Entry information : HaCxxS01 (HanXRQChr05g0130751)
Entry ID 14482
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaCxxS01 (HanXRQChr05g0130751)
Name (synonym) HaCxxS01 (HanXRQChr05g0130751)
Class Thioredoxin Type CxxS    [Orthogroup: CxxS001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaCxxS01
start..stop
S start..stop
ThasCxxS01 153 1e-49 5..121 3..121
AtCxxS01 144 5e-46 12..121 3..112
ThasTrxH09-1 98 1e-27 16..120 28..132
ThasTrxH01 96 4e-27 12..114 7..109
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 9740044..9740148 105 N° 2 9738485..9738607 123 N° 3 9736614..9736766 153  
complement(join(9736614..9736766,9738485..9738607,9740044..9740148))


exon

Literature and cross-references HaCxxS01 (HanXRQChr05g0130751)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr05 (9740148..9736614)
Protein sequence: HaCxxS01 (HanXRQChr05g0130751)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   126
PWM (Da):   %s   14011.19  
PI (pH):   %s   4.56
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MDAADQEPPKPRIVKINSTETWDSHLQQSKSDGTPMVAHFTASWCIPSVAMNPFIEELALVFNDIIFLTVDVDDFKEIANKYEVKAMPTFLLIKEGVVVGRLVGANPDEIKKRIETLLQSNSQFVV*

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATGCTGCTGATCAAGAACCCCCAAAACCAAGAATTGTCAAGATTAATTCAACTGAAACATGGGATTCCCATCTTCAACAATCAAAATCTGATGGAACCCCTGTAAGTATTTGCATC
CTCATGATGTTACAAAAACCCTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATGGTTACTGCATGAAAAAGTGTTATTCTTTAATCTTTTTTAGGTTTTT
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CTTTGGAAGCTAGGTGGAATTATTTATTTCCAATTTGCCTTTTTTGTTTTATTTGATTTTGATATATTCTTCACTTAATGTACTTGTGTTTATGTTTATAGATGGTGGCACATTTTACAG
CATCATGGTGCATCCCTTCTGTAGCCATGAACCCTTTTATAGAAGAGTTGGCCTTAGTTTTCAATGACATAATCTTTCTGACTGTTGATGTTGATGATTTTAAG
GTAATTATCGCCGCTT
AAATCCGTTATTTTTTCGATCTAGCTCTTGATCAATATTGTATACTTTGATGGTAATCGATAAACGATTTGATAGTCACACCCACATTGAACTTCTGTTGTACTTGTTGGGCTCGAATCG
GCTGATTTACACCACTGAGTTAATTGCCATTTTAGTCCTTGTGGTTTGAGCCATTTTGCCAGTTTAGTCCAAATGTTTCATTTTTAACATCTGGATCCAAAAAGGTTTCATCGTTGCCAT
TTTGGTCCAACTGACTTAACTCCATCCATATCTGTTAAGTCTGCCAAGGGCATTTTTGTCATTTCATTTAAAAGAAAATAAAGAAAAAAGGATTAATAAAAAGAAAATGAAATGACAAAA
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ATGGGAATATATATGAGAGATTTTCTTGATGTGGTGGAGTGTTTTTGGAATATATATTCAATTGTGCATCAGTGTCTGTTACATGTATTGGACTCTAAAGCTTACACTTTTATGATACCA
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ACCCGTTCATAAGTCATAGAAGTAGGGCTGCAAACGAATCGAACGTTCAGTGAACAGTTCGTGAATCGTTCGGCGGGAAGTATGTTTGTGTTCGTTCGTTTAATTAAGGAGCGAACACGA
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TTTTATTTAAAACTTCAAAACTACTAATAAATAAAATATTAAAAAAATTAGTGTATTGTACATTCCATACTGTTTAACATATGCTCGATTGTACATGTTCATAAACGTTTGTGTTCATGA
ATGTATGTTTGTGTTCATGAGCGTTTGTTTGTGTTCGTTACCTAAAGTTAACAAACGAATACGAACACATTCATTTCTTTAATGAACAAACATGAACAGATAATCTCGTTCGGTAAGTGT
TCATGAACACGTTTATTTCCTTAAGAAACGAACATGAACAAGGCATTGTCCATGTTTGTTTGGTTCATTTGCAGCCTTACATAGAAGGTAAATACATACAAGAGCAAGAACCGGAGCTTT
TGTATGTTAAAATGTCAGATTTAAAGTACAATAGATACAAAAACGATTGGTCGATAACAATTGGCGCAACATTAGATATGTTTCGACACGTTTAACTCTTTTTCTTTTATCTTAAAAATT
TGAAATTTATAAATATTTGCAGGAAATAGCAAACAAATATGAGGTGAAGGCAATGCCAACATTCTTGTTGATAAAAGAAGGTGTTGTAGTTGGGAGACTAGTAGGAGCCAATCCAGATGA
GATCAAGAAAAGGATTGAGACCCTTCTTCAATCCAACAGTCAGTTTGTGGTCTAG

