Entry information : HaGrxC13 (HanXRQChr10g0280311)
Entry ID 14417
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaGrxC13 (HanXRQChr10g0280311)
Name (synonym) HaGrxC13 (HanXRQChr10g0280311)
Class CGYC Grx    [Orthogroup: GrxC004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaGrxC13
start..stop
S start..stop
HaGrxC24 239 2e-82 8..171 1..164
ThasGrxC05-2 196 5e-65 1..169 3..177
AtGrxC05 190 1e-62 1..169 1..167
ThasGrxC05-1 188 3e-62 1..169 3..167
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 12177827..12178104 278 N° 2 12178181..12178254 74 N° 3 12180076..12180150 75 N° 4 12180834..12180860 27
N° 5 12181287..12181351 65  
join(12177827..12178104,12178181..12178254,12180076..12180150,12180834..12180860 ,12181287..12181351)


exon

Literature and cross-references HaGrxC13 (HanXRQChr10g0280311)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr10 (12177827..12181351)
Protein sequence: HaGrxC13 (HanXRQChr10g0280311)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   172
PWM (Da):   %s   18508.64  
PI (pH):   %s   9.92
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAATSSHLTTSSLTSVSLSTTSLSHFPNSPSSLSFTTIQYPKPLYKTTTTRTTKHGGLKIHAMTASFGSRLEESVKKTVTDNPVVVYSKTWCSYSSEVKSLFNRLGVEPLVVELDQGAQGPQLQKVLERLTGQHTVPNVFIGGKHIGGCTDTVKLHRKGELEGLLAEAKKA

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAGCAACTTCTTCTCATCTTACTACTTCATCCCTCACCTCTGTTTCTCTCTCTACCACCTCTCTCTCTCACTTCCCCAACTCTCCCTCTTCCCTTTCATTCACCACCATTCAATAT
CCAAAACCATTATATAAAACAACCACCACCAGAACAACAAAACATGGTGGGCTCAAGATCCACGCCATGACAGCTTCATTCGGATCTCGATTAGAGGAGTCTGTCAAGAAAACCGTCACT
GATAATCCAGTCGTCGTCTATTCCAAAACCTGGTGTTC
GTAAGTTCACTTAGGGTTTTCTCTTTTCATATTTTGTAATTCATTTATTTCAGACTTTTTTGGTTTGATTGTGAAGGTATTC
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GTAAGTGTTATTGTTTTTTATATATGTATTTGGGGAAAAAGTGAAATAAAGA
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GTTTCGTTTAAATCGTATGTAATATGCACATACTGTATATATAGTCAAGATTTTTTGATTAAATCCAACATGCTATGCGTATGTTATCTTGAAGTCTACATAATGTTAGAAGCCGATTTG
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CTATATGCTACATAGCGAATAGCGATAAATAGCGGGGCTATTTTATAAATAGCGATACACTAGAAAAAGAATTTTGAAAATTTTTATATGTATATTATATCAAAGTACCCTGGTATATAC
GCTATTTTACATGAATATTTAACAAAAAACCTAAAATCCAGCTATTTTATAGCTATATTTAGTTGCTATTTATATTGAGAAAAAAACAAAAAATAAAATAAAATTGAAGTCCGCTATCCA
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CGGTTATCGGTGGTAGCTCAAAATATCGGTTTGTAATATCGGTGTTATCTCGGACAGCGATTATATCGGCTATAAACACCGATATATCGCCGATATTTTGTATAATCTATATCGGTTGTC
TCGCCGATATCTCGTCTCGGTCAATTTTTTACATTTTTTTTTATACAAAACTGCATTTCACAGCAAAAAAAAGCGAAGTTTAAATGGTGCATAAATTACCGATATCCCACCGCGATAAAC
GATATCTCAAATATCGGTCCTTGACCGGTAACCGATATTTTTCCGCATTAACTGCATAGCTATTGAGCTAAAGCATGTGAACGTGAGGTGACTGCTGCATAAAGTATGGTGGGCTACATA
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TACATGAACTATAATATTGAGGCAATTTTGAAAATTAACTGTTAGGACTTAGAAATACTGAATGTAGTTTTATCGTTTTCTTTTCTCAGGTGCACAAGGACCTCAGCTACAGAAGGTTCT
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GTATGTTGTAGTTGCATTAAGAATCTCATATGATTCTCCACTTGAGAACTAAGTATGCTCTAATTTGTATTGAACT
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AAACATATATTTTTTTTCGTAGCGACAGACAATTTAGGATATGTGTCTGCTGCTGAATATGATGCAGTAAATGCTGAGTGCTGACCTTCCATCACTTTTTTCACAATATTAACATTTAAC
AACACTCAATAGAAGAAATATTGAAATGAAAATAGAAATAAAATATATCTACAGTAGCGTTCAGTATAAATTTTGTGCTTTAATTTCTTATTCTAATTTGTTCATTTATCTTGTTCTGTG
ATAACAGGGGGCAAACACATCGGCGGTTGTACGGGTACCTTTTTTACCATATGCTTTTTGGCTACTTCATCTATCAACTATTCCTGTCGTTTTCGTTCTCTCTGGATATCATTATGCATG
ATTATGCAAACACGTTATTTTTCGTTTAAAGATTCGGGAAAATAGTTTGTGTTAAAATCGGTAATCACATGAAACCAAAATCATATATGACAGTATACACATGATTTAACATCCATAGAT
GTTGATAGAGACATTTTATTTTGTGATCGTGAATTATTTACGTTACAAGTCATATCTACTTAGAAAACAAGGATGACTGTCCTAGCTGTATATGTAAGCGTTATCATTATGATTTATTTA
CCTTATAAGTCACATTTACTTACAACAATAGCCGATCTTTTCGATCTATGATGTTGTATAATAGTATAATACTGCAATGTCGTTTTGTGATCCGGTGCAGATACCGTTAAGTTACATAGG
AAAGGGGAACTTGAAGGTTTGCTGGCAGAGGCAAAAAAGGCATAA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAGCAACTTCTTCTCATCTTACTACTTCATCCCTCACCTCTGTTTCTCTCTCTACCACCTCTCTCTCTCACTTCCCCAACTCTCCCTCTTCCCTTTCATTCACCACCATTCAATAT
CCAAAACCATTATATAAAACAACCACCACCAGAACAACAAAACATGGTGGGCTCAAGATCCACGCCATGACAGCTTCATTCGGATCTCGATTAGAGGAGTCTGTCAAGAAAACCGTCACT
GATAATCCAGTCGTCGTCTATTCCAAAACCTGGTGTTC
GTATTCTTCTGAGGTGAAATCGTTGTTTAATCGGCTCGGTGTGGAGCCGCTTGTTGTTGAATTGGACCAGATGGGTGCACAA
GGACCTCAGCTACAGAAGGTTCTTGAACGGCTTACTGGGCAGCATACCGTTCCAAATGTTTTTATTG
GGGGCAAACACATCGGCGGTTGTACGGATACCGTTAAGTTACATAGGAAAGGG
GAACTTGAAGGTTTGCTGGCAGAGGCAAAAAAGGCATAA

