Entry information : Ha4CxxC12 (HanXRQChr13g0414371)
Entry ID 14400
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: Ha4CxxC12 (HanXRQChr13g0414371)
Name (synonym) Ha4CxxC12 (HanXRQChr13g0414371)
Class 4CxxC Grx    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value Ha4CxxC12
start..stop
S start..stop
Ha4CxxC03 372 1e-128 80..404 1..310
Ha4CxxC05 367 3e-125 1..404 1..419
At4CxxC07 207 4e-64 170..404 104..334
At4CxxC07 79 1e-16 1..138 1..151
At4CxxC01 190 1e-57 202..404 113..314
At4CxxC01 56 0.000000006 2..110 3..134
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 152941098..152942312 1215  
join(152941098..152942312)


exon

Literature and cross-references Ha4CxxC12 (HanXRQChr13g0414371)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr13 (152941098..152942312)
Protein sequence: Ha4CxxC12 (HanXRQChr13g0414371)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   404
PWM (Da):   %s   44395.26  
PI (pH):   %s   7.5
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MGCVSSHLLN QDDDFTQISH HIVSLTSSTY GLLTLDPSSS PTTLPPTPST RFTLGSYLHT PLTEPTTEPP PEVIDSLELM AGLDSTPEPS LMVLENAHKF QENAHPDHKN RILSKPGSCK  PVFLNGFQEN ANPDHKNPIL IKPGSCKPVF LDGFQENEYP DHKNRIFNKP GSYKPVFSDG FQENGKPDHK NRNLIKPGSC KPVFLNGFQE NGNPDYKNRI LIKPGCYKQV FLDGFEELCP  PKGENRVVIY TTTLRGVRKT FEACNAVRAV LEGFGVAFCE RDISMDRGFK QELWELMKGK DKCELVPPRV FVKGKYVGGS DEVLRIVEEG CLGKLLECLP KAKVGYVCEV CGGARFLPCV 
VCNGSCKVVV VLKKGIDGKQ LGKSVTVKCS DCNENGLVCC PICS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTTGTG TGTCATCACA TCTACTCAAC CAAGATGATG ATTTCACCCA AATCAGCCAC CACATTGTAT CACTCACCTC ATCCACTTAT GGTCTCTTGA CCCTTGACCC ATCATCCTCC  CCCACCACCC TACCCCCCAC CCCCTCAACC CGGTTCACTC TAGGCTCATA CCTCCACACC CCACTCACCG AACCCACAAC CGAACCACCA CCAGAAGTCA TTGACTCCTT GGAGCTCATG  GCTGGTCTTG ACTCCACCCC TGAACCATCC CTTATGGTTC TTGAAAATGC CCACAAATTT CAAGAAAATG CACACCCTGA TCATAAAAAT CGGATCTTGA GCAAACCCGG GTCTTGTAAA  CCGGTTTTCT TAAATGGGTT TCAAGAAAAT GCAAACCCTG ATCATAAAAA TCCGATCTTG ATCAAACCCG GGTCTTGTAA ACCGGTTTTC TTAGATGGGT TTCAAGAAAA TGAGTACCCT  GATCATAAAA ATCGGATCTT TAACAAACCC GGGTCTTATA AACCGGTTTT CTCAGATGGG TTTCAAGAAA ATGGGAAACC TGATCATAAA AATCGTAACT TAATCAAACC CGGGTCTTGT  AAACCGGTTT TCTTGAATGG GTTTCAAGAA AATGGGAACC CGGATTATAA AAATCGGATC TTGATCAAAC CCGGGTGTTA TAAACAGGTT TTCTTGGATG GGTTTGAAGA ATTATGTCCA  CCCAAGGGGG AGAACAGAGT GGTGATCTAT ACGACGACGT TGAGAGGTGT TAGGAAGACG TTTGAGGCGT GTAATGCGGT TAGGGCGGTT CTTGAAGGGT TTGGGGTGGC ATTTTGCGAG  CGAGATATAT CGATGGACCG CGGTTTTAAA CAAGAGCTTT GGGAGCTAAT GAAGGGGAAA GATAAGTGTG AATTGGTCCC ACCTAGGGTG TTTGTGAAGG GGAAATATGT GGGTGGGTCA  GATGAGGTTT TGAGGATAGT TGAAGAGGGG TGTTTGGGTA AGTTGCTTGA ATGTTTGCCT AAAGCAAAAG TTGGTTATGT GTGTGAGGTT TGTGGTGGTG CAAGGTTCTT GCCATGTGTT  GTTTGTAATG GAAGTTGTAA AGTGGTGGTG GTTTTGAAGA AAGGAATTGA TGGAAAGCAA TTGGGGAAGA GTGTGACTGT GAAATGTAGT GATTGTAATG AGAATGGACT TGTTTGTTGT 
