Entry information : HaDHAR12 (HanXRQChr12g0371001)
Entry ID 14248
Creation 2016-11-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-11-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaDHAR12 (HanXRQChr12g0371001)
Name (synonym) HaDHAR12 (HanXRQChr12g0371001)
Class Dehydroascorbate Reductase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaDHAR12
start..stop
S start..stop
HaDHAR11 374 3e-134 1..208 1..214
ThasDHAR01 329 1e-116 1..207 1..212
AtDHAR04 310 3e-109 1..207 1..213
AtDHAR02 295 3e-103 1..206 1..212
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 66497411..66497468 58 N° 2 66497555..66497645 91 N° 3 66497757..66497900 144 N° 4 66499106..66499223 118
N° 5 66499337..66499477 141 N° 6 66500292..66500366 75  
join(66497411..66497468,66497555..66497645,66497757..66497900,66499106..66499223 ,66499337..66499477,66500292..66500366)


exon

Literature and cross-references HaDHAR12 (HanXRQChr12g0371001)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr12 (66497411..66500366)
Protein sequence: HaDHAR12 (HanXRQChr12g0371001)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   208
PWM (Da):   %s   22983.13  
PI (pH):   %s   6.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAIEICVKAATGAPDVLGDCPFSQRILLTLEEKKVAFKTHLINLDNKPKWFLEVNPDGKVPLAKFDENWISDSDVIVGLIEEKYPHPSLATPPELASVGSKIFPKFVVFLKSKDANDGTEQALLDELNALDEHLKSGPYVTGKTITAVDLSLAPKLYHLEVALGHFKKWTVPESLTHVRNYMKSFEKTKPAKEEYVVAGWAPKVNSA*

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGATTGAGATCTGTGTCAAAGCTGCTACGGGTGCCCCTGATGTTCTTGGCGACTGTAATTAATCTCCCCTTCAAAGATTTCACTTTAATTTCATTGGGGTTTCTTGATCATCAATT
TTTGTGGGTTGTGTTTGATTTTAGGTCCATTTTCCCAAAGGATTCTTTTGACTTTGGAAGAGAAGAAAGTCGCTTTCAAAACCCATCTCATTAACTTAGACAACAAACCTAAATGGTGAT
TATTATTAGTATTATTGTCAGAGAATCTTGAATTTACACATGAAACGTTTGGTTGTTCGTGGCCTCGTGGGATTTTAATATAATTTTTTTTTTTGTGTTTGTGTAGGTTTCTTGAAGTGA
ACCCAGATGGGAAAGTTCCTTTGGCCAAATTTGATGAGAATTGGATATCTGATTCTGATGTTATTGTGGGTCTTATTGAAGAGAAGTACCCTCACCCTTCACTTGCCACTCCCCCTGAAC
TTGCCTCTGT
GTATGCTCTGCCTGGCTCTGTATATATGTCATATGATACAGGTTTATTACGAAATCGGTGGGTTTGAGTTTAGTCTAATTGGGTTTGGGTCGGTTTTAGGCAAATCCTTG
AACATGTTTAGCTAAACTGGTCCTGCTTGGGTTGTTTTGTCAGTTTGCGGGTTGATCGGTTTAACTCTTCTCTCATAAATTTTTAAAAATATAAAAAACAGACATATGGTGTACAGCTCA
GATGAAATTATTTTATTTATATTTGTTTACATGGTTGTAATATGTTATTGTCAGGTAAGGATATTTCAAAAAAAAAAAATAAATAAAAATAAAAATAAAATAAAAATATTGGGTTCAATA
GGGATGGCAAAAAAACCAGAACCCGATGGGTATACCCGAAATCCGAAACATATGGGACGGGTACCCAAACCCCGACGGGTAATGGACGGGTATAATACGTAGTTGTGCTTGATTTTTCCC
TCGACATTCTGTTATATGTTTTTGTTAAAAACGAAGTTGTACTTAAAATAAAATATTTCTTTGGTAGCATAAAACAGTACGATGATCAATTAAACCGTTCTAATGGTTTGGCTTTCTAAA
CAACATGCTTTATTTTCAAATCACGTTTGTTTTACATTATCATTTGTTCGGTTTCGTCGCAACGCGCGACTTCAAAAAAACTAGTAGTAATAAAAATGTATTTGAAAATTTCAATCGGTA
TCTTTTAACAGATTAATGGGTATACCCGATACCCGCGGGTATGCCCAATACCCGACAGGTATTGGGCCGGGTATCGGACACGATTTTACAACCGGGTATGGGTATGAGATTACCAATACC
CGCCCCGAACCCGACCCATTGCCATCCCTACGGTTCAACGGGCCGTGTTTGTGTCGATCCATGAAAACTTGTGTTGTATTGTATCTGGGTTCATGTGTTTGATTTTGAATTCTTGTCACG
TTCGGGTTGTTAAATTTTCACGTTAGTGTAGGGTTTGACCCGCTAATCTGTAAGCACGCCCCGTTAAACACCCCTAAATAGTATATAATTACCACCTATAAGATGGCAAATTCAAGTTGT
TTATGAAAAATTTGCATTTCTAAACTCAAATGACCATTTATGAAATTTTGATTTATTTCATAAACATAAGTTTAGATTTTCCCAAATTGACCAATTAATTGCACAATTATAATACTTCTA
ATTGTGAAATTGTAGGGGGTCAAAGATTTTCCCTAAATTTGTGGTATTTCTAAAGAGCAAGGATGCTAATGATGGGACTGAACAAGCTTTGCTTGATGAATTGAATGCATTAGATGAACA
CCTCAAGAGTAAA
GTACGTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAAAATGATTGTTTTTTTTGCTCTATTTGGTTGATACAAAAATATGTGTTTTTATTTGAATAATAACTAACCTTTATGTTAACA
TGTTAGGGGCCTTATGTTACTGGGAAAACGATCACAGCTGTTGATTTGAGTCTGGCACCAAAGCTATACCATCTTGAGGTGGCTCTTGGCCATTTTAAGAAGTGGACTGTTCCCGAAAGT
CTGACTCATGTGCGTAACTACATGAAG
GTATGACTCTCGCGTATTGAAAGTGATGGTCTGATTATTGAGTTTATAGTGTTGGGTGTGCAAGTGTATAACAAACCCTTTCTGAGTTTTTAA
ATAACCAGTGTTTGTCGATTAGTTGCTCATTTTGTACAATTAGCAGTAGTTTGTTTAAATTTATATATAAACATATTGACTAAATCATTACAATGAAATTTAGAAGTACAAAAATTTGAA
TTATATTGTGTCTTATACGGGCTTGATTGACTCGAGTTTTGTTAGTTTGATTAAGCTTGGGTCGGTTCAGGTCAGGTCCTTTTGGCTTAGTTTTGCCTCACTTTTCGTGAATCAGTCCGT
GTTGTCTTACATGTAGGGTTGTAAATGAGTGTGTCAACTCACAAGTTACTCAATACCAACTATAAATTTGAAACTTGCTCGATTGAAGAAAAGTTGAGCTTGAGCTACTGGAGTAGACTT
TCAAGTTGAGCTTTAGTATTAAAGTCTCCGCTTGTAAAAGTCGCTAGCATTATATTGCCATTTTACATTTTTACCCATTGTGTATATGTGAACTTACATAATTGCAGGCCAGTACTATCT
AGTGAGTCGATCCAAGCGGAGCTCAAAAGTATCTAGTCGAGTCAGTCTTAGCTCATCAAATGATATGACACTAATTACTAACCTTGATTATTATTATTGTTATTATTTTAACTTTGATAA
TCTTGTATACACAAGTCAAGCCTGATCTTGGCATTGTGTTGAATCGGTCAAGACCAAATTACCCCCCATCTTTTTTTTTTTAATACTTATTATGTTAATGCAGTTACTCTTTTCAAGGGA
GTCGTTTGAGAAAACCAAACCTGCTAAAGAAGAATACGTCGTTGCTGGATGGGCGCCAAAGGTTAATAGCGCATGA

