Entry information : CatmAPx02_M2923
Entry ID 14384
Creation 2017-10-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-10-17 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CatmAPx02_M2923
Name CatmAPx02_M2923
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx002]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Chlorokybophyceae Chlorokybaceae Chlorokybus
Organism Chlorokybus atmophyticus     [TaxId: 3144 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CatmAPx02_M2923
start..stop
S start..stop
CatmAPx02_UTEX2591 709 0 1..366 1..367
NtAPx02 392 1e-137 97..366 9..273
McAPx04 393 9e-137 97..366 94..358
McAPx05 394 3e-136 97..366 94..358
Literature and cross-references CatmAPx02_M2923
Protein sequence: CatmAPx02_M2923
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   366
PWM (Da):   %s   39647.05  
PI (pH):   %s   7.89
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAAAVVGSVS VAKAAALFVA SGAPQAGKKS RRAATPAAVL QTLSLRSSQA VASRSALQAS SKCIVPKASR GVLHITCETD VAATPQVDLD TKKKIYRDCK QAVEQLIKDR NCNPIMIRAG  WHDAGTYNVN IEEWPQRGGT NGSLRFPIEQ GHGANAGMVV AYNLLKPINK KFPEVTWADL FQMAGAVAIE VAGGPAIDMK YGRVDTTSDA DCPESGRLPD ADPKTTGRGE PAEHLRNVFY  RMGLNDQDIV ALSGAHTMGR VRQDRSGFGV KETKYTKDGP GIKGGQSWTP EWLVFDNSYF VEVKEKRDAD LVVLPTDAAL FEDDGFKQYA EKYAVDQEAF FKDYAVSHKK LSELGAKWNP 
EDGFSI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from RNA seq (scaffold-AZZW-2019609-Chlorokybus_atmophyticus, short 5'end is misssing).and genomic (Chlatm_Chrsp17S02562).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCGG CGGTGGTGGG TTCTGTCTCT GTGGCGAAGG CGGCTGCCTT GTTTGTTGCA TCCGGAGCAC CTCAGGCTGG GAAGAAGAGC AGGCGCGCTG CCACACCAGC CGCCGTACTG  CAGACTCTGT CCCTGAGGTC GTCCCAGGCC GTGGCTTCCA GGTCTGCCCT CCAGGTAAGG AGCTATTTCG CATGCAGGTT GCTTTAGGCG CTGAGCACAG CCATTCCATC TTCATGCATG  CTTCTGTACG CTGCTCGTGG ATGTATGAGC GGCACCCGTG CGCAAGTCGC TGAGCGCGTG TCCATCAATT GCAACAGTAG ACGTTCTTGC ATGCCGTACT GTTCATACCA GCATGCGCAC  TGCATTGAAC TGTTGTAGGT GCATGCATGT GTGAGTGTGT AGAGTCTGCC ACCAAATCTC ATGCACACGC AGGCCACGTG TTGAATGTTT TATGCCAATA CGCAGCGCAA GAGGGTCAGC  TGCAAGGGCT TGCATTTCTT GTCGCTTATT CGTCTAGAGT AGTCCTTGCA