Entry information : AhalAPx02Araha.22931s0002
Entry ID 14775
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalAPx02Araha.22931s0002
Name AhalAPx02Araha.22931s0002
Class Ascorbate peroxidase family    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalAPx02
start..stop
S start..stop
AlyAPx01 517 0 1..250 1..250
AtAPx01 514 0 1..250 1..250
CagraAPx01 508 0 1..250 1..250
TparAPx01 506 0 1..250 1..250
Literature and cross-references AhalAPx02Araha.22931s0002
Protein sequence: AhalAPx02Araha.22931s0002
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   250
PWM (Da):   %s   27543.79  
PI (pH):   %s   6.04
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTKNYPTVSE DYKKAIEKCK RKLRGLIAEK NCAPIMVRLA WHSAGTFDCQ SRTGGPFGTM RFDAEQAHGA NSGIHIALRL LDPIREQFPT ISFADFHQLA GVVAVEVTGG PEIPFHPGRE  DKPQPPPEGR LPDATKGCDH LRDVFAKQMG LSDKDIVALS GAHTLGRCHK DRSGFEGAWT SNPLIFDNSY FKELLSGEKE GLLQLVSDKA LLDDPVFRPL VEKYAADEDA FFADYAEAHM 
KLSELGFADA * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CATTTTAATG CCGTGCGTTT AATCACGACC GTCGCTTAGA TTGGCAAATT TTGACCACAC GATATCCGTC ATCTAACGGC ATCTATAGAT CTACTAGAAC GTTCTCTTTC ATGACTCTAT  ATATTACGCA TTTCTTCTCC ACAACGCTCT CACAAAAAGT ACTCGTGTCT TACTCGTGCC AGCCACTCGC ATTTCTCCAG ATTTTATTAT CCTTTCTCGG GAAAAGGTAG GTATAATGGA  AATACTCTCT CTCTCGCTGA TCCGTCGTTT CTGCTTCCAA TTTTATCTTG AATTGATCGG ATCATTGTTA TGCTTGGCTT GATCTGAGTT TAATGATGTG TTTATCGCAG TAGATCCACT  ATTTGTTGCT GCGATCGGCG TTAGTATCGT TAGCTCTCTC GTTTATGTTC CGTGGTTCGA TATTGCTGGG TTTCTAGGCT AATCTTACGA ATCTGTGAAA GTTTTTGGGA GATTTGGCGT  CTTTTAGCTC ACTCGTGTGG TGTCTTTGAT GTAGTTAGCT ATATATTAGT GATTGATTTA GGTTTTTCTT TTCATTCATA TGATTATCAG CTTGTTATCC ATAGGTTTTG TTGGATTTCG  TGTGTTTTGG ATTTGATTTG CTAGTGAGGC TCATATATAT CTGTGTATTG GTTTTAGAGT TTAGCTAAGA TGACGAAGAA CTACCCAACC GTGAGCGAGG ATTACAAGAA AGCTATTGAG  AAGTGCAAGA GGAAGCTCAG AGGTTTGATA GCTGAGAAGA ACTGTGCACC CATCATGGTC CGACTCGCGT AAGTAACGAA CTATATCAGC GTGTGGTTGG TTTCTAAAGT ATTTAGGATG  TGCAACACTT CTCATGGTTG ATTTGTTTGG CTAAACTGCA GGTGGCACTC TGCTGGAACT TTCGATTGTC AATCGAGGAC TGGAGGTCCA TTCGGAACAA TGAGGTTTGA TGCTGAGCAA  GCTCATGGAG CCAACAGTGG TATCCACATT GCTCTTAGGT TGTTGGATCC CATCAGGGAG CAATTCCCAA CCATCTCTTT TGCTGATTTC CATCAGGTAC ATACATGATT TTAGAAAAGA  AAACAACAGT ATCGCTGATT ACTCCTGTGT TTGGAATCTT ACTCATGATG ACCTTTTTGT GTGAAATCGA TCATTCAGCT TGCTGGTGTT GTGGCCGTTG AAGTTACTGG TGGCCCTGAA  ATTCCTTTCC ACCCTGGAAG AGAGGTTAGT CATTGCTGTA GATTTGTTTG CCGCCTCTAA GGTTACCATG TACTCAATTT GGTCCAGAGA ATGTGTTTTG TTTTCTTTGT AGAGATGGCT  GATTGATAAT ATGTAGCTGT TCTCTCAATA CTTGTAATAC TGAAACACGA GATTGAATTT GAAGGAGGAA ACACCGTGGG ACTTGATTGT TTGTTTCTAA CATGCATATC TTGCTTTCAG  GACAAGCCCC AGCCACCTCC TGAGGGTCGT CTTCCTGATG CTACCAAGGG TTGTGATCAC TTGAGAGACG TCTTTGCTAA GCAGATGGGC TTGTCTGACA AGGACATTGT CGCTTTATCT  GGTGCCCACA CTCTGGTATG ATTCTCTCCA ACTGCTTAAA CACTTAATTT TTTGCCCCAA TCTTACCAAT TTTGATAAAT ACTTGCAAAA TATGAATCTG CAGGGAAGAT GCCACAAGGA  TAGGTCTGGC TTTGAAGGTG CCTGGACTTC AAACCCTCTA ATCTTTGACA ACTCTTACTT CAAGTGAGTA TCCCAAGTTC