Entry information : HaDHAR02 (HanXRQChr04g0116551)
Entry ID 14238
Creation 2016-11-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-11-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaDHAR02 (HanXRQChr04g0116551)
Name (synonym) HaDHAR02 (HanXRQChr04g0116551)
Class Dehydroascorbate Reductase    [Orthogroup: DHAR003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaDHAR02
start..stop
S start..stop
HaDHAR14 366 2e-130 1..187 1..195
HaDHAR15 324 2e-113 22..186 62..226
ThasDHAR02 273 4e-93 22..186 69..233
AtDHAR03 266 2e-90 22..186 66..230
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 136975989..136976052 64 N° 2 136975163..136975253 91 N° 3 136974932..136975075 144 N° 4 136974721..136974838 118
N° 5 136974480..136974620 141 N° 6 136974193..136974285 93 N° 7 136973956..136974032 77 N° 8 136973759..136973774 16
complement(join(136973759..136973774,136973956..136974032,136974193..136974285,1 36974480..136974620,136974721..136974838,136974932..136975075,136975163..1369752 53,136975989..136976052))


exon

Literature and cross-references HaDHAR02 (HanXRQChr04g0116551)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr04 (136976052..136973759)
Protein sequence: HaDHAR02 (HanXRQChr04g0116551)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   247
PWM (Da):   %s   27958.6  
PI (pH):   %s   9.32
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MMLNRPLKSYMTKNLRYKSTYCPFTQRVLLTLEEKHLPYGLKLVDLGNKPAWFLSISPEGKVPVAKVDDKWIADSDVITQTVEEKFPDPSLVTPPKKASVGSKIFSTYIGFLKSKDANDGTEKALLNELSAFNDYIKEGPFINRKDISAADLSLGPKLYHMEIALGHYKKWSVSDSLPHLKIYMKIGPDHQTLYWSATWPKEVEQLARQLLYNPCKVVIGSSELKANHSIHQHVDIMTENQKLINA

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGATGTTGAATAGGCCATTGAAGAGCTACATGACAAAGAATTTAAGGTATAAATCAACTTACTGTTATCTTTATGAATGCTCACAAGGATTATTGCAATTGTTTTTTTTTTTTTTAATT
TCTCTGTTTTTGAATATAAACGCTTAATGAGGTTATTGCTGACCCATTTACGTATAAATGGGTCGATTTGGGATATCTTCTATTTAACGGGTCGACGGGTAAACACTAAAACTTCACTAA
AAGGAAAAGCAAAATAAGTATATATACACACACACAACATATATACGATTTTTTACGTTTTTAGGTTTGAATTATGTTCTCGGCCCATATTGTCGACTCCTATATTTTTTGAAACATTTG
TAAAAACACTGATACCATTTGTTGCTATCAATGTCATCTTTCGGTTATATCACGGAGTTCTATCAACTTCATAAATCAATTTCTTTGAGTTTGAATAATCAAAACCAAGTTAATACACAC
TAGAAAAAAATAAATATACATTGATATTAATTCAAACCTAAATACGTTAAAAACGTTAAAAAATCTCCCATATTGTGCGCTTGTGATCAATATTGCCAATCTTTTACATGCAAGTTTCTT
TTGATTTTTAGTGTGGATATTCTAAACTAAAGTCTAATAGCATGTAGTTTAACATAAACGATTAGGAATGTTCATGAGCCAAAATGAGCCAAGCCATGGCTATTCAGGCTTCGCTTGTTT
GTAAATGAGCTAAGCCGAGTTGTCTTAGTTTATAAACAAATTTGGGTGCACAGTTATTTTTATATATCTGTTGTTTCAGGTCCGTTTACACAGAGAGTTCTGCTGACACTGGAAGAGAAG
