 2016-10-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-11-04 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-11-04 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PpaTDX01 (Pp3c20_8620)
Name (synonym) PpaTDX01 (Pp3c20_8620)
Class Thioredoxin Type TDX    [Orthogroup: TDX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella
Organism Physcomitrella patens    [TaxId: 3218 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PpaTDX01
start..stop
S start..stop
HaTDX01 259 2e-83 1..285 1..246
AtTDX01 258 9e-83 1..287 2..259
ThasTDX01 252 5e-81 1..273 1..240
KflTDX01 214 4e-65 103..295 143..335
Literature and cross-references PpaTDX01 (Pp3c20_8620)
Protein sequence: PpaTDX01 (Pp3c20_8620)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   434
PWM (Da):   %s   46039.32  
PI (pH):   %s   5.03
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDAAKLKELK VFVQQVEAYP AMLATPALRF FRDFLERFGA TLPSVAYAEE AKSAGGCGKP AGGCCPHPHG PATDEAESDD DMEEKSMPPK TYEDENVTDD ESDIDLDTEG VVEPDDEPPQ  KMGDQDVEVT EEKMDEAQLS KGKAVEAMAE GKLEEALEYF TEAIICNPHS AILFANRAGV YVKMKKPNAA IRDADAAIKI NPDSAKGYKC RGEAKALLGQ WEESAKDLRL ACRLDYDEGT  AQVLKKVEPN AHKIEEHRRK YDRLRKERNE KRAAREREQR RAEAQAAYAR AKKAESTAPP RGSARPGGMP GFPGGMPAGM GGMPGMGGMP GMGGMPAGMG GMPGMGGMPA GMGGMPGMGG 
MPGMGGGPGG IDMSKILNDP ELMAAFSDPE VMAALQDVMK NPANLAKHQA NPKVAPLIAK MLGKFGGGAA RQP* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACGCGG CGAAGCTGAA GGAGCTTAAG GTGTTCGTGC AGCAGGTGGA GGCGTATCCG GCGATGCTGG CCACTCCGGC GCTTCGATTC TTTCGGGACT TCCTGGAGAG GTAGCGTAGT  GAGAGATCCG CGCAGTCTTG CTTTCTCAGT ATTTTCTGTT TCTTCTCAAT TAACTTGATT TGACTTGGAT CGATGATCAC CGATTGTCGG TTGAGGTAGT CGAAGGTGGC GTTTGTCACG  TGTGTGGTCG GTCGATGTGT GGGCGAGTTT TGTGCTTCAT GTTTTTGTAA CGTATTGTTT GTATATTGGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGC TCGTACCTTG GTCTGCTCTA TGTTGTTTTA  TTGTTAGTTG TGTGAAGCTG CGTTATACCA AGACTTCGGC GATGGAATGG TGGGATGTTC TTCAGTGTTG ACTTCTTGTC ATTTGATGTT TTTGATCAGT TTTTTTTATT TTTAGTTCAA  CTGATCAAAA ACATTAGGAT TGAATTATTT TAGGACTTGA TTCAGAACAA