Entry information : HaLilium01HanXRQChr02g0054491
Entry ID 14483
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaLilium01HanXRQChr02g0054491
Name HaLilium01HanXRQChr02g0054491
Class Thioredoxin Type Lilium    [Orthogroup: Lilium002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaLilium01
start..stop
S start..stop
HaLilium05 406 3e-144 1..290 1..295
ThasLilium01-2 296 4e-101 77..290 75..283
ThasLilium01-1 295 9e-101 7..238 24..236
AtLilium01 278 8e-96 98..290 1..177
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 161923820..161924053 234 N° 2 161923004..161923180 177 N° 3 161921970..161922134 165 N° 4 161921139..161921435 297
complement(join(161921139..161921435,161921970..161922134,161923004..161923180,1 61923820..161924053))


exon

Literature and cross-references HaLilium01HanXRQChr02g0054491
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr02 (161924053..161921139)
Protein sequence: HaLilium01HanXRQChr02g0054491
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   290
PWM (Da):   %s   31326.66  
PI (pH):   %s   8.35
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAKIMSSDCVFSGGNCGFGCSNLENLGPVMVKMPIWSKLGSSLTARSSGDGEFFGRSLTLKSQERRVCTHGANASDAKMSISIGKSLRWWEKGVQPNMKEITGAEDLVESLLNAGDKLVVVDFFSPGCGGCKALHPKLCQLAEMNPDVQFLQVNYEEHKSMCYSLNVHVLPFFRFYRGAEGRLCSFSCTNATIKKFKDALAKHKPERCSLGPPKGLEEKELVALGANPDLSFAYTPKPEHPQKEVAPPPMPAVAASNSSSESSLPLPVPLKSTLEKKEDNKNKTLLSSGR*

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Remarks
DNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGAAGATTATGAGTAGTGATTGTGTGTTTTCTGGTGGTAATTGTGGTTTTGGTTGTAGTAATTTGGAGAATTTGGGTCCTGTTATGGTCAAGATGCCGATTTGGTCAAAATTAGGA
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GTATGTCTTAAATTAGTGTATTTTCTCTCG
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TTGCATGTGAAGCTAAGCTCGTCGGGCTCGCCGTGCCTTAGTGTAATATTAGTGTTTATTAATATTTAATAACAGTTACCCCTTATTTAAACTTGTCTAGTAAACCAGTCGAGCCGAGCT
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GCACCCCTAATATAAACGATTCCAATCACCCTCTAAATATGTCTTAAAAAGAAGGTGTATTACATTGCATTGCAAAATTTTCATTTTTTATAACCTAATTCTCTTTGTGTGATTTGCAGT
TATGTCAGTTAGCAGAGATGAATCCGGACGTACAATTTCTACAAGTGAACTACGAGGAGCACAAGTCTATGTGTTATAGCCTCAATGTTCATGTTCTTCCTTTCTTTCGGTTTTACAGAG
GCGCTGAGGGTCGTCTTTGTAGCTTTAGCTGTACCAATGCTACG
GTTCGTGTCCACATAACCTCTTTTTACCGTTTATTTTAATTTTTTTGGGGGTGTTTGGCATTATGTTTTGAAAGTG
ATTGCCTAATTATGGTGCTTCTAGTCATAAATAATCAAGAGTAAAGTACACAGATGGTCCCTGTGGTTAACCAAATTTTCGGATTTAGTCCCTAGCTTTTCAAAAGTACACGGATGGTCC
CTGTGGTTTGCACTTTGTAACGCATTTAGTCCCCAACTAACAAATCTAAAGGTTTCAACAGGTCCAAATTAGGGACTAAATGCGTTTCAAAGTGCAAACCACTGCACTTTTAGCAAAAGT
TGGGGACGGAATATATATTACAAAGTGCAAACCATAGGGACCATTCGTGTACTTTTGGAAAGTTGGGGACCAAATCTAAAATTTTGGTCAACGTCAAGGACCATCCTTGTACTTCACTCA
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ACCCGCAAAAGGAGGTTGCACCGCCGCCAATGCCAGCGGTGGCAGCGTCGAACTCATCATCCGAGTCAAGTCTCCCTCTTCCTGTTCCTCTTAAATCGACATTGGAAAAGAAAGAAGACA
ATAAAAATAAAACATTGTTGTCTTCTGGGAGATGA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGAAGATTATGAGTAGTGATTGTGTGTTTTCTGGTGGTAATTGTGGTTTTGGTTGTAGTAATTTGGAGAATTTGGGTCCTGTTATGGTCAAGATGCCGATTTGGTCAAAATTAGGA
TCAAGTTTGACCGCCCGGTCATCTGGTGATGGTGAGTTTTTTGGTCGGAGTTTGACTTTAAAAAGTCAAGAAAGAAGGGTTTGTACCCATGGGGCTAATGCTTCTGATGCAAAG
ATGAGT
ATAAGCATTGGGAAATCTTTAAGATGGTGGGAGAAAGGTGTTCAACCAAACATGAAGGAAATAACAGGTGCGGAAGATCTTGTTGAATCGCTTTTGAACGCGGGTGATAAATTGGTTGTT
GTCGATTTCTTTTCACCTGGTTGTGGCGGTTGCAAAGCTCTTCATCCCAAG
TTATGTCAGTTAGCAGAGATGAATCCGGACGTACAATTTCTACAAGTGAACTACGAGGAGCACAAGTCT
ATGTGTTATAGCCTCAATGTTCATGTTCTTCCTTTCTTTCGGTTTTACAGAGGCGCTGAGGGTCGTCTTTGTAGCTTTAGCTGTACCAATGCTACG
ATCAAGAAATTTAAAGACGCATTA
GCAAAACACAAGCCGGAACGATGCAGTTTAGGCCCGCCAAAAGGTCTAGAGGAGAAAGAATTAGTGGCACTCGGGGCCAACCCGGACCTTTCTTTTGCGTATACTCCAAAACCCGAGCAC
CCGCAAAAGGAGGTTGCACCGCCGCCAATGCCAGCGGTGGCAGCGTCGAACTCATCATCCGAGTCAAGTCTCCCTCTTCCTGTTCCTCTTAAATCGACATTGGAAAAGAAAGAAGACAAT
AAAAATAAAACATTGTTGTCTTCTGGGAGATGA

