Entry information : AhalAPx01Araha.3642s0004
Entry ID 14774
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalAPx01Araha.3642s0004
Name AhalAPx01Araha.3642s0004
Class Ascorbate peroxidase family    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalAPx01
start..stop
S start..stop
AlyAPx03 590 0 1..287 1..287
AtAPx03 579 0 1..287 1..287
BstrAPx03 544 0 1..287 1..287
CagraAPx03-1 544 0 1..287 1..287
Literature and cross-references AhalAPx01Araha.3642s0004
Protein sequence: AhalAPx01Araha.3642s0004
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   287
PWM (Da):   %s   31451.18 Transmb domain:   %s   o258-280i
PI (pH):   %s   6.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAAPIVDAEY LKAITKARRD LRSLIANKNC APIMLRLAWH DAGTYDAQSK TGGPNGSIRN EEEFTHGANS GLKIALDLCE GVKAKNPKIT YADLYQLAGV VAVEVTGGPD IVFVPGRKDS  NVSPKEGRLP DAKQGFQHLR DVFYRMGLSD KDIVALSGGH TLGRAHPERS GFDGPWTQEP LKFDNSYFVE LLKGESEGLL KLPTDKTLLE DPEFRRLVEL YAKDEDAFFR DYAESHKKLS 
ELGFNPNSSA GKAVADSTIL AQSAFGVAVA AAVVAFGYFY EIRKRMK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAATTTCGG TGCAACCAAA TAAAAATCTT CACACAGATC CTTGACCATT TTTCTTGTTC ATCGCTCTCT TTCTCCTTCA CCAAACCCAG ACGAGTAGGA GCTATGGCGG CACCGATTGT  TGACGCTGAG TACTTGAAGG CGATCACCAA GGCTCGCCGT GACCTCCGTT CTCTCATCGC GAACAAGAAC TGTGCTCCGA TCATGCTTCG ATTGGCGTAA GTTTCGATTT CCTTGGTTTT  TCGTCGCTTC GTTTTTGTTT CGACTGCGAC GGATTTCGTT TGTGTTTCTG TTGAAATCGC TCGGTTTTGT TTGTTTTTTG ACTGTTGAAA TGTTGTATCA TCTGGTTTTT GTGAAGATGG  CACGATGCTG GAACCTATGA TGCTCAATCG AAGACCGGTG GACCTAATGG CTCTATCAGG AACGAAGAAG AGTTCACTCA TGGTGCCAAC AGTGGTTTGA AGATCGCTCT CGATCTCTGT  GGTAGGATTT TTATTTAGTT ATTGTAGATT TCGTTTTCTG AATAATTTCT CCTCGCTGCG CTTGACGAAA GATTACTCTC TATACGCAGG CTTAGTGTGT ACTGTTAATT TTTCATTGGC  ACAATTTCTT GATTTACTTA CTTGCATTGA TTTTAGTTGA CTTGTTGCTA GTCTGTGGTT TAGATTGCTC GTGAATTTTG GATTGCGGAT ACTTTGTTTT CATGTGATGT ATCCGTTTTA  TGTTGTGGTT TAAGAACACT GTTCAAAATA ATTCCATTAT GCTTTTTGGA AATGGACTTT GAATTGTTTA GCTATGAGAT CTTATCTTTG ATATTTCAGA GGGCGTGAAA GCTAAAAATC  CCAAAATCAC ATACGCAGAC CTGTATCAGG TGAGTTAAGG CTGTGAAAGA AATCTTTGTC ATTTGTTTTC AAAGTTCGCT GGAACTGTAT TCTGCTTGTG TCATAACCTC GTCCCAGGTT  TTAGTTTGTT TAGTAGACTT AGTTGATAGT TGAGCAGCTG TGTAATTTTG GTTTCAGTTT ATTGCAACAG GGGAGTGGCT ATTTGTTTCA GGAGATGCTG CTGACTGTGA