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AATCTTCCAT CCGTTGGCTT TTACGCAAAG AAAAGGTTCA AATTAGACGC AAAGGCCACC TCACCTAACA AGAAAAAGCC CCTTTGAGAT CACCACATAA AAAGTGTCAC TGACAGAAAC  ACACACAGAC CAAAAGGAAC AACCATCCTC ATCAATGGCA GCAACTTCTT CTCATCTTAC TACTTCATCC CTCACCTCTG TTTCTCTCTC TACCACCTCT CTCTCTCACT TCCCCAACTC  TCCCTCTTCC CTTTCATTCA CCACCATTCA ATATCCAAAA CCATTATATA AAACAACCAC CACCAGAACA ACAAAACATG GTGGGCTCAA GATCCACGCC ATGACAGCTT CATTCGGATC  TCGATTAGAG GAGTCTGTCA AGAAAACCGT CACTGATAAT CCAGTCGTCG TCTATTCCAA AACCTGGTGT TCGTATTCTT CTGAGGTGAA ATCGTTGTTT AATCGGCTCG GTGTGGAGCC  GCTTGTTGTT GAATTGGACC AGATGGGTGC ACAAGGACCT CAGCTACAGA AGGTTCTTGA ACGGCTTACT GGGCAGCATA CCGTTCCAAA TGTTTTTATT GGGGGCAAAC ACATCGGCGG  TTGTACGGAT ACCGTTAAGT TACATAGGAA AGGGGAACTT GAAGGTTTGC TGGCAGAGGC AAAAAAGGCA TAATTCTACT CTTTACTCCA GATGTGTTGT ATCAATAAGA AATAGTTGTC  TGATTATTTT TTTTTTTCAC AAATTTTAAA GCTGCACAAT TGTTTTATTC TCAAACAATG ATACCTTTTA TTTTAATTTG TGGCACTTGT CTTGTAGATT AAAAAGATGT AATTGGTATG 
ATAGTGAACA TATATGCATA TGTCATTGGC AAATCTTTTT CATTAAGATG TATAATCGTA AATATGTTGC TCAAACAGGA TTTGAGAGAT T 

Retrieve as FASTA