Entry information : HaRboh[P]04 (HanXRQChr05g0155821)
Entry ID 14515
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaRboh[P]04 (HanXRQChr05g0155821)
Name (synonym) HaRboh[P]04 (HanXRQChr05g0155821)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh[P]04
start..stop
S start..stop
HaRboh04 456 9e-157 3..219 714..930
HaRboh11 432 9e-148 3..219 697..913
HaRboh01 390 2e-131 2..219 705..917
HaRboh10 388 2e-130 2..219 715..928
Literature and cross-references HaRboh[P]04 (HanXRQChr05g0155821)
Protein sequence: HaRboh[P]04 (HanXRQChr05g0155821)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   219
PWM (Da):   %s   24406.17 Transmb domain:   %s   o24-41i
PI (pH):   %s   8.62
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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Retrieve as FASTA  
Remarks Only 3'end
DNA
Send to BLAST
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GTTGACCTGA AACACTTTAC TGACATAATT TTTTGTTTTG AAGGTGGCTG TTTACCCGGG AAACGTGTTG GCACTTCACA TGTCGAAGCC TCATGGCTTT AAATACAAAA GTGGGCAGTA  CATGTTTGTG AACTGCAAGG CGGTTTCTCC ATTTGAATGG TGAGTCTTGT GCGTACAAAG GGTTTAAAAT GTTCGTTTTT CAAATAAATA TGTCTTGTAA GTTGTAAATT GACTTAATCA  CGGCTCAGGC ACCCGTTTTC GATAACTTCA GCACCAGGAG ATGACTACTT AAGTGTGCAT ATCCGAACCC TTGGTGACTG GACCCGACAA CTAAAAAATG TCTTCTCTCA GGTACGTGTT  TGAGCGACAA AATAGTGTAG TTTTAATAAT GTTATATAGT TTTAATAATA ATTAAATTTT ATGACCAAAG TTATATAAGA AGTTTTTGCA TACAAAGGTA TCTTGGCTAA GCCATTACAA  ACATTTCCGA CCCAAAACCG CATAACTTGT CACAAAAGCG TTAGAAATTG TCGCGATAGT TTTGTTGTCG TATCACGTGT TTGGCCTGTT AGTCATAAAA CATAACCCGT TTCCTTTTTA  ACTGACTCGA TTTTGGTCGT GTGTAGGTAT GCCAACCACC AGCTAACGGT AAAAGTGGAC TCCTAAGAGC CGATAACCAA GGAGACAACC CGAGGTAAGT TCTCATTGTT ACAATTATAT  CGCGTTATTA AACCATCAAC AACAACAGTT GTTAATAAAA AATAACCGAC ACGATTCCTA ACTCTTTTGA TCAAATTACA GTTTCCCAAA GGTTCTAATC GACGGGCCAT ATGGTGCACC  AGCACAAGAC TACAAGAAAT ATGACGTAGT GTTGCTAGTC GGGTTAGGCA TTGGTGCAAC CCCTATGATC AGTATCGTTA AAGACATCGT GAACAACATG AAAGCGAAAC AAGAGGAAGA  CGAGGCTTTG GAGAGCGGCA ACAACAATGC AATGCCGCCA ATGTCACCAC AGTCGAAAAA GAACTCCGCG AGCAACTTCA AGACTACACG GGCTTACTTC TATTGGGTCA CAAGGGAACA  AGGGTCGTTT GATTGGTTTA AAGGGGTGAT GAACGAGGTT GCGGAAATTG ATCACGATGG TGTGATCGAG ATGCATAACT ATTGCACAAG TGTTTACGAA GAAGGTGATG CTAGATCCGC  TTTGATCACG ATGCTTCAGT CGCTAAATCA TGCCAAAAAT GGTGTTGATG TGATTTCGGG TACTCGGGTC