CATCTTCCTTATGGCCTAAAGTTAGTTGATCTCGGTAACAAGCCAGCCTG
GTAATCATACAGTATTCCGTTTATAACATGTCGTGTTTTCAACCGTTCATAATATGATCTACGCATGACA
CTCTTGGTTTTACGTAGGTTTTTAAGTATTAGCCCAGAAGGTAAAGTCCCAGTGGCGAAAGTTGATGACAAATGGATAGCAGATTCCGATGTTATTACACAGACAGTAGAGGAAAAGTTC
CCCGACCCGTCACTGGTGACCCCACCTAAGAAAGCTTCTGT
GTACACTCATGCTCTTTGTCTCCCCTTTGTTCAGTTTACATTCATTTTTGCAAATTGATGTTGAATAATGGTATTTCTG
ATTCATATATCTAGCGGGTCGAAAATCTTTTCGACATATATTGGCTTCTTAAAAAGCAAAGATGCGAATGATGGAACGGAGAAAGCTTTACTGAATGAACTCTCTGCTTTCAATGATTAC
ATCAAAGAAAAT
GTGGGTTCTGTTCTATCTCTCCACACACGCACATATATATCAAACTGTTTGTTGAATTAGGTTGCTGATTTTAAATTTTTTTCTCACGTGTTTGTTGAAGGGTCCGTT
TATCAACAGAAAGGATATCTCTGCTGCAGACTTGTCGCTAGGTCCGAAGCTGTACCATATGGAGATCGCTTTGGGTCATTATAAGAAGTGGTCAGTCTCAGATTCACTTCCCCATCTGAA
AATATACATGAAG
GTACACTTATCTTTGTTGAATTGCATAAAGTTATCTTTTTGTGAGAGCAGCCTTAATTGTTATGCTCTTTGATTTTTATCTTTTCCATAATATGTTATAACTAACAA
AATATCATTACTGGTGACTACCCCTTGTATATCAGAAGCAAGTAGAAGAGCATTGCAAAACGTTTCACTAATGTGATTTATGTTCAGATTGGGCCAGATCATCAAACTTTGTACTGGAGT
GCTACATGGCCAAAGGAAGTTGAGCAACTTGCAAGGCAGTTGCTTTATAACCCTTGCAAA
GTAAGATATTTAATTTAGAAATGTTAAAGTTAAAGGTAGCAATTTCAACACATTTTTATG
TTGATGGTTCAACTCGGGTTGTATTTCATTGAAAACGTGATACACCAAAAACATAGAAAACTTCATCATGCTGACACATTGTTGTTTGAAATATATACAGGTGGTGATTGGTTCTTCAGA
ATTGAAAGCTAACCATTCAATTCACCAACATGTGGATATTATGACCGAAAATCAAAA
GTATAGCAACTAAGTTAAATCATTTTTATTGGTACCAACCAAGATTCTTCACTACACTTTGTC
AACTCACAAATATAGTTGATTAATTGAGTATTCAGGTTACTTAACGGTTTGTCGGTTAACCTAGCCATTAGTTTTATAACTTTTGTTTTAATAATTAAACCAGCATTTTTGTTTTTAGAT
TGATAAATGCTTAA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGATGTTGAATAGGCCATTGAAGAGCTACATGACAAAGAATTTAAGGTATAAATCAACTTACTGTCCGTTTACACAGAGAGTTCTGCTGACACTGGAAGAGAAGCATCTTCCTTATGGC
CTAAAGTTAGTTGATCTCGGTAACAAGCCAGCCTG
GTTTTTAAGTATTAGCCCAGAAGGTAAAGTCCCAGTGGCGAAAGTTGATGACAAATGGATAGCAGATTCCGATGTTATTACACAG
ACAGTAGAGGAAAAGTTCCCCGACCCGTCACTGGTGACCCCACCTAAGAAAGCTTCTGT
CGGGTCGAAAATCTTTTCGACATATATTGGCTTCTTAAAAAGCAAAGATGCGAATGATGGA
ACGGAGAAAGCTTTACTGAATGAACTCTCTGCTTTCAATGATTACATCAAAGAAAAT
GGTCCGTTTATCAACAGAAAGGATATCTCTGCTGCAGACTTGTCGCTAGGTCCGAAGCTGTAC
CATATGGAGATCGCTTTGGGTCATTATAAGAAGTGGTCAGTCTCAGATTCACTTCCCCATCTGAAAATATACATGAAG
ATTGGGCCAGATCATCAAACTTTGTACTGGAGTGCTACATGG
CCAAAGGAAGTTGAGCAACTTGCAAGGCAGTTGCTTTATAACCCTTGCAAA
GTGGTGATTGGTTCTTCAGAATTGAAAGCTAACCATTCAATTCACCAACATGTGGATATTATGACCGAA
AATCAAAA
ATTGATAAATGCTTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