GGCTTTGGAC CTGGAGTTTA GTTTTAACGA GGTTCGAAGG TGAGCGATTT GGTTTGCAGT TTTTGGATGG  AAGTCGGATT GTTGTCTTCA GTTTCTGTGA GAACTATGTT TATTCGCATG TATGGTCTGA GATGAATAAC CTTGGCATTG TGTACCTGTC TCAGCACTAT TGTGATGCAT ATGGGATAAT  TGTTGATTTG TCGTCTTGTT TCGTGAACGG AATACCTGTA GTTTTAAAAA GTGTTGGCTA CTATACTTGG ATTGAAGCCT CTTTCAGGTC CCTTTACCTT CCCCATTATT TTTAGGACTG  GTAAATGGTG AAGGTAATGC TGGATTCCCA TCTGTATGTA CTGGATCTGA TTTTTAGACA TCTGTTGAGT TTAAGATTGC AGAGGAATTC GATTTGGTAT TGGGCTACCT TCTTCATTGT  TGTCCTTTGA GAAGCATTCT CTTTTTCTCG GAGGTTCGAG CAATTCGGTA TCTTAGAGGG TTCCACACAA AGTTTTTAAA TGTTTTTTTC ATTGGGGATG TTTTATTTTA TATGATTTGT  GATCAGGTTT GGAGCGACTC TGCCGTCAGT TGCGTATGCG GAGGAAGCCA AATCTGCCGG TGGTTGCGGA AAACCTGCTG GAGGCTGTTG TCCTCACCCC CATGGTCCTG CAACGGTATA  CGTTGGATAA TTCCCTGTCA TTTTATTTTA TTTTATTTTA TTTTAGTTTT TTTGGTCGGA TTGTTTGTGC TTGTGCCCTG AATTTAATGT TTCTGAGGAT GTAGTTGCCA GCGTTTACGC  ATCGTCTTCA GATTTTGATG TGTTTATGTC ATCGGATAAT ATTTCGTCGT GGTAACCGTT GTAACTGTAT GGTAATTTTG TTGGTGATGT ATTTCATCGT ATATGTCTTA CTGCGCAGTA  GTCTTAAGTA GTAAGCAGAT GGTTACGGGA GAAGCTCTGC TGGATTGTGA GCTCGACACC TTTCAAGCTG AGTCCGACAT TGTTTTTAAG TCGTGTAGTC ATGTCCAAGT TTAAACGGTT  CACATGTGAG CAGATCTCTA TCTTGTAGAA TTCGCTTAAT CTGTAGCTTA AATTGTGATT TTTAACAGGA CGAAGCAGAG AGCGATGATG ACATGGAGGA GAAATCTATG CCACCTAAGA  CATATGAAGA TGAAAATGTC ACTGATGATG AGTCGGATAT TGACCTAGAC ACCGAGGGTG TTGTGGAACC TGACGACGAG CCTCCCCAGA AGGCAAGTTT CTTTGCGCCT TACACTTCTT  TTGATGATCA TATTCGTGAT CAGTTTTCTT GTCCTGTGGT TTTGTGGTCA TATATCTTTC CTGCTGGGTG CAAGGCTGAG ATTCACAATC TATATACAAG TATTCCTGTA GTAATTCTGT  CGGTGAACCT ATTTATATAG CATTAGGATA TGGTTTTATG TACATGTAGC AAGATTCTTT TCACCCCTCT CGAGCGACTT CAAGAATCTC AACTCTTACA ACGGATGGTT ATGCTGCAGA  TGGGTGATCA AGATGTGGAG GTGACAGAGG AGAAGATGGA CGAGGCTCAG CTCTCGAAAG GCAAAGCAGT GGAAGCTATG GCAGAAGGTA GTTATATTCA GAATTACTTG CTGAATGAAA  TTTAAGGCCT ATTTTCAAAG TGCTTTACTT CAAACTGGAG CTGAATGATG AAGTGCCTAA TGGAGAACTT TGCTTCGTAG TGTAATTTTC AGTGACCAGG CTTTGTCCTC TGCGTACGCC  AAGTCGTATG GCAATTTGTA TACGACCACT ACTTAGATTT GAATACTCAA AAGATAGTTT GCTTTATTCG