Entry information : CatmAPx01_M2923
Entry ID 14383
Creation 2017-10-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-10-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CatmAPx01_M2923
Name CatmAPx01_M2923
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Chlorokybophyceae Chlorokybaceae Chlorokybus
Organism Chlorokybus atmophyticus     [TaxId: 3144 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CatmAPx01_M2923
start..stop
S start..stop
CatmAPx01_UTEX2591 587 0 1..307 1..307
SmAPx02-2_60 407 2e-144 1..299 1..295
SmAPx02-1_0 405 8e-144 1..299 1..295
LuAPx79 400 1e-141 1..301 1..285
Literature and cross-references CatmAPx01_M2923
Protein sequence: CatmAPx01_M2923
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   307
PWM (Da):   %s   33418.52 Transmb domain:   %s   o272-294i
PI (pH):   %s   8.74
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAGPVVDAAY LKSIENARRD IRALIVNKQC APILVRLAWH DAGTFDVRSK TGGPNGSIRN EKELAHAANR GLHIAVQLLE PIKAKYPNLT YADLYQLGGV VAVEATGGPT VDYVPGRRDS  KVSPPEGRLP DAKKGPMHLR DVFGTMGLSD RDIVALSGAH TLGRAHKDRS DFEGPWTPEP LKFDNSYFKE LLRGNRADLL KLPSDLCLLE DPIFRPLVEL YAADEEAFFR DYAAAHKRLS 
ELGCTLPKNV HTTPTGTSMD GSMLSLNNPD TVILVQAGFG IAVAVGVAVL AYTYETRRRL KSLVKKA 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from RNA seq (scaffold-AZZW-2019246-Chlorokybus_atmophyticus) and Genomic (Chlatm_Chrsp187S02929)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGGGC CGGTTGTCGA CGCGGCGTAC TTGAAGGTGA GCACCGCGCT GTGCCTGGGG CTGTTGTCGA ATTTGCCATG CTTAGTAGGG TTCTGGAGGA AAGTGGCGTG GATTCGGGGT  GGCGTGGTGT GCGGGACTGG TGTGAAGCGG TGATGTCTTG GCGAAATCTG TACTGAGTGT GATTATGGAT GAGTGTCGTA GCACGCGTGC AGCCGCTGCT ACGACAGTTC GCTGTTGACG  GTGAAAGCAT GTTGGGGCTA CCCTATGCAT GTGGCACAGA CATCGCATAG CACACACCTG GTGTTCAATT GTGATTGGAT GAGATTCGCG CTCGTTCGGA TTTGGACACC AGCTATGTCA  TGCTGCGGTC AACCTACCAT GTGCGTTTTT GCTCTTGTCA TCATTGTTAC ACACTTTGTA AGCCTTCAGC CGACGTCAGT TTACACTTGC CGCAATTGAC CAAAGATTCA GTTATGTACC  TTATTGTCTT ATCACACAGA GCATAGAAAA TGCAAGGCGC GATATTCGTG CTCTCATCGT CAACAAGCAA TGCGCTCCCA TTCTCGTGCG GCTCGCTTGG CATGATGCCG GCACTTTTGA  TGTCCGATCC AAGACGGGCG GACCCAATGG CTCCATCCGT AACGAAAAGG TACGCCAAAT GCATAGCGAC AACATCTGAC AGTCATGAAG CGCAAACAAT CACTGTTGAC AATTACAGCC  CTGTTTTACA CCAACATATT GCTTGGTACC TGAGACTCTC GTCTATGCAC AAAGCAAACT TTCTGTGTAC AAGTGTGTTT TGGCTTAACG CAAGCTTGAA GCAAGCATGT CTGTTGCAGG  AGCTCGCGCA CGCAGCAAAC CGCGGCTTGC ACATAGCTGT GCAGCTGCTG GAGCCGATCA AAGCAAAGTA TCCCAACTTG ACGTACGCGG ATCTCTATCA GCTCGGGGGT GTAGTTGCAG  TTGAGGCCAC TGGCGGTCCC ACTGTTGATT ACGTGCCAGG CCGTAGAGAC TCCAAGGTTG ATTGTTGGTA CAAAACACTT ATTGACAGGA TGCAGTGCAT GGAGTGTCGT CTAATTTCAG  CTCTCTTTGC GGCTTGTCTT GGCAGGTGTC ACCACCAGAG GGTCGACTTC CAGATGCGAA GAAGGGTCCA ATGCACCTTC GGGATGTGTT TGGAACCATG GGCTTGTCCG ATAGGGATAT  CGTTGCACTT TCGGGTGCCC ACACTTTGGT ACGTGTGTGC TGTATGGTCA TTTACGTGGC ATTGCAGGCA CGGTAGCTGA CTTGAATTGT GGATCGATAG GGCCGAGCGC ACAAGGATCG  CTCTGATTTT GAAGGCCCTT GGACTCCGGA GCCCTTGAAG TTTGACAACT CTTACTTTAA