Entry information : AhalAPx03Araha.16649s0001
Entry ID 14776
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalAPx03Araha.16649s0001
Name AhalAPx03Araha.16649s0001
Class Ascorbate peroxidase family    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalAPx03
start..stop
S start..stop
AtAPx04 568 0 1..279 1..279
AlyAPx04 567 0 1..279 1..279
CrubAPx04 553 0 1..279 1..279
CagraAPx04 553 0 1..279 44..322
Literature and cross-references AhalAPx03Araha.16649s0001
Protein sequence: AhalAPx03Araha.16649s0001
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   279
PWM (Da):   %s   30902.02 Transmb domain:   %s   o250-272i
PI (pH):   %s   8.75
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVNVDAEYL KEIEKTRRDL RALISSRNCA PIMLRLAWHD AGTYDAKKKT GGPNGSIRFK EELNRPHNKG LEKAVAFCEE VKAKHPRVSY ADLYQLAGVV AVEVTGGPAI PFTPGRKDAD  SPDDGELPNP NEGASHLRTL FSRMGLSDRD IVALSGGHTL GRAHKERSDF EGPWTQDPLK FDNSYFVELL KGETPGLLQL KTDKALLDDP KFHPFVKLYA KDEDMFFKAY AISHKKLSEL 
GFNPPRRIPS AVTQQTLGIA VAAAVVIFTI CYEASRRGK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGACTCTTCT TCAATCCTCT TTATATATTC ATCCTTCTCA GTCATCCTTC AATCTTATTC ATTGATCTGA GTTATTTTGC TTGCTCTTTC AAAGCTTAAC AATGGCAGTG AACGTTGATG  CAGAGTACCT CAAAGAGATA GAGAAGACTC GTAGAGACCT TCGAGCTCTC ATCTCCTCCA GAAACTGTGC TCCCATTATG CTCCGTCTTG CGTAAGATCT TTGCTCTCAG AAGCATTCTC  CATTTTCCTT TCTTGCTTAA TGTTTCCAAA TGCTAATTAT TGTGTGCATA TAGATGGCAT GATGCAGGAA CCTATGATGC CAAGAAGAAA ACCGGAGGTC CCAATGGATC TATCAGGTTC  AAGGAAGAGC TAAACCGTCC ACACAACAAA GGTTTGGAGA AGGCAGTCGC TTTTTGCGGT GAGTTTATAT GATCATTCCT TTACTCCATT GCTACTACTC TTCAGGACCT GACAATAAAC  GGTTGCTGTT TCCTTTGATG TCTAAATTTC GGTTTCTAAT TTCAGAGGAA GTAAAGGCTA AGCATCCGCG AGTCTCTTAC GCAGACCTTT ATCAGGTAAA TTAACATTGG TATATAGCAT  CTCTTAGCCA TTAAACTCAC AAAAACTTTC TTCCCCCTTG ATTTAGCTTG ACAGATTCTT TCATTTCAGC TCGCTGGAGT TGTTGCAGTG GAGGTTACTG GCGGCCCTGC AATCCCATTT  ACACCAGGCC GTAAGGTAGT TACACTTACC TCTAAAGCGT ATGCGTTAAA TATTAGTTGC TAAGTAAGTT TACTAATGTT GAGAAATATG GTATCAGGAT GCTGATTCCC CGGACGATGG  AGAACTTCCA AATCCAAATG AAGGTTAGTC AAGCAGCTTG TAGCTCCCAC AATGGAATTC TATTTCACAA ACTGACTAAG CCCTCCTTTT GGATTATTGC AGGTGCCTCA CATTTAAGAA  CTCTCTTCTC TCGTATGGGT CTATCGGATA GAGACATTGT GGCTCTCTCT GGAGGTCACA CTTTGGTACT AATTACTAAC TCTCCTTCAA AATATTCGCC AGTCACTAAA CATGCTCCAA  TAACCAACTT GGTTCTTACT TTGTATATAG GGGCGTGCAC ATAAGGAGAG GTCAGATTTC GAAGGTCCTT GGACACAAGA TCCTCTCAAG TTTGATAACT CATATTTCGT GTAAGCCAAT  AACAAAATCA CAGAGAGTCA AAGGGAGAGT TCCGAAACTT ACATTTTCTG CTGATTGGTT TTTTTCAGAG AGCTTCTAAA AGGGGAGACT CCTGGATTGC TACAACTGAA AACCGACAAG  GCTCTACTTG ATGATCCAAA GTTCCACCCT TTTGTTAAGC TTTATGCAAA GGTAGATTAG CTTTCACACG ATTATAAGAA ACTTTTAGTT TGGATGATTC TCTGGTTTCA TCAACACAAA  AATGTATTAT GATGTGTATA TCAGGACGAG GATATGTTCT TCAAAGCGTA TGCAATTTCA CACAAGAAAC TCTCAGAACT AGGATTTAAT CCGCCAAGAA GAATTCCTTC AGCAGTGACA  CAGCAGACGC TTGGAATCGC TGTTGCTGCA GCTGTGGTGA TCTTTACCAT ATGCTACGAA GCAAGCAGAA GAGGCAAGTG AGGAGGTTTT ACAGATGCGT AAAGGGACAA GAGAAAAATT 
