Entry information : AhalAPx-R01 (Araha.12605s0007)
Entry ID 14777
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-01-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AhalAPx-R01 (Araha.12605s0007)
Name (synonym) AhalAPx-R01 (Araha.12605s0007)
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalAPx-R01
start..stop
S start..stop
AlyAPx-R 653 0 1..329 1..329
AtAPx-R 635 0 1..329 1..329
BstrAPx-R01 581 0 1..329 1..331
CrubAPx-R01 565 0 2..329 3..327
Literature and cross-references AhalAPx-R01 (Araha.12605s0007)
Protein sequence: AhalAPx-R01 (Araha.12605s0007)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329
PWM (Da):   %s   35756.44  
PI (pH):   %s   9.02
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTTTTASLLK TCLFGCDSSS SFKFKCKFES PAKTRGLSPA TEKHVVRSLR AWRIRCISDD PGSSQVFVSS RRKMVVLLST VQLLSHLLPQ NGNAAEIYPV MQNEIRKVVT KGKAAGVLRL  VFHDAGTFEL GDHSGGTNGS IAYELERPEN TGLKKSLKVL AKAKIKVDEI QPVSWADMIS VAGSEAVSIC GGPTIPVALG RLDSAQPDPE GKLPPETLSA SGLKECFKRK GFSTQELVAL 
SGAHTIGSKG FGDPTVFDNA YYKILLEKPW ASTSKMTSMV GLPSDHALVE DDECLRWVKL YAGDQDKFFE DFNNAYIKLV NSGAKWNKL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGACGA CGACTGCTTC TCTTTTGAAG ACTTGTCTTT TTGGGTGCGA CTCGTCTTCT TCTTTCAAAT TCAAATGCAA ATTCGAATCT CCCGCGAAAA CGCGAGGGCT CTCTCCGGCG  ACCGAGAAAC ATGTTGTCAG ATCGTTAAGA GCCTGGCGTA TTCGTTGTAT CTCCGATGAT CCTGGTAAGA CCGGATTCTA GTATCATCGT CAATTCTACT CTATCGCTTT TCGTTTCCGT  CATTCGCCAT ATGCATCTGT CGATTTTCCC TGGTTTATTG ATTTCCTGCT GAGATTGTTC TGTTTCTTTA TAATTTATAG GTTCGAGTCA GGTTTTCGTT TCCAGTAGAA GAAAAATGGT  AGTCTTGTTG TCGACGGTGC AGCTTCTGTC TCATTTGCTT CCGCAAAACG GGAACGCAGC TGAGTGAGTT TGAAACAATC CTTAATTTTG TGTAATTGCT CTGAAATTTG GTAAATTGTT  CAAGTTATAG TTTTCCCAAA TTTTTGTGTG CTAGTTAACC AAATTGATTG TTGGATTTTC AGGATTTATC CGGTGATGCA AAACGAAATA AGGAAAGTGG TGACAAAGGG TAAGGCTGCT  GGTGTGCTTC GTTTAGTGTT TCATGATGCT GGAACCTTTG AACTGGGCGA TCATTCTGGT AAATTTCCAT GACTCTATGT AATGATCAAA ATTTTGCTTC AACTTTAGTA TTCGACTCTT  TTGTCAAGTT GCTATTTCTA CAAGCTGGAT TGTTTCTTTC ATTGTAAATT CAACATAGGT GAACATGGAT ATAACTTTGA AAGTTCATTT ATCAGTTGAC TTGGTGATAG ACAAGTTTGC  AAATGTAAAC ATTGTTTGTT AGATTATATT TAGAATGTGA TTCCTGGATG TTTATTGGCT TAGTTTAACA GACTGTCAAG TATTGAGAGA TCTGGTCTGT