Entry information : AhalAPx06Araha.24206s0001
Entry ID 14779
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalAPx06Araha.24206s0001
Name AhalAPx06Araha.24206s0001
Class Ascorbate peroxidase family    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalAPx06
start..stop
S start..stop
AlyAPx23-2 496 2e-180 1..257 36..292
CrubAPx03-2 474 8e-172 1..257 35..290
TsAPx23-2 468 2e-169 1..257 34..288
BstrAPx03-2 451 1e-162 6..257 28..286
Literature and cross-references AhalAPx06Araha.24206s0001
Protein sequence: AhalAPx06Araha.24206s0001
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   257
PWM (Da):   %s   28373.23 Transmb domain:   %s   o228-250i
PI (pH):   %s   5.21
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLRLAWHDAG TYDAKSKTGG PNGSIRNEEE YSHGANSGLK IALDLCEEVK TKHPKISYAD LYQLAGVVAV EVTGGPDISF VPGRKDSNSC TDEGRLPDAN QGFKHLKDVF YRMGLSDKDI  VALSGAHTLG RAHPERSGFD GPWTQDPLKF DNSYFVELLK EEESEGLLKL ATDKTLLEDP EFRQYVELYA KDEDAFFRDY AESHKKLSEL GFTTPTSSVI KAITDNSTAL AHSAVGVAIA 
AAVVAFGYFY EIRRRMK* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGCTAAGAAG AATTGCGCTC CGATCATGCT CCGATTAGCG TAAGTTTCTA TTTCTGTACT TTTTTCTTCC GATTCCGTCA TGTTAAGCGC GACGAGGTTC TAAGAAATCT CGCGATGTTG  TGGAAAATTG TTCGCTGCAT TTACGATCTC TCAGTACTTT GATTTTGTTG ACATGTTGTT GTTGTTGTCG TCTTTGGTTT TGTGAAGGTG GCATGATGCT GGAACTTATG ATGCTAAATC  GAAGACAGGT GGACCTAATG GCTCGATTAG GAACGAAGAA GAGTATAGTC ATGGTGCTAA TAGTGGTTTG AAGATCGCTC TTGATCTCTG TGGTGCGTTT TTTCGTTCCC TTCTCTGCTG  ATTAGAGATT GAAGTTGAGA TTCAGTGATT TAGGGAACGT ATTAGCTTGA CGAGATAATT CACATTTGGA ACGTATTATT ATATGGCTTT TGAAATCTTG CTAAGTCTAC ATAATCGTTT  TGTACATTGA CCTTAAGATG ATTATGTGTT GGCTCTTTAC TTGAAATGGG ATCGTTCTTT TAGTAGTCCA GAGGATGTAT GAGAAGTTCA CGTGTTAAAC TTTTTAGTCT ATACACATGA  TCATTTTTAC ATTGTATTCA TGTGGTGTAT TAGTTTATCT TATGATTTAC TAACAATTTT CATAACTATC TTACTTTTTC TTTTGAACTT GATGGTGATT CTTTGATATT TCAGAGGAAG  TGAAAACTAA ACATCCCAAA ATCAGTTATG CAGACCTATA CCAGGTAACT ACGAATTTTG CATGAACTTC TATGATAAGT GGGAGTATAA ACAAAGATCA GTGTTAATTA TATCCCTTCT  ATTCAGTTGT ATTGGAAGTA AGACTATGAA CTAAGATTAG TGTTATATCC CTTTTGTTCA GTTGCTTTTT GCCCTCTTTC TTCAGATTTC TCTGGGAGTT TTTAGTAATT AGCGTCTCGT  