TTTACTTTAC  AAAAATCATA GATTGACTAA TGTTTTTGTT CAAGTAGAAC TTTTATCTCT TGCAGTAGTA GCAATATTCA AGTATAATAT ACACACATAG AATTCAAACG AACAAGAAGG AAATTGTAAT  GTGGACTGAA TAGATGTCAC ATGTCTATCA TCTGTACCTA TATCCTGTTT CTACTACTGT TTGTATTGCC GTTTCTCCAT ATTATATTTG GTCTTATAAG GTCGAGGCTT TATATGTACC  AGTTTAATGG CAATTAAGTT TTGGATATGA ATAATTTACT TTTTAAGTAT TTTGTTTTAG CTTGCTGGTG TGGTAGCAGT TGAGGTTACT GGTGGACCTG ACATCGTGTT TGTTCCTGGA  AGAAAGGTAT ATTTTCTCAT CTTTTTAGAC ATTATAACAG CTTTGTTTAA CACTAAAGCA AATAAAATTA CTGTATGTTT CTTCTTGATA GGATTCAAAT GTCAGCCCCA AGGAAGGAAG  ACTTCCTGAT GCCAAACAAG GTACAGTAAA TAGTTATATC AATTATAACA AACTTTCATG TTTTCTACTG ATATTCTAGT CATGAAATTG GAAGATCCTT TCTATGAATT CACATCGTTT  ATATCTCTGT AGGTTTCCAA CATCTTAGAG ATGTCTTCTA CCGCATGGGA CTTTCTGATA AGGATATTGT GGCACTCTCA GGGGGTCATA CTCTGGTAAA TTCATTGGTC ACTTAACTTC  CTTTTTTTTT TTTTACAAAT GAAAGGTATA TGCAGGTGCT TATGACCACT TTTGGGTTTT TAGGGAAGGG CTCACCCAGA GAGGTCAGGC TTCGATGGAC CATGGACTCA AGAGCCGCTG  AAGTTTGACA ACTCCTACTT CGTGTAATTT TCATTTCTTT ATCCTCAGAG ATCTTCTTTA TGTTTTTAGT CTTTTCTGTT TGTGTCTCGA AGAAGAAGAA GCAGCAAACA GATACATTAT  TACAGGATTG GTTATCCATT ATTATTTACT GTTTTGGTAC CAGGGAACTG CTGAAAGGAG AATCAGAGGG CTTGTTGAAA CTTCCAACTG ACAAGACCTT ATTGGAAGAC CCGGAGTTTC  GTCGTCTTGT TGAGCTTTAT GCAAAGGTAT AATATACTGG AAATCTTCTC TGCCTCTTAG CCATTTGTTT CTTGCGTTGC TATGATAGCG GTTGGAACAT AACTCGATTT CCTTTATTGA  CTTCACATTT TCACTGAATC CACAAGCACA TACAGAATCA CAAACCAAAC TTTCTAGGGT TTTGTTCTCG AGTACCCCAC AAATCCTAAT CGCCAATAAT AGTTGCTGAT GTTACAAAGT  GATAAAATGA ACACTCTTAG GAATTAGTAT CATCCTGTAA CGGTGAGAAC CTCACAGTCC CTATTGTTCT TCATGTTTGG TGTGGCTTTA AAATTGGCTT ATGTAAGAAC TAGAAATATG  TAGAAATTCC GACGCTTCTC TATGATTTCA TTCCTTAATT AAGTTTCAAA AAGATAAGCA AATGTTGTTG GCTGTTGACA AGTCCAGTGT GTGGTGACAG GATGAAGATG CATTCTTCAG  AGACTATGCG GAATCGCACA AGAAACTCTC TGAGCTCGGT TTCAACCCGA ACTCCTCAGC GGGCAAAGCA GTTGCAGACA GCACGATTCT GGCCCAGAGT GCGTTCGGGG TTGCGGTTGC  TGCTGCGGTT GTGGCCTTTG GTTACTTTTA CGAGATTCGG AAGAGGATGA AGTAAACGAA ATAGAAGGAA AACACGAAGC AACGGTTCTC TTATTTGGGC ATTAAAGAAA ACTATTAATC  ATCTATCGGA TTTGTAGTTG TAGGGGTTTC CATGTCAAGA TAATACCCTA TTTTGCTGCT ACACTAAACT ATTTGAATCC ACGATTCTAC TGTTTAGTAG TAAAAAAGTT AAAAGTCAAT 
