Entry information : AhalAPx07Araha.12133s0006
Entry ID 14780
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalAPx07Araha.12133s0006
Name AhalAPx07Araha.12133s0006
Class Ascorbate peroxidase family    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalAPx07
start..stop
S start..stop
AlyAPx02 503 0 1..251 1..251
AtAPx02 502 0 1..251 1..251
CagraAPx02 498 0 1..251 1..251
BstrAPx02 494 0 1..251 1..251
Literature and cross-references AhalAPx07Araha.12133s0006
Protein sequence: AhalAPx07Araha.12133s0006
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   251
PWM (Da):   %s   28104.54  
PI (pH):   %s   6.43
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVKKSYPEVK EEYKQAVQRC KRKLRGLIAE KHCAPIVLRL AWHSAGTFDV KTKTGGPFGT IRHPQELAHD ANNGLDIAIR LLEPIKDLFP ILSYADFYQL AGVVAVEITG GPEIPFHPGR  LDKVEPPPEG RLPQATKGVD HLRDVFGRMG LNDKDIVALS GGHTLGRCHK ERSGFEGAWT QNPLIFDNSY FKEILSGEKE GLLQLPTDKA LLDDPLFRPF VERYAADEDA FFEDYTEAHL 
KLSELGFADK E* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTCATTTGA TCATCAGCCG ATTCTATAAA TTGCAAACTA AAGTAATGAC AACTATAACT AGCACTTTCT TCTTTGATCG ATCACTGTGT TTTCCTAGTT GAGTATGTTC TTGTAATCCT  ATTAATCGAT AGGTAATGAA TTCTATTTGG GTTTATTAAA GTCTTTCACG ATTTGCAGAG AGAAGCGAAT TTGAAAAATG GTGAAGAAGA GTTACCCGGA AGTGAAAGAA GAGTACAAGC  AAGCTGTTCA GAGATGCAAG AGGAAGCTCC GTGGTCTTAT CGCCGAGAAG CACTGTGCTC CCATCGTTCT CCGTCTTGCG TAAGATCCTC TCTCTGGTTC CAGTCTCTTC TGTTTCTCAA  TAGTAGTTTC TTTTCGTTTG CTTATGAGTG TTGATGCGTT TGTGAGTTGT CTCTGAGAGT TTCTTTTTGT TGGGAAATTT TGAAGATGGC ACTCGGCTGG GACATTTGAC GTGAAGACGA  AGACAGGAGG ACCGTTTGGA ACTATAAGGC ATCCCCAAGA GCTAGCCCAT GATGCCAACA ATGGTCTTGA TATAGCAATT AGGCTTCTTG AGCCAATCAA GGATCTGTTC CCCATTCTCT  CTTATGCTGA TTTCTACCAG GTAAAGTTTC AACAATGTGC TGATTTTTTG AGCTGTAATA CTGAAGCAAG GGATGCATCA AACTGTAGTA ATTAGGAGTT TGAGGTAAAA CCATATAATA  AAGGTGCGAG TGGAAACATA TGGAAGTGAT TTTGTTGGTT GAAACCGCTA AGTTATGACT TAAAATGGGT TCATCTCTAG CCTGCTATTG GCCCTCTGGT TTGTTTGCAG TGAACTAGAT  TCACGCATGT TAGATTGAAA CAGAATCTGA AAAGCTTACC TTGTATTTCT TGGTTACTGT AGCTAGCCGG AGTTGTTGCT GTTGAGATCA CTGGAGGACC CGAGATTCCA TTTCATCCTG  GCAGACTGGT GAGTCAATAT TCAAATTCTC AGTTTTTTGG CTACCAATTA TTTGCTTCAT CTCTTTGATT CGCAATTTCT TCGTTTTAAA TCGCAACTCA CTGATGATAG TCTAATGCAG  ACACCACTGC TAAGTTTTGT TCATGTGATT AACTTAACCA AACTTCATCT TTCAGGACAA AGTTGAGCCA CCTCCTGAAG GTCGTCTGCC TCAGGCCACT AAAGGTAAAA CAGATCTAAG  AAAATGCTTT TACGTAGTTT GAATTCAGGT ATCAGATTAT AAGTACATGT TCATAATCTG TTTTGTTCGT AAATTCAGGT GTGGATCATC TAAGAGATGT GTTTGGTCGG ATGGGACTCA  ATGACAAAGA TATTGTTGCA TTGTCTGGTG GACACACCTT GGTATGTATG CTGCATCCAA AAACAAAGAC TTATGACCTT TTCCCCAGTT TTGGCTCATA CCATTCATAT ACTTTCAGGG  TCGGTGCCAC AAGGAGCGCT CAGGATTCGA GGGAGCATGG ACACAAAACC CGCTCATTTT CGACAACTCC TATTTCAAGT AAGATCAGAT TCTCTGCTTC TGCTTGCTCA TACTTGAATT  GGACCAGAGC TGAATCAGAA GCTCTTGAAT CTTGATGGTT