Entry information : Ha4CxxC08 (HanXRQChr09g0259941)
Entry ID 14396
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: Ha4CxxC08 (HanXRQChr09g0259941)
Name (synonym) Ha4CxxC08 (HanXRQChr09g0259941)
Class 4CxxC Grx    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value Ha4CxxC08
start..stop
S start..stop
Ha4CxxC11 413 4e-144 1..408 1..366
At4CxxC06 309 2e-102 56..407 26..416
Thas4CxxC03 297 1e-97 65..407 38..431
At4CxxC03 293 1e-96 61..407 30..401
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 150263151..150264377 1227  
join(150263151..150264377)


exon

Literature and cross-references Ha4CxxC08 (HanXRQChr09g0259941)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr09 (150263151..150264377)
Protein sequence: Ha4CxxC08 (HanXRQChr09g0259941)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   408
PWM (Da):   %s   44991.73  
PI (pH):   %s   5.44
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MGCSASRSSP PLFTTTITTT ATTTTVDHQN PPPKSSDSSP SPLNFSPTFS DHHYTTSNSS NSTRTPVSRT MSLPTPLIHH PPHFNGDSNH FVSLTSTTYG SLSAVDAATD NFKTLDQSPV  SPVLSPDSVI NTWELMEGLD EEFDIINVEH KTHLKKDIDT DTEKDKPYVS FGLGGPYELV EYSEVKPKPL WKHLSEESLL SKMDDNLISS YNKALSSKRL GEHKSSLGCL ATHSVSESPV  SKDFEELKNS KGVCCLPGCE DRVVLYYTSL RGIRKTYEDC CEIRLIMKGF RVFVDERDIS MDSSYRKELQ GVFEGKGFSL PQLFVSGERI GGADEIKRLH EEGKLFDLMK GFPVMDPGFV 
CGNCGDVRFV PCMNCSGSRK VFEEDEGRAV RCPDCNENGL IRCVACCS 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTTGCT CTGCTTCTCG CTCATCCCCA CCATTATTCA CCACCACCAT CACAACCACC GCCACCACCA CCACCGTTGA CCATCAAAAC CCACCACCCA AATCCTCCGA TTCTTCACCC  TCACCACTCA ATTTCAGCCC CACCTTCTCA GATCACCATT ACACCACCTC TAACTCCTCC AATTCAACAC GCACCCCTGT TTCTCGAACC ATGTCTCTAC CCACCCCTTT AATCCACCAC  CCACCCCATT TTAACGGCGA CTCCAACCAC TTCGTTTCCC TCACCTCCAC CACCTACGGC TCCCTCTCCG CCGTTGACGC CGCCACCGAC AATTTCAAAA CCCTAGATCA ATCCCCTGTT  TCCCCTGTTT TGTCTCCGGA CTCTGTTATC AACACGTGGG AGCTTATGGA AGGTTTAGAT GAAGAGTTTG ACATTATTAA TGTCGAACAT AAAACACATT TGAAGAAAGA TATAGATACA  GATACAGAAA AAGATAAGCC ATATGTATCA TTCGGCTTGG GTGGTCCGTA CGAATTGGTT GAGTATTCAG AGGTTAAACC TAAACCCTTG TGGAAGCATT TATCTGAGGA GTCCTTGTTA  TCGAAAATGG ATGATAATTT AATATCCAGT TACAACAAAG CACTTTCGTC TAAGCGGTTA GGCGAACATA AGTCGAGTTT AGGCTGTTTG GCAACTCACT CTGTTTCGGA ATCCCCTGTT  TCGAAAGATT TTGAAGAGTT AAAGAATTCG AAAGGGGTTT GTTGTTTACC GGGTTGTGAA GATCGAGTCG TGTTGTATTA CACGAGTTTG AGAGGGATTA GGAAAACGTA CGAAGATTGT  TGCGAAATTC GGTTGATTAT GAAAGGGTTT CGGGTGTTTG TGGATGAAAG GGATATATCG ATGGATTCGA GTTATAGAAA GGAGCTGCAG GGTGTGTTTG AGGGGAAAGG GTTTAGTTTG  CCGCAATTGT TTGTTAGTGG GGAGCGTATT GGTGGTGCGG ATGAGATCAA ACGGCTTCAT GAAGAGGGGA AGTTGTTTGA TTTGATGAAA GGGTTTCCGG TGATGGATCC GGGGTTTGTT  TGTGGGAATT GTGGGGATGT GAGATTTGTT CCGTGCATGA ATTGTAGTGG GAGTAGGAAG GTGTTTGAGG AGGATGAAGG GAGAGCGGTA CGGTGTCCGG ATTGCAATGA GAATGGGTTG 
ATCAGGTGTG TTGCTTGTTG TTCTTGA 