CTTTTTAACC GCTCACGAAA TCCGGGTCGC AGATGTAATC AGGTCGTAGG TATAGTATGT TGCTCTGGAT  ACGGATGCCA GTGTTCTGTG CATGCGCTCA TCAGTTCTGG CCATCTATTG CGCATGTGTT CCTCTGTGCG ACATGCAGAC AACCTTTGCC ATGCTTGTTT TACAGATTTT GTGAGCGCGG  TTTTGGCCAT GCTTCTTGCA AGCAAATAGT GGTATAATGT TTTTCGTTGC GCTGTGGTGA TACCCAAACA ACAAGAGCCG TTACCTTTTG TGTGTTTTGT TTGACAATCG CACTGTGTGT  TAACAGGCTA GCAGCAAGTG CATTGTACCC AAGGCATCCC GCGGTGTCCT GCATATTACC TGCGAAACTG ATGTTGCAGC GACGCCTCAA GTGGACCTTG ACACCAAGAA GAAGATCTAC  AGGGATTGCA AGCAGGCGGT GGAGCAGCTC ATCAAGGACA GGAACTGCAA CCCTATTATG ATTCGCGCAG GCTGGCATGA TGCTGGCACG TACAATGTGA ACATTGAGGA GTGGCCCCAG  AGGGGTGGTA CAAATGGCAG CTTGCGATTC CCTATTGAGC AAGGCCATGG AGCTAACGCA GGCATGGTTG TGGCTTACAA CCTGTTGAAG CCCATCAACG TAAGTGATTG CTACTTTCAA  TTGTTTTTCA AAAGTTCCAT GCAACACACT TGCTGAATGG TCTTTTGTAC ATGCAGAAGA AGTTCCCAGA AGTGACTTGG GCTGATCTTT TCCAAATGGC TGGCGCTGTG GCTATTGAGG  TTGCGGGTGG ACCTGCCATC GACATGAAGT ATGGGCGGGT TGACACAACT AGCGATGCTG ATTGCCCGGA GTCTGGCAGG TAATGAGAGT GACATTCTGG ATTGTCTGCT GTCACAATCT  TTCAGCTGCT CATGCAGTTG TTCAAATCTG ATTGTACAGG TTGCCCGATG CTGACCCAAA GACAACTGGT CGGGGAGAGC CAGCAGAGCA TCTGCGTAAC GTCTTCTACA GAATGGGCCT  CAATGATCAG GATATCGTTG CATTGTCAGG TAACTACACC ACACGAGTGG TATGTGTTAA GGCATTTCTG AACCAGCACC TGCAGCATGA ACGCGCTGGA GCAGCTGCAG GTTGTGATGG  CCAGTGTATG TATTTGCCTG TATCACTCGC ATGTGGTCAT CTGCAGGTGC GCACACCATG GGTCGCGTGC GCCAGGACCG CAGCGGGTTT GGAGTGAAGG AAACAAAGTA CACGAAGGAT  GGCCCTGGCA TCAAGGGTGG GCAGTCGTGG ACCCCGGAGT GGCTGGTCTT TGACAACTCG TACTTTGTGG AAGTGAAGGA GAAGAGGGAT GCTGACCTGG TTGTGCTGCC AACTGATGCC  GCTCTCTTCG AGGATGATGG CTTCAAGCAG TACGCAGAGA AGTACGCAGT TGACCAGGAG GCGTTCTTCA AGGACTATGC AGTCTCGCAC AAGAAGCTGA GCGAGCTTGG GGCAAAATGG 
AACCCTGAAG ACGGGTTCTC CATCTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCGG CGGTGGTGGG TTCTGTCTCT GTGGCGAAGG CGGCTGCCTT GTTTGTTGCA TCCGGAGCAC CTCAGGCTGG GAAGAAGAGC AGGCGCGCTG CCACACCAGC CGCCGTACTG  CAGACTCTGT CCCTGAGGTC GTCCCAGGCC GTGGCTTCCA GGTCTGCCCT CCAGGCTAGC AGCAAGTGCA TTGTACCCAA GGCATCCCGC GGTGTCCTGC ATATTACCTG CGAAACTGAT  GTTGCAGCGA CGCCTCAAGT GGACCTTGAC ACCAAGAAGA AGATCTACAG GGATTGCAAG CAGGCGGTGG AGCAGCTCAT CAAGGACAGG AACTGCAACC CTATTATGAT