Entry information : HaGrxS02 (HanXRQChr10g0304481)
Entry ID 14433
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaGrxS02 (HanXRQChr10g0304481)
Name (synonym) HaGrxS02 (HanXRQChr10g0304481)
Class CGFS Grx    [Orthogroup: GrxS002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaGrxS02
start..stop
S start..stop
HaGrxS05 303 4e-108 1..156 1..158
ThasGrxS14-2 223 4e-76 16..151 25..160
ThasGrxS14-1 220 5e-75 16..151 25..160
AtGrxS14 208 2e-70 3..151 16..162
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 186943170..186943214 45 N° 2 186943349..186943483 135 N° 3 186943565..186943664 100 N° 4 186944616..186944682 67
N° 5 186945333..186945411 79 N° 6 186945492..186945536 45  
join(186943170..186943214,186943349..186943483,186943565..186943664,186944616..1 86944682,186945333..186945411,186945492..186945536)


exon

Literature and cross-references HaGrxS02 (HanXRQChr10g0304481)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr10 (186943170..186945536)
Protein sequence: HaGrxS02 (HanXRQChr10g0304481)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   156
PWM (Da):   %s   17689.84  
PI (pH):   %s   6.52
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MLFNGFRSMEYTTASASRSFLRHGMRFSTSVPNDPDTHDDFKPTNKLENSEITLKDIVEQDVKDNLVMIYMKGDPEQPRCGFSSLAVRVLSEYRVPIHSRNILEDPELKNAVKAFSMWPTFPQIFINGEFIGGSDIILNMHNGELKEKLKARSSE*

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Remarks
DNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCTATTTAACGGATTCAGGTCAATGGAGTATACAACTGCATCGGTATGATGTAATTAATCATTTTACTATAAAGATTTCCCCATTAAATCTGACTTTGAATAAATGTTTCATTGTATC
TAGATCGTTTTTGTTAGTTTTTAGATTTTGTTACATGAATTTTGTGCTTCAATTTGCAGGCATCTAGATCGTTCTTGCGACATGGTATGCGATTTTCGACTAGTGTGCCGAATGATCCTG
ATACACATGATGATTTCAAGCCCACAAATAAGCTTGAGAATTCTGAAATCACTCTGAAGGACATTGTTGAGCAG
GTTGTTGGCTGTTGATGAGTGTATATTGTTTCATGAACGTTTTTGT
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TATTGAGTGAATATA
GTAAGCTCTCAAATCATAAAATTGTTCTTTTCCTGAGATATTTTGACACACAGTTAATATTTTAACCTGAATGGTATTTGTTGAATGTATATGCACTTGCAACTA
GGGGTGTTTAGAAACCGTTAAACCGACCGAACCACCTAAATCCTAGCAAGTCGCTGGTTTGAGATCCAAATGGTTCAGTTTTTGCGGTCTAATCTTATATTTTTTATATAAATAGTTTAG
TTTTTTTTAATTTAAATGAGGCAAATGTAACATATATGTGTATTTTTATTACTATTTTGTAAAAAATAACTTACAAATTAATTTGATATAGGAGTTAATAATGAAAAGAAAATTCACCAA
ATAATAACCAAGCTCCATAATTCAATTTAAGTCAAATTGGAAGAAAAAAATAACTAAATGGTAAACGAGATTCACATATGTTTTATTTGCTACACTTAGTTTTTTTTTTTAAGTAAACAT
TTATAAAGTTATTATATAAGACTGGAACATGCTATGAAAGTTGGATAACTTTAGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTTTTGAGTGACTTTAGTG
AGACACTTGGGAACCAACCCACCCAACCCAGCTGGTTTGGTTTGTTGTTTCCCGAAACTATAGTTAGTGGTTCGGCCAAATATTTTCGTCAAAAGTCAAAACCAGCCAAATCACCCCTAG
TGGCTTATATAAACCGTTACATCCACAACGTATTTAAATAGTTGGTCATACGTTTGTTGTTTAGTTATCATGAAAAGGTAACAATCAATGCACCTTCTAGACGCGATGTATGCGAAGATG
GTATAAGCTATAAGCAGGCTAATTGCCAAAATTCGTTACATTTTAGCATATGATCTAATTCTACATTTCTACTATATTTTCAAATTGGATCAAGCGTATTTAATCATTTTGTGCGTTGCT
GCACAGGAGTCCCTATACATTCCAGAAACATATTGGAAGATCCAGAGCTTAAGAATGCCGTAAAAGCTTTCAGGTATCATTGTATCAAGCACCTCCTATATGCAAATTAGTTTGCTTAAC
TGAACATAAAGCAGTTTCACTTTATCTTCTCCACCCTTTTAGTTATAAAATATATAAGAGTAAATTACGTTTTTGGCCCCTGTGGTTATATCTCTTTTACTATATTAGCCCAAAATAAGA
ATTTTTAACATATCTGCCCCCATGGTCTCTATAACTAACCATTTTGGCCCCTAAGTCTAACCATTTTGGCCCCCATGGTCTCTATAACTAACCATTTTGGCCCTCATGATCTCTAGACTT
AGGGGCTAAAATGGTTAGTTATAGAGACCATGGGGGCAGATATGTTAAAAATTCTTATTTTGGGCTAATATAGTAAAAGTGATATAACCATAGGGGCTAAAAACGTAATTTACTCAATAT
ATAATTTATATGTTGTATGATTGCAAATTCTATATCACTACATATATAATAATAATCTATATTATTGCAAATTCTATATCTTGCCCACTTTGGGCGACTTTAGACGTGTTTTGACCCGTT
TCATTTTTTAGTTAAATTATTAGTTTAGCTTGTCTGACCTGTTTTACAGATAGTTACAACCCAAGTTGACATTTGTATATATAGGTAAACAGTATATAATTAGTTTTTACCCTTTATGTG
CAGCATGTGGCCGACATTTCCTCAAATATTCATCAACGGAGAATTCATTGGAGGATCAGACATTATTCTCAATATGCATCAGGTGTTTTTTGGTTTGTTTTTGGCATAGTGTTATGTTTT
AATGTTCAAAATATGGATTTTAATCTTTTTGGCGTTGTGCAGAATGGTGAACTAAAGGAGAAGCTAAAGGCGAGGTCATCAGAGTAG