CCCATTTGTA GTTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTTGTG TGTCATCACA TCTACTCAAC CAAGATGATG ATTTCACCCA AATCAGCCAC CACATTGTAT CACTCACCTC ATCCACTTAT GGTCTCTTGA CCCTTGACCC ATCATCCTCC  CCCACCACCC TACCCCCCAC CCCCTCAACC CGGTTCACTC TAGGCTCATA CCTCCACACC CCACTCACCG AACCCACAAC CGAACCACCA CCAGAAGTCA TTGACTCCTT GGAGCTCATG  GCTGGTCTTG ACTCCACCCC TGAACCATCC CTTATGGTTC TTGAAAATGC CCACAAATTT CAAGAAAATG CACACCCTGA TCATAAAAAT CGGATCTTGA GCAAACCCGG GTCTTGTAAA  CCGGTTTTCT TAAATGGGTT TCAAGAAAAT GCAAACCCTG ATCATAAAAA TCCGATCTTG ATCAAACCCG GGTCTTGTAA ACCGGTTTTC TTAGATGGGT TTCAAGAAAA TGAGTACCCT  GATCATAAAA ATCGGATCTT TAACAAACCC GGGTCTTATA AACCGGTTTT CTCAGATGGG TTTCAAGAAA ATGGGAAACC TGATCATAAA AATCGTAACT TAATCAAACC CGGGTCTTGT  AAACCGGTTT TCTTGAATGG GTTTCAAGAA AATGGGAACC CGGATTATAA AAATCGGATC TTGATCAAAC CCGGGTGTTA TAAACAGGTT TTCTTGGATG GGTTTGAAGA ATTATGTCCA  CCCAAGGGGG AGAACAGAGT GGTGATCTAT ACGACGACGT TGAGAGGTGT TAGGAAGACG TTTGAGGCGT GTAATGCGGT TAGGGCGGTT CTTGAAGGGT TTGGGGTGGC ATTTTGCGAG  CGAGATATAT CGATGGACCG CGGTTTTAAA CAAGAGCTTT GGGAGCTAAT GAAGGGGAAA GATAAGTGTG AATTGGTCCC ACCTAGGGTG TTTGTGAAGG GGAAATATGT GGGTGGGTCA  GATGAGGTTT TGAGGATAGT TGAAGAGGGG TGTTTGGGTA AGTTGCTTGA ATGTTTGCCT AAAGCAAAAG TTGGTTATGT GTGTGAGGTT TGTGGTGGTG CAAGGTTCTT GCCATGTGTT  GTTTGTAATG GAAGTTGTAA AGTGGTGGTG GTTTTGAAGA AAGGAATTGA TGGAAAGCAA TTGGGGAAGA GTGTGACTGT GAAATGTAGT GATTGTAATG AGAATGGACT TGTTTGTTGT 
CCCATTTGTA GTTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTTGTG TGTCATCACA TCTACTCAAC CAAGATGATG ATTTCACCCA AATCAGCCAC CACATTGTAT CACTCACCTC ATCCACTTAT GGTCTCTTGA CCCTTGACCC ATCATCCTCC  CCCACCACCC TACCCCCCAC CCCCTCAACC CGGTTCACTC TAGGCTCATA CCTCCACACC CCACTCACCG AACCCACAAC CGAACCACCA CCAGAAGTCA TTGACTCCTT GGAGCTCATG  GCTGGTCTTG ACTCCACCCC TGAACCATCC CTTATGGTTC TTGAAAATGC CCACAAATTT CAAGAAAATG CACACCCTGA TCATAAAAAT CGGATCTTGA GCAAACCCGG GTCTTGTAAA  CCGGTTTTCT TAAATGGGTT TCAAGAAAAT GCAAACCCTG ATCATAAAAA TCCGATCTTG ATCAAACCCG GGTCTTGTAA ACCGGTTTTC TTAGATGGGT TTCAAGAAAA TGAGTACCCT  GATCATAAAA ATCGGATCTT TAACAAACCC GGGTCTTATA AACCGGTTTT CTCAGATGGG TTTCAAGAAA ATGGGAAACC TGATCATAAA AATCGTAACT TAATCAAACC CGGGTCTTGT  AAACCGGTTT TCTTGAATGG GTTTCAAGAA AATGGGAACC CGGATTATAA AAATCGGATC TTGATCAAAC CCGGGTGTTA TAAACAGGTT TTCTTGGATG GGTTTGAAGA ATTATGTCCA  CCCAAGGGGG AGAACAGAGT GGTGATCTAT ACGACGACGT TGAGAGGTGT TAGGAAGACG TTTGAGGCGT GTAATGCGGT TAGGGCGGTT CTTGAAGGGT TTGGGGTGGC ATTTTGCGAG  CGAGATATAT CGATGGACCG CGGTTTTAAA CAAGAGCTTT GGGAGCTAAT GAAGGGGAAA GATAAGTGTG AATTGGTCCC ACCTAGGGTG TTTGTGAAGG GGAAATATGT GGGTGGGTCA  GATGAGGTTT TGAGGATAGT TGAAGAGGGG TGTTTGGGTA AGTTGCTTGA ATGTTTGCCT AAAGCAAAAG TTGGTTATGT GTGTGAGGTT TGTGGTGGTG CAAGGTTCTT GCCATGTGTT  GTTTGTAATG GAAGTTGTAA AGTGGTGGTG GTTTTGAAGA AAGGAATTGA TGGAAAGCAA TTGGGGAAGA GTGTGACTGT GAAATGTAGT GATTGTAATG AGAATGGACT TGTTTGTTGT 
CCCATTTGTA GTTGA 

Retrieve as FASTA