Entry information : HaCPF02 (HanXRQChr07g0204451)
Entry ID 14246
Creation 2016-11-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-11-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaCPF02 (HanXRQChr07g0204451)
Name (synonym) HaCPF02 (HanXRQChr07g0204451)
Class CPF Grx    [Orthogroup: CPF002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaCPF02
start..stop
S start..stop
HaCPF04 476 7e-171 1..333 1..328
AtCPF05 404 1e-142 1..332 1..314
ThasCPF05 393 5e-138 99..332 91..320
MpCPF03 370 2e-128 89..331 87..326
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 95541105..95541456 352 N° 2 95542938..95543072 135 N° 3 95543188..95543278 91 N° 4 95543380..95543474 95
N° 5 95543577..95543744 168 N° 6 95546693..95546853 161  
join(95541105..95541456,95542938..95543072,95543188..95543278,95543380..95543474 ,95543577..95543744,95546693..95546853)


exon

Literature and cross-references HaCPF02 (HanXRQChr07g0204451)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr07 (95541105..95546853)
Protein sequence: HaCPF02 (HanXRQChr07g0204451)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333
PWM (Da):   %s   36923.93  
PI (pH):   %s   8.86
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MRRVSTLAASSLSRAILSSSEHHHYKILFPAASSFAANAGSSRRWFSSPVGSISSGGSPSATKVFLSLGCLAASAAAGASLLAEKEAYAKEPVKLDLLPKEVVLYQYESCPFCNKVKAFLDYYDVPYKVVEVNPLSKKEIKWSDYKKVPILVVDGEQLQDSSAIIDQLRNKLSPPAKSSSLVDGDDEEKKWRRWVDDHLVHVLSPNIYRNASEALESFDYFTSGNFSFSEKYTVKYAGAAAMYFVSKKLKKKYNITDERAALYEAAETWVDALDGREFLGGSKPNLADLAVYGVLRPIRYLRSGKDMVEHTRIGEWYTRMESAIGESSRIKA

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Remarks
DNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGAAGAGTCTCCACACTCGCCGCCTCCTCTCTCTCACGCGCCATCCTATCTTCTTCCGAACACCACCACTACAAAATCCTCTTTCCGGCAGCCTCCTCTTTCGCCGCCAATGCCGGA
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GTGAGCCAGAAATATGGTATACTGAAGTTA
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CTGCTATGTATTTTGTATCTAAGAAACTGAAGAAAAAATATAATATCACTGATGAAAGGGCAGCTTTGTATGAAGCTGCTGAAACCTGGGTTGATGCCCTTGACGGCAGGGAGTTTTTAG
GTCAGTTTTTTTGGTGACGTTTTGATCCTTCTTTTGTCAGTGTTTATTCTGTGTTTCACTTGACTTTTACTTTTCAACTTGAAGTGTCAATTGTCAAAACAGTCGGGCAAATGCATCATG
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TTTTTTTCCAAATAACAAACAGATTTTTTTGGGCTTTTGATCAGAACAATGATACGAGCCCATTGATGTAAAACTTACTTCGAAATGGTGCTCCAAGTAACTTGATTTTGGTTAATTGGA
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TGCTTTATTGTTTTCTTGATAATTTTGCAAGTAATTAGTGCGAGGTATGGTTAGCATAACTATATTATTACAATGATACACTAGTTTTTTTTGTATAAATCAGTTTAACGATGTTATGCA
TTTTGGGTGACTTTGACCCGTTTTTCTCAGTTCTTTTTACCCAACTTTAAGTGTGACCTATTGGATTTTAAGGGTGATGGTGCATTTTGTATGGGCCTCATGCATAGTTATCTATGTGAA
GATAGCATTCACTATTGCGCGCTTCATAGTGTAATGCACATATCTTGCAATTTGTTAATTAGCGACTCCATAGCATGATTATAGCGGGATTCCGACGATGAATTCCGGCTCCGGTGCTGC
AATTTCTGATGGAAACCAGGAAGAAGAAGAAGAACGGCTGCGTGTTTCTTGCGTTTTAGCCTTTTAGGGTTAAATAACTTCATGTATTTTAACATTTAACCCCTTTTATCTTTCACTAGT
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AAAAAAGTAGTCGGCGCTTTTTACATTTTTTTATAAAAATGTTCATATATTTACATTCCCGGTTGTTTAGAAAAAAAATAAAAATGTTACGCAGGGTTTTCGTGAGTTTTTTCAACTCAA
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TATTGCTACGTGGCATATAGGTACCTTGGCGCAATTTGTTGCTATTCGCTATCGATAACTAGGGCCTCGTGTAGTAGTTAGGCCAATGGTGCTAAATGTCGGTATGTCACTGTTAGAGAT
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TCATAAAGCCCCCTTCAAAAAATGTAACTGTTAATGCTTCTTAATGCCCATTTCATTCAATACTTCCCATTTTTTTCTCCTCTTTGGGCATTATTCTAGAAATGCACCTCCCTCTTCATG
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CCATCTTCATTCCCCTATAAATCCCACGGGGATGGTGTGGGGGAATTATCAAGCCACTTCACGCCCCTATAATGCCCACTACTCATGGTCTTAAAGGAGTTGCCCGACAAATATATCAAG
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TATCCGTTATCTGAGGTCGGGTAAAGATATGGTTGAGCACACCAGAATTGGCGAGTGGTATACGCGAATGGAGAGTGCTATTGGTGAATCTTCAAGGATAAAGGCCTAA