GTGCGTGGGT GTCATTCTTG TCAGCCGGTT TTTGGTATGA TGAACAGTGC GTGCAGTGTG  TTGACTTGTT TCATGGCTGC ATTGTTCAAC AGGGAACTTC TGAGAGGCAA CCGAGCGGAT TTGCTCAAGC TGCCATCGGA TCTATGCTTG CTGGAAGACC CAATTTTCAG GCCGCTTGTG  GAGCTTTATG CTGCGGTACC CTGCCAGTCT GTGCTGATTG CATATGTGTG ATACTACCCT TGCTAATTGA GGATGTTTAA TGAGCTTGTC GTGGCAGGAT GAGGAGGCCT TCTTTAGGGA  TTATGCGGCA GCGCACAAGC GCTTATCAGA ATTGGGCTGC ACTCTGCCAA AGAACGTCCA CACGACGCCA ACCGGCACCT CTATGGACGG CTCTATGCTT TCTCTCAACA ATCCCGACAC 
GGTGATCCTC GTCCAGGCCG GCTTTGGCAT TGCCGTCGCT GTTGGCGTGG CCGTCCTCGC GTATACGTAT GAGACAAGGC GGCGTTTGAA GAGTCTTGTC AAGAAAGCTT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGGGC CGGTTGTCGA CGCGGCGTAC TTGAAGAGCA TAGAAAATGC AAGGCGCGAT ATTCGTGCTC TCATCGTCAA CAAGCAATGC GCTCCCATTC TCGTGCGGCT CGCTTGGCAT  GATGCCGGCA CTTTTGATGT CCGATCCAAG ACGGGCGGAC CCAATGGCTC CATCCGTAAC GAAAAGGAGC TCGCGCACGC AGCAAACCGC GGCTTGCACA TAGCTGTGCA GCTGCTGGAG  CCGATCAAAG CAAAGTATCC CAACTTGACG TACGCGGATC TCTATCAGCT CGGGGGTGTA GTTGCAGTTG AGGCCACTGG CGGTCCCACT GTTGATTACG TGCCAGGCCG TAGAGACTCC  AAGGTGTCAC CACCAGAGGG TCGACTTCCA GATGCGAAGA AGGGTCCAAT GCACCTTCGG GATGTGTTTG GAACCATGGG CTTGTCCGAT AGGGATATCG TTGCACTTTC GGGTGCCCAC  ACTTTGGGCC GAGCGCACAA GGATCGCTCT GATTTTGAAG GCCCTTGGAC TCCGGAGCCC TTGAAGTTTG ACAACTCTTA CTTTAAGGAA CTTCTGAGAG GCAACCGAGC GGATTTGCTC  AAGCTGCCAT CGGATCTATG CTTGCTGGAA GACCCAATTT TCAGGCCGCT TGTGGAGCTT TATGCTGCGG ATGAGGAGGC CTTCTTTAGG GATTATGCGG CAGCGCACAA GCGCTTATCA  GAATTGGGCT GCACTCTGCC AAAGAACGTC CACACGACGC CAACCGGCAC CTCTATGGAC GGCTCTATGC TTTCTCTCAA CAATCCCGAC ACGGTGATCC TCGTCCAGGC CGGCTTTGGC 
ATTGCCGTCG CTGTTGGCGT GGCCGTCCTC GCGTATACGT ATGAGACAAG GCGGCGTTTG AAGAGTCTTG TCAAGAAAGC TTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGGGC CGGTTGTCGA CGCGGCGTAC TTGAAGAGCA TAGAAAATGC AAGGCGCGAT ATTCGTGCTC TCATCGTCAA CAAGCAATGC GCTCCCATTC TCGTGCGGCT CGCTTGGCAT  GATGCCGGCA CTTTTGATGT CCGATCCAAG ACGGGCGGAC CCAATGGCTC CATCCGTAAC GAAAAGGAGC TCGCGCACGC AGCAAACCGC GGCTTGCACA TAGCTGTGCA GCTGCTGGAG  CCGATCAAAG CAAAGTATCC CAACTTGACG TACGCGGATC TCTATCAGCT CGGGGGTGTA GTTGCAGTTG AGGCCACTGG CGGTCCCACT GTTGATTACG TGCCAGGCCG TAGAGACTCC  AAGGTGTCAC CACCAGAGGG TCGACTTCCA GATGCGAAGA AGGGTCCAAT GCACCTTCGG GATGTGTTTG GAACCATGGG CTTGTCCGAT AGGGATATCG TTGCACTTTC GGGTGCCCAC  ACTTTGGGCC GAGCGCACAA GGATCGCTCT GATTTTGAAG GCCCTTGGAC TCCGGAGCCC TTGAAGTTTG ACAACTCTTA CTTTAAGGAA CTTCTGAGAG GCAACCGAGC GGATTTGCTC  AAGCTGCCAT CGGATCTATG CTTGCTGGAA GACCCAATTT TCAGGCCGCT TGTGGAGCTT TATGCTGCGG ATGAGGAGGC CTTCTTTAGG GATTATGCGG CAGCGCACAA GCGCTTATCA  GAATTGGGCT GCACTCTGCC AAAGAACGTC CACACGACGC CAACCGGCAC CTCTATGGAC GGCTCTATGC TTTCTCTCAA CAATCCCGAC ACGGTGATCC TCGTCCAGGC CGGCTTTGGC  ATTGCCGTCG CTGTTGGCGT GGCCGTCCTC GCGTATACGT ATGAGACAAG GCGGCGTTTG AAGAGTCTTG TCAAGAAAGC TTGACGAGCA AGTGAAAACT GGTGAAGTGC TTTGTCGTGT  CAAACTTGGT TGTGATGAGA CTTGTGCTGT AGCGAGACGA CTCGCTGGCT TCGCTGTCTG TATGTAGCCC TTTCCCCATT GTATAGAGCC GTGTATGTAC CAATAGCTGC GTGTATGAAG 
CGTGCATTGT GTCCTGTG 

Retrieve as FASTA