Entry information : Ha4CxxC11 (HanXRQChr13g0392061)
Entry ID 14399
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: Ha4CxxC11 (HanXRQChr13g0392061)
Name (synonym) Ha4CxxC11 (HanXRQChr13g0392061)
Class 4CxxC Grx    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value Ha4CxxC11
start..stop
S start..stop
Ha4CxxC08 402 1e-139 1..366 1..408
At4CxxC06 261 2e-84 51..365 28..416
At4CxxC03 253 9e-82 60..365 36..401
Thas4CxxC11-2 224 7e-72 205..364 117..276
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 36960616..36961716 1101  
complement(join(36960616..36961716))


exon

Literature and cross-references Ha4CxxC11 (HanXRQChr13g0392061)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr13 (36961716..36960616)
Protein sequence: Ha4CxxC11 (HanXRQChr13g0392061)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   366
PWM (Da):   %s   40826.4  
PI (pH):   %s   6.18
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MGCYASRSSP PFQFTTTITA TVNRQNPPSN SSSSSPSPPH FYSSFSDHHH YISSASQTPV SRTMSMPIPL IHHPPLRKGD SNHFVSLTST SYGSLIVLDT TNDAATTDPS KTVEENHFSS  PDSVINTWEL MEGLDDECGM ANMVNMVNVN DYSNIPNSYN AKMINGSSAK REISNKSVEN SQMKPLWKHL SEEFLVSKID AYLNSSDNKE ICCLSGCEDR IVLYYTSLRG IRKTYEDCYE  TRMILKGFRV FVDERDISMD SSYKKELERV FEGKGFTLPQ VFIRGRHIGG ADEIKRLNEE GRLVGFMEGF RVIDPGFVCD CCGDARFVPC PNCNGSRKVF VEDEGRSVRC LNCNENGLIR 
CATCCS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGGTGTT ATGCTTCTCG TTCATCCCCA CCATTCCAAT TCACCACCAC CATCACCGCA ACCGTAAACC GCCAAAACCC ACCTTCAAAT TCATCCAGTT CATCACCTTC ACCACCCCAT  TTCTACTCCT CATTCTCAGA TCACCACCAT TACATCTCCT CTGCTTCACA AACCCCTGTT TCAAGAACCA TGTCTATGCC CATCCCACTC ATCCACCACC CGCCCCTTCG AAAAGGCGAT  TCGAATCACT TCGTATCGCT TACCTCCACC TCCTATGGCT CCCTGATCGT TCTAGACACT ACCAATGATG CTGCCACAAC TGACCCTAGC AAAACTGTGG AAGAAAACCA TTTTTCGTCT  CCGGATTCGG TGATCAACAC ATGGGAGCTC ATGGAAGGGT TAGATGATGA ATGTGGTATG GCTAATATGG TTAATATGGT TAATGTGAAT GATTATTCGA ATATACCCAA TTCTTATAAT  GCAAAAATGA TCAATGGGTC GAGTGCGAAA AGGGAAATTT CGAACAAATC GGTTGAGAAT TCGCAAATGA AGCCGTTATG GAAGCACTTA TCGGAGGAAT TCTTGGTGTC GAAAATTGAT  GCTTATTTGA ATTCTAGTGA TAATAAAGAA ATTTGTTGTT TATCTGGTTG TGAGGATAGG ATTGTTTTGT ATTATACAAG TTTGAGGGGA ATTAGAAAGA CTTATGAAGA TTGTTACGAA  ACTCGAATGA TTTTGAAGGG GTTTCGTGTG TTTGTCGATG AAAGGGATAT ATCGATGGAT TCGAGTTACA AAAAGGAGTT GGAGAGAGTG TTTGAAGGTA AAGGGTTCAC TTTGCCACAA  GTGTTTATTA GGGGAAGACA TATTGGTGGT GCGGATGAGA TCAAACGACT TAATGAAGAA GGGAGATTGG TCGGGTTTAT GGAGGGGTTT CGTGTGATTG ATCCTGGGTT TGTTTGTGAT  TGTTGTGGTG ATGCGAGATT CGTTCCTTGC CCAAATTGCA ATGGAAGCCG AAAGGTTTTT GTGGAAGATG AAGGGCGATC GGTTAGGTGC CTGAATTGCA ATGAGAATGG CTTGATCAGG 