ATTTTG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCAC CGATTGTTGA CGCTGAGTAC TTGAAGGCGA TCACCAAGGC TCGCCGTGAC CTCCGTTCTC TCATCGCGAA CAAGAACTGT GCTCCGATCA TGCTTCGATT GGCATGGCAC  GATGCTGGAA CCTATGATGC TCAATCGAAG ACCGGTGGAC CTAATGGCTC TATCAGGAAC GAAGAAGAGT TCACTCATGG TGCCAACAGT GGTTTGAAGA TCGCTCTCGA TCTCTGTGAG  GGCGTGAAAG CTAAAAATCC CAAAATCACA TACGCAGACC TGTATCAGCT TGCTGGTGTG GTAGCAGTTG AGGTTACTGG TGGACCTGAC ATCGTGTTTG TTCCTGGAAG AAAGGATTCA  AATGTCAGCC CCAAGGAAGG AAGACTTCCT GATGCCAAAC AAGGTTTCCA ACATCTTAGA GATGTCTTCT ACCGCATGGG ACTTTCTGAT AAGGATATTG TGGCACTCTC AGGGGGTCAT  ACTCTGGGAA GGGCTCACCC AGAGAGGTCA GGCTTCGATG GACCATGGAC TCAAGAGCCG CTGAAGTTTG ACAACTCCTA CTTCGTGGAA CTGCTGAAAG GAGAATCAGA GGGCTTGTTG  AAACTTCCAA CTGACAAGAC CTTATTGGAA GACCCGGAGT TTCGTCGTCT TGTTGAGCTT TATGCAAAGG ATGAAGATGC ATTCTTCAGA GACTATGCGG AATCGCACAA GAAACTCTCT  GAGCTCGGTT TCAACCCGAA CTCCTCAGCG GGCAAAGCAG TTGCAGACAG CACGATTCTG GCCCAGAGTG CGTTCGGGGT TGCGGTTGCT GCTGCGGTTG TGGCCTTTGG TTACTTTTAC 
GAGATTCGGA AGAGGATGAA GTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAATTTCGG TGCAACCAAA TAAAAATCTT CACACAGATC CTTGACCATT TTTCTTGTTC ATCGCTCTCT TTCTCCTTCA CCAAACCCAG ACGAGTAGGA GCTATGGCGG CACCGATTGT  TGACGCTGAG TACTTGAAGG CGATCACCAA GGCTCGCCGT GACCTCCGTT CTCTCATCGC GAACAAGAAC TGTGCTCCGA TCATGCTTCG ATTGGCATGG CACGATGCTG GAACCTATGA  TGCTCAATCG AAGACCGGTG GACCTAATGG CTCTATCAGG AACGAAGAAG AGTTCACTCA TGGTGCCAAC AGTGGTTTGA AGATCGCTCT CGATCTCTGT GAGGGCGTGA AAGCTAAAAA  TCCCAAAATC ACATACGCAG ACCTGTATCA GCTTGCTGGT GTGGTAGCAG TTGAGGTTAC TGGTGGACCT GACATCGTGT TTGTTCCTGG AAGAAAGGAT TCAAATGTCA GCCCCAAGGA  AGGAAGACTT CCTGATGCCA AACAAGGTTT CCAACATCTT AGAGATGTCT TCTACCGCAT GGGACTTTCT GATAAGGATA TTGTGGCACT CTCAGGGGGT CATACTCTGG GAAGGGCTCA  CCCAGAGAGG TCAGGCTTCG ATGGACCATG GACTCAAGAG CCGCTGAAGT TTGACAACTC CTACTTCGTG GAACTGCTGA AAGGAGAATC AGAGGGCTTG TTGAAACTTC CAACTGACAA  GACCTTATTG GAAGACCCGG AGTTTCGTCG TCTTGTTGAG CTTTATGCAA AGGATGAAGA TGCATTCTTC AGAGACTATG CGGAATCGCA CAAGAAACTC TCTGAGCTCG GTTTCAACCC  GAACTCCTCA GCGGGCAAAG CAGTTGCAGA CAGCACGATT CTGGCCCAGA GTGCGTTCGG GGTTGCGGTT GCTGCTGCGG TTGTGGCCTT TGGTTACTTT TACGAGATTC GGAAGAGGAT  GAAGTAAACG AAATAGAAGG AAAACACGAA GCAACGGTTC TCTTATTTGG GCATTAAAGA AAACTATTAA TCATCTATCG GATTTGTAGT TGTAGGGGTT TCCATGTCAA GATAATACCC 
TATTTTGCTG CTACACTAAA CTATTTGAAT CCACGATTCT ACTGTTTAGT AGTAAAAAAG TTAAAAGTCA ATATTTTG 

Retrieve as FASTA