Entry information : Ha4CxxC03 (HanXRQChr03g0085271)
Entry ID 14391
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: Ha4CxxC03 (HanXRQChr03g0085271)
Name (synonym) Ha4CxxC03 (HanXRQChr03g0085271)
Class 4CxxC Grx    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value Ha4CxxC03
start..stop
S start..stop
Ha4CxxC12 372 6e-129 1..310 80..404
Ha4CxxC05 270 7e-89 1..310 76..419
At4CxxC07 203 8e-64 139..310 155..334
At4CxxC01 190 8e-59 139..310 144..314
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 143055159..143056091 933  
join(143055159..143056091)


exon

Literature and cross-references Ha4CxxC03 (HanXRQChr03g0085271)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr03 (143055159..143056091)
Protein sequence: Ha4CxxC03 (HanXRQChr03g0085271)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   310
PWM (Da):   %s   34207.61  
PI (pH):   %s   4.74
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAGLGSTPES FHFSPQPSRP SPFRYPFQEN SNPDHKNPIF IKPVDSKPVL FDGFEELCTP KGGNTHKNPI FTKLVDSKPV FLDGFEEVCS SKGENNHEDS IFVKPVASEP EILDGFEEIC  SPNGENNHKD SIFTESVDFK PEILDGFEEL CPPKGENKVV IYTTSLRGVR KTFEACNAVR AVLEGFRVMF SERDVSMDRG FREELWELMK GKDKSELVPP RVFVKGRYVG GSDEVLRIVE 
EGCLGQLLDG LPKLKAGYVC ETCGGARFLP CCSCNGSCKV VMDGDQFGET VTVKCTDCNE NGLVRCPVCS 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTGGTC TTGGTTCCAC CCCAGAAAGC TTTCATTTTT CCCCACAACC CTCTAGACCA TCCCCTTTTA GATACCCATT TCAAGAAAAC TCAAACCCTG ATCATAAAAA TCCAATTTTT  ATTAAACCGG TTGATTCTAA ACCGGTTTTG TTTGATGGGT TTGAAGAACT TTGCACACCA AAAGGGGGAA ATACTCATAA AAATCCAATC TTTACCAAAT TAGTGGATTC TAAACCGGTT  TTCTTGGATG GGTTTGAAGA AGTTTGCTCA TCAAAGGGGG AAAATAATCA TGAAGATTCA ATCTTTGTAA AACCAGTGGC TTCTGAACCG GAAATCTTGG ATGGGTTTGA AGAAATTTGC  TCACCAAATG GGGAAAACAA TCATAAAGAT TCAATCTTTA CCGAATCAGT GGATTTTAAA CCGGAAATCT TGGATGGGTT TGAAGAGCTC TGCCCACCAA AGGGGGAAAA CAAGGTGGTG  ATCTATACGA CGTCGTTGAG AGGTGTAAGG AAGACATTTG AGGCGTGTAA TGCGGTGAGG GCGGTTCTTG AGGGGTTCAG GGTGATGTTT AGCGAGCGAG ATGTATCGAT GGATCGTGGT  TTTAGGGAGG AGCTTTGGGA GCTAATGAAG GGGAAGGATA AGAGTGAATT GGTTCCACCA AGAGTGTTTG TGAAGGGGAG ATATGTGGGT GGGTCTGATG AGGTTTTGAG GATTGTTGAA  GAGGGGTGTT TGGGTCAGTT GCTTGATGGG TTGCCTAAGT TGAAAGCAGG GTATGTGTGT GAGACTTGTG GTGGTGCAAG ATTCTTGCCA TGTTGTAGTT GTAATGGAAG TTGTAAAGTG 
GTAATGGATG GGGATCAGTT TGGGGAAACT GTGACTGTGA AATGTACAGA TTGTAATGAG AATGGGCTTG TTAGGTGTCC CGTTTGTAGT TGA 