TCGCGCAGGC  TGGCATGATG CTGGCACGTA CAATGTGAAC ATTGAGGAGT GGCCCCAGAG GGGTGGTACA AATGGCAGCT TGCGATTCCC TATTGAGCAA GGCCATGGAG CTAACGCAGG CATGGTTGTG  GCTTACAACC TGTTGAAGCC CATCAACAAG AAGTTCCCAG AAGTGACTTG GGCTGATCTT TTCCAAATGG CTGGCGCTGT GGCTATTGAG GTTGCGGGTG GACCTGCCAT CGACATGAAG  TATGGGCGGG TTGACACAAC TAGCGATGCT GATTGCCCGG AGTCTGGCAG GTTGCCCGAT GCTGACCCAA AGACAACTGG TCGGGGAGAG CCAGCAGAGC ATCTGCGTAA CGTCTTCTAC  AGAATGGGCC TCAATGATCA GGATATCGTT GCATTGTCAG GTGCGCACAC CATGGGTCGC GTGCGCCAGG ACCGCAGCGG GTTTGGAGTG AAGGAAACAA AGTACACGAA GGATGGCCCT  GGCATCAAGG GTGGGCAGTC GTGGACCCCG GAGTGGCTGG TCTTTGACAA CTCGTACTTT GTGGAAGTGA AGGAGAAGAG GGATGCTGAC CTGGTTGTGC TGCCAACTGA TGCCGCTCTC  TTCGAGGATG ATGGCTTCAA GCAGTACGCA GAGAAGTACG CAGTTGACCA GGAGGCGTTC TTCAAGGACT ATGCAGTCTC GCACAAGAAG CTGAGCGAGC TTGGGGCAAA ATGGAACCCT 
GAAGACGGGT TCTCCATCTA G 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCGG CGGTGGTGGG TTCTGTCTCT GTGGCGAAGG CGGCTGCCTT GTTTGTTGCA TCCGGAGCAC CTCAGGCTGG GAAGAAGAGC AGGCGCGCTG CCACACCAGC CGCCGTACTG  CAGACTCTGT CCCTGAGGTC GTCCCAGGCC GTGGCTTCCA GGTCTGCCCT CCAGGCTAGC AGCAAGTGCA TTGTACCCAA GGCATCCCGC GGTGTCCTGC ATATTACCTG CGAAACTGAT  GTTGCAGCGA CGCCTCAAGT GGACCTTGAC ACCAAGAAGA AGATCTACAG GGATTGCAAG CAGGCGGTGG AGCAGCTCAT CAAGGACAGG AACTGCAACC CTATTATGAT TCGCGCAGGC  TGGCATGATG CTGGCACGTA CAATGTGAAC ATTGAGGAGT GGCCCCAGAG GGGTGGTACA AATGGCAGCT TGCGATTCCC TATTGAGCAA GGCCATGGAG CTAACGCAGG CATGGTTGTG  GCTTACAACC TGTTGAAGCC CATCAACAAG AAGTTCCCAG AAGTGACTTG GGCTGATCTT TTCCAAATGG CTGGCGCTGT GGCTATTGAG GTTGCGGGTG GACCTGCCAT CGACATGAAG  TATGGGCGGG TTGACACAAC TAGCGATGCT GATTGCCCGG AGTCTGGCAG GTTGCCCGAT GCTGACCCAA AGACAACTGG TCGGGGAGAG CCAGCAGAGC ATCTGCGTAA CGTCTTCTAC  AGAATGGGCC TCAATGATCA GGATATCGTT GCATTGTCAG GTGCGCACAC CATGGGTCGC GTGCGCCAGG ACCGCAGCGG GTTTGGAGTG AAGGAAACAA AGTACACGAA GGATGGCCCT  GGCATCAAGG GTGGGCAGTC GTGGACCCCG GAGTGGCTGG TCTTTGACAA CTCGTACTTT GTGGAAGTGA AGGAGAAGAG GGATGCTGAC CTGGTTGTGC TGCCAACTGA TGCCGCTCTC  TTCGAGGATG ATGGCTTCAA GCAGTACGCA GAGAAGTACG CAGTTGACCA GGAGGCGTTC TTCAAGGACT ATGCAGTCTC GCACAAGAAG CTGAGCGAGC TTGGGGCAAA ATGGAACCCT 
GAAGACGGGT TCTCCATCTA G 

Retrieve as FASTA