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CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGATTGAGATCTGTGTCAAAGCTGCTACGGGTGCCCCTGATGTTCTTGGCGACTGTCCATTTTCCCAAAGGATTCTTTTGACTTTGGAAGAGAAGAAAGTCGCTTTCAAAACCCAT
CTCATTAACTTAGACAACAAACCTAAATG
GTTTCTTGAAGTGAACCCAGATGGGAAAGTTCCTTTGGCCAAATTTGATGAGAATTGGATATCTGATTCTGATGTTATTGTGGGTCTTATT
GAAGAGAAGTACCCTCACCCTTCACTTGCCACTCCCCCTGAACTTGCCTCTGT
GGGGTCAAAGATTTTCCCTAAATTTGTGGTATTTCTAAAGAGCAAGGATGCTAATGATGGGACTGAA
CAAGCTTTGCTTGATGAATTGAATGCATTAGATGAACACCTCAAGAGTAAA
GGGCCTTATGTTACTGGGAAAACGATCACAGCTGTTGATTTGAGTCTGGCACCAAAGCTATACCATCTT
GAGGTGGCTCTTGGCCATTTTAAGAAGTGGACTGTTCCCGAAAGTCTGACTCATGTGCGTAACTACATGAAG
TCGTTTGAGAAAACCAAACCTGCTAAAGAAGAATACGTCGTTGCTGGA
TGGGCGCCAAAGGTTAATAGCGCATGA

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cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGATTG AGATCTGTGT CAAAGCTGCT ACGGGTGCCC CTGATGTTCT TGGCGACTGT CCATTTTCCC AAAGGATTCT TTTGACTTTG GAAGAGAAGA AAGTCGCTTT CAAAACCCAT  CTCATTAACT TAGACAACAA ACCTAAATGG TTTCTTGAAG TGAACCCAGA TGGGAAAGTT CCTTTGGCCA AATTTGATGA GAATTGGATA TCTGATTCTG ATGTTATTGT GGGTCTTATT  GAAGAGAAGT ACCCTCACCC TTCACTTGCC ACTCCCCCTG AACTTGCCTC TGTGGGGTCA AAGATTTTCC CTAAATTTGT GGTATTTCTA AAGAGCAAGG ATGCTAATGA TGGGACTGAA  CAAGCTTTGC TTGATGAATT GAATGCATTA GATGAACACC TCAAGAGTAA AGGGCCTTAT GTTACTGGGA AAACGATCAC AGCTGTTGAT TTGAGTCTGG CACCAAAGCT ATACCATCTT  GAGGTGGCTC TTGGCCATTT TAAGAAGTGG ACTGTTCCCG AAAGTCTGAC TCATGTGCGT AACTACATGA AGTCGTTTGA GAAAACCAAA CCTGCTAAAG AAGAATACGT CGTTGCTGGA 
TGGGCGCCAA AGGTTAATAG CGCATGA 

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