AAGTCTCACT TTGCAAAGCC CAATTGGAGA AGCGTTTATA AGCGGATTGC  TCTTACTCAC AACGGTCAAC GTATAGGTGA GTTTTTCTTC TATTATTCAA GTTTTATGAA AATTATACAA TTGTCAAATT AAATACGGGC CGGTTCAACC AGTTTTGACA AAATTTATGG  ATCGTGCCTT TAGCTTCCGT TTTGAAAAAC GACAAACCAA ACAAGCCTGG ATGAGTGGGT CCGCCGGTTC AACCAAACAT ATATTACATT AACCCATTTT GACCCTTTAC CGAATGTGTG  TTGCGCCATA AAATCTTATA TAACATTTTG TTTTTTAAAT TACAGGGGTA TTTTATTGTG GAGCACCAGC GCCAGTCAAA GAGTTGAAAC AACTTGCTGC TGACTTTTCT CACAAGACTA  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TCGTGACCTT TATGGTGTAA CGGTATATAG AGACCA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCATTTCC CAAAGGTTCT AATCGACGGG CCATATGGTG CACCAGCACA AGACTACAAG AAATATGACG TAGTGTTGCT AGTCGGGTTA GGCATTGGTG CAACCCCTAT GATCAGTATC  GTTAAAGACA TCGTGAACAA CATGAAAGCG AAACAAGAGG AAGACGAGGC TTTGGAGAGC GGCAACAACA ATGCAATGCC GCCAATGTCA CCACAGTCGA AAAAGAACTC CGCGAGCAAC  TTCAAGACTA CACGGGCTTA CTTCTATTGG GTCACAAGGG AACAAGGGTC GTTTGATTGG TTTAAAGGGG TGATGAACGA GGTTGCGGAA ATTGATCACG ATGGTGTGAT CGAGATGCAT  AACTATTGCA CAAGTGTTTA CGAAGAAGGT GATGCTAGAT CCGCTTTGAT CACGATGCTT CAGTCGCTAA ATCATGCCAA AAATGGTGTT GATGTGATTT CGGGTACTCG GGTCAAGTCT  CACTTTGCAA AGCCCAATTG GAGAAGCGTT TATAAGCGGA TTGCTCTTAC TCACAACGGT CAACGTATAG GGGTATTTTA TTGTGGAGCA CCAGCGCCAG TCAAAGAGTT GAAACAACTT 
GCTGCTGACT TTTCTCACAA GACTAGCACC AAATTTGACT TTCACAAGGA GAACTTTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTTGTGTTT TTCTTTAGAT AAAAGATTCT TTGTACGTTT ATAAATCTAT GCATTTCCCA AAGGTTCTAA TCGACGGGCC ATATGGTGCA CCAGCACAAG ACTACAAGAA ATATGACGTA  GTGTTGCTAG TCGGGTTAGG CATTGGTGCA ACCCCTATGA TCAGTATCGT TAAAGACATC GTGAACAACA TGAAAGCGAA ACAAGAGGAA GACGAGGCTT TGGAGAGCGG CAACAACAAT  GCAATGCCGC CAATGTCACC ACAGTCGAAA AAGAACTCCG CGAGCAACTT CAAGACTACA CGGGCTTACT TCTATTGGGT CACAAGGGAA CAAGGGTCGT TTGATTGGTT TAAAGGGGTG  ATGAACGAGG TTGCGGAAAT TGATCACGAT GGTGTGATCG AGATGCATAA CTATTGCACA AGTGTTTACG AAGAAGGTGA TGCTAGATCC GCTTTGATCA CGATGCTTCA GTCGCTAAAT  CATGCCAAAA ATGGTGTTGA TGTGATTTCG GGTACTCGGG TCAAGTCTCA CTTTGCAAAG CCCAATTGGA GAAGCGTTTA TAAGCGGATT GCTCTTACTC ACAACGGTCA ACGTATAGGG  GTATTTTATT GTGGAGCACC AGCGCCAGTC AAAGAGTTGA AACAACTTGC TGCTGACTTT TCTCACAAGA CTAGCACCAA ATTTGACTTT CACAAGGAGA ACTTTTAACT TTAGAGATAA 
TTTAATCATT TATTAAATAA AATTATTTTA ATTGTTGAAA TTTGTATGTA TGACCCAATT CGGACCTAGT ATCTCGTGAC CTTTATGGTG TAACGGTATA TAGAGACCA 

Retrieve as FASTA