CATTGAAGAG CTATTTTCTG CTTACCGCTA GAATTGCATT TTCTGTGTTT CAGTGATTTT GTGCTTGATT ATTGATGATT GTAACCGAAG ATTCAATGTT GAGTGAAAAT TAAAGACGCG  AATTGAATTT GCCCTATCGT TTCCATTCCC TCATCACAAG GAATACAAAT CATCCATATC ATCAATTCCC TTCGGTTACA GGCCGTAATC GTTGTCATAT CATGATTGAA GAACCTAACA  CAATCGTCAT CTCCCTTGTT GCTGTTGCGT AAGTTTGAAC CAGGAAAGGA GCTCGGGTTG ATCAATCGCA GGGTAACCGG GTGAAGAAGA CGACCGGTAA ACCAAACCAC GTGCACCCGT  TTCAGCTGAG TTCGAGTTAC AGTCCAAACT TCAGGGTTAA AATCCGGTTC TGTCTCTACA AACTTGGCTT CGGTTCTGAG TAGCAGGCCA CCGTTTCAAG CTTCTTATTG TGTATTCATC  TACCAGATGA TTGAAAGTAG CCAATGTGGG GATAATTTGG AAGGGGAAGT AACATTGTCA CAGCTGGATT TTAAATGACG TGGCAGGATC TGAAAGTTCT AAAACAGAAC CAAACTGGAA  TGAGGAGAAG AGGTTGTGAT TATTGGTTTC AATTGCAAAT ACCGTATCTG GAGTCGATTG ATTGGTTAGC TGGTCGCTAT GAAGAATTGC TCTTACCCAA AAGTGGAAGG TTTCGAGTGA  ACTTTGTGAA CCATTTTGGG GTGTTGAGGT GAGGTTGGTA ACAAATAAGG ACACTAGCAT TCAGAAGTAA AGATGATGTT GAATAGGCCA TTGAAGAGCT ACATGACAAA GAATTTAAGG  TATAAATCAA CTTACTGTCC GTTTACACAG AGAGTTCTGC TGACACTGGA AGAGAAGCAT CTTCCTTATG GCCTAAAGTT AGTTGATCTC GGTAACAAGC CAGCCTGGTT TTTAAGTATT  AGCCCAGAAG GTAAAGTCCC AGTGGCGAAA GTTGATGACA AATGGATAGC AGATTCCGAT GTTATTACAC AGACAGTAGA GGAAAAGTTC CCCGACCCGT CACTGGTGAC CCCACCTAAG  AAAGCTTCTG TCGGGTCGAA AATCTTTTCG ACATATATTG GCTTCTTAAA AAGCAAAGAT GCGAATGATG GAACGGAGAA AGCTTTACTG AATGAACTCT CTGCTTTCAA TGATTACATC  AAAGAAAATG GTCCGTTTAT CAACAGAAAG GATATCTCTG CTGCAGACTT GTCGCTAGGT CCGAAGCTGT ACCATATGGA GATCGCTTTG GGTCATTATA AGAAGTGGTC AGTCTCAGAT  TCACTTCCCC ATCTGAAAAT ATACATGAAG ATTGGGCCAG ATCATCAAAC TTTGTACTGG AGTGCTACAT GGCCAAAGGA AGTTGAGCAA CTTGCAAGGC AGTTGCTTTA TAACCCTTGC  AAAGTGGTGA TTGGTTCTTC AGAATTGAAA GCTAACCATT CAATTCACCA ACATGTGGAT ATTATGACCG AAAATCAAAA ATTGATAAAT GCTTAATGAG GAAGGTCGAG TGGATGTGGG  ACAAGTGACA CTTACAACTA CACGGTACCT GTCGGGTCGA AACGGTGAGA GACATGTGGC GATGTTACGA GTTAGTGCGT TTCGACGACG AACCGGTGGC ATATGGCGGA GTTGCAATCC  GTCACACATC ATGCGAGGCG GAAACGGAAA TTGACAAACT CGAAAGACAT ACCCTTCTAC TGAAACATAA TATATTAGTG AATTGGTAAA ACGTTATATA GAGCTAGCAG GGCCAACCCT  GAGAATTCGT GTACCATGTT CGAGCTCGAA AAAACGTGCC CTTAGGTGGA GGAATGTGGA GAGCTTTGAG TTTGATGAGG AAGAACTTAA ATCTTTCAAA CTCTTTTTGC TTTGACAGTA  TTTGTTTTTG TTTCATATAA GTTAAGTTGG TTCTTTAATA TGTACTCTTT TCTATCATTC ACATGTTATA TGTATTTGAT CATGTAGCAG CAACCCGATC AGTATCCAAA GAAAGAGCCA  AGATATAGAA TAAAAGGTCA AAGCTCAATT GAGCCTGGTC TCTCAAGTTG AGAGTCAAAA TTGTTGGGCG GAATGATTTG AAAAACTTGA TGTCCAAATT CTCTTATGTC ATTCGTTTTA 
AAAATATACC CAATCACCCA ATGTTCATGT AGTATTACTT GCCCTTTTGT ATTTGTACAC ATAGAGGTCG AAATTTCAAT TCTATTTTTG ATTGGGTTGA TTATGGTTGT CTTT 

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