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CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTTGCT CTGCTTCTCG CTCATCCCCA CCATTATTCA CCACCACCAT CACAACCACC GCCACCACCA CCACCGTTGA CCATCAAAAC CCACCACCCA AATCCTCCGA TTCTTCACCC  TCACCACTCA ATTTCAGCCC CACCTTCTCA GATCACCATT ACACCACCTC TAACTCCTCC AATTCAACAC GCACCCCTGT TTCTCGAACC ATGTCTCTAC CCACCCCTTT AATCCACCAC  CCACCCCATT TTAACGGCGA CTCCAACCAC TTCGTTTCCC TCACCTCCAC CACCTACGGC TCCCTCTCCG CCGTTGACGC CGCCACCGAC AATTTCAAAA CCCTAGATCA ATCCCCTGTT  TCCCCTGTTT TGTCTCCGGA CTCTGTTATC AACACGTGGG AGCTTATGGA AGGTTTAGAT GAAGAGTTTG ACATTATTAA TGTCGAACAT AAAACACATT TGAAGAAAGA TATAGATACA  GATACAGAAA AAGATAAGCC ATATGTATCA TTCGGCTTGG GTGGTCCGTA CGAATTGGTT GAGTATTCAG AGGTTAAACC TAAACCCTTG TGGAAGCATT TATCTGAGGA GTCCTTGTTA  TCGAAAATGG ATGATAATTT AATATCCAGT TACAACAAAG CACTTTCGTC TAAGCGGTTA GGCGAACATA AGTCGAGTTT AGGCTGTTTG GCAACTCACT CTGTTTCGGA ATCCCCTGTT  TCGAAAGATT TTGAAGAGTT AAAGAATTCG AAAGGGGTTT GTTGTTTACC GGGTTGTGAA GATCGAGTCG TGTTGTATTA CACGAGTTTG AGAGGGATTA GGAAAACGTA CGAAGATTGT  TGCGAAATTC GGTTGATTAT GAAAGGGTTT CGGGTGTTTG TGGATGAAAG GGATATATCG ATGGATTCGA GTTATAGAAA GGAGCTGCAG GGTGTGTTTG AGGGGAAAGG GTTTAGTTTG  CCGCAATTGT TTGTTAGTGG GGAGCGTATT GGTGGTGCGG ATGAGATCAA ACGGCTTCAT GAAGAGGGGA AGTTGTTTGA TTTGATGAAA GGGTTTCCGG TGATGGATCC GGGGTTTGTT  TGTGGGAATT GTGGGGATGT GAGATTTGTT CCGTGCATGA ATTGTAGTGG GAGTAGGAAG GTGTTTGAGG AGGATGAAGG GAGAGCGGTA CGGTGTCCGG ATTGCAATGA GAATGGGTTG 
ATCAGGTGTG TTGCTTGTTG TTCTTGA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTTGCT CTGCTTCTCG CTCATCCCCA CCATTATTCA CCACCACCAT CACAACCACC GCCACCACCA CCACCGTTGA CCATCAAAAC CCACCACCCA AATCCTCCGA TTCTTCACCC  TCACCACTCA ATTTCAGCCC CACCTTCTCA GATCACCATT ACACCACCTC TAACTCCTCC AATTCAACAC GCACCCCTGT TTCTCGAACC ATGTCTCTAC CCACCCCTTT AATCCACCAC  CCACCCCATT TTAACGGCGA CTCCAACCAC TTCGTTTCCC TCACCTCCAC CACCTACGGC TCCCTCTCCG CCGTTGACGC CGCCACCGAC AATTTCAAAA CCCTAGATCA ATCCCCTGTT  TCCCCTGTTT TGTCTCCGGA CTCTGTTATC AACACGTGGG AGCTTATGGA AGGTTTAGAT GAAGAGTTTG ACATTATTAA TGTCGAACAT AAAACACATT TGAAGAAAGA TATAGATACA  GATACAGAAA AAGATAAGCC ATATGTATCA TTCGGCTTGG GTGGTCCGTA CGAATTGGTT GAGTATTCAG AGGTTAAACC TAAACCCTTG TGGAAGCATT TATCTGAGGA GTCCTTGTTA  TCGAAAATGG ATGATAATTT AATATCCAGT TACAACAAAG CACTTTCGTC TAAGCGGTTA GGCGAACATA AGTCGAGTTT AGGCTGTTTG GCAACTCACT CTGTTTCGGA ATCCCCTGTT  TCGAAAGATT TTGAAGAGTT AAAGAATTCG AAAGGGGTTT GTTGTTTACC GGGTTGTGAA GATCGAGTCG TGTTGTATTA CACGAGTTTG AGAGGGATTA GGAAAACGTA CGAAGATTGT  TGCGAAATTC GGTTGATTAT GAAAGGGTTT CGGGTGTTTG TGGATGAAAG GGATATATCG ATGGATTCGA GTTATAGAAA GGAGCTGCAG GGTGTGTTTG AGGGGAAAGG GTTTAGTTTG  CCGCAATTGT TTGTTAGTGG GGAGCGTATT GGTGGTGCGG ATGAGATCAA ACGGCTTCAT GAAGAGGGGA AGTTGTTTGA TTTGATGAAA GGGTTTCCGG TGATGGATCC GGGGTTTGTT  TGTGGGAATT GTGGGGATGT GAGATTTGTT CCGTGCATGA ATTGTAGTGG GAGTAGGAAG GTGTTTGAGG AGGATGAAGG GAGAGCGGTA CGGTGTCCGG ATTGCAATGA GAATGGGTTG 
ATCAGGTGTG TTGCTTGTTG TTCTTGA 

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