AAACTCATCA GAAGTGCTAG TTTGTTAGAT AAATTCGGTG GAATTGTGCG ATTGTGGTCC TCAGGGTATC GAAACAGGGG AATTGACAAT TGCTCTTCAG AGTTGAAATA TTTGGCTTAT  TTGCAGTGTG AAAATTCTTA TCACAGATTA AAAATAATGG TCTTGTTTGT ATTCTCTGGC TTTAACAATC GTAATTCAAG TGAAATATAT TGATACAGTG TAAGAATTAT GGAGGAATTT  AACAGAACGT CAAATCCATT TCTGTGCTAG GAGAGATCGG TTGACTGTAA ATTTTTGAAA ATTTCCTGAA TTTGGCTGTG TCAGTAAAGC TGAATTAACA TTTCAATTTG TTTCTTAGAA  CTATCTACTC ATCAGTGGTG TTCTATTTAG GCCTGGACTT ACTAGGGCTT ACATGTTTGT GCTTTTACAC CTATATCACA TCCTCTAGTA CTGTACATAT CATGAATTGT ACCACCATTT  TCTTCCTTTG GTATCAGTAT GTCAAGGCTT TAGCTGTGAA TGCAATATCA AATGTCCACA AGCAGGGCTG CTATTATATT ATTGCTAGCA ATTTTCGGAT CTTAATCAAT TTAACATGAA  ATTGATTCTG TCATTTTCAG CTCGCTGGTG TGGTAGCGGT TGAAGTTACT GGTGGACCTG ACATCAGTTT TGTTCCTGGT CGAAAAGTAA TGTTCTCTTA GCCATTAAGA TGAATTGTGC  TTACTTCCAA AAGCATTTAA CTAAATTAGC TGAATGTTTC TCTCTTATAT AGGATTCAAA TTCCTGCACC GATGAGGGAA GACTTCCTGA TGCTAATCAA GGTTGGATGA ATTTTCTTTT  TCCATTTATC AGAAACTCGC CTTTTATTGA AAATTAAACA CCTGACCTTT GTATTCAAGT AGCAAACAAA TAACGGAAGA TGATCGCGTG GAATATTTGG AGGGTCATGG TGTTTCCACG  ATGTACAACA AAATCTTTAT TTTGAATGTA ATCTTCCTCA GTGAGGGTTT GAAGTTATGT CTGCTATTTT GCATGTAGGT TTCAAACATC TTAAAGATGT CTTCTACCGG ATGGGACTGT  CTGATAAAGA TATTGTGGCA CTCTCAGGAG CTCATACTCT GGTAAATTCT TTGATTGCAC AATTCACATT TGTTGTTTGC TATTTAAAAG TTATGTCTGG GGGTTTTAAT TAGACTGCAA  TATTTAGGGA AGGGCTCATC CAGAGAGATC AGGTTTTGAT GGACCATGGA CTCAAGATCC TCTAAAGTTT GACAATTCAT ACTTTGTGTA AGATCCCCTA AATCTGTGGA CATAGTTTTC  TTTTATTGGA GACAACTACT AGTTGTTTTG TATACTGAAT TGTTTAAATC ATGATCATTG TTGGTACAGG GAACTGCTGA AAGAAGAAGA ATCAGAGGGC TTACTGAAAC TTGCAACGGA  CAAGACTTTG TTGGAAGACC CCGAATTCCG TCAATACGTT GAGCTTTACG CAAAAGTAAT ATTTGGGAGT CTATCTTTAC TCTGGTCCAA AGATCCGATT CAGTTATTAA TTCGAATACA  AGCCAAGGTA ATGTTGCAAG TGGCATCTTG ACTTCTTCTT TTGTCCCTTA CAGGACGAAG ATGCATTCTT CAGAGACTAT GCAGAGTCAC ACAAGAAACT CTCAGAGCTT GGGTTCACTA  CACCAACGTC TTCAGTCATT AAGGCAATAA CAGACAACAG CACGGCGCTA GCACATAGTG CAGTCGGGGT TGCAATCGCT GCTGCTGTGG TGGCCTTTGG TTACTTCTAT GAAATTCGGA  GAAGGATGAA GTAAATAAAA TAGAAAGAAG AAACGATTCT TCTTCTTATA TCTCTGGTTT TGTAAGCATT TTGGAACAAG ATAACACGTC CAATAGTTTG TCGCTTAAAT CAACATTTCA 