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATGCTGCTGATCAAGAACCCCCAAAACCAAGAATTGTCAAGATTAATTCAACTGAAACATGGGATTCCCATCTTCAACAATCAAAATCTGATGGAACCCCTATGGTGGCACATTTT
ACAGCATCATGGTGCATCCCTTCTGTAGCCATGAACCCTTTTATAGAAGAGTTGGCCTTAGTTTTCAATGACATAATCTTTCTGACTGTTGATGTTGATGATTTTAAG
GAAATAGCAAAC
AAATATGAGGTGAAGGCAATGCCAACATTCTTGTTGATAAAAGAAGGTGTTGTAGTTGGGAGACTAGTAGGAGCCAATCCAGATGAGATCAAGAAAAGGATTGAGACCCTTCTTCAATCC
AACAGTCAGTTTGTGGTCTAG

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TAAAATAAGA AGTCTTGAAG TATTAGTTAA CCATAAATAT GTTGTTTTAA TCATTAAATT ATTAATATTA AATATCTGTG GGCTGTATAT CAAACAAAAG CATCCCATAG GATCAGTGCA  AACGGCAATA CAAATCCCCT GTGACACCTT CAAAGAATGA TTTGAATCTG AATATGGACC CAATTTATGT TTATCCAAAA CCATCTTTAG TCCTATTATA AACCTATTTT TTAGTAAAAT  TATTAGTAAA TCTTTTTAAA AAACAGGGGA GATATGGATG CTGCTGATCA AGAACCCCCA AAACCAAGAA TTGTCAAGAT TAATTCAACT GAAACATGGG ATTCCCATCT TCAACAATCA  AAATCTGATG GAACCCCTAT GGTGGCACAT TTTACAGCAT CATGGTGCAT CCCTTCTGTA GCCATGAACC CTTTTATAGA AGAGTTGGCC TTAGTTTTCA ATGACATAAT CTTTCTGACT  GTTGATGTTG ATGATTTTAA GGAAATAGCA AACAAATATG AGGTGAAGGC AATGCCAACA TTCTTGTTGA TAAAAGAAGG TGTTGTAGTT GGGAGACTAG TAGGAGCCAA TCCAGATGAG  ATCAAGAAAA GGATTGAGAC CCTTCTTCAA TCCAACAGTC AGTTTGTGGT CTAGTGCTAC TCTAACAAGT ACCATGAGTT TGTTTTCTTG TACATTCCTA ATCAATGTGT GCTGCACAAC  ATGGTTTGTG GACCCTTTGT GATTCTTGTT TATACAAAAC TTTTTGTGAG ATTGGTTTGT GTTCACCCAA TTTGATATTT TGTGAGTGGT ACATAAAGCA TATTGTCAAC TCAAATCTTT 
CCATAATATA TGCATATAGT TTTTAACTTC TCATTCAATT CAAAAATTAC AAGCTAAAAA AATCCTTACC TCTTTTTAAT GATTTT 

Retrieve as FASTA