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CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCTATTTAACGGATTCAGGTCAATGGAGTATACAACTGCATCGGCATCTAGATCGTTCTTGCGACATGGTATGCGATTTTCGACTAGTGTGCCGAATGATCCTGATACACATGATGAT
TTCAAGCCCACAAATAAGCTTGAGAATTCTGAAATCACTCTGAAGGACATTGTTGAGCAG
GATGTTAAAGACAACCTTGTGATGATTTACATGAAAGGCGATCCAGAACAACCGCGCTGT
GGGTTCAGTTCGTTAGCAGTCAGAGTATTGAGTGAATATA
GAGTCCCTATACATTCCAGAAACATATTGGAAGATCCAGAGCTTAAGAATGCCGTAAAAGCTTTCAGCATGTGGCCGACA
TTTCCTCAAATATTCATCAACGGAGAATTCATTGGAGGATCAGACATTATTCTCAATATGCATCAG
AATGGTGAACTAAAGGAGAAGCTAAAGGCGAGGTCATCAGAGTAG

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cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ACAGAAAATA AGCGCCGGAA AGGGTAAATC ATCAAAGCAG ACATTTCCCT TTGCTTCGTG GAGGCCAGGA ACATCACTAA CCTTAAACCC TTCTTACATC GTAACACGAT GGCTAGGGTG  TTATTATCAA ACATGCTATT TAACGGATTC AGGTCAATGG AGTATACAAC TGCATCGGCA TCTAGATCGT TCTTGCGACA TGGTATGCGA TTTTCGACTA GTGTGCCGAA TGATCCTGAT  ACACATGATG ATTTCAAGCC CACAAATAAG CTTGAGAATT CTGAAATCAC TCTGAAGGAC ATTGTTGAGC AGGATGTTAA AGACAACCTT GTGATGATTT ACATGAAAGG CGATCCAGAA  CAACCGCGCT GTGGGTTCAG TTCGTTAGCA GTCAGAGTAT TGAGTGAATA TAGAGTCCCT ATACATTCCA GAAACATATT GGAAGATCCA GAGCTTAAGA ATGCCGTAAA AGCTTTCAGC  ATGTGGCCGA CATTTCCTCA AATATTCATC AACGGAGAAT TCATTGGAGG ATCAGACATT ATTCTCAATA TGCATCAGAA TGGTGAACTA AAGGAGAAGC TAAAGGCGAG GTCATCAGAG  TAGACAAGTC TCGTTTGCAT CTCGTGTCGC CAAATTATAT TAGATTTGGG ACGCTTAAGT TTCGAGCCAG TATACGTTAT AAACAGTTTT TAAAGCATTC TTTTTACCGT GAGTGTTGTT  CAAATAATGT TGATGTTACA ATCTACTTTT ACTGAACAAG TTGTGGTCGT TTGCTATATA CTTCTTTACA AACTGCATGA CAAAAAAGTA GACGTAAAAA ATGGCCTTGA TTTTCGATCT 
GAAGTTACCA GATTTGATAT TTCAGGTTGC CCCTACAGGG AAACAAAGAC TCGTTTCAAA TCTTTAC 

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