Entry information : AhalAPx05Araha.4910s0002
Entry ID 14778
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalAPx05Araha.4910s0002
Name AhalAPx05Araha.4910s0002
Class Ascorbate peroxidase family    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalAPx05
start..stop
S start..stop
AlyAPx07 584 0 1..286 44..329
BstrAPx07 569 0 1..286 63..348
CrubAPx07 566 0 1..286 59..344
CagraAPx07 564 0 1..286 62..347
Literature and cross-references AhalAPx05Araha.4910s0002
Protein sequence: AhalAPx05Araha.4910s0002
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   286
PWM (Da):   %s   31095.01  
PI (pH):   %s   6.09
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGMELIGNGF INHVGDANAA DLNQRRQRSE LQSKIKITLS SAIKAKPELV PSILKLALND AMTYDKATKS GGANGSIRFS SELSRAENEG LSDGLSLIED VKKEIDSISK GGPISYADLI  QLAGQSAVKS TFLASAIRKC GGNEEKGNLL YTAYGSAGQW GLFDRNFGRS DATEADPEGR VPQWGKATVQ EMKDKFIAIG LGPRQLAVMS AFLGPDQLAT EQLLATDPQV APWVQKYQRS 
RETVSQTDYE VDLITAFTKL SCLGQQINFE AYTYPVERIN LSKLKL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGCACTGCC ATGGGAATGG TACATTAACA CTTGACTCAA AATCAAATTA CTTACAACTT TGGTCTAAAT GAGACATTGT AATGTATAAT CTTTATGTCA ACATTTGATG AGTTTTTGGC  AGTGATGATC TCTCTTGTTA GGAATTAATA GGCAATGGTT TCATTAATCA TGTGGGTGAT GCAAATGCTG CTGATTTGAA TCAACGTAGA CAACGATCCG AGCTTCAATG TGAGTTCTGA  AACAAGAACA CAAGTGTAGT ACCAAGAGGT TGTTGTTATT GACATTATAT GTTTCATTTT TATTATGCAG CAAAGATCAA GATTACGCTT TCGAGCGCCA TTAAGGCTAA ACCGGAGCTT  GTACCTTCCA TACTCAAACT AGCTCTCAAT GATGCAATGA CTTATGATAA GGTTAGGCTT CATATAATTC TCTTATCCAT CTCTTTGGGG TGATTGCACA ACTCTTTACC ATTTATGCTG  GCTTTTTGTA TAGGCTACAA AATCCGGGGG AGCCAATGGA TCTATTCGGT TCAGGTATTG TGATCTAAGA ACATTATAAG AGTTAATCTT TAGATGATGT CTCATGCAAT TTTTTATTTT  TGTGAAGCTC TGAGCTAAGT AGAGCAGAGA ACGAGGGACT TTCTGATGGG TTGAGTCTGA TAGAGGATGT GAAGAAGGAG ATTGACTCGA TCTCGAAGGG AGGGCCTATT TCATATGCAG  ATCTCATTCA ATTGGCAGGT GATGATGTTA TAGCATATGC CAAAAACATG TTCATGAACA GAATTATTAT TGTGGTAACT GAAATCTTTC TTGGGTTGGT TTCTATAGGG CAATCAGCGG  TCAAGTCTAC GTTTTTAGCA TCGGCAATCC GCAAATGTGG TGGAAATGAA GAAAAAGGGA ACTTACTCTA CACAGCATAT GGTTCTGCTG GTCAGGTAAA CAATGCTATC TTATGTGTTT  TGAGTCGCGG AGTATTGTTC AAATCGAGAC TGAACCGTTG TGAATCTGTT AGTGGGGCTT GTTTGATAGA AATTTCGGAA GGAGTGATGC AACTGAGGCA GATCCAGAAG GCAGAGTCCC  ACAGTGGGGT AAAGCAACTG TGCAAGAGAT GAAAGATAAG TTCATTGCCA TTGGATTGGG TCCTCGTCAG GTACATGATT ATGGGTTTCA AAATACGGTT ATCGGATTTG ATCATTCAAA  GTAACTAACC TGTATTCGAA TCAATGTTTT GAGGGATTTG TAGCTAGCTG TAATGTCTGC ATTCTTGGGT CCTGATCAAC TAGCAACAGA ACAGCTCTTG GCTACTGACC CGCAAGTTGC  TCCATGGGTT CAGAAGTACC AAAGAAGCCG TGAAACCGTA TCTCAGACTG ATTACGAGGT TTGTTTTCAC TTGATCTGCG TTAATATATA TTCCTCTACA TCAAGATCAA GCTCATGTTT  GTTTTCTGAA CATGTTTGCA GGTTGATCTA ATAACAGCAT TCACAAAGCT AAGTTGCTTA GGACAACAAA TCAACTTCGA GGCATACACT TATCCCGTCG AACGGATCAA TCTGAGCAAA 
