Entry information : HaGrxS01 (HanXRQChr04g0124081)
Entry ID 14432
Creation 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Last sequence changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaGrxS01 (HanXRQChr04g0124081)
Name (synonym) HaGrxS01 (HanXRQChr04g0124081)
Class CGFS Grx    [Orthogroup: GrxS001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaGrxS01
start..stop
S start..stop
AtGrxS17 703 0 3..489 5..488
ThasGrxS17-2 702 0 3..489 5..490
ThasGrxS17-1 689 0 3..488 5..494
ThasGrxS17-1 271 9e-86 282..489 152..388
MpGrxS04 587 0 2..489 6..498
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 168236146..168236310 165 N° 2 168232517..168232591 75 N° 3 168231068..168231781 714 N° 4 168229540..168230055 516
complement(join(168229540..168230055,168231068..168231781,168232517..168232591,1 68236146..168236310))


exon

Literature and cross-references HaGrxS01 (HanXRQChr04g0124081)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr04 (168236310..168229540)
Protein sequence: HaGrxS01 (HanXRQChr04g0124081)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   489
PWM (Da):   %s   53219.06  
PI (pH):   %s   5.39
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MGVKDVKSKQELDNLVKDGSAVMVHFWASWCEASKHMDQVFNHLSGDFPHAHFVRVEAEEQPEISEAYSVSAVPYFVFLKNGKTVDTLEGAHPSELANKVSKIVGSIHAGEPAAPASLGMAAGPSVLEAIQDLAKIDNSPRGKTQPPAPAGISDSLKTRLEKLTRSHPIMLFMKGNPEAPQCGFSKKAVEILKTENVKFGTFDILSDNEVREGLKKFSNWPTYPQLYCNGELLGGSDILIAMHEGGELKQAFADHGVGNDDVSKSTVAGPDGQQAGVTNSTGLSLALTSRLESLIKSAPVMLFMKGTPDEPRCGFSRKVVDILREEKVDFKTFDILSDDEVRQGLKVYSNWSSYPQLYIKSELIGGSDIVLEMQKSGELEKVLVENGIMSLEDRLKKLVNSKPVMLFMKGTPDAPKCGFSSKVVNALKEEGIKFGSFDILSDEEVRQGLKTFSNWPTFPQVYYKGELIGGCDIILELKSNGELASTLSE*

Retrieve as FASTA  
Remarks Warnings: The paralog 100013581 is in an intron of the proteins.
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTGTGAAAGATGTGAAGTCAAAGCAAGAACTTGATAATCTTGTGAAAGATGGGTCAGCTGTTATGGTTCACTTCTGGGCTTCGTGGTGTGAAGCTTCTAAGCACATGGATCAAGTT
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GTCCCTGAGGTTTGGCCAGTTTTGCGACTTTCGTCTAAAGGTTTGTTTTTCCGCATCCGGCTACAAAAGGTTTGAAATCTTACAATTTTCATCCGGCTCGCTAACTCCATCTATTTTTCT
CTGGAGTAAACTGCCATTTTGGTCCCTATGGTTTGTCACTTTTGCCACTTTAGTCCAAAACTCAAACTTTTTGCATCTGGTCCCTGTGGTTTCAGTTTATTGCCATTTTGGTCCAAAAAT
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TTGATAATCTATCAGGTAGTCGATATTCTCAGAGAAGAAAAGGTTGATTTCAAGACTTTCGATATACTCTCAGATGATGAAGTAAGGCAAGGTCTAAAAGTATACTCAAACTGGTCAAGT
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ATTTTGGAGCTTAAAAGCAATGGTGAGCTTGCATCTACCTTATCAGAGTAA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTGTGAAAGATGTGAAGTCAAAGCAAGAACTTGATAATCTTGTGAAAGATGGGTCAGCTGTTATGGTTCACTTCTGGGCTTCGTGGTGTGAAGCTTCTAAGCACATGGATCAAGTT
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AATGGCAAGACAGTTGATACATTGGAAGGCGCACATCCATCTGAGCTGGCGAACAAAGTTTCAAAAATCGTGGGGTCAATCCATGCTGGCGAACCGGCTGCACCCGCGAGCTTAGGGATG
GCAGCGGGACCCTCGGTTCTCGAAGCAATTCAAGATCTCGCTAAAATCGACAACTCACCACGTGGGAAAACGCAACCGCCAGCGCCAGCTGGCATTAGCGATTCACTGAAGACCCGTCTC
GAAAAACTCACCCGTTCTCACCCCATAATGCTATTCATGAAAGGAAACCCTGAAGCACCCCAATGCGGATTCAGTAAAAAAGCCGTTGAAATATTGAAAACCGAAAATGTTAAATTTGGT
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GCAATGCATGAGGGGGGTGAATTGAAACAAGCTTTTGCCGATCATGGGGTCGGAAATGATGATGTCAGCAAGTCAACTGTGGCGGGACCCGATGGTCAACAGGCTGGAGTTACCAATTCC
ACTGGGTTGAGTTTGGCTTTGACTTCTCGCCTTGAAAGTCTCATTAAGTCGGCTCCTGTTATGCTTTTTATGAAGGGAACTCCAGATGAACCTAGATGTGGCTTCAGCCGAAAG
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AGCGACGAGGAAGTTCGACAAGGGTTGAAAACATTCTCAAACTGGCCTACTTTCCCTCAAGTTTATTATAAAGGTGAGTTGATTGGAGGATGTGATATCATTTTGGAGCTTAAAAGCAAT
GGTGAGCTTGCATCTACCTTATCAGAGTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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ACCTTATCAG AGTAAAAGGT AAGACTTTTA TCAGTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTT 

Retrieve as FASTA