TTGTTATATA TGACAACTTT ATATAGCAAG TTACCTTCTT GATTTGTTCG  TAAGGTCTGC TATCATTGTT TGCAGGGAAG TTGGAAGAAG CTCTTGAGTA TTTTACCGAA GCTATAATCT GCAATCCACA TTCAGCAATC CTATTCGCCA ACCGAGGTAT GATTTCATAC  GTATGTCTTG TAAGATTAAC CAATATGCTG TGAACTTGAA ACGGTTTTAT TATATATTAA CGTGTAGTGG ATCATTTGTT CCCGATGTCT TGTTACCATT TAAACAATAA CCGTTTATTA  TTCTGCTTGG AACAGCTGGT GTATACGTTA AAATGAAGAA GCCGAATGCT GCAATTAGAG ACGCTGATGC TGCTATCAAG GTGACTTGAG AAGATAAATG TCGTGGTTCC TTTTGATGCT  TTGAATGCCT CAAATCTCTT TCTAGTTTCC TTTGTTTGCT GGCTCCTGAA TCGTGTATAC GTTGTTGCCT TATTCAACTT CCGTGTTTAC ATCCCTGGTG TCTTGTTTTA GTGGTGAATC  ATTTTCTCTC TACTACCTCT AGTCAGTGAC AACGAGTTCT GAAGCCTTTG GAAAATAGTG TTGATCTCGG TATCTTGTGC ACTTCTCGAT ATTGCTCTTG GACTCAGATG CTCATTTATA  CTATTAATCA TGTATCAATT GTATGATGAA TTTTGGATTC TTTGTTTTAA TTTTTAACAT TTTTCTCTGA ACGATACAAG TCATTTGTGC CTGATTTTGG AACACATCAT CTAACAGATT  AACCCAGACT CTGCAAAAGG TTACAAGTGC AGAGGTGAGG CCAAAGCATT GTTAGGGCAA TGGGAAGAGT CGGCCAAGGA TTTACGATTG GCATGTCGAC TTGACTATGA TGAGGGGACT  GCCCAGGTTC TTAAAAAGGT ATCTTTACGT CATGACTGCA GCATCAAAGT TGATTTTAAA ATGACCTTAT GAAGGCTTAT TTACAGTTCC TCTTATACAG GGCCAGTCGA TCAATTGACG  TTCTGTAACA TTTCTATGCT CTCTCCCTGT CGTATATCTA GGTTGAGCCA AATGCGCACA AAATTGAAGA ACACCGAAGG AAGTACGACC GTTTGCGGAA AGAGCGCAAT GAAAAAAGAG  CGGCTCGGGA AAGGGAACAA CGGCGTGCTG AGGCTCAGGT TATTCAGTTT GCATGCGTGC ACATGTGTTA ATCTTCACTT CAACTTGGTT GATGTTGTAT TTCAGATTGT CTTAGAATTT  TTTGTGTTGT GACCCTTCAA TTCTATGTCC TTTCAGACTG AGAATATGAA TGGTGAATTT AGGATCACAA TGTGGCTTTG AAAGATTGAT GACATTGATG AATTATGTAT TGATTGGTCT  GTGCAGGCTG CATATGCCAG AGCAAAAAAA GCTGAATCAA CAGCACCTCC ACGTGGCTCT GCAAGACCAG GAGGTATGCC AGGATTTCCA GGCGGCATGC CTGCAGGAAT GGGCGGTATG  CCAGGCATGG GAGGCATGCC AGGAATGGGC GGTATGCCTG CAGGAATGGG CGGTATGCCA GGAATGGGAG GTATGCCTGC AGGAATGGGC GGTATGCCAG GAATGGGAGG TATGCCGGGA  ATGGGAGGAG GGCCTGGGGG CATCGACATG AGCAAGATTC TTAATGTAAG CATTAGCATA GAGCATTAAA ATGCATTCGC CCATTCTCTT GATCTATGTC GATCCTACCT AGAGCTCAAT  GGTATTATCG ATATAATAAC TTTTCTGTTG GATGCGAATG CTGTGCTTTT TGTGTCTAGA CCGAGTTGCG ACGTTTTAAT GTCTCGTCAA ACTTGTGATC