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CDS
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGAAGAGTCTCCACACTCGCCGCCTCCTCTCTCTCACGCGCCATCCTATCTTCTTCCGAACACCACCACTACAAAATCCTCTTTCCGGCAGCCTCCTCTTTCGCCGCCAATGCCGGA
TCCTCTCGCCGGTGGTTCTCTTCACCTGTAGGATCCATTTCCTCCGGCGGCTCTCCCTCCGCCACTAAAGTTTTTCTCTCGTTAGGTTGTCTCGCCGCCTCCGCTGCTGCCGGTGCGTCG
CTCTTGGCGGAGAAAGAGGCGTATGCGAAAGAGCCGGTTAAGTTAGATCTGCTTCCGAAGGAGGTTGTGCTGTATCAGTATGAATCGTGTCCGTTTTGTAACAAGGTTAAAG
CGTTTCTA
GATTACTATGATGTGCCGTACAAAGTTGTGGAGGTGAACCCACTTAGTAAGAAGGAAATCAAATGGTCTGATTACAAGAAGGTGCCTATACTAGTTGTGGATGGTGAACAGCTGCAAGAT
TCATCAG
CTATTATTGATCAGCTCAGAAACAAGCTCAGTCCTCCCGCGAAGTCAAGTTCACTGGTTGACGGTGATGATGAAGAAAAGAAGTGGCGTCGGTGGGTTGATGATCATTTGGTT
CACGTTTTATCACCGAATATTTACCGAAACGCTTCTGAGGCTCTGGAATCCTTTGACTATTTCACTAGCAATG
GTAATTTCAGCTTTTCGGAAAAATATACAGTAAAATACGCGGGGGCT
GCTGCTATGTATTTTGTATCTAAGAAACTGAAGAAAAAATATAATATCACTGATGAAAGGGCAGCTTTGTATGAAGCTGCTGAAACCTGGGTTGATGCCCTTGACGGCAGGGAGTTTTTA
G
GTGGTTCTAAACCTAATCTGGCTGATCTTGCTGTCTACGGAGTGTTGAGACCTATCCGTTATCTGAGGTCGGGTAAAGATATGGTTGAGCACACCAGAATTGGCGAGTGGTATACGCGA
ATGGAGAGTGCTATTGGTGAATCTTCAAGGATAAAGGCCTAA

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cDNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TTAAAAAGGC GGTTCTATTT TTCAACAACT CATACACACG GTCCCGAGTC CACCAGGTAG CACCAACTTA CACCATCCAC CCCATTCCAC ACACCTCTAA ATATTCTCTC CACCTCCGGC  CACCGTACAC AACCACCGTA AAACCCTAAA AACCATGAGA AGAGTCTCCA CACTCGCCGC CTCCTCTCTC TCACGCGCCA TCCTATCTTC TTCCGAACAC CACCACTACA AAATCCTCTT  TCCGGCAGCC TCCTCTTTCG CCGCCAATGC CGGATCCTCT CGCCGGTGGT TCTCTTCACC TGTAGGATCC ATTTCCTCCG GCGGCTCTCC CTCCGCCACT AAAGTTTTTC TCTCGTTAGG  TTGTCTCGCC GCCTCCGCTG CTGCCGGTGC GTCGCTCTTG GCGGAGAAAG AGGCGTATGC GAAAGAGCCG GTTAAGTTAG ATCTGCTTCC GAAGGAGGTT GTGCTGTATC AGTATGAATC  GTGTCCGTTT TGTAACAAGG TTAAAGCGTT TCTAGATTAC TATGATGTGC CGTACAAAGT TGTGGAGGTG AACCCACTTA GTAAGAAGGA AATCAAATGG TCTGATTACA AGAAGGTGCC  TATACTAGTT GTGGATGGTG AACAGCTGCA AGATTCATCA GCTATTATTG ATCAGCTCAG AAACAAGCTC AGTCCTCCCG CGAAGTCAAG TTCACTGGTT GACGGTGATG ATGAAGAAAA  GAAGTGGCGT CGGTGGGTTG ATGATCATTT GGTTCACGTT TTATCACCGA ATATTTACCG AAACGCTTCT GAGGCTCTGG AATCCTTTGA CTATTTCACT AGCAATGGTA ATTTCAGCTT  TTCGGAAAAA TATACAGTAA AATACGCGGG GGCTGCTGCT ATGTATTTTG TATCTAAGAA ACTGAAGAAA AAATATAATA TCACTGATGA AAGGGCAGCT TTGTATGAAG CTGCTGAAAC  CTGGGTTGAT GCCCTTGACG GCAGGGAGTT TTTAGGTGGT TCTAAACCTA ATCTGGCTGA TCTTGCTGTC TACGGAGTGT TGAGACCTAT CCGTTATCTG AGGTCGGGTA AAGATATGGT  TGAGCACACC AGAATTGGCG AGTGGTATAC GCGAATGGAG AGTGCTATTG GTGAATCTTC AAGGATAAAG GCCTAATCTT ACGGTGAAAT GATATGCAAA AGTAAAGTAT ATATACATTT  TGCCTTCAGT CTTGATTGAA TTATGTTGAT GAGATTTTGT TAAATTTTTG TTGTTGCTAT GAATTTGTAG CACGATATCG GTTTTCTTTT TGCTGTAACA GATTAGAACC AGTGCCACAC  ATAGGCTGGT ATAGTACAAT AATAGAGAAA AGACTGGTAG GATGTGATCA TACTATTATT GATACAAAAA AAAATAAAAC TCATCAAAAC TTTGCATTTT AGTGTTTGGT ACTATTGGTT 
TTGATAGCAG GTTAGTGTGT TTGTG 

Retrieve as FASTA