GTTAAACAGA GAGATACTAA GCGGAGAGAA AGAAGGACTT CTTCAACTAC CAACCGACAA GGCTCTTCTC GATGATCCTC  TCTTTCGTCC CTTTGTTGAG AGATATGCTG CAGTAAGTTA TTCAACTCAT CATTTCATGA TTCTCTCATC ATACATATAT GTCAATAGGA TATATCACTG ACTCGATTCT TACTCTCAGG  ATGAGGATGC CTTCTTCGAA GACTATACTG AAGCTCATCT GAAGTTGTCA GAACTCGGGT AAATAACACA TAAAACAATC TCTCTCTCAA CATTTTGTTT AACTTTTTTC TTATTGTCCT  AGTCGTAAAC TTCGATTGTT CCTCAGAAAC TTTTCAATTA CAAACAGATT TTGTCTAAAC CAGATATAAT CACTAAACTT TTTGGGTACG TTGGCAGGTT TGCTGACAAG GAGTAATATG  GAATCTGGTG CCATGTCCTA TCCCTTGAAT TTGATTCTTG TTCCTTCACA TTATCGTGTT GTAATCATAT GAAAGACAGT AAAATCGAAT GGAAGGATTT GTATTGTACG TATGCCTTGG 
GGTTGCTTGT AACTAATGAA ATAAGACAAC ATCTTCATAT CTCTGACATT ACAATACTTT GGGATTAGAT GATAAAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGAAGA AGAGTTACCC GGAAGTGAAA GAAGAGTACA AGCAAGCTGT TCAGAGATGC AAGAGGAAGC TCCGTGGTCT TATCGCCGAG AAGCACTGTG CTCCCATCGT TCTCCGTCTT  GCATGGCACT CGGCTGGGAC ATTTGACGTG AAGACGAAGA CAGGAGGACC GTTTGGAACT ATAAGGCATC CCCAAGAGCT AGCCCATGAT GCCAACAATG GTCTTGATAT AGCAATTAGG  CTTCTTGAGC CAATCAAGGA TCTGTTCCCC ATTCTCTCTT ATGCTGATTT CTACCAGCTA GCCGGAGTTG TTGCTGTTGA GATCACTGGA GGACCCGAGA TTCCATTTCA TCCTGGCAGA  CTGGACAAAG TTGAGCCACC TCCTGAAGGT CGTCTGCCTC AGGCCACTAA AGGTGTGGAT CATCTAAGAG ATGTGTTTGG TCGGATGGGA CTCAATGACA AAGATATTGT TGCATTGTCT  GGTGGACACA CCTTGGGTCG GTGCCACAAG GAGCGCTCAG GATTCGAGGG AGCATGGACA CAAAACCCGC TCATTTTCGA CAACTCCTAT TTCAAAGAGA TACTAAGCGG AGAGAAAGAA  GGACTTCTTC AACTACCAAC CGACAAGGCT CTTCTCGATG ATCCTCTCTT TCGTCCCTTT GTTGAGAGAT ATGCTGCAGA TGAGGATGCC TTCTTCGAAG ACTATACTGA AGCTCATCTG 
AAGTTGTCAG AACTCGGGTT TGCTGACAAG GAGTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTCATTTGA TCATCAGCCG ATTCTATAAA TTGCAAACTA AAAGAGAAGC GAATTTGAAA AATGGTGAAG AAGAGTTACC CGGAAGTGAA AGAAGAGTAC AAGCAAGCTG TTCAGAGATG  CAAGAGGAAG CTCCGTGGTC TTATCGCCGA GAAGCACTGT GCTCCCATCG TTCTCCGTCT TGCATGGCAC TCGGCTGGGA CATTTGACGT GAAGACGAAG ACAGGAGGAC CGTTTGGAAC  TATAAGGCAT CCCCAAGAGC TAGCCCATGA TGCCAACAAT GGTCTTGATA TAGCAATTAG GCTTCTTGAG CCAATCAAGG ATCTGTTCCC CATTCTCTCT TATGCTGATT TCTACCAGCT  AGCCGGAGTT GTTGCTGTTG AGATCACTGG AGGACCCGAG ATTCCATTTC ATCCTGGCAG ACTGGACAAA GTTGAGCCAC CTCCTGAAGG TCGTCTGCCT CAGGCCACTA AAGGTGTGGA  TCATCTAAGA GATGTGTTTG GTCGGATGGG ACTCAATGAC AAAGATATTG TTGCATTGTC TGGTGGACAC ACCTTGGGTC GGTGCCACAA GGAGCGCTCA GGATTCGAGG GAGCATGGAC  ACAAAACCCG CTCATTTTCG ACAACTCCTA TTTCAAAGAG ATACTAAGCG GAGAGAAAGA AGGACTTCTT CAACTACCAA CCGACAAGGC TCTTCTCGAT GATCCTCTCT TTCGTCCCTT  TGTTGAGAGA TATGCTGCAG ATGAGGATGC CTTCTTCGAA GACTATACTG AAGCTCATCT GAAGTTGTCA GAACTCGGGT TTGCTGACAA GGAGTAATAT GGAATCTGGT GCCATGTCCT  ATCCCTTGAA TTTGATTCTT GTTCCTTCAC ATTATCGTGT TGTAATCATA TGAAAGACAG TAAAATCGAA TGGAAGGATT TGTATTGTAC GTATGCCTTG GGGTTGCTTG TAACTAATGA 
AATAAGACAA CATCTTCATA TCTCTGACAT TACAATACTT TGGGATTAGA TGATAAAA 

Retrieve as FASTA