CTCAAGCTAT AAGCTATGTA CACTATATGT ATAACCTGAG AGGAAACTTA AAACTCATTC CGCAATTGAT TTGCTGAAAT AAACCAAAGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAATGG AATTAATAGG CAATGGTTTC ATTAATCATG TGGGTGATGC AAATGCTGCT GATTTGAATC AACGTAGACA ACGATCCGAG CTTCAATCAA AGATCAAGAT TACGCTTTCG  AGCGCCATTA AGGCTAAACC GGAGCTTGTA CCTTCCATAC TCAAACTAGC TCTCAATGAT GCAATGACTT ATGATAAGGC TACAAAATCC GGGGGAGCCA ATGGATCTAT TCGGTTCAGC  TCTGAGCTAA GTAGAGCAGA GAACGAGGGA CTTTCTGATG GGTTGAGTCT GATAGAGGAT GTGAAGAAGG AGATTGACTC GATCTCGAAG GGAGGGCCTA TTTCATATGC AGATCTCATT  CAATTGGCAG GGCAATCAGC GGTCAAGTCT ACGTTTTTAG CATCGGCAAT CCGCAAATGT GGTGGAAATG AAGAAAAAGG GAACTTACTC TACACAGCAT ATGGTTCTGC TGGTCAGTGG  GGCTTGTTTG ATAGAAATTT CGGAAGGAGT GATGCAACTG AGGCAGATCC AGAAGGCAGA GTCCCACAGT GGGGTAAAGC AACTGTGCAA GAGATGAAAG ATAAGTTCAT TGCCATTGGA  TTGGGTCCTC GTCAGCTAGC TGTAATGTCT GCATTCTTGG GTCCTGATCA ACTAGCAACA GAACAGCTCT TGGCTACTGA CCCGCAAGTT GCTCCATGGG TTCAGAAGTA CCAAAGAAGC  CGTGAAACCG TATCTCAGAC TGATTACGAG GTTGATCTAA TAACAGCATT CACAAAGCTA AGTTGCTTAG GACAACAAAT CAACTTCGAG GCATACACTT ATCCCGTCGA ACGGATCAAT 
CTGAGCAAAC TCAAGCTATA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGCACTGCC ATGGGAATGG AATTAATAGG CAATGGTTTC ATTAATCATG TGGGTGATGC AAATGCTGCT GATTTGAATC AACGTAGACA ACGATCCGAG CTTCAATCAA AGATCAAGAT  TACGCTTTCG AGCGCCATTA AGGCTAAACC GGAGCTTGTA CCTTCCATAC TCAAACTAGC TCTCAATGAT GCAATGACTT ATGATAAGGC TACAAAATCC GGGGGAGCCA ATGGATCTAT  TCGGTTCAGC TCTGAGCTAA GTAGAGCAGA GAACGAGGGA CTTTCTGATG GGTTGAGTCT GATAGAGGAT GTGAAGAAGG AGATTGACTC GATCTCGAAG GGAGGGCCTA TTTCATATGC  AGATCTCATT CAATTGGCAG GGCAATCAGC GGTCAAGTCT ACGTTTTTAG CATCGGCAAT CCGCAAATGT GGTGGAAATG AAGAAAAAGG GAACTTACTC TACACAGCAT ATGGTTCTGC  TGGTCAGTGG GGCTTGTTTG ATAGAAATTT CGGAAGGAGT GATGCAACTG AGGCAGATCC AGAAGGCAGA GTCCCACAGT GGGGTAAAGC AACTGTGCAA GAGATGAAAG ATAAGTTCAT  TGCCATTGGA TTGGGTCCTC GTCAGCTAGC TGTAATGTCT GCATTCTTGG GTCCTGATCA ACTAGCAACA GAACAGCTCT TGGCTACTGA CCCGCAAGTT GCTCCATGGG TTCAGAAGTA  CCAAAGAAGC CGTGAAACCG TATCTCAGAC TGATTACGAG GTTGATCTAA TAACAGCATT CACAAAGCTA AGTTGCTTAG GACAACAAAT CAACTTCGAG GCATACACTT ATCCCGTCGA 
ACGGATCAAT CTGAGCAAAC TCAAGCTATA AGCTATGTAC ACTATATGTA TAACCTGAGA GGAAACTTAA AACTCATTCC GCAATTGATT TGCTGAAATA AACCAAAGA 

Retrieve as FASTA