Entry information : HaSTC21HanXRQChr13g0389441
Entry ID 14596
Creation 2017-11-07 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-07 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaSTC21HanXRQChr13g0389441
Name HaSTC21HanXRQChr13g0389441
Class Stellacyanin    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaSTC21
start..stop
S start..stop
HaSTC22 224 1e-73 1..127 1..127
HaSTC16 210 5e-68 1..125 1..125
HaSTC15 172 1e-53 18..125 16..123
HaCRX04 102 7e-27 6..136 1..134
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 16549211..16549394 184 N° 2 16548289..16549136 848  
complement(join(16548289..16549136,16549211..16549394))


exon

Literature and cross-references HaSTC21HanXRQChr13g0389441
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr13 (16549394..16548289)
Protein sequence: HaSTC21HanXRQChr13g0389441
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa): %sProtein length in amino acid 343 (314)
PWM (Da): %sMolecular Weight of protein
Protein Mw is calculated by the addition of average isotopic masses
of amino acids in the protein and the average isotopic mass of one water molecule.
Molecular weight values are given in Dalton (Da).
30991.88 (27823.2) Transmb domain: %sTransmembrane domain
Calculation done with TMHMM
The topology is given as the position of the transmembrane helices
separated by i if the loop is on the inside or o if it is on the outside.
For example i7-29o44-66i87-109o means that it starts on the inside,
has a predicted TMH at position 7 to 29, the outside, then a TMH at position 44-66 etc.
i13-30o
PI (pH): %sIso electric point of protein
Calculation done with EMBOSS parameters.
Please see Dataset for pKi calculation for more information
7.37 (6.86) Peptide Signal: %sProtein signal for mature protein.
if exist :cut position of signal peptide.
range: start-end pos of mature protein
cut: 30 range:30-343
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MNCTKMANKNLSIIILIATLVAQATWVRAAEHIVGDDKGWAEGVDYEAWAKGREFKQGDKLVFNYDPAKYMVLYVTMDKYKCCCAAGPIMGIKKDVILGGVGDYPFIANRNECLKGMKLLVTVKPSGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPCPAKP

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAATTGTACCAAAATGGCTAACAAGAATTTGAGCATCATCATCCTCATAGCAACACTAGTGGCTCAAGCTACTTGGGTTAGAGCAGCAGAGCATATAGTTGGAGATGATAAAGGTTGG
GCCGAGGGTGTCGATTACGAAGCATGGGCTAAGGGTCGGGAATTCAAGCAGGGAGACAAACTTG
GTAAATATTACACATGCTTTGTTGATAATTATATGTCTATGTCTTGCAGCAAGCTA
ACTATGTTGTTGGTTTAGTGTTCAATTACGACCCAGCAAAATATATGGTATTATACGTCACTATGGACAAATACAAGTGCTGTTGTGCTGCGGGACCAATTATGGGCATAAAGAAAGATG
TCATCTTAGGAGGAGTGGGCGACTATCCGTTTATTGCTAATCGAAATGAGTGTTTGAAAGGTATGAAGCTTCTTGTCACTGTCAAGCCATCTGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTG
GGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGATGTCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCGGGTGGGTGTCCAGGAGGGTGTCCCGGTG
GATGTCCCGGTGGATGTCCGGGTGGGTGTCCAGGAGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGGGGGTGTCCCGGAGGGTGCCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAG
GCTGTCCCGGAGGGTGCCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGCTGTCCCGGAGGCTGTCCTGGTGGGTGCCCCGGTGGGTGCCCCGGTGGGTGCCCCGGTGGGTGCCCCGGTGGGTGCCCCGGTG
GGTGCCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAG
GGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGATGTCCCGGAGGATGTCCCGGGG
GGTGTCCATGTCCTGCAAAGCCATGA