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CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTGGTC TTGGTTCCAC CCCAGAAAGC TTTCATTTTT CCCCACAACC CTCTAGACCA TCCCCTTTTA GATACCCATT TCAAGAAAAC TCAAACCCTG ATCATAAAAA TCCAATTTTT  ATTAAACCGG TTGATTCTAA ACCGGTTTTG TTTGATGGGT TTGAAGAACT TTGCACACCA AAAGGGGGAA ATACTCATAA AAATCCAATC TTTACCAAAT TAGTGGATTC TAAACCGGTT  TTCTTGGATG GGTTTGAAGA AGTTTGCTCA TCAAAGGGGG AAAATAATCA TGAAGATTCA ATCTTTGTAA AACCAGTGGC TTCTGAACCG GAAATCTTGG ATGGGTTTGA AGAAATTTGC  TCACCAAATG GGGAAAACAA TCATAAAGAT TCAATCTTTA CCGAATCAGT GGATTTTAAA CCGGAAATCT TGGATGGGTT TGAAGAGCTC TGCCCACCAA AGGGGGAAAA CAAGGTGGTG  ATCTATACGA CGTCGTTGAG AGGTGTAAGG AAGACATTTG AGGCGTGTAA TGCGGTGAGG GCGGTTCTTG AGGGGTTCAG GGTGATGTTT AGCGAGCGAG ATGTATCGAT GGATCGTGGT  TTTAGGGAGG AGCTTTGGGA GCTAATGAAG GGGAAGGATA AGAGTGAATT GGTTCCACCA AGAGTGTTTG TGAAGGGGAG ATATGTGGGT GGGTCTGATG AGGTTTTGAG GATTGTTGAA  GAGGGGTGTT TGGGTCAGTT GCTTGATGGG TTGCCTAAGT TGAAAGCAGG GTATGTGTGT GAGACTTGTG GTGGTGCAAG ATTCTTGCCA TGTTGTAGTT GTAATGGAAG TTGTAAAGTG 
GTAATGGATG GGGATCAGTT TGGGGAAACT GTGACTGTGA AATGTACAGA TTGTAATGAG AATGGGCTTG TTAGGTGTCC CGTTTGTAGT TGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTGGTC TTGGTTCCAC CCCAGAAAGC TTTCATTTTT CCCCACAACC CTCTAGACCA TCCCCTTTTA GATACCCATT TCAAGAAAAC TCAAACCCTG ATCATAAAAA TCCAATTTTT  ATTAAACCGG TTGATTCTAA ACCGGTTTTG TTTGATGGGT TTGAAGAACT TTGCACACCA AAAGGGGGAA ATACTCATAA AAATCCAATC TTTACCAAAT TAGTGGATTC TAAACCGGTT  TTCTTGGATG GGTTTGAAGA AGTTTGCTCA TCAAAGGGGG AAAATAATCA TGAAGATTCA ATCTTTGTAA AACCAGTGGC TTCTGAACCG GAAATCTTGG ATGGGTTTGA AGAAATTTGC  TCACCAAATG GGGAAAACAA TCATAAAGAT TCAATCTTTA CCGAATCAGT GGATTTTAAA CCGGAAATCT TGGATGGGTT TGAAGAGCTC TGCCCACCAA AGGGGGAAAA CAAGGTGGTG  ATCTATACGA CGTCGTTGAG AGGTGTAAGG AAGACATTTG AGGCGTGTAA TGCGGTGAGG GCGGTTCTTG AGGGGTTCAG GGTGATGTTT AGCGAGCGAG ATGTATCGAT GGATCGTGGT  TTTAGGGAGG AGCTTTGGGA GCTAATGAAG GGGAAGGATA AGAGTGAATT GGTTCCACCA AGAGTGTTTG TGAAGGGGAG ATATGTGGGT GGGTCTGATG AGGTTTTGAG GATTGTTGAA  GAGGGGTGTT TGGGTCAGTT GCTTGATGGG TTGCCTAAGT TGAAAGCAGG GTATGTGTGT GAGACTTGTG GTGGTGCAAG ATTCTTGCCA TGTTGTAGTT GTAATGGAAG TTGTAAAGTG 
GTAATGGATG GGGATCAGTT TGGGGAAACT GTGACTGTGA AATGTACAGA TTGTAATGAG AATGGGCTTG TTAGGTGTCC CGTTTGTAGT TGA 

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