CCTTGTAGGA AGATTCAATG GCTGATATGG TTATTAATAA  AATTATATAT ATGATCAGGG AACTCTTGAG CGGAGAGAAG GAAGGCCTTC TTCAGCTTGT CTCTGACAAG GCGCTATTGG ACGACCCTGT TTTCCGTCCT TTGGTCGAGA AATACGCTGC  TGTATGCATC CTTTCTCTTT TCCCTGTTCT TCACTTGGTA GAGAGAGAGA GAACTCATGA TTTCTTGTGA CAATGTGAAC AGGATGAAGA TGCCTTTTTC GCTGATTACG CCGAGGCCCA  CATGAAGCTT TCTGAGCTTG GGTACTTATC TTGAATCTAT TAATCATTCG AAAGTAAATA TTAATTCAGT CGTGTGATTT GAGTTTGTAT CTGTTGGTTG CAGGTTTGCT GATGCTTAAG  CTCTGACGTA TGTTGTGTGT GTGTGTCTCC GAGAGTCATG GCTGTTTTTG GTTGGGGGCT GGAGGGGTCG CATTGCATTT GAACTTTGTC ATATGATTGC TTAATGTACT CTCAGATTTG 
CGTATCTTGT TTTTCGGTGG GTTGTGATTT GACACATCCG TTGCGCTTTT GCTGGTTAGA CTTTTAATAA AATTAATTTA TCTCAATATT TA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGAAGA ACTACCCAAC CGTGAGCGAG GATTACAAGA AAGCTATTGA GAAGTGCAAG AGGAAGCTCA GAGGTTTGAT AGCTGAGAAG AACTGTGCAC CCATCATGGT CCGACTCGCG  TGGCACTCTG CTGGAACTTT CGATTGTCAA TCGAGGACTG GAGGTCCATT CGGAACAATG AGGTTTGATG CTGAGCAAGC TCATGGAGCC AACAGTGGTA TCCACATTGC TCTTAGGTTG  TTGGATCCCA TCAGGGAGCA ATTCCCAACC ATCTCTTTTG CTGATTTCCA TCAGCTTGCT GGTGTTGTGG CCGTTGAAGT TACTGGTGGC CCTGAAATTC CTTTCCACCC TGGAAGAGAG  GACAAGCCCC AGCCACCTCC TGAGGGTCGT CTTCCTGATG CTACCAAGGG TTGTGATCAC TTGAGAGACG TCTTTGCTAA GCAGATGGGC TTGTCTGACA AGGACATTGT CGCTTTATCT  GGTGCCCACA CTCTGGGAAG ATGCCACAAG GATAGGTCTG GCTTTGAAGG TGCCTGGACT TCAAACCCTC TAATCTTTGA CAACTCTTAC TTCAAGGAAC TCTTGAGCGG AGAGAAGGAA  GGCCTTCTTC AGCTTGTCTC TGACAAGGCG CTATTGGACG ACCCTGTTTT CCGTCCTTTG GTCGAGAAAT ACGCTGCTGA TGAAGATGCC TTTTTCGCTG ATTACGCCGA GGCCCACATG 
AAGCTTTCTG AGCTTGGGTT TGCTGATGCT TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CATTTTAATG CCGTGCGTTT AATCACGACC GTCGCTTAGA TTGGCAAATT TTGACCACAC GATATCCGTC ATCTAACGGC ATCTATAGAT CTACTAGAAC GTTCTCTTTC ATGACTCTAT  ATATTACGCA TTTCTTCTCC ACAACGCTCT CACAAAAAGT ACTCGTGTCT TACTCGTGCC AGCCACTCGC ATTTCTCCAG ATTTTATTAT CCTTTCTCGG GAAAAGAGTT TAGCTAAGAT  GACGAAGAAC TACCCAACCG TGAGCGAGGA TTACAAGAAA GCTATTGAGA AGTGCAAGAG GAAGCTCAGA GGTTTGATAG CTGAGAAGAA CTGTGCACCC ATCATGGTCC GACTCGCGTG  GCACTCTGCT GGAACTTTCG ATTGTCAATC GAGGACTGGA GGTCCATTCG GAACAATGAG GTTTGATGCT GAGCAAGCTC ATGGAGCCAA CAGTGGTATC CACATTGCTC TTAGGTTGTT  GGATCCCATC AGGGAGCAAT TCCCAACCAT CTCTTTTGCT GATTTCCATC AGCTTGCTGG TGTTGTGGCC GTTGAAGTTA CTGGTGGCCC TGAAATTCCT TTCCACCCTG GAAGAGAGGA  CAAGCCCCAG CCACCTCCTG AGGGTCGTCT TCCTGATGCT ACCAAGGGTT GTGATCACTT GAGAGACGTC TTTGCTAAGC AGATGGGCTT GTCTGACAAG GACATTGTCG CTTTATCTGG  TGCCCACACT CTGGGAAGAT GCCACAAGGA TAGGTCTGGC TTTGAAGGTG CCTGGACTTC AAACCCTCTA ATCTTTGACA ACTCTTACTT CAAGGAACTC TTGAGCGGAG AGAAGGAAGG  CCTTCTTCAG CTTGTCTCTG ACAAGGCGCT ATTGGACGAC CCTGTTTTCC GTCCTTTGGT CGAGAAATAC GCTGCTGATG AAGATGCCTT TTTCGCTGAT TACGCCGAGG CCCACATGAA  GCTTTCTGAG CTTGGGTTTG CTGATGCTTA AGCTCTGACG TATGTTGTGT GTGTGTGTCT CCGAGAGTCA TGGCTGTTTT TGGTTGGGGG CTGGAGGGGT CGCATTGCAT TTGAACTTTG  TCATATGATT GCTTAATGTA CTCTCAGATT TGCGTATCTT GTTTTTCGGT GGGTTGTGAT TTGACACATC CGTTGCGCTT TTGCTGGTTA GACTTTTAAT AAAATTAATT TATCTCAATA 
TTTA 

Retrieve as FASTA