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CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAATTGTACCAAAATGGCTAACAAGAATTTGAGCATCATCATCCTCATAGCAACACTAGTGGCTCAAGCTACTTGGGTTAGAGCAGCAGAGCATATAGTTGGAGATGATAAAGGTTGG
GCCGAGGGTGTCGATTACGAAGCATGGGCTAAGGGTCGGGAATTCAAGCAGGGAGACAAACTTG
TGTTCAATTACGACCCAGCAAAATATATGGTATTATACGTCACTATGGACAAATAC
AAGTGCTGTTGTGCTGCGGGACCAATTATGGGCATAAAGAAAGATGTCATCTTAGGAGGAGTGGGCGACTATCCGTTTATTGCTAATCGAAATGAGTGTTTGAAAGGTATGAAGCTTCTT
GTCACTGTCAAGCCATCTGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGATGTCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGG
TGTCCCGGAGGGTGTCCGGGTGGGTGTCCAGGAGGGTGTCCCGGTGGATGTCCCGGTGGATGTCCGGGTGGGTGTCCAGGAGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGGGGG
TGTCCCGGAGGGTGCCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGCTGTCCCGGAGGGTGCCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGCTGTCCCGGAGGCTGTCCTGGTGGGTGCCCCGGTGGG
TGCCCCGGTGGGTGCCCCGGTGGGTGCCCCGGTGGGTGCCCCGGTGGGTGCCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGG
TGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGTGGG
TGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGATGTCCCGGAGGATGTCCCGGGGGGTGTCCATGTCCTGCAAAGCCATGA

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cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAATTGTA CCAAAATGGC TAACAAGAAT TTGAGCATCA TCATCCTCAT AGCAACACTA GTGGCTCAAG CTACTTGGGT TAGAGCAGCA GAGCATATAG TTGGAGATGA TAAAGGTTGG  GCCGAGGGTG TCGATTACGA AGCATGGGCT AAGGGTCGGG AATTCAAGCA GGGAGACAAA CTTGTGTTCA ATTACGACCC AGCAAAATAT ATGGTATTAT ACGTCACTAT GGACAAATAC  AAGTGCTGTT GTGCTGCGGG ACCAATTATG GGCATAAAGA AAGATGTCAT CTTAGGAGGA GTGGGCGACT ATCCGTTTAT TGCTAATCGA AATGAGTGTT TGAAAGGTAT GAAGCTTCTT  GTCACTGTCA AGCCATCTGG TGGGTGTCCC GGTGGGTGTC CCGGTGGGTG TCCCGGTGGG TGTCCCGGTG GGTGTCCCGG TGGGTGTCCC GGTGGATGTC CCGGTGGGTG TCCCGGAGGG  TGTCCCGGAG GGTGTCCGGG TGGGTGTCCA GGAGGGTGTC CCGGTGGATG TCCCGGTGGA TGTCCGGGTG GGTGTCCAGG AGGGTGTCCC GGTGGGTGTC CCGGAGGGTG TCCCGGGGGG  TGTCCCGGAG GGTGCCCCGG TGGGTGTCCC GGAGGGTGTC CCGGAGGCTG TCCCGGAGGG TGCCCCGGTG GGTGTCCCGG AGGCTGTCCC GGAGGCTGTC CTGGTGGGTG CCCCGGTGGG  TGCCCCGGTG GGTGCCCCGG TGGGTGCCCC GGTGGGTGCC CCGGTGGGTG CCCCGGTGGG TGTCCCGGTG GGTGTCCCGG TGGGTGTCCC GGTGGGTGTC CCGGTGGGTG TCCCGGTGGG  TGTCCCGGAG GGTGTCCCGG AGGGTGTCCC GGAGGGTGTC CCGGAGGGTG TCCCGGAGGG TGTCCCGGTG GGTGTCCCGG AGGGTGTCCC GGAGGGTGTC CCGGAGGGTG TCCCGGTGGG  TGTCCCGGTG GGTGTCCCGG TGGATGTCCC GGAGGATGTC CCGGGGGGTG TCCATGTCCT GCAAAGCCAT GATGTCCTCC ATGATACAAG CATAAAACTC TAAGCTTCGG CATGTCTTGT 
TTCTTTTTTT ATTTGTTGTT TGTTAATAAA TGTTAATATC TGAACAATAA TTATATCATA TGTATTGGAG AATAATGAAT TTAAGATTTA TCATGATCA 

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