GCAGGACCCA GAACTTATGG  CTGCATTTTC TGATCCAGAA GTTATGGCAG CTCTTCAAGA TGGTATGATT ACTCTTTCGC TTAGAACTGT GCGATGTTTT TAATTGTTGA TCTCTGAACT GAAGGTTTTA GGTCGAATGC  TGGCGAATTC AATCCGGAAA AAAGTATTAA TCTCTCCGCT CGTAGACGTT GCCAATATTT TTCTTGTGGC TACGTTAGGC AGTACCTTAT TGGTGGTGTG TTAAGTGCAC TGGTGGATTG  GCATGATTCC CGAAGTACTT GAAAATTCTC GTTTAATTGA GGATTAGTGT CCAAAGAGCC TCATTATTAT TGTTATTATT GTTATGCAGT GATGAAGAAT CCTGCTAATC TAGCCAAGCA 
TCAAGCGAAT CCGAAGGTCG CACCGTTAAT TGCCAAAATG TTAGGTAAAT TTGGAGGTGG AGCTGCAAGG CAACCTTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACGCGG CGAAGCTGAA GGAGCTTAAG GTGTTCGTGC AGCAGGTGGA GGCGTATCCG GCGATGCTGG CCACTCCGGC GCTTCGATTC TTTCGGGACT TCCTGGAGAG GTTTGGAGCG  ACTCTGCCGT CAGTTGCGTA TGCGGAGGAA GCCAAATCTG CCGGTGGTTG CGGAAAACCT GCTGGAGGCT GTTGTCCTCA CCCCCATGGT CCTGCAACGG ACGAAGCAGA GAGCGATGAT  GACATGGAGG AGAAATCTAT GCCACCTAAG ACATATGAAG ATGAAAATGT CACTGATGAT GAGTCGGATA TTGACCTAGA CACCGAGGGT GTTGTGGAAC CTGACGACGA GCCTCCCCAG  AAGATGGGTG ATCAAGATGT GGAGGTGACA GAGGAGAAGA TGGACGAGGC TCAGCTCTCG AAAGGCAAAG CAGTGGAAGC TATGGCAGAA GGGAAGTTGG AAGAAGCTCT TGAGTATTTT  ACCGAAGCTA TAATCTGCAA TCCACATTCA GCAATCCTAT TCGCCAACCG AGCTGGTGTA TACGTTAAAA TGAAGAAGCC GAATGCTGCA ATTAGAGACG CTGATGCTGC TATCAAGATT  AACCCAGACT CTGCAAAAGG TTACAAGTGC AGAGGTGAGG CCAAAGCATT GTTAGGGCAA TGGGAAGAGT CGGCCAAGGA TTTACGATTG GCATGTCGAC TTGACTATGA TGAGGGGACT  GCCCAGGTTC TTAAAAAGGT TGAGCCAAAT GCGCACAAAA TTGAAGAACA CCGAAGGAAG TACGACCGTT TGCGGAAAGA GCGCAATGAA AAAAGAGCGG CTCGGGAAAG GGAACAACGG  CGTGCTGAGG CTCAGGCTGC ATATGCCAGA GCAAAAAAAG CTGAATCAAC AGCACCTCCA CGTGGCTCTG CAAGACCAGG AGGTATGCCA GGATTTCCAG GCGGCATGCC TGCAGGAATG  GGCGGTATGC CAGGCATGGG AGGCATGCCA GGAATGGGCG GTATGCCTGC AGGAATGGGC GGTATGCCAG GAATGGGAGG TATGCCTGCA GGAATGGGCG GTATGCCAGG AATGGGAGGT  ATGCCGGGAA TGGGAGGAGG GCCTGGGGGC ATCGACATGA GCAAGATTCT TAATGACCCA GAACTTATGG CTGCATTTTC TGATCCAGAA GTTATGGCAG CTCTTCAAGA TGTGATGAAG 
AATCCTGCTA ATCTAGCCAA GCATCAAGCG AATCCGAAGG TCGCACCGTT AATTGCCAAA ATGTTAGGTA AATTTGGAGG TGGAGCTGCA AGGCAACCTT GA 

Retrieve as FASTA