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATTATCCACC ATTGGATTAT GTTATCCAAA AAAAAAAAAA AAACTCAAAA AAGTGAAATT GACCCAACAA CAACTTCTTC AATCTCAAAT TCGAAACAAC CCCTTTTCCT TCTTACACAC  AACAAGAAAT TTTGAATTTC CCCTTTTTCG CCTTTGACCC AAATCCAAAA ACCCTAATTT CAATCCTCAA AAAGACCCAA TTTTTCTGCA ATTAAATTGA ATGGCGAAGA TTATGAGTAG  TGATTGTGTG TTTTCTGGTG GTAATTGTGG TTTTGGTTGT AGTAATTTGG AGAATTTGGG TCCTGTTATG GTCAAGATGC CGATTTGGTC AAAATTAGGA TCAAGTTTGA CCGCCCGGTC  ATCTGGTGAT GGTGAGTTTT TTGGTCGGAG TTTGACTTTA AAAAGTCAAG AAAGAAGGGT TTGTACCCAT GGGGCTAATG CTTCTGATGC AAAGATGAGT ATAAGCATTG GGAAATCTTT  AAGATGGTGG GAGAAAGGTG TTCAACCAAA CATGAAGGAA ATAACAGGTG CGGAAGATCT TGTTGAATCG CTTTTGAACG CGGGTGATAA ATTGGTTGTT GTCGATTTCT TTTCACCTGG  TTGTGGCGGT TGCAAAGCTC TTCATCCCAA GTTATGTCAG TTAGCAGAGA TGAATCCGGA CGTACAATTT CTACAAGTGA ACTACGAGGA GCACAAGTCT ATGTGTTATA GCCTCAATGT  TCATGTTCTT CCTTTCTTTC GGTTTTACAG AGGCGCTGAG GGTCGTCTTT GTAGCTTTAG CTGTACCAAT GCTACGATCA AGAAATTTAA AGACGCATTA GCAAAACACA AGCCGGAACG  ATGCAGTTTA GGCCCGCCAA AAGGTCTAGA GGAGAAAGAA TTAGTGGCAC TCGGGGCCAA CCCGGACCTT TCTTTTGCGT ATACTCCAAA ACCCGAGCAC CCGCAAAAGG AGGTTGCACC  GCCGCCAATG CCAGCGGTGG CAGCGTCGAA CTCATCATCC GAGTCAAGTC TCCCTCTTCC TGTTCCTCTT AAATCGACAT TGGAAAAGAA AGAAGACAAT AAAAATAAAA CATTGTTGTC  TTCTGGGAGA TGATGTGTGT TTAAGAATTA AGATTATAAA AAAATGGTCA TATGTTTAAT GTTAGTAGTA TATTAGTGTT TGTATGTACA GGGTAGCTTT GTACTATGTT TTTTGTTGTG  TAAATAGTAC AAAAGTTGAG CTGCAAGTGT GTTTTTAGAA GCCTAAATTT GTCTAATATA TGTATGTATA TGAGAGAAAG TTTGTTTTTA CTTTTAAACA TGGTGTTAGT GTATGTATGT  ATATACAGGT TTATTTATAT ATTGTAACAT GTGCTTGTTT TTTTGCTGAT GACAATGGTA TGAAAAGATT ATTGATCATA CAATCAAGGA AGATTGAACA GAGGGTTTAT GATCTGTTTA 
ACCTAAATGG TAGTGTTTGT TTCAAAGAAT AAAATGGATT TTAAATAAAA TTAAAATGTA GATTCACACC TTATGTTGTT TGTTTCAACA AAAGAATGAA AATGAATTAG AATT 

Retrieve as FASTA