TGTGCAACTT GTTGTTCTTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGGTGTT ATGCTTCTCG TTCATCCCCA CCATTCCAAT TCACCACCAC CATCACCGCA ACCGTAAACC GCCAAAACCC ACCTTCAAAT TCATCCAGTT CATCACCTTC ACCACCCCAT  TTCTACTCCT CATTCTCAGA TCACCACCAT TACATCTCCT CTGCTTCACA AACCCCTGTT TCAAGAACCA TGTCTATGCC CATCCCACTC ATCCACCACC CGCCCCTTCG AAAAGGCGAT  TCGAATCACT TCGTATCGCT TACCTCCACC TCCTATGGCT CCCTGATCGT TCTAGACACT ACCAATGATG CTGCCACAAC TGACCCTAGC AAAACTGTGG AAGAAAACCA TTTTTCGTCT  CCGGATTCGG TGATCAACAC ATGGGAGCTC ATGGAAGGGT TAGATGATGA ATGTGGTATG GCTAATATGG TTAATATGGT TAATGTGAAT GATTATTCGA ATATACCCAA TTCTTATAAT  GCAAAAATGA TCAATGGGTC GAGTGCGAAA AGGGAAATTT CGAACAAATC GGTTGAGAAT TCGCAAATGA AGCCGTTATG GAAGCACTTA TCGGAGGAAT TCTTGGTGTC GAAAATTGAT  GCTTATTTGA ATTCTAGTGA TAATAAAGAA ATTTGTTGTT TATCTGGTTG TGAGGATAGG ATTGTTTTGT ATTATACAAG TTTGAGGGGA ATTAGAAAGA CTTATGAAGA TTGTTACGAA  ACTCGAATGA TTTTGAAGGG GTTTCGTGTG TTTGTCGATG AAAGGGATAT ATCGATGGAT TCGAGTTACA AAAAGGAGTT GGAGAGAGTG TTTGAAGGTA AAGGGTTCAC TTTGCCACAA  GTGTTTATTA GGGGAAGACA TATTGGTGGT GCGGATGAGA TCAAACGACT TAATGAAGAA GGGAGATTGG TCGGGTTTAT GGAGGGGTTT CGTGTGATTG ATCCTGGGTT TGTTTGTGAT  TGTTGTGGTG ATGCGAGATT CGTTCCTTGC CCAAATTGCA ATGGAAGCCG AAAGGTTTTT GTGGAAGATG AAGGGCGATC GGTTAGGTGC CTGAATTGCA ATGAGAATGG CTTGATCAGG 
TGTGCAACTT GTTGTTCTTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGGTGTT ATGCTTCTCG TTCATCCCCA CCATTCCAAT TCACCACCAC CATCACCGCA ACCGTAAACC GCCAAAACCC ACCTTCAAAT TCATCCAGTT CATCACCTTC ACCACCCCAT  TTCTACTCCT CATTCTCAGA TCACCACCAT TACATCTCCT CTGCTTCACA AACCCCTGTT TCAAGAACCA TGTCTATGCC CATCCCACTC ATCCACCACC CGCCCCTTCG AAAAGGCGAT  TCGAATCACT TCGTATCGCT TACCTCCACC TCCTATGGCT CCCTGATCGT TCTAGACACT ACCAATGATG CTGCCACAAC TGACCCTAGC AAAACTGTGG AAGAAAACCA TTTTTCGTCT  CCGGATTCGG TGATCAACAC ATGGGAGCTC ATGGAAGGGT TAGATGATGA ATGTGGTATG GCTAATATGG TTAATATGGT TAATGTGAAT GATTATTCGA ATATACCCAA TTCTTATAAT  GCAAAAATGA TCAATGGGTC GAGTGCGAAA AGGGAAATTT CGAACAAATC GGTTGAGAAT TCGCAAATGA AGCCGTTATG GAAGCACTTA TCGGAGGAAT TCTTGGTGTC GAAAATTGAT  GCTTATTTGA ATTCTAGTGA TAATAAAGAA ATTTGTTGTT TATCTGGTTG TGAGGATAGG ATTGTTTTGT ATTATACAAG TTTGAGGGGA ATTAGAAAGA CTTATGAAGA TTGTTACGAA  ACTCGAATGA TTTTGAAGGG GTTTCGTGTG TTTGTCGATG AAAGGGATAT ATCGATGGAT TCGAGTTACA AAAAGGAGTT GGAGAGAGTG TTTGAAGGTA AAGGGTTCAC TTTGCCACAA  GTGTTTATTA GGGGAAGACA TATTGGTGGT GCGGATGAGA TCAAACGACT TAATGAAGAA GGGAGATTGG TCGGGTTTAT GGAGGGGTTT CGTGTGATTG ATCCTGGGTT TGTTTGTGAT  TGTTGTGGTG ATGCGAGATT CGTTCCTTGC CCAAATTGCA ATGGAAGCCG AAAGGTTTTT GTGGAAGATG AAGGGCGATC GGTTAGGTGC CTGAATTGCA ATGAGAATGG CTTGATCAGG 
TGTGCAACTT GTTGTTCTTG A 

Retrieve as FASTA