TCAGTGTCTC TCTCAGGATG  TTCTTATCAT TTTACAAGTT GATATACCTC AGTTTTGGCT TTGATGAACC AAGCTTGGTT GGTTTAGATT CAGGTCTTTG CGATTTAGTA TACTTCTGGT GGTGTTGTCC TTCCTTCTCA  TTAAAAGATG CTACAACTAT GTCTTAGTTC TTCTTGGTTA TGAATTTAAT TGCAGGTGGC ACCAACGGGT CTATTGCTTA TGAACTCGAG AGACCTGAAA ACACAGGTTT GAAGAAATCC  TTAAAGGTAC TAAATCCATC TCTTTTATTT CTGTTAGCAT GAGCAAATAG AGATGTACTT TTCTCGTCTG TTTAACTGCT TTTTTTTGTG TCTATTTGCA CTTGTTTCTC GGATTTGTCA  AATATGTTAC TTTCAAAGGA TTAATCTTCT TAGTAGATGA TTTCTTTGTT AGGTTCTAGC AAAAGCAAAG ATTAAGGTTG ATGAGATACA ACCAGGTAAT TGTTATTTGA AACGTGTTCT  GTTATGCGCC TTGGTGCCAG TGTTCTCATT CTATGTGATC TCAGTGTCTT GGGCGGATAT GATCTCTGTC GCTGGGTCTG AAGCAGTTTC AATATGTGGC GGCCCAACAA TTCCAGTAGC  TTTGGGAAGA CTTGATTCAG CGTAAGCACA ACATAAACGG TTTTTGTCCT GATTCGATAG ATCTCTGGTC ACTATTTCTA TACTTCCAAC AGGGTGATTG TTTCATGTTC ACAGGCAACC  TGATCCAGAA GGCAAGCTAC CTCCAGAAAC CCTGAGTGCC TCGGGTTTGA AAGAATGCTT CAAAAGAAAA GGATTTTCGT GAGTCCTTAA CTGAGAATTT TTTCAACATA TTTTTTATTA  TATCAACATT TTGTAATTTG ACATCACTGG GTTTATGCGC CAATGCAGGA CCCAGGAGCT TGTTGCCTTA TCTGGGGCAC ATACGATTGG GAGTAAAGGC TTTGGAGATC CGACAGTTTT  TGACAATGCA TACTACAAAA TCCTTCTTGA AAAACCATGG GCATCAACTT GTAAGTCTCA TGACATGATT CTTATGTTCT TGTACGCATA CAGTTTCAGT TTCCAACCAT TGCTGATTGC  TCCCATTGTT TCATCATCTG CCATGTTCTG AAGATTGATT GTAAGACTGA GATTATATAT TTGCCTAATA TTTTCTTCTT ATGATGCAGC AAAAATGACC AGCATGGTCG GGCTTCCTTC  GGATCATGCC TTAGTGGAGG ATGATGAGTG CTTAAGGTTT CTCAGTTTCA GAAAGTTCTT ACCTTATCAT TTCGTATCTA ATCTTCTCTT AACTACCATT TAAAGTATAG TAGAGTAATG  TGCTGAACAC TTGGACTATA GGATCATGGA TAAAACTGGA AACTGTTGAA CACTGTTCTT CTCTGGAAAA CTATATAACT GATATAGATT CGTGGTTTGA TGATGCACAG GTGGGTGAAA  CTATATGCGG GAGACCAAGA CAAGTTCTTC GAAGACTTCA ACAATGCTTA TATCAAACTA GTTAATTCTG GGGCCAAATG GAATAAGTTA TGATGTCTAG TTTTATCTTT TGTTAGCTCA  TAAGTGTTTC AAACATGCCT GAATAATTTG GGTAGTAATG CTTATTTGCT AGTAAGTAAA AAGTTTATCT GCCAACTACT ACAAAACTAA ACATCAAATA TACTCGAAAT TTACTTAAAA 