CACAAATGTT AATTGAATGT ATGCAATAAA TAGAAAGATT CATGCAATGT TACCCTCCAT GTTCCTTTTC AAGCTTCAGT GCTTTGGAAT TGCCCAGAAT TATGGATGTT ACA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGTGA ACGTTGATGC AGAGTACCTC AAAGAGATAG AGAAGACTCG TAGAGACCTT CGAGCTCTCA TCTCCTCCAG AAACTGTGCT CCCATTATGC TCCGTCTTGC ATGGCATGAT  GCAGGAACCT ATGATGCCAA GAAGAAAACC GGAGGTCCCA ATGGATCTAT CAGGTTCAAG GAAGAGCTAA ACCGTCCACA CAACAAAGGT TTGGAGAAGG CAGTCGCTTT TTGCGAGGAA  GTAAAGGCTA AGCATCCGCG AGTCTCTTAC GCAGACCTTT ATCAGCTCGC TGGAGTTGTT GCAGTGGAGG TTACTGGCGG CCCTGCAATC CCATTTACAC CAGGCCGTAA GGATGCTGAT  TCCCCGGACG ATGGAGAACT TCCAAATCCA AATGAAGGTG CCTCACATTT AAGAACTCTC TTCTCTCGTA TGGGTCTATC GGATAGAGAC ATTGTGGCTC TCTCTGGAGG TCACACTTTG  GGGCGTGCAC ATAAGGAGAG GTCAGATTTC GAAGGTCCTT GGACACAAGA TCCTCTCAAG TTTGATAACT CATATTTCGT AGAGCTTCTA AAAGGGGAGA CTCCTGGATT GCTACAACTG  AAAACCGACA AGGCTCTACT TGATGATCCA AAGTTCCACC CTTTTGTTAA GCTTTATGCA AAGGACGAGG ATATGTTCTT CAAAGCGTAT GCAATTTCAC ACAAGAAACT CTCAGAACTA  GGATTTAATC CGCCAAGAAG AATTCCTTCA GCAGTGACAC AGCAGACGCT TGGAATCGCT GTTGCTGCAG CTGTGGTGAT CTTTACCATA TGCTACGAAG CAAGCAGAAG AGGCAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGACTCTTCT TCAATCCTCT TTATATATTC ATCCTTCTCA GTCATCCTTC AATCTTATTC ATTGATCTGA GTTATTTTGC TTGCTCTTTC AAAGCTTAAC AATGGCAGTG AACGTTGATG  CAGAGTACCT CAAAGAGATA GAGAAGACTC GTAGAGACCT TCGAGCTCTC ATCTCCTCCA GAAACTGTGC TCCCATTATG CTCCGTCTTG CATGGCATGA TGCAGGAACC TATGATGCCA  AGAAGAAAAC CGGAGGTCCC AATGGATCTA TCAGGTTCAA GGAAGAGCTA AACCGTCCAC ACAACAAAGG TTTGGAGAAG GCAGTCGCTT TTTGCGAGGA AGTAAAGGCT AAGCATCCGC  GAGTCTCTTA CGCAGACCTT TATCAGCTCG CTGGAGTTGT TGCAGTGGAG GTTACTGGCG GCCCTGCAAT CCCATTTACA CCAGGCCGTA AGGATGCTGA TTCCCCGGAC GATGGAGAAC  TTCCAAATCC AAATGAAGGT GCCTCACATT TAAGAACTCT CTTCTCTCGT ATGGGTCTAT CGGATAGAGA CATTGTGGCT CTCTCTGGAG GTCACACTTT GGGGCGTGCA CATAAGGAGA  GGTCAGATTT CGAAGGTCCT TGGACACAAG ATCCTCTCAA GTTTGATAAC TCATATTTCG TAGAGCTTCT AAAAGGGGAG ACTCCTGGAT TGCTACAACT GAAAACCGAC AAGGCTCTAC  TTGATGATCC AAAGTTCCAC CCTTTTGTTA AGCTTTATGC AAAGGACGAG GATATGTTCT TCAAAGCGTA TGCAATTTCA CACAAGAAAC TCTCAGAACT AGGATTTAAT CCGCCAAGAA  GAATTCCTTC AGCAGTGACA CAGCAGACGC TTGGAATCGC TGTTGCTGCA GCTGTGGTGA TCTTTACCAT ATGCTACGAA GCAAGCAGAA GAGGCAAGTG AGGAGGTTTT ACAGATGCGT  AAAGGGACAA GAGAAAAATT CACAAATGTT AATTGAATGT ATGCAATAAA TAGAAAGATT CATGCAATGT TACCCTCCAT GTTCCTTTTC AAGCTTCAGT GCTTTGGAAT TGCCCAGAAT 
TATGGATGTT ACA 

Retrieve as FASTA