GTGATTTTGG TTTGGAACAC CCAGGTTTTG GTCCAGGTTT TAGGAAATTA CTAGTAAACA AACCAAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTCCGAT TAGCGTGGCA TGATGCTGGA ACTTATGATG CTAAATCGAA GACAGGTGGA CCTAATGGCT CGATTAGGAA CGAAGAAGAG TATAGTCATG GTGCTAATAG TGGTTTGAAG  ATCGCTCTTG ATCTCTGTGA GGAAGTGAAA ACTAAACATC CCAAAATCAG TTATGCAGAC CTATACCAGC TCGCTGGTGT GGTAGCGGTT GAAGTTACTG GTGGACCTGA CATCAGTTTT  GTTCCTGGTC GAAAAGATTC AAATTCCTGC ACCGATGAGG GAAGACTTCC TGATGCTAAT CAAGGTTTCA AACATCTTAA AGATGTCTTC TACCGGATGG GACTGTCTGA TAAAGATATT  GTGGCACTCT CAGGAGCTCA TACTCTGGGA AGGGCTCATC CAGAGAGATC AGGTTTTGAT GGACCATGGA CTCAAGATCC TCTAAAGTTT GACAATTCAT ACTTTGTGGA ACTGCTGAAA  GAAGAAGAAT CAGAGGGCTT ACTGAAACTT GCAACGGACA AGACTTTGTT GGAAGACCCC GAATTCCGTC AATACGTTGA GCTTTACGCA AAAGACGAAG ATGCATTCTT CAGAGACTAT  GCAGAGTCAC ACAAGAAACT CTCAGAGCTT GGGTTCACTA CACCAACGTC TTCAGTCATT AAGGCAATAA CAGACAACAG CACGGCGCTA GCACATAGTG CAGTCGGGGT TGCAATCGCT 
GCTGCTGTGG TGGCCTTTGG TTACTTCTAT GAAATTCGGA GAAGGATGAA GTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGCTAAGAAG AATTGCGCTC CGATCATGCT CCGATTAGCG TGGCATGATG CTGGAACTTA TGATGCTAAA TCGAAGACAG GTGGACCTAA TGGCTCGATT AGGAACGAAG AAGAGTATAG  TCATGGTGCT AATAGTGGTT TGAAGATCGC TCTTGATCTC TGTGAGGAAG TGAAAACTAA ACATCCCAAA ATCAGTTATG CAGACCTATA CCAGCTCGCT GGTGTGGTAG CGGTTGAAGT  TACTGGTGGA CCTGACATCA GTTTTGTTCC TGGTCGAAAA GATTCAAATT CCTGCACCGA TGAGGGAAGA CTTCCTGATG CTAATCAAGG TTTCAAACAT CTTAAAGATG TCTTCTACCG  GATGGGACTG TCTGATAAAG ATATTGTGGC ACTCTCAGGA GCTCATACTC TGGGAAGGGC TCATCCAGAG AGATCAGGTT TTGATGGACC ATGGACTCAA GATCCTCTAA AGTTTGACAA  TTCATACTTT GTGGAACTGC TGAAAGAAGA AGAATCAGAG GGCTTACTGA AACTTGCAAC GGACAAGACT TTGTTGGAAG ACCCCGAATT CCGTCAATAC GTTGAGCTTT ACGCAAAAGA  CGAAGATGCA TTCTTCAGAG ACTATGCAGA GTCACACAAG AAACTCTCAG AGCTTGGGTT CACTACACCA ACGTCTTCAG TCATTAAGGC AATAACAGAC AACAGCACGG CGCTAGCACA  TAGTGCAGTC GGGGTTGCAA TCGCTGCTGC TGTGGTGGCC TTTGGTTACT TCTATGAAAT TCGGAGAAGG ATGAAGTAAA TAAAATAGAA AGAAGAAACG ATTCTTCTTC TTATATCTCT  GGTTTTGTAA GCATTTTGGA ACAAGATAAC ACGTCCAATA GTTTGTCGCT TAAATCAACA TTTCAGTGAT TTTGGTTTGG AACACCCAGG TTTTGGTCCA GGTTTTAGGA AATTACTAGT 
AAACAAACCA AA 

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