AGATATAGAA AAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGACGA CGACTGCTTC TCTTTTGAAG ACTTGTCTTT TTGGGTGCGA CTCGTCTTCT TCTTTCAAAT TCAAATGCAA ATTCGAATCT CCCGCGAAAA CGCGAGGGCT CTCTCCGGCG  ACCGAGAAAC ATGTTGTCAG ATCGTTAAGA GCCTGGCGTA TTCGTTGTAT CTCCGATGAT CCTGGTTCGA GTCAGGTTTT CGTTTCCAGT AGAAGAAAAA TGGTAGTCTT GTTGTCGACG  GTGCAGCTTC TGTCTCATTT GCTTCCGCAA AACGGGAACG CAGCTGAGAT TTATCCGGTG ATGCAAAACG AAATAAGGAA AGTGGTGACA AAGGGTAAGG CTGCTGGTGT GCTTCGTTTA  GTGTTTCATG ATGCTGGAAC CTTTGAACTG GGCGATCATT CTGGTGGCAC CAACGGGTCT ATTGCTTATG AACTCGAGAG ACCTGAAAAC ACAGGTTTGA AGAAATCCTT AAAGGTTCTA  GCAAAAGCAA AGATTAAGGT TGATGAGATA CAACCAGTGT CTTGGGCGGA TATGATCTCT GTCGCTGGGT CTGAAGCAGT TTCAATATGT GGCGGCCCAA CAATTCCAGT AGCTTTGGGA  AGACTTGATT CAGCGCAACC TGATCCAGAA GGCAAGCTAC CTCCAGAAAC CCTGAGTGCC TCGGGTTTGA AAGAATGCTT CAAAAGAAAA GGATTTTCGA CCCAGGAGCT TGTTGCCTTA  TCTGGGGCAC ATACGATTGG GAGTAAAGGC TTTGGAGATC CGACAGTTTT TGACAATGCA TACTACAAAA TCCTTCTTGA AAAACCATGG GCATCAACTT CAAAAATGAC CAGCATGGTC  GGGCTTCCTT CGGATCATGC CTTAGTGGAG GATGATGAGT GCTTAAGGTG GGTGAAACTA TATGCGGGAG ACCAAGACAA GTTCTTCGAA GACTTCAACA ATGCTTATAT CAAACTAGTT 
AATTCTGGGG CCAAATGGAA TAAGTTATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGACGA CGACTGCTTC TCTTTTGAAG ACTTGTCTTT TTGGGTGCGA CTCGTCTTCT TCTTTCAAAT TCAAATGCAA ATTCGAATCT CCCGCGAAAA CGCGAGGGCT CTCTCCGGCG  ACCGAGAAAC ATGTTGTCAG ATCGTTAAGA GCCTGGCGTA TTCGTTGTAT CTCCGATGAT CCTGGTTCGA GTCAGGTTTT CGTTTCCAGT AGAAGAAAAA TGGTAGTCTT GTTGTCGACG  GTGCAGCTTC TGTCTCATTT GCTTCCGCAA AACGGGAACG CAGCTGAGAT TTATCCGGTG ATGCAAAACG AAATAAGGAA AGTGGTGACA AAGGGTAAGG CTGCTGGTGT GCTTCGTTTA  GTGTTTCATG ATGCTGGAAC CTTTGAACTG GGCGATCATT CTGGTGGCAC CAACGGGTCT ATTGCTTATG AACTCGAGAG ACCTGAAAAC ACAGGTTTGA AGAAATCCTT AAAGGTTCTA  GCAAAAGCAA AGATTAAGGT TGATGAGATA CAACCAGTGT CTTGGGCGGA TATGATCTCT GTCGCTGGGT CTGAAGCAGT TTCAATATGT GGCGGCCCAA CAATTCCAGT AGCTTTGGGA  AGACTTGATT CAGCGCAACC TGATCCAGAA GGCAAGCTAC CTCCAGAAAC CCTGAGTGCC TCGGGTTTGA AAGAATGCTT CAAAAGAAAA GGATTTTCGA CCCAGGAGCT TGTTGCCTTA  TCTGGGGCAC ATACGATTGG GAGTAAAGGC TTTGGAGATC CGACAGTTTT TGACAATGCA TACTACAAAA TCCTTCTTGA AAAACCATGG GCATCAACTT CAAAAATGAC CAGCATGGTC  GGGCTTCCTT CGGATCATGC CTTAGTGGAG GATGATGAGT GCTTAAGGTG GGTGAAACTA TATGCGGGAG ACCAAGACAA GTTCTTCGAA GACTTCAACA ATGCTTATAT CAAACTAGTT  AATTCTGGGG CCAAATGGAA TAAGTTATGA TGTCTAGTTT TATCTTTTGT TAGCTCATAA GTGTTTCAAA CATGCCTGAA TAATTTGGGT AGTAATGCTT ATTTGCTAGT AAGTAAAAAG 
TTTATCTGCC AACTACTACA AAACTAAACA TCAAATATAC TCGAAATTTA CTTAAAAAGA TATAGAAAAG 

Retrieve as FASTA